Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHB37482.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSSSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGSMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFVPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGETIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYLPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQVITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTLGLGRDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTAGGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKNKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNSDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGADDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLDKYSSTEKTPAAPKATSSSFKESATDVINDTITTIKSKSTDITNWFRNSTIGKAVKAVSPVESIRKMVTTVVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAAAAKQKDMATDKELIGGAADTSMTDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSAADVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2237 AA molecular weight: 245580,81680 Da isoelectric point: 8,68307 aromaticity: 0,07599 hydropathy: -0,46097
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
STR
1–899
Coil
Unmapped
149–173
Unmapped
149–173
IPR023346
STR
1883–2015
STR
1883–2015
IPR008258
ENZ
1885–1978
ENZ
1885–1978
1
2237
Architecture
STR 1-2065 | RBD 2066-2237
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage vB_PaeM_HUST_1 [NCBI] |
3348357 | Viruses > |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] |
287 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB37482.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ227241.1
[NCBI]
CDS location
range 36397 -> 43110
strand -
strand -
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCCGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATTCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCCGCTATAGACCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGCGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGCGATAAGGTATCGGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGTTCTATGTTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCGGCTCAACGGGTATCGAGTAGTTTTGTTGACAACGCCATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCAAATGAAAATATCCGTAACTTTGCTGATGCAGCTCGTGCTGGAAGCATGTTTGGCGCAGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCCGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGTGGTCGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTGTTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGTGGTGTAAGTGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCACTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGATCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGACGATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAATATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGACCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAAGGTATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGCGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCTTCTAAGCTGGCCCAAGAACAAGCTAATAAAGGGTATGATTATGCGCAGCAAAAAGTATCACTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTGTACGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGGGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATCACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTTTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCTGCACAGATCGCTGGTGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATTTACCTGGTCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAGTTATAACCAATTTGAAAGATGCTAAGGGTACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACCGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGATCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTCTTGGATTAGGTAGGGATATTCTAAGTAATCGAGATGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTACTACACAGCTGGTGGCAACCTATTAAAATCATTCGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCTGATGGATCTAAGCATACTGCTGCTAAGAATAAGGGTTTATTCCGAACTGGTTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAATGGTTGGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACAACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGTCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACAGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGAGCATTATCAACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACCAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTACGGTGCTACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCCTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTGCTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGATTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGATATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTGGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACACCTGCCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACTGATGTAATAAATGATACCATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATCACTAATTGGTTTAGGAATTCAACTATTGGAAAAGCAGTTAAAGCAGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAGTAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCATTGCAAGCGCTACGTGTACACGCTTATGGGATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTACTATCGATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
9d2d46059882c7ca33bfecc737bbafb1ebb9fa79f6ee6af356e2a96df7a256a1
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50