Protein

View in Explore
Genbank accession
QJT70953.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,52
Protein sequence
MLNKGIFNFGNSLKVPGDVSVAPPVYDPQRSLRFDSSLSQYLTWLPKVNGNLKQWTYSFWFKRTELTNGFNVPRVFQVSPAYNSYIYVHNGGVLLASSRAGISSVNVSWEYDLVDTTEWYHIVIRADTTQANASDRITLWLNGELLPITTTTTTPALNSDLSFFSTDQENTFGILKNNATTALSQQYDGYLTELAMFDGAADLQIDRFGYFDNLGVWRPSNLRLTIPQEYWVGNSFYLPCTSRTTRTGNSADLVVSTPRGTPVRTKLKPDFLLVKAVDVSALAGIYDRTRGTGKILPLNANPEITNNNTLTSWDDDGYTLGSDFNTASRYASLTLEDNPDFGFDIVTYTGNGLNGRTLAHDLGKLPEMIWIKNRTSTSNWVVWHKDLDDNKTLDLNRNIAQAASTYMGGVTTENFVINAAGNVNANESEYVAYIFTSVDNFCKVGKFTGTGSSSTLSIECGFRPSAYIFKSINHIDSWYTTFSDYYYLIESFNAAVNFNTPPMYETGFHVTTGYGAANPFIFIAWADTTQLQDILESDISDIQFEFVGASDIESVVSLDNPENNLGVLMQKPSSVSAVSPTDGGRVSRLGHRLPDGVIPAVWSKPLTGKVYWEIEYLSDTHPTQNTILLTGLDSRQGKLGHANRIAAYYAGNGHLYTSIPSEVNEAYGDTWTVGDVIGVQCDSDNNTVEYFKNGVSQGIFDYSTYWTGLVYPQGHSASTTDTVRFRIRTTYEEFKYPSSKSADAITLTESDMRYKRADVKKSDIGFTATTYTGFGDYPYSQIISSSRGAVGSFFVEVDGKLVTLYEQHYSGSTYANPVEQFYMNPETRQFEVLPGADFLNMSGALGFMKFIEGSDTYVVIPNYRSDSTHNVTSKVLRWDSSSADDGQFVVHQEIPTSACTDGSILEINGDIFIGLNQFSSEESLTNYAHSLKLMKFNHTSKIFEDIPEIATQGIRGSTMFEVDGKAYIAVSEIEGVNRVRLFEFNPDTHVSTLIQTLTGSTNGRIASTVHEGKAYLITSNQTSDVPVFYTLDTSVNPAQLVTVGDGSTGHIATHHKFLSYSDDKLLVLCARAQAGSSYITNSYLREFTISTGLWATINEYPTRSGYYPDMIEHNGQIYGSIGSYFNGTNYAQYVGYLTVNEDPNTPDDITGEREIYLGGEYDLIWVKSRTGSANSHKVFDTTRGWGKQMSTDLSGPESAQLETNMRGFTKDGFLVGDGSLNANAVNYVAWGWKKDPNLGFDIITYQGDSTGAAHPDRLLTHNCGGEVEFGLVKAYDANIDWYPYVKGVTTDPGHFLQFNTNNALNTSVRPLWAPSKMSPTEFAIGNNDGINQNGTNYIAYLWRSVPGFSKIGTYVGNGNADGPFIDCGFKPAFVLIKCIDSAQNWYLTDSARSPYNNITNRLIPDSSNPEATVATDSITYLSNGFQISGIGNINNIASQKFLYMAFAENPFEHTRAR
Physico‐chemical
properties
protein length:1457 AA
molecular weight: 161189,71690 Da
isoelectric point:4,92421
aromaticity:0,12286
hydropathy:-0,31414

Domains

Domains [InterPro]
IPR013320
9–200
IPR013320 IPR055906 IPR001870 IPR055906
PF13385
40–200
PF13385 IPR043136
IPR013320
607–712
IPR013320
IPR003877
609–699
IPR003877
QJT70953.1
1 1457
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage vB_VcorM_GR7B
[NCBI] 		2711165 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJT70953.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT366760 [NCBI]
CDS location
range 139418 -> 143791
strand +
CDS
ATGCTTAACAAAGGCATATTCAACTTCGGTAACTCACTGAAAGTTCCTGGTGACGTATCCGTAGCACCTCCGGTTTACGACCCTCAAAGAAGTTTACGGTTTGACTCATCACTAAGTCAATACCTAACATGGTTACCAAAAGTAAATGGTAACCTAAAGCAATGGACATACTCTTTCTGGTTCAAGAGAACAGAATTAACTAACGGATTTAACGTTCCCCGCGTTTTCCAAGTATCACCTGCCTATAACAGTTATATCTATGTACATAATGGTGGCGTACTCTTGGCTTCTAGCCGCGCAGGTATATCTAGTGTAAATGTCTCATGGGAATATGATCTAGTAGATACTACAGAGTGGTATCACATCGTTATCAGGGCTGATACCACTCAAGCGAACGCCTCCGATAGAATTACCCTGTGGCTAAATGGTGAATTGTTGCCTATAACAACAACCACCACAACACCCGCATTAAACTCCGATTTGAGTTTCTTCTCTACAGACCAAGAAAATACGTTTGGTATACTCAAGAATAATGCTACTACTGCACTATCGCAACAATATGATGGATACCTTACTGAACTAGCTATGTTCGACGGAGCTGCTGACCTTCAGATAGACAGGTTTGGTTACTTTGACAACTTGGGTGTTTGGCGTCCTTCAAATCTACGACTAACAATACCACAAGAATACTGGGTAGGTAACTCTTTCTACTTACCGTGTACATCACGTACAACCAGAACTGGTAACTCCGCTGACTTAGTTGTCTCTACCCCACGAGGCACACCCGTACGTACTAAACTGAAACCTGACTTCCTTTTAGTTAAAGCAGTTGATGTATCAGCATTAGCAGGTATTTATGACCGCACACGTGGTACAGGTAAAATACTGCCATTAAACGCTAATCCTGAAATTACTAACAACAACACACTAACCTCATGGGACGACGACGGGTACACACTAGGTTCAGATTTCAACACTGCTTCCAGATATGCATCCCTAACACTGGAAGATAACCCTGACTTCGGTTTCGACATTGTAACCTACACGGGTAATGGTCTTAATGGTCGTACCCTAGCCCACGACCTTGGCAAACTGCCAGAAATGATATGGATTAAGAATCGAACTTCCACATCCAACTGGGTTGTTTGGCACAAAGATCTCGATGACAACAAGACATTAGACCTGAATAGAAATATTGCGCAAGCAGCCTCAACCTACATGGGTGGCGTAACTACAGAAAACTTCGTGATAAACGCTGCGGGTAACGTTAATGCAAATGAATCTGAATACGTTGCGTACATCTTCACGAGTGTTGATAACTTCTGCAAAGTAGGTAAATTCACTGGTACTGGTTCTTCTAGTACGTTATCTATTGAGTGTGGTTTCAGACCATCAGCGTATATATTCAAATCAATAAACCATATAGACAGTTGGTACACCACCTTCAGTGATTATTACTACCTGATTGAATCATTCAATGCTGCCGTTAACTTTAACACACCTCCTATGTATGAAACAGGGTTCCACGTAACAACAGGTTATGGTGCTGCCAACCCATTTATCTTTATTGCATGGGCGGACACAACACAACTTCAAGACATACTTGAGTCAGATATTTCAGACATTCAGTTTGAATTCGTAGGTGCATCCGATATCGAGAGTGTTGTATCCCTCGATAATCCCGAGAACAATCTTGGGGTTCTAATGCAAAAACCGTCCTCAGTTAGTGCTGTATCACCTACTGACGGTGGTCGGGTATCTCGCTTAGGTCACAGACTACCCGACGGTGTAATACCTGCCGTATGGTCAAAACCACTAACTGGCAAAGTATACTGGGAAATAGAATACCTTTCCGATACTCATCCAACTCAGAACACCATTCTGCTTACGGGTCTAGACTCTAGGCAAGGTAAATTAGGACATGCTAACCGCATAGCTGCCTACTATGCAGGTAATGGTCACCTCTACACGTCGATACCCTCTGAAGTTAATGAAGCTTACGGTGACACTTGGACAGTAGGTGATGTGATTGGTGTTCAATGTGACTCGGATAACAACACTGTCGAATACTTCAAAAATGGTGTTAGTCAGGGTATCTTTGATTATAGTACATATTGGACAGGGTTAGTATACCCACAGGGTCACTCTGCATCAACGACGGATACCGTACGTTTCAGAATACGTACTACCTATGAAGAATTCAAATATCCGTCAAGTAAGAGTGCTGACGCAATAACGTTAACTGAATCCGATATGCGCTATAAAAGAGCCGACGTTAAAAAATCAGATATAGGCTTCACTGCTACTACTTACACAGGTTTCGGTGATTATCCTTATTCACAAATTATTAGTTCTTCTCGTGGTGCTGTGGGTTCTTTCTTCGTTGAAGTAGACGGTAAACTAGTTACACTCTATGAACAACATTACAGTGGTAGTACCTACGCAAACCCTGTTGAACAGTTCTATATGAACCCCGAAACACGTCAATTCGAAGTACTACCAGGTGCTGACTTTTTAAATATGAGTGGTGCTCTAGGATTCATGAAGTTCATCGAAGGTTCAGACACTTACGTAGTTATCCCTAACTACCGAAGTGACTCTACTCACAATGTAACTTCAAAAGTACTACGTTGGGACAGTTCTTCCGCAGATGACGGTCAATTCGTAGTACATCAGGAGATACCTACTTCCGCCTGTACTGACGGTTCTATCTTAGAGATAAATGGTGACATCTTCATTGGTCTAAACCAATTCTCAAGCGAGGAATCCCTAACTAACTACGCACACTCACTGAAACTGATGAAGTTCAACCACACTTCTAAGATATTCGAAGATATACCAGAGATAGCTACTCAAGGTATTCGTGGTAGTACAATGTTTGAGGTTGACGGTAAAGCCTACATCGCTGTATCTGAGATTGAAGGTGTAAACCGTGTTAGGTTGTTTGAGTTTAACCCAGATACCCATGTGTCTACTCTAATTCAAACTCTAACTGGTTCTACTAATGGTCGCATTGCTTCTACCGTTCATGAAGGTAAAGCCTACCTGATTACCTCAAACCAGACCAGTGACGTACCTGTTTTCTACACGCTAGACACATCAGTTAACCCTGCTCAGTTGGTAACCGTGGGCGATGGTAGTACAGGACACATCGCTACACACCATAAATTCCTGTCGTATTCCGACGACAAATTGTTGGTACTTTGTGCTCGTGCTCAGGCTGGTAGTAGCTACATTACTAACTCATACCTACGTGAGTTTACCATATCAACAGGACTATGGGCTACGATAAATGAATACCCTACTCGATCTGGATATTACCCAGATATGATTGAACACAATGGTCAGATTTATGGTTCAATTGGTTCCTACTTCAATGGTACTAACTACGCTCAATATGTTGGATACCTCACGGTTAACGAAGATCCAAATACCCCAGATGACATAACGGGTGAGCGCGAAATATACCTAGGTGGTGAATATGACCTTATATGGGTTAAGTCAAGGACTGGCTCAGCTAATTCCCACAAGGTATTTGATACTACCCGTGGTTGGGGTAAACAGATGTCAACTGATTTATCAGGACCTGAATCAGCTCAATTAGAGACTAACATGCGTGGGTTCACGAAGGACGGGTTCCTAGTAGGTGATGGTTCCTTGAATGCCAATGCAGTAAATTACGTTGCTTGGGGTTGGAAGAAAGATCCTAACCTTGGCTTCGATATTATAACATACCAAGGTGATTCAACGGGTGCTGCTCATCCAGACAGACTACTAACCCACAATTGTGGTGGTGAGGTTGAATTCGGTCTGGTTAAAGCATATGACGCTAACATAGATTGGTATCCCTATGTTAAGGGTGTAACAACTGACCCTGGTCACTTCCTACAGTTTAACACTAATAACGCACTTAATACATCTGTTCGTCCATTGTGGGCACCATCTAAAATGTCACCAACTGAATTCGCCATAGGTAACAACGATGGTATCAACCAGAACGGTACTAACTATATAGCATACCTATGGCGTTCAGTTCCAGGGTTCAGTAAGATAGGTACATATGTAGGTAACGGTAATGCGGACGGTCCTTTCATCGACTGTGGCTTTAAACCTGCATTTGTTCTTATAAAATGTATAGATAGTGCCCAGAACTGGTATTTGACAGACAGTGCAAGATCACCATACAATAACATAACTAATCGACTAATCCCCGATTCTAGTAATCCTGAGGCTACTGTAGCCACTGATTCCATTACTTACTTATCTAATGGTTTCCAGATATCTGGTATTGGTAATATTAATAACATTGCTAGTCAGAAGTTCCTGTATATGGCATTTGCTGAGAATCCGTTCGAACATACAAGAGCTCGCTAA

Tertiary structure

PDB ID
285556ab0d1ff4a04abc6b8ee6ee9fea71d3fe7c524a612b2d2338aee9fbaede
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6089
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequencing of Vibrio coralliilyticus phages from Hawaiian seawater Richards,G.P. 2017-10-12 — GenBank