Protein
View in Explore- Genbank accession
- XNS44648.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MADLAKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVDGPSALNDTVTVAEGKTITFTNADLSGNMVRHITGKNALNDGWYIGSGGVSNEGFLEIGTIDDGNEEIRFVTRGSADTIRRTLKLIDTGGNTRVPGNIYIDEAMGGGGSAFISKNKAFFGAGGADIYMRNTAGGSTNQLTITDAGELLFQAKPVYWDGRKPTLTELGIGRIENARQMQQDNWPITTGNETRWVKVALLKDPASGQSRLQLMVTNGGNYGSTRGSFDFIDCSARSMPSTLTAANIRSYLQIRRLGDPSMDDTNQMRYSLVRTSEGLELWFTQRSFIGSTKIALLSTAGVTEYYIPSGYTSQTTAPDGLIESKPIRIYDEMNKPSLDDGTDGILSVAKGGTGASTAAAARTNLGLGTAATRDVGTGSGQVMLVGAYGLGGKGTSYNISTARDYLKQLRTDGSQFMRNQVGTDVNYGMGASFYSSVSDVHAIISVDWATGRVKVGATNDTNLNSDTGKISFQELYGTANKPTPDDVGAVSRTGDTMSGDLLITKASPSLHLNAAGSGNSVIWFKYNGNESGVVWATPNTATSGEVRIRARTSTGVNSGEFVFKHDGTMVSPGNITITSGAFNGKSVNTQYGNFNNTSSTTTEQTVTISGSQHTPLLLNRPTNSNLSIGFKLSGMNMKRLGVDVNGDIRYGEAENQTTNAWLLTSDTVNRWSVNFGRDIAVAGLVNSTGGFNGPISAYDLTGVTQDLDALTINYTDPGHLKMYSCRSMGGGDNITNKPSGVGGNFIMYVECIRKVNNTDYTNRQTFIASDNKRTWERWLTVSGSTNTWTPWRVVVVSGNDDDVSFKSVTTTTGNLNSGNDLIVANNARIGGNLGLAGASSVMYSDKGIAIGAGTALLESSDGRAIVGSSGGGRAVELRPGGPTQSNNAVKITATSGSGGDTAIEYGQGVKIRSNAAGALIISAKAGQALYLRPQGDTSSTNETRIDASGNMTINGSVTANGNLSVSGTTTINNTLTVNNVGAIEKRGIRTYTEGSVTVNETDGIKMFGNGTIHGTMRLVERVNNTTFIGLQTSINDTTNGWFEFHHTGKFKSNNIEASGNIVSLTGSIGAVGALTVTAPSSDNGTDHIWFRNSDGSERGVIYMPGNANIGGFRVRGVEWQFDGGASQFIGPGARWRIHPDGNIQADVFSGYLNNYINDRFNACAQWVRTGAQQDFGQIGRPAPGLTVPAGWVLVGLNANGNEANQNMQLIGGRLQVWKNNVQWVDSAT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1288 AA molecular weight: 136301,61220 Da isoelectric point: 6,64984 aromaticity: 0,07298 hydropathy: -0,31887
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS44648.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP738775.1
[NCBI]
CDS location
range 168380 -> 172246
strand +
strand +
CDS
ATGGCTGATTTAGCAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTGGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTAGATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACAATCACTTTTACTAATGCCGACCTAAGTGGTAATATGGTTCGCCATATTACAGGTAAAAATGCCCTTAACGATGGTTGGTATATTGGTTCTGGTGGTGTGAGTAATGAAGGTTTCTTAGAAATCGGTACTATTGACGATGGTAATGAAGAGATCCGTTTTGTTACTCGCGGTTCTGCCGATACTATTCGCCGTACTCTGAAACTTATTGATACTGGTGGGAACACTCGCGTACCTGGCAACATCTATATTGATGAAGCTATGGGTGGCGGCGGTTCTGCTTTTATCTCTAAAAACAAAGCATTTTTCGGGGCTGGCGGTGCTGATATCTATATGCGTAACACCGCTGGAGGTTCTACTAATCAGTTAACGATCACTGATGCTGGTGAATTGCTGTTTCAAGCAAAACCTGTATACTGGGACGGTCGTAAACCGACTTTAACCGAATTGGGGATCGGGCGGATTGAAAACGCGCGTCAAATGCAGCAAGACAATTGGCCTATAACTACAGGTAATGAAACCCGATGGGTTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGATCCGGCATCCGGTCAGAGTCGCTTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACACGCGGCTCGTTCGATTTTATCGATTGTTCTGCTCGTAGTATGCCTTCAACATTAACGGCTGCAAATATTCGTTCTTATCTGCAAATTCGTCGATTGGGCGATCCGTCAATGGATGACACTAACCAGATGCGTTATAGTTTGGTTCGCACATCCGAAGGTTTGGAATTGTGGTTTACTCAAAGATCGTTCATCGGTAGTACAAAAATTGCTCTGTTATCTACGGCTGGCGTGACTGAATATTATATTCCTAGTGGATATACATCACAAACAACCGCTCCGGATGGTTTGATCGAGAGTAAGCCTATTCGTATCTATGACGAAATGAACAAACCTAGCCTTGACGATGGTACTGATGGTATTCTGTCTGTCGCTAAAGGTGGTACAGGTGCAAGTACAGCGGCTGCTGCTCGCACAAACTTAGGTTTAGGTACGGCTGCAACTCGCGATGTTGGTACGGGATCTGGACAAGTAATGCTCGTTGGGGCTTACGGTTTAGGTGGTAAAGGTACATCGTACAATATATCAACCGCACGTGATTATTTGAAACAGTTACGTACTGATGGCTCTCAGTTCATGAGAAACCAGGTTGGCACGGACGTTAACTATGGCATGGGTGCAAGTTTTTATAGCTCTGTATCTGATGTACATGCTATTATTTCGGTTGATTGGGCTACTGGACGTGTTAAAGTTGGCGCAACTAACGATACTAACCTTAACTCAGATACTGGGAAAATTTCTTTCCAGGAACTGTATGGTACTGCGAATAAACCAACTCCGGATGATGTAGGTGCGGTTTCTCGTACTGGTGATACAATGTCTGGTGATCTCCTGATCACTAAAGCATCTCCGTCTTTGCATCTTAATGCTGCGGGTAGCGGTAACTCGGTGATCTGGTTTAAGTACAATGGCAATGAATCTGGTGTTGTTTGGGCTACTCCAAACACTGCAACTTCTGGTGAAGTAAGGATCCGTGCTCGTACATCAACAGGGGTAAACAGCGGGGAATTTGTATTTAAGCATGATGGTACGATGGTATCTCCTGGTAACATCACTATTACCAGTGGTGCGTTTAATGGTAAATCCGTCAATACGCAATATGGTAACTTTAATAACACAAGTTCAACAACAACTGAACAAACAGTAACTATTAGCGGTTCGCAGCACACCCCGTTATTACTGAATAGACCAACTAACTCAAACTTATCTATTGGGTTCAAACTTAGCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTGTTGATGTTAACGGTGATATTCGTTACGGGGAAGCAGAAAACCAAACCACAAACGCATGGTTACTAACTTCTGATACGGTAAACCGATGGTCTGTTAACTTTGGTCGAGATATAGCGGTTGCTGGTTTGGTTAACTCAACTGGTGGATTTAATGGCCCGATTTCTGCATATGATTTGACTGGCGTTACTCAGGATCTGGATGCACTAACAATCAACTATACCGATCCGGGACATTTAAAAATGTATTCGTGTCGTAGTATGGGCGGTGGTGATAATATCACAAACAAACCTTCTGGTGTTGGTGGTAACTTCATCATGTATGTCGAGTGTATTCGTAAAGTAAACAATACTGATTATACTAACCGTCAAACATTTATTGCGTCAGATAATAAACGCACATGGGAACGTTGGCTTACTGTTAGCGGTTCTACTAATACATGGACACCGTGGAGAGTGGTTGTTGTATCAGGGAATGATGACGATGTGTCATTTAAATCTGTGACAACTACTACCGGAAACTTGAACAGCGGTAATGATCTGATTGTTGCTAACAACGCTCGTATAGGTGGCAACTTAGGATTAGCTGGTGCGTCTTCTGTCATGTATAGTGATAAGGGTATTGCGATCGGTGCTGGTACTGCTCTGTTAGAATCTTCTGATGGGCGTGCTATTGTCGGTAGTTCTGGCGGTGGTCGTGCTGTTGAATTGCGTCCAGGTGGCCCAACTCAAAGCAATAACGCCGTGAAGATTACAGCAACTTCTGGAAGTGGTGGTGATACCGCGATCGAATACGGTCAAGGGGTAAAAATCCGTTCTAATGCTGCTGGTGCTCTTATTATTTCTGCGAAGGCAGGACAGGCTCTATATCTGAGACCGCAAGGGGATACTTCAAGTACCAACGAAACCCGCATTGATGCTAGTGGCAACATGACTATTAACGGTTCTGTTACTGCTAACGGGAATCTGTCTGTTTCTGGTACTACTACAATAAACAACACGCTAACTGTTAATAACGTAGGGGCAATCGAGAAACGAGGCATTAGGACGTATACAGAAGGCTCTGTTACTGTCAACGAAACTGACGGTATCAAGATGTTTGGTAATGGCACAATTCATGGCACAATGCGATTAGTTGAGAGAGTGAATAATACTACTTTCATCGGTCTGCAAACTTCCATTAATGACACTACAAACGGTTGGTTTGAATTCCACCACACAGGAAAATTCAAATCAAACAATATCGAAGCCTCTGGTAATATTGTTAGTTTGACTGGTTCCATTGGTGCTGTTGGTGCATTGACTGTAACGGCTCCTTCTTCTGATAACGGTACTGACCATATTTGGTTCCGTAACTCTGATGGATCTGAACGTGGTGTTATCTATATGCCAGGCAATGCTAATATTGGCGGTTTCCGCGTTCGTGGTGTGGAATGGCAATTTGATGGCGGTGCTAGTCAGTTTATCGGCCCTGGTGCTCGTTGGCGTATTCACCCTGATGGTAATATTCAGGCTGATGTTTTTAGCGGTTATCTGAATAACTACATCAATGATCGGTTTAACGCGTGTGCTCAGTGGGTTCGTACTGGTGCTCAACAGGACTTTGGTCAGATCGGTCGTCCTGCTCCTGGTTTAACAGTTCCTGCTGGTTGGGTTTTAGTTGGTCTTAACGCCAACGGTAACGAAGCTAACCAGAACATGCAGTTAATCGGTGGTCGTTTGCAGGTATGGAAGAATAACGTTCAATGGGTTGATTCTGCAACTTGA
Tertiary structure
PDB ID
9318f1b04f228022e1ba8a17e7995a451f16e0dcda633a7b16ec7bd69084ffb5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50