Protein

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Genbank accession
QXO12472.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTISKDLLVKGSAVITNNLTVGGTINFANATFTQITVTGTANLADVNSTGTAALNNVQVSGNTTLGDSDADSVTVNGTSTFNAPITAKSNVSIEGNTVVGNASTDTLTVNATSTFAAPATFNNNVTVGDAAADALTVNSTSTFKNNVTVGEDATDTLTINSTTNLKNNVTVGEDTTDNLVVNSTSDFKNNVTLGDASTDVLTVNATSNFNNNVTIGSDSSDTLTIKAATDIQGDLHATGETTLESLVVEGTTNLKGNLSMPTGTTATFQDVVINGTLSGDYTIANGNFTTLTVTGQSNLNSVILSGNVTGTTRSATFQTYNVAGASGVVQFTYNDPARPSDIKSSIEPYKVSSNEFQGQKATVGHVIFGDVTYADYGLTALGKASIDYLDIKGNSTTGTTRAQLTVAGKSVLNDVEFTGSVTGLTVDVTGQDITPNSVIADAMVQGAQVKSTGQLTGESLQINGISTFQGDGSFNETLQVKDLVVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPQSVNATTSIKGATVESTGSLTVNGSITSTNTNVAIGKNTVISGTLNSGSISSTGDVSATGNFLGAGASLTGPNTAFAVTNNAVIGGRLTVDGNTSFGGSTGTTTIHDLVVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPNKVTVSTTLGVTGQSTLGAVSASTLSTSGLATLASATVTGVATAGSLVTSSIGNSTNAVNFTSPVTTSGNLTVGGTLILAGGLDLSDVDIEAKSIHTTEQATFDGDVIVGGQISLSSASVAALTFTATDNVNTNTLPVLQSVTATINTADITTLNATGTSTLATASIGTLTGTGTATFAAATVTGAATFNGNITSTNATVAIAKNTAITGNLSVSGTLTPGAVDLSTADVTVKSLTSSGNAHVVGDLTVDGAFDLSATNLVAATLESTGKTTVGADLILTTGVITGAPKISGNTTIAGTLGVTGNTSVSTLSTSGVATLNSAAVTTTLGVSGATTLSTLTTNGLATLNSATVSGALIANGNITLGNASSDTLTVNATSTFAGDVTVNGSFTPAGGLNLGSAALNVASVTTTGAISVGTTLGVTGITTLAAVNSGNHAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGNTAMTGTLTVNGSGTSKIQALQVGTGTADTDKVLNVFGDTIITGDLDVTGIINAQIDLTSRDISPRNVTASGNISSAGSLTAATSLTAATAIIGAPSSTNNNLQVNGNVVTNGDFTVTGVINGTLNQTNSDVTFKSVTTSAGVTVGTTLGVTGLSTLAGLNAGNTAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGATTLAATSATTLSTSGLATLNSATITGALTANGNTVIGDAAADTLTVNATSNFIGNTTVKNITITGTLTADLSNLTTTSFKTGTYFVAQHAAETVSTATWTPDGTSNVYNVNVTANTSIQPITGVNGAGSWFIYVTQDATGGHTVTWDTAYAIIGGEVNTDPNAVSICQVVYCGIGSKYDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1490 AA
molecular weight: 147076,63440 Da
isoelectric point:4,12136
aromaticity:0,03557
hydropathy:0,19544

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
179–486
DC_0092 DC_0092 DC_0931
IPR058970
RBD
1403–1479
IPR058970
QXO12472.1
1 1490
Architecture
STR
STR
RBD
STR 179-486 | STR 778-986 | RBD 1131-1490
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Erwinia phage pEa_SNUABM_49
[NCBI] 		2859284 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Erwinia amylovora
[NCBI] 		552 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXO12472.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW879344.1 [NCBI]
CDS location
range 134927 -> 139399
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAAACGGATCTTGACGTATCTGGTAATCAAACGATTTCTAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAGTGCAGTCATTACAAATAATCTTACTGTAGGTGGTACGATTAATTTTGCTAATGCTACATTTACACAGATTACAGTCACAGGTACTGCTAATCTAGCTGATGTTAACTCTACTGGTACTGCTGCATTGAACAATGTTCAAGTTTCTGGTAACACAACTCTTGGTGATTCCGACGCCGATTCTGTTACTGTAAATGGAACATCAACATTTAATGCTCCAATTACTGCAAAAAGTAATGTATCAATTGAAGGAAACACAGTAGTAGGTAATGCTAGTACTGACACATTAACTGTCAATGCAACTTCAACATTTGCTGCACCAGCTACATTCAATAATAATGTAACTGTGGGTGACGCTGCTGCTGATGCATTAACCGTTAACTCTACTTCTACATTTAAAAATAATGTAACAGTTGGTGAAGATGCTACTGATACACTAACAATTAATTCAACAACTAACTTAAAAAATAACGTTACCGTTGGTGAAGATACTACTGATAATCTAGTTGTTAATTCAACTTCAGATTTCAAAAATAACGTTACTTTAGGTGACGCGAGTACTGATGTTCTAACTGTAAATGCTACATCCAATTTTAATAACAACGTAACAATTGGTTCAGATTCATCAGATACTTTAACAATTAAAGCTGCAACTGACATTCAAGGCGACCTACACGCTACTGGTGAAACCACATTAGAAAGTCTAGTTGTAGAAGGAACTACCAACTTAAAAGGCAATCTTTCAATGCCTACTGGTACAACTGCAACTTTCCAAGATGTAGTTATTAATGGTACTTTAAGTGGTGATTATACTATTGCAAATGGCAATTTTACAACCTTAACAGTAACTGGTCAAAGTAATCTAAACAGTGTTATTCTCAGTGGTAACGTAACTGGTACAACTCGTTCTGCTACTTTCCAAACTTATAATGTTGCTGGTGCTTCTGGTGTTGTTCAATTTACATACAATGACCCAGCACGTCCATCAGATATTAAATCAAGTATTGAACCTTATAAAGTAAGTTCTAACGAATTCCAAGGTCAAAAAGCTACTGTAGGTCACGTAATTTTTGGTGATGTTACATATGCTGACTATGGTCTAACTGCACTTGGTAAAGCAAGTATTGATTATCTTGATATTAAAGGTAACAGCACTACTGGTACAACTCGTGCACAACTTACTGTTGCAGGAAAATCAGTACTTAATGATGTTGAGTTTACTGGTTCCGTGACTGGTTTAACAGTTGATGTAACTGGTCAAGATATTACACCAAACTCTGTAATTGCCGATGCAATGGTGCAAGGTGCACAAGTAAAATCAACTGGTCAACTTACTGGTGAAAGTTTACAAATTAATGGAATTTCAACATTCCAAGGTGATGGTAGTTTCAACGAAACTTTACAAGTAAAAGATTTAGTAGTAACTGGTACAACAACTGGTGTAACGGCTGAAGCAAATGTTGATGGTTTAGATATTGCACCACAATCTGTAAATGCAACAACATCAATTAAGGGTGCTACCGTAGAAAGTACTGGTTCTCTAACTGTAAACGGATCTATCACTTCTACTAACACAAATGTTGCAATTGGTAAAAATACCGTAATTAGTGGAACACTAAACTCCGGTTCTATATCTTCTACTGGTGATGTTAGTGCGACAGGTAATTTCTTAGGTGCTGGAGCATCATTAACTGGTCCAAATACTGCATTCGCAGTAACAAATAACGCAGTTATTGGTGGAAGATTAACAGTTGATGGTAATACTTCATTCGGTGGAAGCACAGGAACAACAACTATTCACGATCTTGTAGTAACTGGTACAACAACTGGTGTAACGGCTGAAGCAAATGTTGATGGTTTAGATATTGCTCCTAATAAAGTTACAGTTTCAACCACTTTAGGCGTAACTGGTCAAAGTACATTAGGTGCTGTTTCAGCTTCTACATTAAGTACTTCTGGATTAGCAACATTAGCATCTGCAACAGTAACTGGTGTAGCTACTGCGGGTTCTTTAGTAACTTCAAGTATCGGAAATAGTACTAATGCAGTAAACTTTACTTCTCCAGTGACTACTTCTGGTAATTTAACAGTTGGTGGAACATTAATTCTTGCTGGTGGTTTAGATCTATCAGATGTAGATATTGAAGCTAAATCTATTCATACTACAGAACAAGCAACTTTTGATGGTGACGTAATTGTTGGTGGACAAATTAGTTTAAGTTCAGCCAGTGTTGCGGCTCTTACATTCACAGCTACTGATAATGTTAATACAAACACATTACCAGTATTGCAAAGTGTTACTGCAACAATCAATACTGCTGATATAACTACATTAAATGCTACTGGTACAAGTACTCTTGCAACCGCTAGTATCGGTACACTAACTGGAACAGGTACAGCGACTTTCGCTGCTGCAACAGTAACTGGTGCTGCAACATTTAACGGAAATATTACTTCAACGAATGCAACTGTAGCAATCGCTAAGAATACTGCAATTACTGGTAACTTATCAGTATCTGGTACTCTAACCCCTGGTGCTGTGGATTTAAGTACTGCTGATGTAACTGTTAAATCATTAACATCTTCTGGTAATGCTCATGTTGTTGGTGACCTAACTGTTGATGGTGCATTTGATTTAAGTGCAACAAATCTAGTAGCTGCAACATTAGAAAGTACTGGTAAAACTACCGTTGGTGCAGATTTAATTCTAACTACTGGTGTTATCACAGGTGCTCCAAAAATCTCTGGAAATACAACAATTGCCGGAACATTAGGTGTAACTGGAAATACTTCTGTAAGTACTCTAAGTACTTCTGGTGTAGCTACTTTAAATAGTGCTGCGGTAACTACCACTCTAGGTGTATCTGGTGCAACAACTCTAAGTACTTTAACTACTAATGGGTTAGCTACTTTAAATAGTGCTACTGTATCTGGTGCATTAATTGCAAATGGTAATATTACTCTAGGTAATGCAAGCTCTGATACTTTAACTGTTAATGCTACAAGTACTTTTGCTGGAGATGTAACTGTTAATGGTTCATTCACCCCTGCTGGTGGATTAAACTTAGGTTCTGCGGCTTTGAATGTTGCTTCAGTAACCACAACTGGTGCAATTTCTGTAGGAACTACTTTAGGTGTAACTGGTATTACAACACTTGCTGCTGTAAATTCTGGTAACCATGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCCTCTATTACAACTACTTTAGGTGTAACTGGTAATACTGCAATGACTGGTACTCTAACTGTTAATGGATCTGGTACTTCTAAGATTCAAGCATTACAAGTTGGTACTGGTACTGCTGATACTGATAAAGTTCTAAATGTATTTGGTGATACAATCATCACTGGTGATTTAGATGTAACTGGTATTATAAACGCACAGATTGACTTAACATCACGTGATATTTCACCACGTAACGTAACTGCTTCAGGAAATATTAGTTCTGCTGGTTCATTGACCGCTGCAACTTCTCTAACTGCTGCAACAGCAATCATTGGTGCACCATCAAGTACAAATAACAACCTACAAGTTAACGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTTACAGTAACTGGTGTAATTAATGGTACATTGAATCAAACTAACTCTGATGTAACTTTCAAATCTGTAACTACATCTGCTGGTGTAACAGTAGGGACTACATTAGGTGTAACTGGTTTAAGTACATTAGCTGGATTGAATGCTGGGAATACTGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCAGGATTAGCAACACTAAACAGTGCTTCAATCACCACTACATTAGGTGTAACTGGTGCAACAACATTAGCTGCAACATCTGCAACCACTTTGAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCTACAATTACTGGTGCATTAACCGCTAATGGTAACACTGTTATTGGTGATGCAGCGGCAGATACATTAACTGTTAATGCTACAAGTAACTTTATTGGTAATACAACTGTTAAGAATATTACAATCACTGGTACTTTAACTGCTGATTTATCTAACTTAACAACAACATCATTCAAAACTGGAACATACTTTGTTGCTCAACATGCTGCTGAAACAGTAAGTACTGCAACTTGGACTCCAGATGGTACTTCAAACGTTTATAACGTAAACGTAACTGCAAATACCTCAATTCAACCAATTACTGGTGTGAATGGTGCAGGTTCATGGTTCATCTATGTAACACAAGATGCTACTGGTGGACATACTGTAACATGGGATACTGCTTATGCAATCATTGGTGGTGAAGTTAATACTGATCCAAACGCTGTAAGCATCTGTCAAGTAGTGTACTGTGGTATTGGTTCTAAATATGATGTGTTCATTGCACAACGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8f7d4f0a6784c664131d8ab6b06a362d8950ab8b518e49a8011a00d94968db9c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6104
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Erwinia phage pEa_SNUABM_49 Kim,S.G., Lee,S.B. and Park,S.C. 2021-01-07 — GenBank