Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBZ70778.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MKDDYEINWDSEDMFAGDYDFDMDFDMDPNAKKGFLGGFASGFLTGVTDGMVGTTDAKIRTLRTVLPSTWSTALDKAEFIHGRYQELKTEFQQENAQTFKSLQNIAGHLSEKMSDKMPNFVSEGINKFSEKDFSDWEKPSEYSSDLARMDDASDDEAEYAQDRALASQSSMFSSLSDSLNSMTAAATASLQSTIMGGNRQLVNIEGGVRDLLNYQRNVQARMDQAMLNLTARQYVQSSKFYKFMEAGVHEEIRQLKKILESSEKSDFEKTSTFAATKQAARDAALGAVGRRMGGLGEFMSTRFGKGARKDMYGTMGGIVDAAAMGLDMGVGEMSKGTIGDLLGQMVAGQAIEQLPYFFTHGPGKKMIDKLMKNNPAQAKWIRGQVKQLKDMGNVVSYLSTSGPGMVNRLAENYQAMDEMKFYDYDEYLQSLSPGEKPIPKNIWKVTNAASNVMKSKINSFMQDVGKSRGTQYTISKRDPREMAQPGHWKEMNNITLNEVIPGLISQTNQILEQIRTGRDDVEKVSYNYMRGQFMKESDRKVTTKADLMQHSDFKNIASAALEMADSLDTRKLLSPAAKKALALQIAKDVDAEKAFNPFYYLGDLPGVPPSQLKEIHAVMKLHFGIEDQDIVDFENGDAFTQLKMASKMPTRKGRERLATASVAAENLKSNYPNVTQRINLLRQTGNEQMLRDLGVIYTEGGVDKINAQMFHDRIGQYMDDPNNPELRGVVNGDSRGIDAPTRGLGLGGTSGAPAPIVQVSGQEELNDTLKQLNERLAGMISKNDEQSKRGELVNFDSMTGEITSIKDINQGILGKTTEMAETMSKFYEMAAAGKLLIGKLTVKEEREEEDAKLSIWKAVKSKFPKGFATKGMEFLANNSPLVLGGMLGGLSSAFISNPLLAAGVASAGLLAGGIVQYWGRQDAKAATGNAPSDDEDILNERGEPILAAQALKAEQYLDAVTRRVIKTWNDIKGPVYDTLNKVVIGVTTLSGKIFGPDGRAVVLNGLKRVKDAAVSAYGLLDPINRIKSAMQMGKDLIYQQDVYVRGDKEPRLLSIKFKSGEYFIRTDNNEFKSISGWNEINGPVYDEQGNQLVTQEEYEAGLITATGAAVRNVGAGAANMVGMATGLAKSGMDTLLGKLGYNKAPTAPGAAGGASGAMGSASGVERRLDRIYKLLEKQFGISIDDDALDSAMAAAGMGGAGSGGGSTGGNSNSSTSPFRLNSLSFKARQKEEEEKHKVNEAIISIAENTKGLGAGDGKDEKEGGIFSKLKGFIGGIATFGMNLIKNPIGTIGGLIFGSLVKSTERLGKIGKLLFNGVLGAASPIYKLMKWGFSSLAKAFMGGKMVRGAMDALDGPDVDVEQHGQSGKKKKGKAGKKGKGAKAGGRTRTPKTRGKFKIGNPMSMVVGTGLSWALGEAMGDDEIPASPTENADIGIGDRDPVTGHYRTAGDAGIEALTSWLPQGQLAKAAVDSAISSDTRQTLDNYGLFWSSDGKFFFNRNTMEKHEDEVRGIAKDETGYGLIKDPGKPSRQRSIRLAMYGIKDSSSPLGRRVLLLEKLLYPWVAIRGDRASLKPDTPIEKILTQFVEATSAPYKDNNAISSWYTARFKPIFLMYNAAISVARMGDLDEFDAKQSFEVVQVVSRVSEAIATMDPFPYNIDIRIDNTEGIMNEELTRHTVTAMFERLSKDFPPPDENAVEKIATDADTAKKLETQGTPTSAVPTHEQASQDIMGKKAALASQQAIDAKFQQPAKVSEIDISDMMPGGDQPMDAFVMTRLAAYGNIDNMPWRVAAVLRLERYMENFIMVMGDDARFTGKSGQVLELFKASFRLDTDIAINNWMTWFRDRFLPVLMTYVKGVKKYKGTMPSVGWKSLSATNRAQIAHQLTEQLVVVNDQQVSVWEIEASPFPSSKSGKWADRAKKYLEILDAKAAQARLRDPELEDMSSRTMEEKDPQKFAKDEAETKEKAKQTTLEIQQRASGSSPNTFGGAMPGFGGAGGQTAMSQGGYYPNATMSAPGGPAGSAGEFMGKANENFNPEFIKQAGEDKGVKMSLEQGEKLMLNHLVKAGFKDNKVLALALAMARKETGNYQNTVENTNWSAPTLLKYFKNVPDAATAQKVAAMSPAERAMWVYGRAPKGPQLGNSKPEDGWNYRGRGFFQLTGKSNYEKFKKDTGIDVVSNPKLVSEDPNVMAESAVWYLKNNPAMKSIAKSGDFDTAVRGINGGNAVPATDERRKYYNDYLNKLRSGDIDLGDTSGAADAADPDAADPMAGGGKAPTAADQNAPPEQVAGQTAVKEAGAKAETVSDILAKEQKPPSNVGSTASAGSASPLDPSTKGTAAADAIESSAASESGSSSATDSSSAPSTASAASAPAVKAPEVAPAAPQGPIKAEVALPDNLQTTDTTVAGILSQTNQLLTQLVQGQKKGDGGNVVDMR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2433 AA molecular weight: 262918,14490 Da isoelectric point: 6,04047 aromaticity: 0,07069 hydropathy: -0,45475
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–2208
STR
1–2208
Coil
Unmapped
762–789
Unmapped
762–789
IPR023346
STR
2070–2242
STR
2070–2242
IPR000726
ENZ
2145–2199
ENZ
2145–2199
PTHR22595
Unmapped
2146–2244
Unmapped
2146–2244
1
2433
Architecture
STR 1-2242 | RBD 2243-2432 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Edwardsiella phage pEt-SU [NCBI] |
2562142 | Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Petsuvirus pEtSU > |
| Host |
Edwardsiella tarda [NCBI] |
636 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBZ70778.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK689364.1
[NCBI]
CDS location
range 202268 -> 209569
strand -
strand -
CDS
ATGAAAGATGATTACGAGATCAATTGGGATTCGGAGGATATGTTCGCCGGAGACTATGATTTCGACATGGACTTCGATATGGACCCAAATGCCAAGAAAGGTTTTCTTGGTGGGTTTGCATCGGGGTTCTTAACCGGCGTAACTGATGGCATGGTAGGAACAACGGATGCCAAGATCAGAACATTACGTACTGTGTTACCGAGTACGTGGTCTACTGCGCTTGACAAAGCCGAGTTTATCCATGGCCGTTATCAGGAACTCAAAACAGAGTTCCAGCAAGAAAATGCCCAGACCTTTAAATCATTACAAAACATTGCTGGCCACCTATCAGAGAAAATGTCTGATAAGATGCCTAATTTTGTTAGTGAGGGCATTAATAAATTTAGTGAGAAGGACTTCTCTGATTGGGAAAAGCCAAGTGAGTACTCTAGCGACCTAGCGCGTATGGATGATGCTTCGGATGACGAAGCCGAATATGCTCAAGATCGCGCTCTAGCTTCGCAGAGCAGTATGTTCTCCTCACTGAGTGATTCCCTTAACTCAATGACCGCAGCGGCTACAGCGAGCTTACAGTCCACCATTATGGGTGGTAACCGTCAGCTTGTTAATATCGAGGGCGGTGTCCGGGATTTACTCAACTATCAACGCAATGTTCAAGCTCGCATGGATCAAGCGATGCTGAACTTAACTGCTCGTCAATACGTCCAGTCATCCAAGTTCTACAAATTCATGGAAGCAGGTGTCCATGAAGAGATCCGTCAGTTGAAGAAGATCTTAGAGTCCTCAGAGAAATCTGATTTCGAAAAGACTTCTACCTTTGCTGCTACTAAGCAAGCTGCGCGTGATGCGGCATTAGGTGCTGTTGGACGTCGCATGGGCGGTCTGGGTGAATTTATGAGTACCCGTTTTGGTAAGGGTGCTCGTAAAGATATGTATGGGACTATGGGTGGGATAGTCGATGCCGCAGCTATGGGTCTCGACATGGGTGTTGGCGAAATGTCAAAGGGAACCATTGGTGACTTACTTGGTCAGATGGTTGCCGGGCAGGCTATTGAACAACTCCCTTATTTCTTTACCCATGGTCCTGGGAAGAAGATGATCGATAAGTTGATGAAAAATAACCCAGCACAAGCGAAATGGATTCGCGGCCAGGTTAAACAACTTAAAGATATGGGTAACGTCGTTTCATACCTTTCCACCTCAGGTCCGGGGATGGTAAACCGATTGGCTGAGAACTATCAAGCCATGGATGAAATGAAATTCTACGATTATGATGAATATCTCCAGTCGTTGTCCCCAGGTGAAAAACCGATTCCCAAAAATATCTGGAAAGTAACTAACGCAGCATCAAACGTCATGAAGTCTAAGATCAACAGCTTCATGCAGGATGTGGGTAAATCCCGTGGTACCCAGTACACCATTTCCAAACGTGATCCTCGTGAGATGGCTCAGCCTGGTCACTGGAAGGAAATGAACAACATCACACTTAACGAAGTTATTCCTGGGTTGATTTCACAAACCAACCAGATTCTGGAACAGATTCGTACTGGCCGTGATGATGTTGAGAAAGTTAGTTATAACTATATGCGCGGTCAGTTCATGAAAGAATCTGATCGTAAAGTCACAACCAAAGCTGACTTAATGCAGCATTCTGATTTTAAGAATATTGCGTCAGCGGCATTGGAGATGGCTGACAGTCTTGATACACGCAAATTACTTTCTCCTGCGGCTAAGAAAGCATTAGCCTTGCAGATTGCTAAAGACGTGGATGCTGAGAAAGCATTTAACCCGTTCTATTACTTAGGTGATCTTCCGGGTGTACCTCCGTCACAGCTGAAAGAAATTCACGCAGTAATGAAACTGCACTTTGGTATCGAAGATCAAGATATTGTTGACTTTGAAAACGGCGATGCCTTTACCCAATTGAAGATGGCGTCGAAAATGCCTACCCGTAAAGGGCGTGAGCGTTTGGCTACAGCTTCGGTCGCTGCAGAGAACTTAAAGTCCAACTATCCTAACGTTACTCAGCGCATTAACTTGCTTCGTCAAACAGGCAACGAACAGATGCTCCGTGACCTGGGTGTTATCTATACCGAAGGTGGTGTTGATAAGATTAATGCCCAGATGTTCCATGATCGTATTGGTCAGTATATGGACGACCCAAACAACCCTGAATTAAGAGGAGTTGTTAATGGGGATTCTCGTGGTATTGATGCGCCTACTCGTGGTCTGGGTCTGGGAGGAACTTCTGGTGCTCCAGCGCCTATTGTTCAAGTTAGCGGTCAGGAAGAATTAAACGACACTCTTAAACAGCTGAATGAACGTTTAGCTGGAATGATCAGTAAGAATGACGAGCAATCCAAAAGAGGTGAACTCGTTAACTTTGATTCCATGACTGGCGAGATTACTTCTATTAAGGATATCAACCAGGGGATTCTCGGTAAGACAACAGAGATGGCTGAAACCATGTCTAAGTTCTACGAGATGGCTGCTGCTGGTAAACTTCTTATTGGTAAGTTGACTGTTAAAGAAGAACGTGAAGAAGAAGATGCTAAGCTTTCTATTTGGAAAGCCGTGAAGTCTAAATTCCCTAAAGGGTTCGCCACTAAGGGAATGGAGTTCCTCGCTAACAACTCACCATTAGTTTTAGGCGGTATGTTGGGCGGTCTTTCTTCTGCATTCATTTCCAATCCACTATTGGCCGCAGGTGTTGCAAGTGCTGGTTTACTTGCCGGTGGTATTGTTCAATACTGGGGTCGTCAAGACGCCAAAGCAGCAACAGGTAACGCTCCATCTGACGATGAGGATATCCTTAACGAAAGAGGGGAACCTATTTTAGCAGCGCAAGCGCTAAAAGCAGAACAATACCTGGATGCCGTGACCCGTCGAGTAATTAAAACCTGGAACGATATCAAAGGGCCTGTCTATGACACCTTGAATAAGGTTGTTATTGGGGTCACTACCTTGAGTGGTAAAATCTTTGGGCCAGATGGTCGTGCCGTTGTACTGAACGGATTGAAACGTGTTAAAGATGCTGCAGTATCTGCTTATGGATTGTTAGATCCTATTAACCGTATCAAGTCAGCGATGCAAATGGGTAAAGACCTTATCTACCAACAAGACGTTTATGTCCGTGGGGATAAGGAACCGAGATTACTCTCAATTAAATTCAAATCTGGCGAGTACTTCATTCGTACGGATAATAATGAATTTAAATCCATCTCTGGTTGGAATGAAATCAATGGTCCAGTCTATGATGAACAAGGTAATCAACTGGTTACTCAGGAAGAGTATGAAGCAGGACTTATCACTGCCACAGGTGCTGCTGTACGCAATGTGGGCGCTGGTGCTGCTAATATGGTTGGTATGGCGACAGGACTTGCTAAATCAGGAATGGACACCCTACTGGGTAAGCTTGGTTATAACAAAGCTCCAACCGCTCCTGGAGCCGCTGGCGGCGCAAGTGGAGCAATGGGTTCAGCTTCAGGGGTAGAACGTCGCTTAGACCGTATCTACAAACTCCTGGAGAAACAGTTCGGTATCTCTATCGATGATGACGCCCTCGATTCAGCTATGGCTGCCGCAGGCATGGGCGGTGCTGGATCTGGCGGTGGTTCAACCGGTGGAAACTCTAACAGTTCGACTTCCCCATTCCGTCTCAACTCACTTTCCTTTAAAGCGCGTCAAAAGGAAGAAGAAGAGAAGCACAAAGTAAATGAAGCGATTATTTCGATTGCTGAAAATACCAAAGGTCTGGGTGCGGGTGACGGTAAGGATGAAAAAGAAGGCGGGATCTTCAGTAAGCTGAAAGGTTTCATTGGGGGTATCGCTACCTTTGGGATGAACCTGATTAAAAACCCAATTGGAACTATTGGTGGGTTGATCTTTGGTTCTCTTGTGAAGTCCACTGAGCGTTTAGGTAAGATCGGTAAACTGCTGTTCAACGGTGTGCTCGGCGCAGCGTCACCTATCTATAAACTGATGAAGTGGGGATTCAGTTCTCTGGCTAAAGCGTTTATGGGCGGGAAAATGGTCAGGGGAGCGATGGATGCTCTTGATGGTCCAGATGTGGATGTTGAACAACACGGTCAGTCAGGTAAGAAGAAGAAAGGTAAAGCTGGGAAGAAAGGTAAAGGAGCTAAAGCCGGAGGTCGTACCCGTACACCTAAGACCCGTGGTAAGTTTAAGATCGGTAACCCAATGAGTATGGTTGTGGGAACTGGCTTGAGCTGGGCATTAGGCGAGGCCATGGGCGATGATGAAATTCCTGCTTCTCCAACCGAAAATGCAGATATCGGTATTGGTGATCGTGACCCAGTTACTGGTCACTATCGTACTGCCGGTGACGCGGGAATAGAAGCCTTGACTTCCTGGCTTCCTCAAGGTCAGTTAGCTAAAGCAGCGGTTGATTCAGCTATTAGTTCTGACACTCGACAAACTCTGGATAACTACGGTCTATTCTGGTCCTCAGATGGTAAGTTCTTCTTCAACCGTAACACTATGGAAAAACACGAAGATGAGGTTCGTGGGATTGCCAAGGACGAAACAGGTTACGGCCTGATTAAAGATCCGGGTAAACCATCTCGTCAACGTTCTATCCGTTTAGCGATGTACGGTATTAAGGACAGTAGTTCACCATTAGGTCGCCGAGTGCTGTTACTTGAGAAACTTCTCTATCCTTGGGTCGCTATTCGTGGTGACCGTGCTAGTCTGAAACCAGACACACCGATCGAGAAGATTCTGACTCAGTTTGTTGAAGCAACCTCAGCACCGTACAAAGATAACAACGCCATATCAAGTTGGTATACTGCTCGCTTTAAACCAATCTTCCTGATGTACAACGCAGCTATCTCTGTAGCGCGCATGGGTGACTTGGATGAGTTTGATGCCAAGCAGTCGTTTGAAGTAGTTCAAGTTGTTTCCCGTGTCAGTGAAGCCATTGCTACTATGGATCCGTTCCCTTACAACATCGATATACGTATCGATAATACCGAAGGGAT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
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Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50