Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOV58096.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTLRNVPKAHTLEQQRQEINLIASDLDNAVEGTKTFGGSKTFSSDVTFQSTVDFDGIATFNSSPTFSDNVAANFGDDADLKIYYDGSVGVLTSFIDSDALQIRSKTDTSELYLTALKDGPVELYYDGAKKIGTNLTGATVLGDLEVNDELHSASGSFIIKTADQITPGQMVTEAVFGGSMYVPYGFSTYPIAEFPGGGINETSTNAGFSVSNGGQIYIANISAQALWKGRQVGTAGITSEIDAAGNVTFAGTLDIGSTATFGGTVDFNDAVDVNAHVEFKAASGNSSLYMYDENAINLGSNNDARLIYNNTGNIVKFERLTAGEIEIDAAPVTLQHSNSTKLQTTSTGVTVTGTLDATAFTVGGSPFTAGSAATTSSTGVVQPDGTTIAVDSNGVISVAGGGDPFTANGFKFGVNEGSGPTATQGEIRQISGKPHFYDGSNWQEFILGSTQTATIPAETDWDKVLLRSTFDSDFNDVKFGDTGTAQIYGGIAASTLVGTPANYGAKVLKTVGNGVRYDDRSDYDFTNTFTLEFWINIDSAPNASLTGVNDKYVIVSKSAGTLAGSNNKTAGATGGGWQLYYAYVGVNIGWRLDIHDTATNTTSTIGFQTDSSTVFASKFVQSWNHIALVKESDGQLHFYVNGLEDITWTKGTSYSGTNMSNTSEPILFGGSQVSTNTAGIVDAYIDDIRFTKDARYTSSQSSNTQSFTPPAAAHPVSGTTTTYTPPATSKAGEITLGATPTWTGTAGATVSRQSAGNYELNFTSPFTNATDYYVIANVMDINGTTNLEITRSADKIGFSVLAGGSGTDSGSIAIQVIAHS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 820 AA molecular weight: 85938,92250 Da isoelectric point: 4,43295 aromaticity: 0,09634 hydropathy: -0,17963
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM1 [NCBI] |
754037 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV58096.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686195
[NCBI]
CDS location
range 85238 -> 87700
strand +
strand +
CDS
ATGACACTACGTAACGTACCAAAGGCGCATACGCTGGAACAGCAGCGTCAAGAGATTAACTTAATTGCATCTGATCTCGATAATGCGGTCGAGGGCACGAAAACATTTGGTGGGAGTAAGACATTCTCTAGTGATGTAACATTCCAAAGCACTGTAGACTTTGACGGCATTGCAACATTCAATAGCAGTCCTACCTTTTCTGATAATGTAGCAGCAAACTTTGGTGATGATGCTGATCTAAAAATTTATTATGATGGTTCGGTAGGTGTCCTAACATCGTTCATTGATTCTGATGCTTTGCAGATCAGATCAAAGACTGATACTAGTGAACTGTATCTCACAGCTCTCAAAGATGGTCCTGTCGAACTTTACTATGACGGTGCTAAAAAAATTGGAACTAATCTTACAGGTGCGACAGTTTTAGGAGATCTCGAAGTTAATGACGAGTTACATTCTGCATCAGGTAGTTTTATTATTAAAACGGCAGATCAGATAACTCCTGGTCAGATGGTTACTGAAGCTGTCTTTGGTGGATCAATGTATGTACCATACGGTTTTAGTACATATCCTATTGCTGAATTTCCTGGTGGTGGTATCAACGAGACATCTACTAATGCTGGATTTAGTGTAAGCAACGGTGGACAGATTTATATTGCTAACATTAGCGCACAGGCTCTTTGGAAGGGTAGACAAGTAGGAACTGCTGGAATCACATCAGAAATCGATGCTGCTGGTAATGTCACGTTTGCTGGCACCCTGGACATTGGTAGCACTGCTACTTTTGGTGGTACTGTTGATTTCAATGATGCTGTTGATGTAAATGCACACGTTGAATTCAAAGCAGCTAGTGGAAATAGTTCACTATACATGTATGATGAGAATGCAATTAATCTTGGTAGTAACAATGATGCAAGATTAATTTATAACAACACTGGAAATATTGTTAAATTTGAAAGATTAACTGCTGGTGAAATTGAAATTGATGCTGCACCAGTTACACTTCAACACTCTAATAGTACAAAATTACAGACTACCTCCACTGGTGTAACAGTCACAGGAACTCTTGATGCTACGGCATTCACAGTTGGTGGTTCTCCATTCACTGCAGGTAGTGCCGCAACCACATCTTCTACTGGTGTTGTACAACCAGATGGCACAACCATCGCTGTTGATAGCAATGGTGTTATCAGCGTAGCTGGTGGTGGCGACCCATTCACTGCTAATGGATTCAAGTTTGGCGTCAATGAAGGATCTGGTCCAACAGCAACACAAGGTGAGATCAGACAGATTAGTGGTAAACCACATTTCTATGATGGAAGTAACTGGCAAGAGTTTATTCTTGGTAGCACTCAAACAGCTACTATCCCAGCAGAAACTGATTGGGATAAGGTTCTATTAAGATCCACTTTCGATAGTGATTTTAACGACGTAAAGTTTGGTGACACTGGCACTGCTCAAATTTATGGCGGTATAGCTGCCTCAACCCTTGTAGGAACCCCCGCCAATTATGGAGCGAAAGTTCTAAAAACAGTTGGTAATGGTGTTAGGTATGACGACAGAAGTGACTATGATTTCACTAACACATTTACATTAGAGTTTTGGATTAATATAGATTCCGCACCAAACGCTTCTCTGACTGGGGTAAATGATAAGTATGTTATTGTATCAAAATCTGCTGGCACTCTTGCTGGAAGTAATAATAAAACTGCAGGAGCGACAGGTGGTGGATGGCAACTATATTATGCGTATGTTGGTGTTAACATAGGATGGAGACTTGACATACATGATACAGCTACTAATACAACTAGTACCATAGGTTTTCAAACCGATAGTAGCACGGTTTTTGCTAGCAAATTTGTACAAAGTTGGAATCATATTGCTTTAGTAAAAGAATCTGATGGACAACTTCATTTTTATGTAAATGGTCTAGAAGATATCACTTGGACAAAGGGAACCTCCTATAGTGGCACCAATATGTCCAATACTTCCGAACCAATTTTATTTGGAGGAAGTCAAGTATCTACTAACACTGCTGGTATTGTTGATGCATATATTGACGATATTCGTTTTACAAAAGATGCTAGATATACATCATCTCAAAGTAGTAACACGCAATCTTTCACACCACCAGCAGCAGCACATCCTGTCAGTGGCACTACGACAACTTATACACCACCTGCAACTAGCAAGGCTGGTGAGATTACGCTAGGTGCAACTCCTACGTGGACTGGAACAGCAGGAGCAACAGTGTCACGGCAATCTGCTGGCAACTATGAGCTGAACTTTACAAGTCCATTTACTAATGCCACTGACTACTATGTTATTGCTAATGTCATGGATATTAATGGAACAACGAATTTAGAAATAACGAGATCTGCTGACAAGATAGGTTTTAGTGTCCTAGCGGGGGGAAGTGGCACTGATAGTGGATCGATCGCTATCCAAGTTATTGCACACTCATAA
Tertiary structure
PDB ID
db74b2cdbde4aa085acb1bc4d738214541f8804f61b4ddf065dba40d46823c3a
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50