Protein
View in Explore- Genbank accession
- QMP18675.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVIYDNRIWVSQREIAEPAGSFVQQYWTATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKVQSSNVPGQGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRIEPSSGKYRTQASDFIMRHYTTAEKITFVLPKYANQGDIVKSVDIDGLGPLYHLDVETFDESSSLGKQGQHSMEFRTTGDGFFVYNATEKLWVTWDGDNKTRLRVIRDSVKLLSNESIIVFGNDNNTSQTINIDLPTGVRPGDVVKIALNYLRKAQTVNIKASATDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLVDSLTFNGNISYTPVIELSYLEDTVKNINYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALANQAQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIANTAQVNQDTTFAFQDDIIVSPKKLNERTATETRRGLAEIATQQETDAGIDDTTIITPRKLQARQGSESLSGIVKYVPTTGTTPAASRITVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQSEVNAGATNTGFSNSVVTPETLGARRATDSNHGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQSEFDTGTDDTRIATPLKIKTRLNNTARTSVIAASGLVETGTLWDHYTLNILEANETQRGTARLATQLEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATEGTEGIVRIATRAETIAGTSSVLAVSPVSLKWIAQSEPTWAATTTTRGFAKMSEGAITFVGNATAGSTQALDLYEKNSYAISPYELNKTLGNFLPRLAKAADSDKLDNLDSTQFIRRDIDQIVEGTLTLRKNIRVDGQLATGGTGEFGGSLAANSTFTIRNTGTPTRIVFEKGPASGANPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNNLGNITFSINGTVQPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAINGQYGFFIRNDNSNIYFMLTNANDQTGGFNGLRPLAISNTSGQVTIGESLIIAKGATINLGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVDVNDEATYKQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTANASTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPADNASMSNLTIRDWLRIGNVRIVPDPVTKSVKFEWIDTP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1299 AA molecular weight: 141898,08800 Da isoelectric point: 5,55524 aromaticity: 0,08237 hydropathy: -0,41363
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
987–1100
987–1100
1
1299
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage CJ20 [NCBI] |
2744001 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QMP18675.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT533174
[NCBI]
CDS location
range 44886 -> 48785
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCTAAAGCTGATTACTCAGTTTTGTCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACGCGTGGATACAAAAAGAACTTCGCAGTTATCTATGATAACCGTATTTGGGTTTCCCAACGCGAAATCGCAGAACCAGCTGGCTCATTTGTTCAGCAATATTGGACTGCAACCCGTACTGACCCGAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCGACTCGTCAGCTTAATTCCGGGGAATTTATCGCGGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTACCCCCGAACCCGACTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGTAATACCGGTTATAATGAAATCAAAGTTCAATCGAGCAACGTACCTGGTCAAGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACAAAACCGTTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAGTTTTGGGAAGCCGGTAACGAAGAACGCGGAATAAGAATTGAACCAAGCTCTGGTAAATATCGAACTCAAGCATCAGATTTTATTATGCGTCATTATACGACTGCAGAAAAAATTACATTTGTTCTTCCTAAGTATGCTAACCAAGGTGATATTGTCAAATCGGTAGACATAGATGGATTAGGGCCATTATATCACCTGGATGTTGAAACGTTTGACGAGTCAAGCTCTCTGGGTAAACAGGGTCAGCACAGTATGGAATTCCGTACAACTGGTGATGGCTTCTTCGTTTATAATGCCACTGAAAAACTGTGGGTGACTTGGGATGGTGATAACAAAACTCGCCTGCGCGTAATCCGTGACAGTGTGAAATTGCTGTCAAACGAAAGTATTATCGTGTTCGGTAATGATAACAACACCTCGCAGACAATTAACATCGACCTTCCGACGGGTGTTCGTCCAGGGGACGTAGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTTCGCAAGGCACAGACTGTTAATATTAAAGCTTCGGCTACTGATAAAATCGCGTCTTCTGTTCAGCTGCTCCAGTTCCCGAAACGTTCGGAATATCCACCGGATACTGAATGGGTATTGGTTGACTCTTTGACTTTCAATGGTAACATAAGTTATACGCCAGTTATCGAATTAAGTTATCTTGAAGATACGGTTAAGAACATTAACTATTGGGTTGTTGCGCAAAACGTTCCGACTGTAGAACGAGTTGACTCGAAGGATGATTTGACCCGTGCTCGTCTGGGTGTTATTGCATTGGCTAACCAGGCACAGGCCAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAAAAAGAATTAGCAATTACTCCGCAGACTTTGGCTAACCGTGTGGCTACTGAATCACGTCGTGGTATTGCACGAATTGCTAACACTGCTCAGGTGAACCAGGATACGACTTTTGCTTTCCAGGATGATATTATCGTTTCTCCGAAAAAGTTAAACGAACGTACAGCTACAGAAACAAGACGTGGGCTCGCAGAAATCGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGTATAGATGATACTACAATCATCACTCCACGCAAGCTACAAGCTCGTCAGGGCTCCGAAAGCTTATCTGGTATCGTTAAGTATGTTCCTACTACTGGGACTACTCCAGCAGCAAGCCGTATAACTGTTGGGACAAACGTTTATAATAAAAATACAACCACTCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTTTGGACCAATATAAAGCTGACCAGAATAACCAAGGTGCTGTATATCTGGCTACTCAGTCAGAAGTTAACGCCGGGGCAACAAATACAGGATTCAGTAACTCGGTCGTGACTCCGGAAACATTAGGTGCACGCAGAGCAACAGATTCAAACCATGGTTTAATCGAGATTGCAACTCAGGCTGAAACTAATGCCGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTGAATGACCGTAAAGCAACAGAATCATTATCCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGCACTGATGATACTCGTATCGCAACGCCATTAAAAATTAAAACTAGACTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTATTGCAGCAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATACGCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGCACTGCAAGACTGGCTACTCAACTTGAAGTTAATACTGGTACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAGTTGATGTCGAAAAAAGCCACAGAAGGCACCGAAGGTATTGTTCGCATCGCTACTCGCGCAGAAACTATCGCAGGAACAAGTTCAGTTCTGGCTGTTTCTCCGGTTAGTCTGAAATGGATTGCGCAGTCCGAACCAACATGGGCAGCAACCACGACGACCCGCGGCTTTGCTAAGATGTCTGAAGGTGCAATTACTTTTGTCGGTAATGCAACTGCAGGTTCGACCCAGGCTCTTGACCTGTACGAGAAAAATAGCTATGCTATCTCTCCGTATGAGTTAAACAAAACCCTTGGTAACTTCCTGCCGCGTTTAGCTAAAGCCGCAGACTCGGATAAACTGGATAACCTGGATAGCACGCAGTTCATTCGTCGTGATATTGACCAAATCGTTGAAGGTACATTAACCCTTAGAAAGAACATAAGAGTTGATGGTCAGCTGGCGACTGGTGGTACCGGTGAATTTGGTGGCTCGTTGGCTGCTAACTCCACATTTACTATACGTAACACAGGAACTCCGACCCGTATCGTTTTCGAAAAAGGTCCTGCATCCGGTGCAAACCCGGTTCAGTCAATGAGCATCCGTGTGTGGGGTAACCAGTATGGTGGCGGTTCGGATACGACTCGTTCTACCGTGTTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCGCAACGGAATAATCTTGGTAATATTACTTTTAGTATCAACGGCACAGTTCAACCGATTAACGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACTGCACAAGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTTAGAGCTATTAATGGACAGTACGGGTTCTTTATTCGTAATGATAACTCGAACATCTATTTCATGCTTACAAATGCAAATGACCAGACTGGTGGCTTTAACGGATTAAGACCATTAGCTATTAGTAATACATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTTGGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAACCTGCGGACCTTTATTCTAGAAAACCTAATGCAGATAATACCGGTTTCTGGTCCGTTGACGTTAATGACGAAGCCACTTATAAGCAATTCCCTGGTTATTTCAAAATGGTTGAAAAGACTAACGAAGTAACTGGTCTGCCTTATTTGGAGCGTGGTGAAGAAGTTAAATCACCTGGTACATTGACTCAGTTTGGCAACACGCTGAATTCACTCTATCAAGACTGGATTACTTATCCGAATACTGCTAATGCAAGCACCACTCGTTGGACTCGTACATGGCAGCAGAACAAAAACGCATGGTCTGGTTTTGTTCAGGTCTTTGATGGCGGTAACCCACCTCAGCCGTCGGATATTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTTCGATGAGTAACCTGACTATCAGGGATTGGTTAAGAATCGGTAACGTACGTATTGTTCCGGACCCAGTAACTAAATCCGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA
Tertiary structure
PDB ID
46a835e44419549aac27487e617fde965dfc0d49be92d6738188ea0cd5a8e24b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50