Protein

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Genbank accession
AIX46301.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDDIDNRGNSSLRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPSEYIIDNRPGEILYTNIPPLDSNSNMDITSPNNVLYKFNSVEGGVIVPRGCSLVGMDLRRTKIIPKYVPYPTTYPAKGINTEDQVPSKTAVFRVTGGCYFWQFSFFDGDSSGVYFKPDDSELIPPSYSHHKLTAFEFADGTNTLSQLINDLGTVENSSEITGSSIPNLLERTDLDIYYQKVSRGFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEFRVLQITRNGNTATAITVDEQGNPKNHGFSVGVNVNISGVTGSTGPQTDLDAQNYNGSFAVTSASGNVFTYQLAEEPSGNAIGSNIVVKVEIDTVDSASPYIFNLSLRSTWGMCGMHADGAKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVKYNSTTGNYDEGGPGAHLDGFAEYKKGWRSTHVMCSNDSFVQVVSVFAVGYADHFAGYQGADMSITNSNSNFGNTALRSKGFKRASFTKDKAGTITHIIPPKSLSDVDEISANWTNIDIKRTKDINNALAGQGGTLGSRLYIYGYTNVNAPPPNKVQGYVIGARQDGIGAAAVPDKLYCLLIASGATSPTIQAAEINPFGPDVSGTVAGGDGSPLQYDANTYTINGVANEVGGWYLSVNSTNNEIYQTLVNNTATYNNLNFTPTTFIKRVPDARNLTDRTYRVRYVIPKEQNPPLPRSPIAGFVLQPYNTDNTAYQLNKCYYIYDITEVSKFERGVTDGIFYLTLLCGSIAPTTSNFDDMAFSQNVNEVYPAFDRDNPNSDPEPSISVADNETIGLVYGTDGAQPTPARDDQRSITKEAVLFLLNDSGWVAGSSPGWNSINETLSDIPLTSRLGDEEARKIPILQDSADNDALVPINVELRRHSILRSGNHTFEYTGFGPGNYSTAFPQTQVETLTDEQIRLSQSLKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITSEDIAQLNVLGEENTTIETFSEVVVTDKLTVIGGASNNLESIFSGPVTIQGTLTAQKEFIAKKLTYNNQDGTVLKSTLLAPELKTGTPPVGQGVPDLSNILNYNAPSDGDILYNIDWSPGSNLGWMYYEGAWVKFGLTNTGVFQFGAYGGASAQNIGLGRAASTTYRLEVDGSQRITGDLRVDGRGGVAPDKYLTRRTQGDGSTLNYQITSYSGVVHTSKSLIVTINGVLQHPDVNYTVDSNGTNVVFASGDAPTTSDYVEIRELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1264 AA
molecular weight: 137060,23170 Da
isoelectric point:4,73312
aromaticity:0,09494
hydropathy:-0,31835

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014d
[NCBI] 		1493509 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX46301.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019162 [NCBI]
CDS location
range 22622 -> 26416
strand +
CDS
ATGGCACTTACTCGTCTTAAGAATATTATCACGTCCCGTACGGGTCGTATCATTTATGTCAACCCCGATGACTTTGATGCGAGTGATGATATTGATAACAGAGGAAACTCTTCCCTCCGACCATTCAAATCCCTGCAACGTGCGTTTCTTGAAGTAGCAAGATTTTCGTATAGAGTGGGTTTGTCTAATGACGAGTTTGATGCCTTCAGTATCATGCTCTATCCTTCTGAGTATATTATTGATAATCGTCCTGGTGAGATTCTATACACTAATATCCCACCATTGGATAGTAATTCCAATATGGATATTACTTCTCCCAATAATGTATTATATAAATTTAACTCCGTTGAAGGTGGTGTAATCGTACCTAGAGGTTGTTCTTTGGTCGGTATGGACCTTAGAAGAACGAAAATCATTCCTAAGTACGTTCCATATCCTACAACTTATCCTGCTAAAGGTATTAACACAGAGGATCAAGTTCCTTCTAAGACTGCTGTTTTCCGTGTTACTGGTGGTTGTTACTTCTGGCAGTTCTCATTCTTTGATGGTGATTCAAGTGGTGTATATTTCAAACCAGATGATTCTGAACTGATCCCACCATCATACTCTCACCATAAACTAACAGCATTTGAGTTTGCTGATGGTACTAATACTTTAAGTCAACTAATTAATGATCTTGGAACTGTAGAGAACTCTTCAGAGATTACTGGTTCTTCTATCCCTAACCTGCTAGAAAGAACTGACCTTGATATTTACTATCAGAAAGTATCTCGTGGTTTTGCTACTATTCCCGATACTTCTGGTGATCCTGCAACTGACCAGATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAATCGTATTGTTGGACCGATTTCAGATGAATTTAGAGTTCTCCAAATTACACGCAATGGCAACACTGCTACAGCAATTACTGTTGATGAGCAAGGAAACCCAAAGAACCACGGATTTTCTGTCGGCGTTAACGTTAACATTTCTGGTGTCACTGGATCTACTGGACCACAAACAGACCTAGATGCACAAAACTATAACGGATCATTTGCTGTAACTTCAGCATCAGGTAATGTCTTTACATATCAATTAGCAGAAGAACCTAGTGGTAATGCTATCGGTTCTAATATTGTTGTTAAAGTTGAAATTGATACTGTAGACTCTGCTTCTCCATATATCTTCAACCTGTCCCTAAGATCCACTTGGGGCATGTGTGGTATGCACGCTGATGGTGCTAAGGCAACAGGATTTAAGTCCATGGTTGTTGCCCAGTTCACTGGTTTGAGTCTTCAAAAAGATGATAGAGCGTTTGTTAAATATAACTCTACGACAGGAAACTATGACGAGGGTGGTCCTGGTGCTCACCTAGATGGTTTCGCTGAATATAAGAAAGGTTGGAGAAGTACACATGTTATGTGCTCCAATGACTCATTTGTTCAGGTTGTTTCTGTGTTCGCGGTTGGATATGCTGACCACTTCGCTGGTTATCAAGGCGCTGACATGTCTATTACTAACAGTAATAGTAACTTTGGTAATACAGCTTTAAGATCAAAAGGGTTCAAGAGAGCATCATTTACCAAGGATAAAGCGGGTACGATTACTCATATTATTCCTCCCAAGTCCTTGTCAGATGTTGATGAAATCTCTGCAAACTGGACTAACATTGATATTAAGAGAACCAAAGATATTAACAACGCTCTTGCTGGTCAAGGTGGCACACTTGGTTCCAGATTGTATATCTACGGATATACTAATGTTAATGCACCCCCACCGAATAAGGTCCAAGGTTATGTTATTGGTGCCAGACAAGATGGTATCGGTGCTGCTGCTGTACCTGATAAACTTTACTGCCTATTGATTGCTTCTGGTGCAACTTCGCCAACTATTCAAGCAGCAGAGATCAATCCATTCGGTCCTGATGTATCTGGAACCGTTGCAGGTGGTGATGGTTCTCCTCTGCAATATGATGCCAATACTTATACTATTAACGGTGTAGCGAATGAAGTTGGTGGGTGGTACTTATCAGTCAACTCAACTAATAATGAGATCTATCAGACTCTAGTTAATAATACTGCAACATATAACAATCTAAACTTCACTCCAACAACATTTATCAAGCGTGTTCCTGACGCTAGAAACCTTACTGACAGAACATATCGTGTTCGTTATGTAATTCCTAAGGAACAGAATCCACCCCTTCCTCGTTCACCTATTGCAGGATTCGTACTTCAACCATATAATACTGACAACACTGCATATCAACTGAATAAGTGTTACTATATCTACGATATCACTGAGGTATCAAAGTTTGAACGTGGTGTCACTGATGGTATATTCTATCTGACTTTGTTGTGTGGTTCTATTGCACCAACTACATCAAACTTTGATGATATGGCGTTCTCTCAGAACGTAAACGAAGTATATCCTGCTTTTGATAGAGACAATCCTAATAGTGATCCTGAACCTTCAATATCTGTTGCCGATAATGAAACTATTGGTCTCGTATATGGTACTGATGGAGCACAACCAACCCCTGCAAGAGATGATCAGAGATCAATCACTAAGGAAGCAGTATTGTTCCTTCTAAATGATAGTGGTTGGGTCGCAGGTTCTTCTCCTGGTTGGAACTCTATTAACGAAACTCTATCAGATATCCCACTCACTTCTCGTCTTGGTGATGAAGAAGCGAGAAAGATTCCTATCCTTCAAGATAGTGCAGACAATGATGCTCTTGTTCCAATCAACGTAGAACTTCGTCGTCACTCTATTCTTAGATCTGGTAATCACACGTTTGAGTATACTGGTTTCGGTCCTGGTAACTATTCCACGGCATTCCCACAAACTCAGGTTGAGACACTAACTGATGAGCAGATTAGACTATCACAGTCTCTCAAAGAAGAGGCAGGAGTTGCATTCTATTCGGGTCTAAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAAGTTATTAACCCTGTTACGGGTCAGATTACATCTGAAGATATTGCTCAGTTGAACGTTCTTGGTGAAGAGAATACTACTATTGAGACATTCTCTGAGGTTGTTGTTACTGATAAACTCACTGTTATTGGTGGTGCATCAAACAACTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTAACGATTCAGGGCACGTTAACAGCACAGAAAGAATTTATTGCTAAGAAACTTACATATAACAACCAAGATGGTACAGTTCTTAAGTCTACATTACTAGCACCTGAGTTAAAGACAGGCACTCCACCTGTTGGTCAAGGTGTACCTGATCTAAGCAATATTCTGAACTATAATGCACCTTCTGATGGTGACATTCTTTATAACATTGACTGGAGTCCTGGATCTAATTTAGGTTGGATGTATTATGAAGGTGCTTGGGTTAAGTTTGGTCTAACTAACACTGGAGTATTCCAATTTGGTGCCTATGGTGGTGCTTCTGCACAGAATATTGGTCTCGGTCGTGCTGCTTCTACCACATATAGACTGGAAGTAGATGGATCCCAGCGTATTACTGGAGACCTGAGAGTTGATGGACGTGGTGGAGTTGCCCCTGATAAGTATCTCACAAGGAGAACACAAGGTGATGGTTCAACATTGAACTATCAGATTACGTCCTATTCTGGTGTTGTTCATACTTCCAAATCTTTGATCGTTACTATCAACGGTGTCCTTCAACATCCTGATGTAAACTATACTGTAGACAGTAATGGTACTAACGTAGTGTTTGCCTCAGGCGATGCACCTACGACTAGTGATTATGTTGAAATTAGAGAGTTGCCAATCTAA

Tertiary structure

1 / 2
PDB ID
Source
Method
Resolution
Oligomeric State

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank