Protein

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Genbank accession
QBP05601.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDGNSRERGIIFSPNNAGATTQVVNIRVQDYAADSESIYAFSGNGVFSSPEVSARKSISSPQILTDKVITDGKKTGDYDISSLSNNTPLAESETAINHLRVMRNAVGAGIFHEVNVNDGITWYSGDGLDTYLWSFNWAGGLKAGHSISVGLPGGPKGYSELGTASIALGDNDTGLKWYQDGYFYVVNNGTRTFLYSPESTVSLRKMVMGYSVNGNDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAYGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGSSSVDNMTINVWGNTFSTVDGFRKNVMEISDAIGWMHYIQRNKDNTIEAVLNGQQTINENLVVKKDILVDRAVHTAGEITTSAVNGLRIWNNDYGAIFRRSEGSLHIIPTAFGEGMSGDIGPLRPFSLALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAISKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEINSGTFVLHHIKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKTFTSAGDITNIRDAIATRVAKEGDTMTGTLWINKDAAGIVLNPPLSSDSSFIRSDTAGANNWYIGKGGADNGLGFYSYITQGGVYITNTGEISLSPQGQGTFNFNRDRLYINASQWVAHKSGAWGDQWGLEAPIFVDFGGVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYISGVDFGMRRITNTWAQAIIRVGNQESESNPQAIYEFHSNGTFYAPSLLKSNRVSAGGGDPAWGSPCIVLGDNDTGFLWEADGIFNAYANGQGVFSFRAGLAQTFGNVNFHCNAGMYVRDNIDVNDVYIRSDIRCKSEIKLIKNAQEKSKLLGGYTYLLKNPVTDEVKPSAGLIAQEVQEILPELVSEDKETGLLRLNYNGIIGLNTATINEHTDEIKELKSEIAELKALIKSLIK
Physico‐chemical
properties
protein length:1088 AA
molecular weight: 117481,24630 Da
isoelectric point:5,44781
aromaticity:0,09743
hydropathy:-0,27776

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
730–782
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
983–1038
IPR030392 Coil
QBP05601.1
1 1088
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PHB12
[NCBI] 		2530037 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBP05601.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK524178.1 [NCBI]
CDS location
range 48597 -> 51863
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAATTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGTAGCATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAATTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACTTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGTGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGTGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAGCCGCGAACGTGGCATTATCTTTTCGCCAAATAATGCTGGAGCGACCACTCAGGTAGTTAATATTCGCGTACAAGATTATGCCGCTGATAGCGAAAGCATTTATGCGTTTTCAGGCAACGGTGTATTTTCTTCACCTGAAGTATCGGCACGGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGATAAAGTTATTACAGATGGGAAGAAGACGGGCGATTATGATATATCTTCATTATCAAATAACACTCCATTGGCAGAAAGCGAAACGGCTATTAACCACCTCCGTGTTATGCGAAATGCTGTAGGAGCAGGTATTTTCCACGAAGTTAATGTTAATGACGGAATAACCTGGTATTCCGGAGATGGACTTGACACTTATCTTTGGTCGTTTAACTGGGCCGGTGGATTGAAAGCCGGTCATTCTATTTCTGTAGGTCTTCCAGGCGGCCCTAAAGGATATTCTGAGTTAGGAACGGCCTCAATTGCTCTTGGTGATAATGATACCGGATTAAAATGGTATCAAGATGGTTATTTCTATGTAGTAAACAATGGTACGAGAACTTTCCTTTATAGTCCTGAATCAACCGTAAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTGTAAATGGCAATGATTTGACTACTCCTCCGACTGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAATGCGTATGGTGACGGTCAGACTCTTTTAGGATATTACCAAGGCGGTAATTATCATCACTATTTCCGTGGTAAAGGTACTACAAATATTAATACTCACGGCGGTTTATTAGTCACTCCTGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATTGATGGTCGTAATAATGCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAGCAGTTCAGTTGATAATATGACTATCAACGTTTGGGGTAACACCTTTAGTACAGTAGATGGTTTTCGTAAAAACGTGATGGAAATATCTGATGCTATTGGTTGGATGCATTATATTCAGCGCAATAAAGATAATACCATTGAGGCTGTATTAAATGGACAACAAACTATTAACGAAAATCTTGTTGTTAAAAAAGATATTTTGGTTGATAGAGCGGTCCATACCGCAGGCGAAATTACTACAAGTGCTGTTAACGGGCTCCGCATCTGGAACAACGATTATGGCGCCATTTTTAGACGTTCGGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCTACTGCATTCGGTGAAGGCATGTCCGGTGATATTGGCCCACTTCGCCCGTTTAGTTTGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTTGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGTGGATATGATATTCAATATGCCCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTATAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACGGTAAATCCGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCGGGTACATTTGTTTTACACCATATCAAAGAAGATGGATCACAAGGACATACATCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCGGATAACGTTCTGGTCGGCGGTGGCGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCGGATATCTGGAAAACGTTTACTTCAGCAGGAGACATTACAAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCTAAAGAAGGCGATACGATGACCGGCACTCTTTGGATTAATAAAGATGCTGCTGGAATAGTTCTTAATCCTCCTTTGTCTAGTGATTCATCATTTATTCGTTCTGATACGGCCGGGGCCAATAATTGGTATATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAGGTTTTTACAGTTACATTACACAAGGCGGTGTATACATAACAAATACCGGTGAAATATCGCTTTCTCCTCAAGGACAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTTTATATAAATGCTAGTCAATGGGTTGCACATAAATCTGGCGCTTGGGGCGACCAATGGGGCTTAGAAGCTCCTATATTTGTGGATTTTGGTGGTGTCGGTAATGATAGTTATTATCCGATTATCAAAGGAAAATCTGGTATTACCAATGAAGGATATATATCGGGTGTAGATTTCGGTATGCGTCGTATTACTAATACATGGGCCCAAGCTATTATCCGTGTTGGTAACCAGGAAAGCGAGTCGAACCCGCAAGCTATCTATGAATTCCACTCTAATGGCACTTTTTATGCTCCGAGCTTACTTAAGAGTAACAGAGTATCGGCTGGTGGTGGTGACCCAGCATGGGGCAGTCCTTGTATTGTATTAGGTGACAATGATACCGGATTTCTTTGGGAAGCAGATGGTATTTTCAACGCATATGCAAACGGCCAAGGCGTATTCAGTTTTAGAGCTGGTCTCGCACAAACGTTCGGTAACGTTAACTTCCACTGTAACGCCGGTATGTATGTTCGTGATAACATTGATGTTAACGATGTTTATATCCGTTCTGATATTCGTTGTAAGTCAGAAATTAAGCTTATTAAGAACGCTCAAGAGAAATCTAAACTCTTAGGCGGCTATACTTATCTGCTTAAAAACCCTGTTACAGACGAAGTTAAACCGTCTGCAGGTTTAATTGCTCAGGAAGTTCAAGAAATATTGCCTGAACTTGTTTCTGAAGATAAAGAGACCGGCTTACTTCGTTTAAACTATAACGGTATTATCGGTTTAAATACTGCTACTATCAACGAGCATACTGACGAAATCAAGGAATTGAAATCTGAAATTGCTGAATTGAAAGCATTAATTAAATCATTGATAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
cc70f552e2d9defdd135291c18164a26001774b2a3f86bac2f419f66195217d5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5433
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Identifican and characterization of a broad host-range O157 phage against Escherichia coli O157 Chen,Y., Yang,L., Song,J., Qian,P. and Li,X. 2023 — GenBank