Protein
View in Explore- Genbank accession
- URN70897.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMLSVTKSINDIGTKLDDLAITMIEVADKLEVGFDGVSRSVKTMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRALGGTARGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKIGGSLPIMYAALASNIFVLQSAFEQLKLGDQLNRLEKFGVIVGTQTGTPVQTLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLTTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRKIQQAAAKYLGPVIDAINTVFYTSQASISAEAARAQEKTNRQIDPTNVGAVALSLAASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKSEFDKRMEQADFYTKLAIRQVGEGIPVGLAAAGASEANKKFVEETAAMGLQVTRLGKEVEDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKANPEFQKQINLQRDTTDPDAVYDFNSTVLKGLTEQQKAYNQTKKTASDLANDIQNVAQNTDTAAKTSATLADAIKNIESLSLGTGKSADEYVKNLNLGYNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNQTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQEAALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTIEKEKYEWYTKQADKQKEAEQSRRSQAQIEREIWKFRQNQQAEMTSKRQEAFENTLTSMFPLAGEMQKMEMQLDFYTQMKELTKGNANEQMRWNAEIAKTRAQMSALTAQRNAQMQQQVGSSVGATYTPTTGLSGADKDFADMQNRMSSYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNSMIQFSQGSLDTTSMIASGMQTVASMIQYSTSQQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGALALAQASSASGMSSIADSGADTTSYLTLGERQKNIDVSMSANAGELSYIRGDKGIGGANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVVTPMVPMKATPNDELKTSSNSTSGRPIILNISAMDAASFREFASSNSSALRDAVELALNENGASLKTLGNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1227 AA molecular weight: 132936,05680 Da isoelectric point: 5,92714 aromaticity: 0,05542 hydropathy: -0,44165
Domains
Domains [InterPro]
IPR056207
TAS
1–81
TAS
1–81
Coil
Unmapped
686–745
Unmapped
686–745
1
1227
Architecture
TAS 1-81 | STR 82-1189 | TAS 1190-1225 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage EC105 [NCBI] |
2936940 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URN70897.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON185582.1
[NCBI]
CDS location
range 89956 -> 93639
strand -
strand -
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTACTAATAGACGTTAAACAGAAGGGGGCAACTCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCATTAGAGAATGCTGCTGCGGCTTCTGAGCTAACGAATGAACAGTTAGGTAAAATGCCCAAAACTCTATACTCCATTGAGAGGGCAGCAGATAGAGCAGCAAAAAGTCTTACTAAAATGCAAGCTAGTAGGGGTATGCTTAGTGTTACTAAATCTATTAATGATATAGGAACTAAGCTGGACGACCTTGCTATTACAATGATAGAGGTAGCTGATAAGCTAGAAGTTGGATTCGATGGGGTTTCTAGATCTGTTAAAACAATGGGCAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAGAAAGTTCAAGATAGGTTATATGATACTAATAGAGCATTAGGTGGCACAGCTAGGGGTTTTAATGACACTGCTGGTGCCGCTGGTAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCTGGTTCAGCACGTGGTGCAACTCGTGATTTTGCAGCAATGGCTAAGATAGGTGGTAGTTTACCTATTATGTACGCAGCTCTTGCTTCCAACATCTTCGTTTTGCAATCAGCGTTCGAACAACTTAAACTAGGTGACCAGCTAAATCGTCTAGAAAAATTTGGTGTTATAGTAGGTACTCAGACAGGTACTCCTGTTCAGACCCTTGCTAGATCACTACAAGAAGCTGCTGGATATGCTATTTCTTTTGAGGAAGCAATGAGACAGGCATCTTCAGCATCTGCTTATGGATTTGATGCCGAACAACTTAATAAATTTGGTTTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGTGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATTAAGGGCGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGATGAACTTGGTGTCACCATCCGTCTTAATGACGCATACGCCGATTATGTTAAACAGTTAAATGCTGCAAACACAGGTATAACATATAATGTTAATAGTCTTACCACTTTCCAGAAACAACAAGCATACGCTAACGCGGTAATTGCTGAATCTACTAAGAGGTTTGGCTACCTAGATGAAGTACTACGTGCAACTCCATGGGAGCAATTTGCTGCTAATGCAGATGCCGCCCTGAGAAAGATTCAGCAGGCTGCTGCTAAGTATTTAGGGCCAGTAATTGATGCTATCAATACTGTATTCTACACTTCTCAGGCTTCGATATCTGCTGAGGCAGCTAGAGCGCAAGAAAAAACTAATAGACAGATAGATCCTACCAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTGGCTGCTTCTGAAGAAGGCTATAATAAAGCTCTAGATATGTATAAGGAATCTCTTGATAAGCGTAATAAGCTAAAATCTGAGTTCGACAAACGAATGGAACAAGCAGATTTCTATACAAAACTAGCCATACGTCAAGTTGGTGAAGGTATTCCTGTTGGTCTTGCTGCTGCTGGTGCTTCCGAAGCTAATAAAAAGTTCGTAGAAGAAACTGCGGCTATGGGTCTACAAGTAACCAGACTAGGTAAGGAAGTAGAAGATTCTACTGAAAACCTTAATGCTTGGAAGTCAGCCTATCAAGCTGCGGGTGCTGCTGCTGCAAAAGCTAATCCAGAGTTTCAGAAACAGATTAATCTACAGAGAGATACTACTGATCCTGATGCTGTATACGATTTTAACTCTACTGTATTAAAAGGACTAACTGAGCAGCAGAAAGCGTACAATCAGACTAAGAAAACGGCTAGTGACTTAGCTAATGACATACAGAACGTTGCTCAGAATACAGATACTGCTGCTAAAACTAGTGCTACTTTAGCAGATGCTATAAAAAATATAGAATCTCTATCTCTAGGTACTGGTAAAAGTGCAGATGAGTACGTTAAAAATCTTAACCTAGGCTATAACACTCTGTCTGAAATGAAAACTGCGTCTCAGGCCTTATCTGAGTATGTTAAACTAACCGGTAATGAAACTAAAAATCAGTTAGCAGTTCAACAGAAGATAGCTGATGTATATAACCAAACTAAGGATAAAGAAAAAGCACAGGAAGCCGGTAGGCGTTTAGAACTCCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAGCTGCTTTACGCCGTGTTCTTCAAACAAACCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAACTTACCAATCAGGGTATGGAAGCTCAGAAGAAGGTCAAGGATTACACAGATAAAATTCTTGGTGTAGATCGTGAGATAGCTCTCTTAAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTCTAGCACAGTTAAATCTTGAATTGACCATTGAAAAAGAGAAGTACGAATGGTATACAAAACAAGCGGACAAACAGAAAGAGGCTGAACAGTCTAGACGTTCTCAAGCCCAAATTGAACGTGAAATATGGAAATTCCGTCAGAACCAGCAAGCTGAAATGACCAGTAAAAGGCAAGAAGCCTTTGAAAATACTCTAACTTCCATGTTCCCTCTGGCAGGGGAAATGCAAAAAATGGAAATGCAGTTAGATTTTTATACTCAGATGAAAGAACTTACCAAAGGTAACGCTAATGAGCAAATGCGTTGGAATGCTGAAATAGCTAAGACAAGGGCTCAGATGTCAGCTTTAACAGCACAACGTAATGCTCAGATGCAGCAACAGGTAGGTTCTTCTGTTGGAGCTACTTATACTCCTACAACTGGCCTATCTGGAGCAGATAAAGATTTTGCTGATATGCAGAATAGGATGTCTTCGTATGACCAAGCAATTTCTAAACTATCTGAGTTAAATTCCGAAGCAACTGCTGTAGCTCAAAGCATGGGTAATTTAACTAACTCTATGATTCAGTTCTCCCAGGGATCCCTAGATACTACGTCTATGATTGCTTCTGGTATGCAGACTGTAGCCTCGATGATTCAATATAGTACTAGCCAACAAGTTAGTGCAATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAACAGAAACGTGATGGTAAATCAGAAGCATCTAAAGCTAAGTTGAAGAAGTTGGAAGCTGAAAAGCTGAAGATTCAACAAGACGCAGCTAAGAAGCAGATTATCATCCAAACTGCAGTAGCTGTAATGCAAGCGGCAACAGCTGTACCATACCCGTTCTCTATTCCTTTAATGGTTGCGGCAGGTTTAGCGGGTGCATTGGCGTTAGCACAAGCATCTTCTGCATCTGGCATGTCTTCTATTGCAGATTCTGGGGCGGATACAACTAGTTATTTAACCTTAGGAGAACGTCAGAAGAATATAGATGTGTCCATGTCTGCTAATGCTGGTGAATTATCTTATATTCGTGGCGATAAAGGCATAGGCGGTGCTAACTCTTTCGTTCCTCGTGCTGAGGGTGGTAATATGTACCCTGGGGTTAGCTATCAAATGGGTGAGCATGGTACAGAAGTAGTTACCCCTATGGTTCCTATGAAAGCTACACCTAATGATGAGTTAAAAACCTCATCTAACTCAACTTCAGGAAGACCTATCATCTTGAATATTAGTGCTATGGATGCTGCAAGTTTTAGAGAGTTTGCTTCTAGTAATAGTAGTGCTCTAAGAGACGCAGTAGAATTAGCTCTGAATGAGAACGGTGCTAGTCTGAAAACATTAGGAAATTCTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
67b557f7c15da418a13261467e29620434d7f9b1c528fc47e353f1fc3820eccd
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50