Protein

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Genbank accession
YP_007675157.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MANRIQLRRDGAQQWANVNPILAQGELGIELDTSRLKIGDGVTPWNSLKYERPLETESNTANTLVKRDADGNFEAGAITASIIGNAATATRLANARSFTLTGDMSGSASFDGSANINITAELNYQPGLPHYDPNNLSATAQYTRLTIDSRGRVTTGDNPTTLAAYGIADAQPADPELQALADMTGFGIIARTGAGTLANRQIAVSAGRLLVSNGTGQNGNPLLDLADTPVVVGTYNGVGNLDTPLVSVTSGDETVNTTNFTVDRYGRLTYAQTSAIATATQGSEVAAFNNGSNYARNDKVKNTSDKLYQAILPINSGGGEPTHTDTSDTGSWRYLGSALAPQKGLASFNQEDFDVTQWDAGSNYEGGFVTIADAGVDNHQLQNSRIGFADGNTVENFDLDQELTAVTGYRGFNYLNYTKVNDTTGNLLVGANNTGNGSSGNQQAVQNVVVTLGTDTVGGQSTGVFYLDGVESPTNFPLKKGIKYIFNQDDSTNETYGGANHPLMVSSGADGDHNGHGHYMMGITYKLDGSVVDMAGYVSGFNAATTRRMEWLVQAEAPASLYYWCHHHTGQGDSFAITEGGAGEFDINVRSYFSHPDITLDGAISQTLDKTGDGDLYFQLTQNTASNRNLNILSTNAGAGNATILIQSENDITINASNVSNRVNVEGFQFQDDTLSSTAATMILDPGDDDAATGKVQIRGDLQVDGTTTTVNSTVVTIDDPIFTLGGDTAPGSDDNKDRGIEFRYYDTQARVGFFGWDEDYADSNIWSGTGGFRFLYNATNTSEVFSGTDAPLIVGNLRLTTNTGSTSTTTGTLVVTGGLGLSENAHIGGTVTIAGQSEVNNNVIFKADNKSFSIQNAAGVNKFSVDYDNGNTVIEGTLDVQLETEITDNLIIKADNKKFDIQTAAGVSVFDVDTDNGNTHTDGTLDVDGGTTLNNTLDVDGATTLNDILDVDGNSTFHNNITLDTTGKNFKITNGSQDKFTVLSTNGNTDIRGTLDVGSAVVFENNFNANGNNVTLGNANTDVLTVNSVATFTDNVTVNGTVDFDTTLNVDGQADFNSTVVIDGQTTIYDSVIIQSDNEVFNINNASAQTQFSVDSDNGNTVIGRNGLGTNSVGLLTVHGDTLLNRDLTVDGNTTIGDANTDTLTVNSESTFNADVTIAGTNNLQVTGNAIVDGNLTVHGTTTTVNSTVVTLDDPIITLGGDTAPGSDDGKDRGVEFRYYSGAAKIGWFGWDNDAGRFALYDDATNSSEVFSGTRSGIDAGSLKLFDTTNATNSSSGALIVGGGAGIGLDLHVGDDLTVVDDASIGGNLDVTGTFDVTDDLAVNNTKFTVDAGTGNTVIQGTVQVDGNATIGNGSGDQHTVTGTVTFNQAITSTDITADNIQIGVSGATEIDTTSGNLILDSQGGTVNVTDDLDVDNNLNVDGNAKVDGTLTVDGNTTIGNASGDSHSVTGTVQFNQAITSTDITADDIKIGVDAANEISTTSGNLVLDSDGGKVHITDNAEIDGTLQVDGNATIGDNSSDQHEFTGTVTFNQAITSTDITADNIRIGVAASSEIDTTSGALTLDSNTGETIIDDNLTINGTLDVDALTVITDALTVKADNKLFSVQTGSAATIFSVDTDNGNTDIQGTLNVEGATTIDDTFNVTQATDLDGTLNVDGVATFQNDVVLNADNKNFKIQLDNGTDKFTVASASGNTDIQGTLDVNGAANVTNTLGVTGLTSLTNNTNPTSLSANAALMVTAGGATIDEDLYVGSDLFLGPNAGTTITLNGGTGNATIGGTLGVTGQTTLTTVSATSLTTSAGVTMDGSLIINTSKFTVAGATGNTAVDGTLDVNGATTITDNLNVTGAVDFDTTLNVDGNSTFSGTITQNSTSLFKDNVVLRGSTKTLKLQNGSGTDKITLNSTSGAATFTGLTTTNTLDVTSNTTIGGTLGVTGQITGDVTGDLTGNADSATLVSVTETASSNLTYYPAFVSSTSGNTEIRTDSTNLSYNPGTNTLTVNNFTSTTDFTVQGNLTITGNIQYNQSQVGSIANHTTDALAEGAGNLYYTEERVDDRVAALISGGTGISATYNDAGNLLTLSADFGEFDTDDVNEGTSNKYHTQARVRNSFTYGTGIEHDGSGGIQVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRGHISVSGDLGYNASTGVLSYTTPTTIASLSNHDTDDVAEGSTNLYYTDERVDDRINALIIAGTGVTKVYDDAANTYTLSVTQADINSDNVTEGSTNLFHTTARARASISATGSLSYNSGTGVISYTTPTTIASLSNHDTDDLAEGSNLYYTDARADARIAAADTGDLSEGSNLYYTDARARASISENSTQLAYNSTTGVLTYTQGDTDTVAEGSSNLYYTDARADARIAAADTDDLSEGSTNLYYTDARADARVSAGITGKLDASAVSTFGGTLIDDADAAAARTTLGLGTAAVAATGDFATAAQGTKADDAAPLASPGLTGTPTAPTAAQATNTTQVATTAFVQSNLTAALLRTALGIVSAANDAGSGLASGEMYFNTTSNTYVLVA
Physico‐chemical
properties
protein length:2538 AA
molecular weight: 262606,84260 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06068
hydropathy:-0,24984

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–141
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
YP_007675157.1
1 2538
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage P-RSM6
[NCBI] 		929832 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Prochlorococcus marinus str. NATL2A
[NCBI] 		59920 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007675157.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020855 [NCBI]
CDS location
range 81832 -> 89448
strand -
CDS
ATGGCAAATAGAATACAATTAAGACGTGACGGAGCACAGCAGTGGGCTAACGTCAACCCAATACTTGCTCAGGGTGAGTTAGGTATCGAACTTGATACTTCTCGACTGAAGATAGGAGATGGTGTAACTCCATGGAACTCACTTAAGTACGAACGTCCTTTAGAAACAGAAAGTAATACTGCTAATACCCTTGTTAAGAGAGATGCCGACGGTAACTTTGAGGCAGGTGCCATTACTGCGTCAATTATCGGTAACGCTGCTACTGCTACGAGACTTGCTAACGCTAGATCATTCACCCTAACAGGTGACATGTCAGGATCTGCATCCTTTGACGGATCTGCAAACATCAACATCACTGCTGAACTAAACTATCAACCAGGTCTCCCACACTACGACCCTAATAATCTATCTGCCACTGCACAATACACTCGTCTGACTATTGACTCTCGTGGTCGTGTTACTACTGGTGACAATCCCACGACTCTTGCTGCTTATGGTATTGCTGATGCTCAACCTGCTGACCCAGAATTGCAAGCATTAGCAGACATGACTGGTTTCGGTATCATTGCAAGAACTGGAGCTGGTACATTAGCAAATAGACAGATTGCTGTATCTGCAGGTAGACTTTTAGTATCCAACGGTACTGGACAAAATGGAAACCCTCTACTCGACCTTGCTGATACTCCTGTTGTTGTTGGTACTTATAATGGTGTAGGTAACTTAGATACTCCATTAGTCTCTGTGACCAGTGGTGATGAGACTGTTAACACAACCAACTTCACGGTTGATAGATATGGTCGTCTTACCTATGCACAGACTTCTGCTATTGCCACTGCAACACAAGGTAGTGAGGTAGCAGCATTTAATAATGGATCGAATTATGCACGAAACGACAAGGTTAAGAATACGTCTGATAAGTTGTATCAGGCTATCCTTCCTATTAACTCTGGGGGCGGTGAGCCTACACACACGGACACCAGTGATACAGGATCTTGGAGATATCTCGGATCTGCTCTAGCACCTCAGAAAGGTCTAGCATCATTTAACCAAGAAGATTTTGATGTAACACAATGGGATGCAGGTAGTAACTATGAAGGTGGTTTTGTAACCATTGCAGACGCAGGTGTTGACAATCATCAATTACAGAACTCTCGTATAGGTTTTGCTGATGGTAATACAGTAGAGAACTTTGATCTTGATCAGGAATTAACTGCTGTTACTGGTTACAGAGGATTTAATTACCTTAACTATACAAAGGTAAACGATACAACTGGAAATTTATTAGTAGGTGCTAACAATACTGGTAATGGTTCTAGTGGTAATCAACAAGCAGTACAGAACGTTGTTGTCACACTCGGTACAGATACAGTAGGTGGACAATCAACAGGTGTATTTTACTTAGATGGTGTAGAAAGTCCTACAAACTTCCCACTTAAGAAAGGTATTAAGTATATCTTTAATCAAGATGATTCTACCAATGAAACATATGGTGGTGCAAATCATCCTTTAATGGTTAGTTCAGGTGCTGACGGTGATCACAATGGTCATGGTCATTACATGATGGGTATCACCTATAAGTTAGATGGTTCTGTTGTTGATATGGCAGGGTATGTTAGCGGATTTAATGCTGCTACTACTCGTAGAATGGAATGGTTGGTGCAAGCAGAAGCACCTGCTAGTCTTTACTATTGGTGTCATCATCACACAGGTCAAGGTGATAGTTTTGCTATTACTGAAGGCGGTGCAGGTGAATTTGACATTAACGTAAGATCATACTTCAGTCATCCTGATATCACTTTAGATGGTGCTATATCTCAGACACTTGATAAGACTGGTGATGGAGATCTATATTTCCAACTTACTCAAAACACTGCATCAAATAGAAACTTAAACATTCTTTCTACTAACGCAGGAGCTGGTAATGCTACCATTCTCATACAATCTGAGAATGATATTACAATCAATGCTAGTAACGTTTCTAATAGAGTAAACGTAGAAGGTTTCCAATTCCAAGATGATACTCTAAGTAGCACTGCTGCTACTATGATATTGGATCCAGGTGATGACGATGCTGCAACTGGTAAGGTTCAGATTCGTGGAGATCTACAGGTAGATGGTACAACGACCACGGTAAATTCTACTGTTGTTACCATTGATGATCCTATATTCACACTGGGTGGTGATACTGCTCCAGGTTCAGACGATAATAAAGACCGTGGTATAGAATTTAGATATTATGACACACAAGCAAGAGTCGGGTTCTTTGGGTGGGACGAAGATTATGCAGACTCTAACATATGGTCTGGCACTGGCGGGTTTAGGTTCCTCTACAACGCCACTAACACCTCTGAAGTTTTCTCTGGTACTGACGCTCCTCTCATTGTTGGTAACCTCAGGCTCACAACCAACACAGGATCAACCTCAACCACGACGGGTACGTTGGTGGTCACGGGGGGATTAGGTCTTTCTGAGAACGCACATATTGGTGGAACTGTTACTATTGCAGGACAGTCAGAAGTTAATAATAATGTAATCTTTAAGGCAGACAATAAGTCATTTAGTATACAGAACGCAGCTGGTGTAAATAAATTCTCTGTTGACTATGACAATGGTAATACAGTAATAGAAGGTACATTAGATGTTCAGTTAGAAACTGAAATTACTGATAACCTTATTATAAAAGCAGATAATAAAAAGTTTGATATCCAAACTGCTGCAGGTGTCAGTGTATTTGATGTAGATACTGACAACGGAAATACCCACACAGATGGTACTCTTGATGTAGATGGTGGGACAACCTTAAACAATACATTAGATGTTGATGGTGCTACAACCCTCAATGACATTCTTGATGTTGATGGCAACTCAACATTCCATAATAATATTACTCTTGATACAACTGGTAAGAACTTTAAGATCACTAATGGATCTCAGGATAAGTTTACAGTACTATCAACCAATGGTAATACAGATATTAGAGGAACCTTAGATGTAGGTTCTGCAGTCGTATTCGAAAATAACTTTAATGCAAACGGTAATAACGTTACTCTTGGTAATGCAAATACTGATGTGCTTACTGTTAATTCAGTTGCAACATTCACTGATAATGTCACAGTCAATGGTACAGTTGATTTCGACACTACACTTAATGTAGATGGTCAAGCAGACTTTAATAGCACTGTAGTTATAGATGGGCAAACTACAATCTATGATTCAGTAATTATTCAGTCTGATAACGAAGTATTTAATATTAATAACGCTAGTGCCCAGACACAATTCTCTGTCGATTCTGACAATGGTAACACTGTCATTGGTAGAAATGGTCTAGGTACTAACTCAGTAGGTCTCTTAACAGTTCACGGAGACACTCTACTAAACCGTGATTTGACTGTTGATGGAAACACCACTATAGGTGATGCTAACACAGATACACTAACTGTCAACTCTGAGTCAACATTTAATGCAGATGTAACAATCGCAGGTACTAATAACCTCCAAGTTACTGGTAACGCAATCGTTGATGGAAACCTCACAGTTCATGGAACTACAACCACAGTCAATTCTACTGTAGTTACATTAGATGATCCTATCATTACATTGGGTGGTGACACTGCTCCTGGTTCTGATGATGGTAAGGATCGTGGTGTGGAGTTCAGATATTATAGTGGTGCTGCTAAGATAGGTTGGTTTGGTTGGGATAATGATGCAGGTAGATTTGCATTATATGATGATGCAACAAACTCTTCTGAAGTATTTTCAGGAACAAGATCTGGTATTGATGCAGGTAGCCTAAAACTATTTGATACAACTAATGCTACAAACTCATCTTCAGGTGCTTTAATCGTTGGTGGTGGTGCAGGTATAGGTTTAGACTTACATGTTGGTGATGATTTAACAGTTGTTGATGACGCTTCTATTGGTGGTAACTTAGATGTCACAGGAACATTTGATGTAACTGATGACTTAGCTGTTAACAATACTAAATTTACTGTTGATGCAGGAACTGGTAATACAGTCATTCAGGGAACTGTTCAGGTAGATGGTAATGCTACTATTGGTAATGGATCTGGGGATCAGCATACTGTTACTGGTACAGTAACCTTTAACCAAGCAATAACTTCTACAGATATCACTGCTGATAACATTCAGATCGGTGTATCTGGTGCAACAGAAATTGATACAACCTCTGGAAATCTAATTTTAGATTCACAAGGTGGTACTGTTAATGTCACAGACGATTTAGATGTTGACAATAACCTTAATGTTGATGGAAATGCTAAGGTTGATGGCACCCTTACAGTTGATGGGAATACTACTATCGGTAACGCATCTGGAGATTCACACTCTGTTACTGGTACTGTTCAGTTTAACCAAGCAATAACTTCTACAGACATCACTGCTGATGACATTAAGATTGGTGTTGATGCTGCTAATGAAATTAGCACTACTTCTGGAAATCTAGTATTAGATTCTGATGGTGGTAAAGTTCATATCACAGATAATGCTGAGATAGATGGAACTCTACAAGTAGATGGCAATGCTACTATCGGTGATAACTCTAGTGATCAACATGAATTTACTGGTACTGTAACATTTAATCAGGCAATCACTTCTACAGATATTACTGCTGACAACATCAGAATTGGTGTTGCTGCTTCATCTGAAATTGATACAACCTCTGGTGCTCTTACCTTAGATTCTAATACTGGTGAGACTATTATTGATGATAATTTAACTATCAACGGAACATTAGATGTTGATGCGTTAACAGTTATTACTGATGCTCTAACAGTTAAGGCAGACAATAAATTATTCTCTGTACAGACTGGATCTGCTGCTACTATCTTCAGTGTTGATACTGACAACGGTAACACTGATATACAGGGTACTCTTAATGTAGAGGGTGCGACAACTATTGACGATACATTTAATGTCACTCAGGCAACTGATTTGGATGGCACTCTAAATGTTGATGGTGTTGCTACTTTCCAAAACGATGT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Tertiary structure

PDB ID
d92f460caf126a961155404d24994e40044488c451f9d64e7c02c1961a445867
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4427
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage P-RSM6 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank