Protein

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Genbank accession
XMR90270.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGSFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFTLPPSPLDGETVIIQDIGGKPGINQVKISSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMIFIFNNRLWQMYVADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDSEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATPAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATQLIFEKGPQTGTNPTQTMTVKVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIIRNDGSVTNFMLTASGNQTGGFNGLRPLSINNQSGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGVKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140338,87900 Da
isoelectric point:5,61373
aromaticity:0,07292
hydropathy:-0,35361

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
XMR90270.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage EPIMAM01
[NCBI] 		3385013 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XMR90270.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ493298 [NCBI]
CDS location
range 147676 -> 151545
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAGTTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCTGTATATACAACCGTATCATCTGGACCGTATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGTAATGACATTGAGTTTACTTTACCACCTTCTCCGCTCGATGGAGAAACAGTAATAATTCAAGATATCGGTGGAAAACCTGGTATAAATCAGGTTAAAATAAGTTCTTCAAATCAGAGCATTGTTAATTTTAGAGGTGAACAAGTACGTTCAGTTTTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATGATATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCAATTGTTACTCCATCGACTGCATATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCAGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACGACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAGTGAAAAATTATGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATTGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCCCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAAACATTATCGGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCCTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAATACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCACTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACACCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGCGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGCGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACCGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCCACTCCAGCCATAAGAGGATTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCCCAGACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCAAACAAACGAACCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCAGCAAATAGTACACTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCAATTAATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCGACTCAAACAATGACTGTAAAAGTGTGGGGAAATCAATTTAGCGGGGAGTCAGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACTTCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGTAATAAAGCTGGTAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTGAATGCTTCAGGAACATTGAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAATGGAAATTACGGTTTCATTATTCGTAATGACGGGTCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCAGGCAATCAAACTGGTGGATTTAATGGATTGCGTCCATTGTCCATTAATAATCAATCTGGGCAGGTCACAATTGGTGAAAGCTTGATCATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTGTTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTTACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAAAAAACTAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCTTCGGATATAGGAGCAATTCCATCTGATAATGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
01d05bf836159af8dc62cad50fd979e195bf80227c3e97495d47754237b71290
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5527
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50