Protein

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Genbank accession
QHR63706.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAATGTLDNVLITPKKLLSTKSTESQEGVIKVATQSETVTGASANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFSGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNQSGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140136,56640 Da
isoelectric point:5,44577
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,33095

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
QHR63706.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage teqhal
[NCBI] 		2697538 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR63706.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN895435 [NCBI]
CDS location
range 54902 -> 58771
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCTGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACCGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCGGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGTCAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCAAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACCGTAGAAAGAGTAGACTCTTTGAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGCGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACGCAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTACAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAAGTACTAAATCTACCGAATCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAGCATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAATATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTACCGTTAAAAGCAAAAGCTGCAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTAGTGGCGGATCAGATACAACGCGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGTAATATTACGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCCGGTTCATTGAATGCGAATGGCGTAGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATCAGGAATGATGGCGGCAGCACATATTTTATGCTTACTGCATCTGGTGATCAGACCGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTATCAATTAATAATCAATCCGGTCAAGTCACAATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACGGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACACAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACACCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAGCCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
ea29b9d00a164dc2867363c0d6bcd584517852dadb5558f1676f3889f39a8d73
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5580
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank