Protein

View in Explore
Genbank accession
AIX41060.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAYLLSNGGVIINDSREIVNAGVVTATAFFGDGSGLSGIATISDGGISIGDANITGNLNVSGISTVEFLNASDINVGGALTVTGDLSVGGDLSFDEVSGRNLNITGISTLGTVKISNGIVTATSGVVTYYGDGSNLTGIDITDSDVRLRNLSVTGVSTFTGDVSFGANASLVGDLTSGRNANLSGIATVNDIYIDNLLYDSNGSVGAAGSILVTAGGKLQWLPPDQAGIATVFQPGNTFFVSKNGDDSSDGLSMEKSFATISYALSQISSGTNNVLLITAGDYEEVFPLSVPDGLTVKGVGQRAVLVRPTSATETNDGFQLGNASTVEDLTIGQMFKPQGASNNNYAFTYRSGATISSRGPYVSRVTVLNKGSVTSASDPFGYGSADAYPTTAPGGAGVLADGSVLNSASLEASFLLNEVTTFTAGNIGIDMVNGARVEWLNGFSYFASEGVKGRADQSTGLYGAGKTRLRVENASGGLVNGNTIELYDIDGTTSLASGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFDIAGSRKAKASSFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFQDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCAVEYGNKGVVGDGAGVALRLIGINFSFVGALGDLTNDPNLAVQANEVTETNNAEVSFTSIDQGGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDILATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGISTISQVDIGKITVGDFTVTGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLANDASINGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTESLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSDATRKEDVVEIEDALAKVLDLRGVTFNWKNGEGSSAGVLAQEVQMVLPEIVKGDVGNMSVQYNGIIALLVQAVKELSSEVEELKRTKSDKRRKKS
Physico‐chemical
properties
protein length:1956 AA
molecular weight: 199227,79840 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06186
hydropathy:0,10322

Domains

Domains [InterPro]
DC_0763
STR
2–899
DC_0763 DC_0407 DC_1671
G3DSA:2.60.120.200
STR
505–703
G3DSA:2.60.120.200 IPR030392
IPR013320
STR
541–696
IPR013320 IPR030392 Coil
PF13385
LEC
568–697
PF13385
AIX41060.1
1 1956
Architecture
STR
STR
RBD
STR 2-899 | STR 911-1154 | RBD 1259-1950 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX41060.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019141 [NCBI]
CDS location
range 204305 -> 210175
strand +
CDS
ATGGCATATTTACTTTCTAATGGGGGCGTTATTATTAACGACTCCAGAGAAATCGTAAATGCTGGGGTTGTAACTGCTACTGCGTTCTTTGGGGACGGTTCTGGTTTATCTGGAATCGCAACCATTTCTGATGGGGGAATCTCCATCGGCGACGCAAACATCACTGGAAACTTAAATGTTTCTGGTATTTCTACCGTAGAATTCTTAAACGCTTCTGACATTAATGTCGGCGGTGCTTTAACAGTCACAGGTGATCTATCTGTCGGTGGTGATTTATCTTTTGATGAGGTTTCTGGTAGAAACCTAAACATCACTGGTATTTCCACACTCGGAACAGTTAAGATTTCAAATGGCATTGTAACCGCCACTAGTGGCGTTGTTACATATTACGGTGATGGTAGCAATCTAACCGGCATTGACATCACAGATAGTGATGTAAGACTCAGAAACCTTTCGGTTACTGGTGTCTCTACATTCACAGGTGATGTATCTTTTGGAGCAAACGCTTCTCTAGTGGGCGACCTAACTTCTGGTCGTAACGCAAACCTTTCAGGTATTGCGACAGTAAATGATATCTATATTGATAACTTACTTTATGATTCCAACGGTAGCGTTGGAGCAGCTGGTTCAATTCTTGTAACCGCAGGTGGAAAGTTACAGTGGCTACCGCCCGATCAAGCGGGTATTGCTACAGTATTCCAACCAGGAAATACATTCTTTGTTTCTAAGAATGGTGATGATAGTAGTGATGGTCTCTCCATGGAGAAATCATTTGCTACCATTTCCTACGCTCTGTCTCAGATTTCATCAGGGACAAACAACGTTCTCTTAATCACCGCTGGTGATTATGAAGAAGTATTCCCACTATCAGTTCCCGATGGACTGACTGTTAAGGGTGTTGGACAACGTGCGGTTCTAGTTAGACCCACTTCAGCTACAGAAACCAACGATGGTTTCCAACTTGGTAACGCATCCACAGTTGAAGATTTGACCATTGGTCAGATGTTTAAACCTCAAGGTGCTTCCAATAATAACTACGCTTTCACATATAGAAGTGGTGCTACCATTTCATCTCGTGGACCTTATGTTTCTAGAGTTACGGTTCTAAACAAAGGTAGCGTAACCTCTGCCTCTGATCCATTTGGATATGGTTCAGCTGATGCTTATCCAACGACTGCCCCTGGTGGTGCTGGTGTATTGGCTGATGGTAGTGTTCTTAACTCCGCCTCACTAGAAGCATCATTCCTACTTAACGAAGTCACCACCTTCACTGCCGGTAACATCGGTATTGATATGGTCAACGGTGCTCGTGTTGAGTGGTTGAATGGTTTCTCCTACTTCGCATCCGAGGGTGTTAAAGGTAGAGCCGACCAGTCAACTGGTTTGTATGGCGCAGGTAAGACGAGACTAAGAGTTGAGAACGCCTCTGGTGGTCTAGTCAATGGCAATACCATTGAACTCTATGATATTGATGGCACGACTAGCCTTGCTAGTGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGATATTGCAGGAAGTCGTAAGGCAAAAGCTTCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCCAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGACAGATTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAAGACTCATCGGTATTAACTTCAGTTTCGTAGGTGCCCTAGGTGATCTAACTAACGATCCAAACCTAGCCGTTCAGGCTAATGAAGTTACAGAAACCAACAATGCTGAGGTATCTTTCACCAGTATTGATCAAGGTGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCAACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATTACAGCAGTGGATATCCTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCTGATGTTGATTCTATCAATGTCACTGGTATCTCTACTATCTCTCAGGTTGATATCGGTAAGATTACCGTAGGTGACTTCACTGTAACTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCAATGATGCATCAATTAACGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGTGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAACACAGGTATTGGTACTCTATCCTTAGGGGATGATACTTTCTCTGTTGTTGGTGATGGTACAAACGTAGTCACTACTGCAAGTGGTGTAACTACTACCGTAACCATTTCACTATCCGATAGTGTGGCAATCGCCGGTTCTATGACCGCTGGTAGCTTCCTTGGTGAGAACCTCAATGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGCGTTACAACCTTCAGAGGTGATGTCTTCATCGAAGGTAACCTAATCATTGATGGTGATGAGAGTCAGGATCTAGTCAGTGGTACTAACCTAATTATTACTGGTATTGCTACCATTGGTACATTAGGAGTAACTACTACTACTACCAATACTCTCACCGTACTCGATACCTTCACTCTAGATAACCCAGTCAATTCTATCGGAATTAGTTCTGATCTAGGTGGTGCCGGTGCTGCTCACACAGCTCTTGCTTCCCAGTTAGCAATCAAACAATACATTGATGCTAATAACTCAGATCAAAACCTAAACTTCACTGGTGATACTGGTTCTGGCTCGATTGGTCTTGGTACTGAATCCCTAGAGGTTCGTGGTACAGCACAACAGGTTACAACCATTGGTGTTGGTAACAGTGTTGTTATTGGACTACCTAACACAGTAAGAGTACCACAGAGACTATATGTTGGTGGTGGTGCCTTTACTCAGGTTATGGATGCCAACTCCGCTTCTGGTGTGGTATTTGCCAATAAGATTGTTACGATCAACAAAGGTCTAACCCTCAGTAGTAGTGACCTAACCGGAGTTCGTAACCTAGTTCAGACTGGTATTGCAACTCTTGGTACAGTTAACTTCTCTGGTGTAACAACCACTGTAGGTAACGCATTCGTTGGTAATGACTTAAGTGTCTTAGGCACAGTCAACGCTAATGACTTTAACTCTACTTCTGACGCTACTAGAAAAGAAGACGTAGTTGAGATTGAAGATGCACTCGCTAAGGTCCTAGACCTACGTGGTGTAACATTCAACTGGAAGAATGGTGAAGGATCATCTGCTGGTGTTCTTGCACAAGAAGTTCAGATGGTTCTACCTGAGATTGTTAAGGGTGATGTAGGCAATATGTCCGTTCAGTATAACGGTATTATAGCACTTCTCGTCCAAGCAGTCAAGGAACTCTCTTCTGAAGTTGAAGAACTCAAGAGAACCAAGAGTGACAAGAGAAGGAAGAAATCCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c069d4ce5a9940d43c298c24f91f43676efbc1b049b19cd83ab8120ba0115e18
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6553
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank