Protein

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Genbank accession
AIX23928.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTFSFAPNDEPLYVSEGDYVQFKFKAPSSWDTTQTVTLQIGDLLQYWLITTIKEDFTPDPYPMQGFEDADVDTLYTFADGSRPGESIVVVSGLTPTTQAAVGISSNVPIPGGSPVTDYVAMRIDYDGDGSWDTGWIDNTASSLTVENGARIQVRGRTSTFYTQIMRIVLEIGTATEVWEVQNEAVPGNFAIPFPNFTDLDPVEPDTMIYSEVLAVQGLNEDAPISVSGTGEYALSVSGNTSTNVNGFDVLLGAAWSTSGIVSNGDYLQLRIPSSTANLTPVFTDLSIADTANGSTWTVTTGVADDDTPGNFSFQDKTGQLTDTLIGSDQQPSAGITGLTAGLSVPVEVVSTDSSLVRVRVNSGSIGVFPTSVQNGDKLTIYLQSNTSFNTPNTLQIKVGERTISTWTVITGSGPDSDAIFTPPIDLTNQVPNTYVTSSQVTISGINIPITINATNGSLISIDSDIPVAGPRTFDPNANTSFAITSLVPTNLNTSQPTVVTVGTGSLNNPFTWTVTSYASAPLPPDNLGVWYSKKVEKFDGYPIGTVLPILKENSVVGYGDLDGDLNSRYPGFIKCEGQSLSTTQYFMLFDVIEYTYGGSGSSFNVPDYRNRRLCGTGQVDASRGNSTSLPIDSGGSILSVGAEGGYWYFDKVDVLGSQPLEQIQGTGTSGVDSQFFTLGTVRITGLETVTDDIIFSITGQVSGIIGPLEDVIVNVPLHDHAYVAALPDSDGGDPLIKWGPPAGRSMFGGQTGTSTYRNQVGSSDDIAGKWADFIGGLGIFENEMKLYYGNGFNLKNWAAENLPTNWEVNVDVPSGAIGQSDFGSENDDATATVDFMTWWISPVSGLSGASLQSTGANEPNPAAAVVDTETTRFTIEQYIPTSGFTNAHAHFLTEDIVQNAQVDFSSGNSGGAGTITGGLGNGVTQLNLVFTQADIFMDMTDATFNWNSSFSKPTPSVTMTPQIQVPILNPFHKTKYIIKAY
Physico‐chemical
properties
protein length:981 AA
molecular weight: 104410,12080 Da
isoelectric point:4,05497
aromaticity:0,09582
hydropathy:-0,11417

Domains

Domains [InterPro]
IPR037053
533–609
IPR037053
SSF88874
569–621
SSF88874
IPR011083
570–611
IPR011083
AIX23928.1
1 981
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014j
[NCBI] 		1493514 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX23928.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019069 [NCBI]
CDS location
range 35976 -> 38921
strand +
CDS
ATGACATTTTCATTTGCACCAAATGATGAACCACTTTACGTGTCCGAAGGCGATTACGTTCAGTTTAAATTTAAGGCACCTTCTTCTTGGGATACAACCCAAACAGTCACTCTTCAAATTGGTGACTTACTTCAATATTGGTTAATTACTACGATCAAAGAGGATTTTACTCCTGATCCATATCCCATGCAGGGATTTGAGGATGCTGACGTTGATACTTTGTATACATTTGCTGATGGTAGTAGACCTGGAGAATCAATTGTTGTTGTTAGTGGATTAACACCAACTACACAGGCAGCTGTGGGCATTTCGTCTAATGTTCCTATACCTGGAGGATCTCCTGTTACTGATTATGTTGCGATGCGTATTGATTACGATGGTGATGGAAGTTGGGATACTGGTTGGATTGATAATACTGCTTCTAGTTTGACAGTTGAAAATGGTGCAAGGATACAGGTAAGGGGAAGAACTTCTACTTTTTATACTCAAATTATGAGGATTGTTCTTGAAATTGGAACAGCAACTGAAGTATGGGAAGTTCAAAATGAAGCTGTCCCAGGTAATTTTGCTATACCATTTCCAAATTTTACTGATCTAGATCCGGTAGAACCAGACACAATGATCTATAGTGAGGTTTTGGCGGTACAAGGGTTAAATGAAGATGCTCCTATTAGTGTTAGTGGCACAGGTGAATATGCTTTATCTGTATCTGGTAATACTAGCACTAATGTTAATGGGTTTGATGTATTACTTGGTGCTGCTTGGTCCACTAGTGGAATTGTAAGTAATGGAGATTATTTACAATTACGAATTCCAAGTTCTACTGCTAATTTAACACCTGTATTTACAGATTTGTCAATTGCTGATACTGCAAACGGATCAACCTGGACAGTTACCACTGGTGTTGCTGATGATGATACACCAGGCAATTTTTCATTCCAAGATAAAACGGGTCAGTTAACTGACACATTGATTGGATCAGATCAGCAACCATCTGCTGGTATTACTGGATTGACAGCTGGTTTATCTGTTCCTGTTGAGGTAGTTTCTACGGATTCTAGTTTAGTTCGTGTGAGAGTTAATAGTGGATCTATTGGAGTATTTCCAACATCTGTGCAAAATGGTGATAAGTTAACAATTTATTTACAATCAAATACTTCATTTAATACTCCTAACACTTTACAAATTAAGGTGGGAGAACGTACTATATCTACATGGACAGTTATAACTGGTAGTGGACCAGATAGTGATGCAATATTTACTCCCCCGATTGATTTGACCAATCAAGTTCCAAACACATATGTGACTAGTTCTCAGGTTACAATAAGCGGTATTAATATACCGATTACTATCAATGCTACGAATGGATCTTTAATTTCTATTGATTCTGATATTCCTGTTGCTGGTCCTAGAACTTTTGATCCTAATGCAAATACATCATTTGCTATAACATCATTAGTACCAACAAACCTTAATACGTCACAACCTACCGTAGTTACAGTAGGAACAGGATCTTTAAACAATCCTTTTACTTGGACAGTAACAAGTTATGCCTCAGCACCTCTACCACCAGATAACCTAGGTGTTTGGTATAGTAAGAAAGTAGAGAAATTTGATGGTTATCCTATTGGGACTGTGTTACCTATTCTTAAAGAAAATTCAGTAGTTGGATATGGAGATCTGGACGGAGATTTAAACTCTAGATATCCAGGATTTATTAAATGTGAAGGTCAATCCTTAAGTACCACTCAATATTTTATGTTATTTGATGTAATTGAATACACTTATGGTGGGTCTGGGTCTAGTTTTAATGTTCCTGACTATAGAAATAGAAGATTGTGTGGAACTGGTCAAGTTGATGCTAGTAGAGGTAATTCTACTTCACTACCAATTGATAGTGGTGGATCTATTCTTAGCGTTGGTGCTGAAGGTGGATATTGGTATTTCGATAAAGTAGATGTTTTAGGTTCGCAACCACTAGAACAAATTCAGGGAACGGGAACCAGTGGAGTAGATAGTCAATTTTTTACTTTGGGCACAGTGAGAATAACTGGTCTTGAAACAGTTACTGATGATATTATATTTTCTATTACTGGTCAAGTTAGTGGTATAATTGGTCCATTGGAAGATGTTATAGTAAATGTTCCTTTACATGATCATGCATATGTTGCCGCTCTTCCTGATAGTGATGGTGGAGATCCATTAATTAAATGGGGTCCTCCTGCTGGTAGGTCTATGTTTGGTGGTCAAACTGGAACAAGTACTTATAGAAATCAAGTTGGTAGTTCTGATGATATTGCTGGTAAATGGGCAGATTTTATTGGTGGTCTTGGAATTTTTGAAAATGAGATGAAATTGTATTATGGCAATGGTTTTAATTTGAAAAATTGGGCAGCTGAAAATTTGCCAACTAATTGGGAAGTTAATGTGGATGTTCCAAGTGGAGCCATTGGTCAATCTGATTTTGGATCAGAGAATGATGATGCTACAGCAACAGTTGATTTTATGACCTGGTGGATATCTCCTGTTAGTGGTTTATCAGGGGCATCTTTACAATCTACTGGTGCCAATGAACCAAACCCAGCAGCTGCTGTTGTTGATACTGAAACAACTAGATTTACAATTGAGCAATATATTCCCACTAGTGGATTTACAAATGCACATGCTCACTTTCTCACAGAAGATATTGTTCAGAATGCTCAAGTTGATTTTAGTTCCGGTAATAGTGGTGGTGCTGGTACTATTACAGGTGGATTGGGAAATGGCGTGACTCAACTTAACCTCGTATTTACTCAAGCAGATATTTTTATGGATATGACAGATGCGACGTTCAACTGGAATAGTAGTTTTTCTAAACCAACTCCTAGTGTTACAATGACACCACAGATTCAAGTGCCAATTCTCAATCCATTCCATAAGACTAAATATATCATCAAAGCATATTAG

Tertiary structure

PDB ID
5f52f1fdef67951d0d005da50ae247c2cc400a255630e9357d1fa8ec68696b6d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5275
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank