Protein

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Genbank accession
YP_009056823.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,64
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDDTRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPQNPLDGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAAAQSIVDFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQMYVSDYERNAVTVTPATPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDETTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQAETNAGTDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATIRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQAGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNDGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPSWTATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRAADNRVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTIRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138445,98980 Da
isoelectric point:5,06671
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,33007

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–128
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
969–1089
IPR048390 IPR048391
YP_009056823.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-128 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1261 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_PhAPEC2
[NCBI] 		1391224 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Mosigvirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009056823.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_024794 [NCBI]
CDS location
range 148807 -> 152640
strand +
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGATACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGTGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTCAAAATCCTTTAGATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGCGGCTCAAAGTATTGTAGACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAATGTATGTTTCCGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCCACGCCATATCAAGCGCAACCTAATGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGTAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTGGATTTAGACAAATTAAACCCATTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGAAACAACTTCTATACGAGAAGCTGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCCAATAGTTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGCGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCGGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTGGAATTTAATGGTGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACCGTAACCGTTGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACAACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTGGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGCTGAAACTAATGCTGGAACAGATGACACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCTGCTACTATTCGTGGTAATGCTGGGACTAATGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCCCTTGACCAATATAAAGCTACCCCTACTCAGCAGGGTGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCCGGCGAATCACAAGCCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGATGGGACCGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACATTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCACCTAAGAATTTAAAATGGATTGTTCAATCAGAACCATCATGGACTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTTGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAATCTTTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTACTTACCGTTGAAAGCTAAAGCAGCTGATAGTAATTTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAGTATTTGAAGCGGGTGATGAAACCGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTGCTGATAATAGAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGTATTGTTTCTACAAATGGATTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACAGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTACGGTGTTATGCTTTATAACGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAACGCAACAGGCTTAGTTCGTCTTGACAATGGTGTTCAAATCACAAGTGGTGCAACAATAACTACCGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGAATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCCACTGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTCGGTAATAGCTTAGATTCACTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGCATTCGATATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTATTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACAGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
eba45491296a17fe09c2b414e927cb1bf3a7c48690be4f485853552b75cfe31a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5512
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50