Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIX45572.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPLNKLENFIKNTDGRTLYVNPNDLNATDSITNQGTSLTEPFRTIQRALIESARFSYVRGDDNDLIERTTIMVYPGEHPIDNRPGFGIKTVGNSPVAVTPSGELIDPFQAFNLTDASNFDIESSNNVLYRFNSIYGGVVVPRGTSIVGMDLRKTKIRPIYVPNPTDDSVDYSAIFRITGTCYFWQFTIFDGNENGVVFTDPRDFSENNQSRPTFSHHKLTAFEYADGVNPAVESGFELTDLAMYYSKLSNAYNEASGRPIDEKYPSDPGGFSPQRPEFEIVGAFATDPINITRLISGDGFVPDAVITVDTQVPHELNTGTPIKIRGVAISDYNISTKVSAVLSPTRFTYNLSFVRPNLPAEPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNCSMRSVWGINGMHADGAKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVTYNKQARRYDGINVNKTVRGAELSAQSSSTNSATVYHLDPDAIYRPDWGTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFASIGGADASITNSNSNFGQFALKADGFKNDAFLKDDKGFLTSFVSPKSAYNPETDDIEIIDWINIDFDLTRSIAFANQLYLTGYTNAEDKPPVVNQGFRIGANYKESLIQRTTVGAGADVTSSVRMCDNILGPGNNQATGSSVARKVYQVLAGPINNTLSLGVHGLLNGESVRVFSSTGDLPENLERGALYYANVVDGENIRIATSESNALNNIFLNIYGGVELRVESRVNDKEAGERGHPVQYDYTNQNWFVHTDANSDIYQYIVANPTSTDGIDFVSIFKRFGDNRALEDKLYRLRYVIPKESRNAKPPTPGYVLQASATTGARNNDDFILQDIGINDYEYNRNPRYVVSCTVIANEVEVRSEIPHNLNVGDKIKIVNVASTNNTGASQIKGFNGEFLVTRVINSREFRYDITDVNGFSRNPGTFTNNINERNILLPRYERKDLQSNVFVYRIETITDFLEGERDGIYHLFLLNGSNPVTETFTDIQYNQPVEDLYPQMDPDNLIQNPPATTTFAKRAPLGDVTIDEQQNSITKESVDKIYKTLNVGIIETATDGTVGAGGTRTTTLTFQREHEFNSVYSYTTLVGGGGYTDGTFYDVKLLSEFGTVWGGASAVVTVTAGTVTAVTIMDPGSGYSAGQTLFIDGTTIGGGTNATISITQADLEDNKHSILQISGGALYNPDSYVVMTSVEDQSSVGVARTSGSPAIIPGMYAYPADSGTGISSTTYNSDTGLTTLVSTGSAGFGLQRGNTFVVFSSNYSYLGKFFVSNVPTPDTLEFYSYRDLGTVSIVGKTGLDVNDANTGSLGENVGVRATPLYDNGVFYLEQSSGTGTQLTVRAEDGGVAGSVDSKMYLGRYFQMGSEIIRVASKNFDGANNNIVTVIRGALGTVVSNLPINTKVKAIRPSALELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTSLPQLQVKQLPDDEIYLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQSTFDVPIPTVAGQPGSSNNVVFDEVIINRRLFVSGGETNEVQSQFDGPVKFTQSVTIQNNLFVTGTTQLNRIEITSTENATSSANGGALTIRGGAAIGKDFYVGGEMYTNAYQIEDTSAVLEIGTNQSSKDISVGGSTDTDRVVFNTTKLATGEGAEEVVNADAGVVVEGGLVVRDVIIAKEFRGAGTGGGPGTILLWGGSTSALPDRYLLCNGATLNRTTYNKLFEAIGYIHGGSGSSFKLPDLRNRFIPGAGSSYAVAAKGGDDSVVLTQTQMPRHTHSTSAVNAPHTHPVSFTSGAANAPHKHPAGTGGGGNHNHPSGGTGGGGNHNHPSGGSNNTGNHGHPYSAPGQSKTDVANSNEKNVTSNVNASGAGTGGGGAHSHSVSVNSTSSAHNHPVSVNSGSSAHNHPVSVNSANAPHSHPISGNAGSANAPHVHPIGNTGGTDSFDNRPKYYALCYIIQSE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1955 AA molecular weight: 209731,90230 Da isoelectric point: 5,19084 aromaticity: 0,08900 hydropathy: -0,31698
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014f [NCBI] |
1493511 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX45572.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019159.1
[NCBI]
CDS location
range 19428 -> 25295
strand +
strand +
CDS
TTGCCCCTTAATAAGTTAGAGAATTTCATTAAGAATACGGATGGACGTACTCTGTATGTTAATCCAAACGATCTTAATGCTACTGATAGTATTACAAACCAAGGCACTTCCCTTACAGAACCCTTCAGAACTATTCAGAGGGCGTTAATTGAGAGTGCGCGTTTCTCATATGTGCGTGGTGATGATAATGATCTCATCGAGAGAACCACCATCATGGTGTATCCCGGTGAGCATCCTATCGATAACCGTCCTGGTTTCGGTATTAAGACAGTAGGTAATAGTCCGGTAGCGGTAACTCCTTCAGGTGAGTTGATTGATCCGTTCCAAGCATTTAACCTGACTGATGCTAGTAACTTTGATATTGAGTCTAGTAATAACGTTCTCTATAGATTTAACAGTATCTACGGTGGTGTTGTTGTTCCCCGTGGTACTTCTATCGTGGGTATGGACCTACGTAAGACAAAGATTCGTCCGATATATGTTCCCAACCCCACTGATGATTCAGTAGATTACTCAGCGATCTTCCGTATCACAGGTACTTGCTACTTCTGGCAGTTCACCATCTTTGATGGTAATGAGAATGGTGTAGTATTCACTGACCCAAGAGATTTCTCTGAGAATAACCAGTCCAGACCCACTTTCTCACACCACAAACTAACAGCATTTGAATACGCTGATGGTGTCAACCCAGCGGTAGAATCAGGGTTTGAACTCACTGACCTTGCTATGTATTATAGTAAGTTGTCTAACGCATATAATGAAGCATCTGGTCGTCCTATTGATGAGAAGTATCCATCAGATCCTGGTGGTTTTTCACCACAACGTCCTGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTCGCAACTGACCCAATCAATATCACTCGTTTAATCTCTGGTGATGGTTTTGTCCCTGATGCTGTCATCACAGTAGATACACAGGTCCCACATGAACTAAACACTGGAACACCAATTAAGATTCGTGGTGTTGCCATCAGTGACTATAATATCTCTACAAAAGTATCTGCAGTTCTTAGTCCTACTAGGTTTACGTATAACCTATCATTCGTAAGACCTAACCTACCAGCAGAACCTTCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTAACAGGTGCTTCACCATACATCTTTAACTGTTCGATGAGATCAGTTTGGGGTATCAATGGAATGCACGCCGATGGTGCCAAAGCAACTGGATTCCGTTCCATGGTTGTTGCTCAGTTCACCGCGATCTCCCTTCAAAAAGATGATAGATCCTTCGTTACTTATAATAAACAGGCACGTAGATACGATGGTATCAACGTCAATAAGACTGTAAGGGGTGCTGAACTATCTGCACAGTCATCTTCTACTAACTCAGCAACTGTATACCACCTAGATCCTGACGCTATCTATCGTCCTGACTGGGGTACAACTCACATCAAGATGAGTAATGATGCAGTCATTCAGATTGTGTCTGTATTCGCTATTGGTTTCAATCAACACTTTGCTTCTATTGGTGGAGCTGATGCATCAATCACAAACTCTAACTCCAACTTTGGTCAGTTTGCACTGAAAGCTGATGGATTCAAGAATGATGCTTTCCTCAAAGATGATAAAGGTTTCCTAACATCATTTGTTTCTCCTAAGAGTGCGTATAACCCAGAAACTGATGATATTGAGATCATTGACTGGATCAACATTGACTTTGATCTAACTCGTAGTATTGCCTTTGCTAATCAACTCTATCTAACTGGTTATACTAACGCGGAAGATAAACCACCAGTAGTTAATCAGGGTTTCCGAATTGGTGCCAACTACAAAGAGAGTCTCATTCAGAGAACAACAGTTGGTGCTGGTGCAGATGTAACCTCATCAGTAAGAATGTGTGATAATATTCTCGGTCCTGGTAACAATCAAGCAACTGGTAGTAGTGTCGCTAGAAAGGTATATCAAGTTCTAGCTGGACCTATCAACAATACCCTTTCATTGGGTGTTCATGGACTACTTAATGGTGAGAGTGTAAGAGTATTCTCATCAACAGGTGACCTACCTGAGAACCTAGAAAGAGGTGCCCTATACTACGCAAATGTGGTTGATGGTGAGAATATTCGTATTGCTACTTCCGAGTCTAATGCACTCAACAACATCTTCCTCAACATCTATGGTGGTGTTGAACTTCGTGTTGAGTCTAGAGTTAATGATAAGGAAGCAGGTGAAAGAGGTCATCCCGTTCAGTATGACTACACTAACCAGAACTGGTTTGTTCATACTGATGCCAATAGTGATATCTATCAGTATATTGTAGCCAACCCAACCTCTACAGATGGTATTGACTTTGTATCCATATTCAAGAGATTTGGTGATAACAGGGCACTAGAAGACAAACTATATCGCCTCAGGTATGTTATTCCTAAGGAGTCAAGGAACGCAAAACCACCTACCCCTGGTTATGTTCTACAAGCATCAGCAACAACAGGTGCTAGGAATAACGATGACTTTATCCTACAGGATATTGGTATCAATGACTATGAATATAACAGAAACCCACGTTATGTTGTAAGTTGTACTGTTATTGCTAATGAAGTTGAGGTTCGTAGTGAGATTCCACACAACTTGAATGTTGGTGATAAGATTAAAATAGTGAATGTTGCCAGTACAAATAACACTGGCGCATCACAAATCAAAGGTTTTAATGGTGAGTTCCTAGTTACTAGAGTTATCAACTCTCGTGAGTTTAGGTATGATATTACTGATGTAAATGGTTTTAGTAGAAATCCTGGTACCTTCACCAACAACATCAATGAAAGAAACATTCTTCTACCTCGTTATGAGAGAAAGGATCTACAGAGTAATGTATTCGTATATCGTATTGAAACTATCACTGATTTCCTAGAAGGTGAGAGGGATGGTATCTACCACTTATTCCTTCTTAATGGTTCTAACCCAGTAACAGAGACATTCACTGATATCCAATACAATCAACCTGTGGAAGATTTATATCCACAGATGGATCCTGATAACCTTATTCAGAACCCCCCTGCAACCACAACGTTTGCTAAGAGGGCACCCCTAGGTGATGTTACTATTGATGAACAACAGAACTCCATTACTAAAGAGTCTGTTGATAAAATATACAAGACACTTAATGTTGGTATCATTGAGACTGCTACTGATGGCACTGTTGGTGCTGGTGGAACACGTACAACCACACTAACATTCCAAAGAGAGCACGAGTTCAACTCTGTGTATAGTTACACCACACTAGTTGGTGGTGGTGGATATACTGATGGTACTTTCTATGATGTTAAACTACTCAGTGAGTTTGGCACAGTATGGGGAGGTGCTTCTGCTGTTGTTACTGTTACTGCTGGTACAGTTACCGCAGTTACTATCATGGATCCTGGTTCAGGTTATTCTGCAGGTCAGACACTATTCATCGATGGAACTACAATTGGTGGTGGTACTAACGCTACTATTAGTATTACTCAGGCAGACTTAGAGGATAACAAGCATAGTATCCTACAGATTTCTGGTGGTGCTTTGTATAACCCAGATTCATATGTAGTGATGACCAGTGTTGAGGATCAGTCTTCAGTTGGTGTTGCTAGAACTTCTGGAAGTCCTGCTATTATTCCTGGTATGTACGCATATCCAGCAGATAGTGGAACAGGTATTTCTTCAACTACATATAACTCCGATACAGGTTTAACAACACTAGTATCTACAGGTAGTGCTGGTTTTGGTCTTCAGAGGGGTAACACTTTCGTTGTATTCAGTAGTAACTACAGCTATCTCGGTAAGTTCTTTGTATCTAATGTTCCAACTCCAGATACATTGGAGTTCTACTCATACCGAGATCTAGGAACTGTATCTATTGTAGGTAAGACAGGTTTAGATGTAAATGATGCTAACACTGGTTCCTTAGGTGAGAACGTGGGTGTTAGAGCTACACCACTATATGATAACGGTGTATTCTATCTTGAACAGTCTTCAGGTACTGGAACACAACTAACAGTTAGGGCTGAAGATGGTGGTGTGGCTGGTAGTGTAGACTCTAAGATGTACCTAGGAAGATACTTCCAAATGGGTTCTGAGATTATCAGAGTTGCTAGTAAGAACTTTGATGGAGCCAATAACAATATCGTAACTGTTATCCGTGGTGCTCTTGGTACCGTTGTTAGTAACCTTCCCATTAATACTAAGGTGAAGGCAATCAGACCTTCCGCACTAGAACTTAGAAGACCTTCTATTCTACGTGCCTCAGGTCACACCTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCACTTCATTACCACAACTACAGGTTAAGCAACTCCCAGATGATGAAATTTACCTAGTACAGGCTCAGGAACTATCCTGTGGTCAGGTTGTTTATACTGGTATGAGTGATAATGGTGACTTCTATATCGGTAATACCAAGTATTCCGCAACCTCAGGAACACAATCAACCTTTGATGTTCCCATCCCAACTGTTGCTGGTCAACCAGGTAGTTCTAATAATGTTGTGTTTGATGAAGTTATCATCAACCGTCGTCTATTCGTATCTGGTGGTGAAACTAATGAGGTTCAGTCACAGTTTGATGGTCCTGTTAAGTTTACCCAGTCTGTTACTATCCAGAACAATCTTTTCGTAACTGGTACAACTCAACTCAATAGAATTGAGATCACCAGTACAGAGAACGCAACCAGTTCTGCTAATGGTGGAGCACTAACTATCAGAGGTGGTGCTGCTATTGGTAAAGACTTCTATGTTGGTGGTGAAATGTACACCAACGCATATCAAATAGAAGATACAAGTGCAGTTCTTGAAATTGGTACTAACCAGTCATCTAAGGATATCTCTGTTGGTGGTTCAACTGATACAGATAGAGTTGTTTTTAATACAACTAAACTAGCAACAGGTGAAGGTGCTGAAGAGGTAGTTAACGCAGACGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGATTAGTTGTTCGTGA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Tertiary structure
PDB ID
9ca030f7deb20123a0c2134dfd9ae0aad40a77693cff25631a86efe8365572ef
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50