Protein
View in Explore- Genbank accession
- QCQ65467.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQISKYTADKAVTDASITSINESIGNINTALGGINTSLNSKAAKGANNDITELNALTKAITIAQGGTGAKTLDGAKQALQVERLRQQDNGTFVASPSGKYSLFIYNSGDFGLIDSATAAVSAMKVAFGGTGGTTPKDARRSLNVPVGALAEVIPNGEDVLNYVAISGQSGYYSSGELIVNGPPVQMGWWTYNFHCHGVDINGAAQYGVLRAVSLTGSSWINVLDGTGDWRGWQEQFNLQSTIPLTNGGTGANSVEGAKINLGIERFKQTAAETMMYAPGSPYRITARPNGEWGYWRDDNGSWIPLPIAAGGTGGNTPTQVRTNLELTEWGLLPSMSGKYPGGFNFDNLVVNSTFTVPPTPGSNITGVRPFQQVAGLDDGWFYLETLVHPDTGYTMQRATQMTGAWAGSVSIRVKQGGTWSVWKQASANFGLLATPVGNRATFRSSGTATGGSGCLVGGQISGGSFTSWRDRPCGVLVEHETTDAAYAIWKSVKCGVDWISGMDAVMWSAGGAQLSLYCKGAEYRFDSAGAAAAGSWVSTSDIRMKANLQKIDTARDKLKSLVGYTYYKRNKLEEDKDTIYSVEAGVIAQDVQSVLPEAVYKIEPQKEDSMLGVSHAGVNALLVNAVNELSEIVDQQKQEIDELKKLVKQLIDK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 696 AA molecular weight: 73924,12660 Da isoelectric point: 5,76588 aromaticity: 0,08477 hydropathy: -0,18678
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage Seabear [NCBI] |
2565516 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QCQ65467.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK728824.1
[NCBI]
CDS location
range 82823 -> 84913
strand -
strand -
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCAAAATCTGGCGCAATGGCGCCTTACGTTGTAGTTAACAGAGACGCAGCAGTAGCTGGTGTTTTCTCTGTTGATGGAGAAGCTGGTGCTGTTGTACTAACTTCCAAATATCTACAAATATCAAAGTACACTGCTGATAAGGCGGTTACAGATGCTTCTATTACTAGTATTAATGAATCTATTGGAAATATTAATACTGCTTTGGGTGGTATTAACACTTCCCTGAATAGCAAGGCAGCTAAAGGAGCTAATAATGATATTACAGAACTAAATGCTCTAACAAAGGCTATTACTATTGCTCAGGGAGGTACAGGAGCAAAAACACTTGATGGGGCTAAACAAGCATTACAAGTTGAACGATTAAGACAGCAGGATAATGGTACTTTTGTAGCTTCTCCTAGTGGTAAATACTCCCTATTTATCTATAATAGTGGGGATTTTGGACTAATAGATAGTGCTACTGCTGCTGTTAGTGCAATGAAAGTTGCATTTGGTGGTACTGGTGGAACTACCCCAAAAGATGCTAGAAGAAGCCTTAATGTTCCTGTAGGTGCCCTTGCTGAGGTAATCCCTAATGGAGAAGACGTTTTAAACTACGTAGCTATTTCAGGACAAAGTGGTTACTACTCCTCTGGAGAACTTATTGTTAATGGTCCTCCGGTTCAGATGGGATGGTGGACTTATAACTTCCATTGTCATGGTGTGGATATTAATGGGGCGGCACAGTACGGAGTGCTAAGAGCTGTTAGCTTAACCGGTAGTTCTTGGATAAATGTTCTCGATGGAACAGGAGACTGGAGAGGTTGGCAGGAGCAATTTAACCTACAATCTACTATTCCCCTCACAAATGGAGGTACGGGAGCTAATTCAGTAGAAGGTGCCAAGATTAACCTTGGAATTGAGAGGTTTAAGCAAACAGCAGCAGAAACTATGATGTATGCTCCGGGATCTCCCTATAGGATTACAGCTAGACCTAATGGAGAATGGGGTTATTGGAGAGATGATAATGGTAGTTGGATACCTCTCCCTATAGCTGCTGGAGGTACAGGCGGAAATACCCCTACCCAAGTTAGAACAAATCTTGAGTTGACAGAGTGGGGTCTTTTACCCTCTATGTCTGGTAAATACCCAGGAGGATTTAACTTTGATAACTTAGTAGTGAATAGTACATTTACGGTACCTCCTACTCCTGGATCTAATATTACAGGTGTGAGACCTTTTCAGCAAGTAGCAGGCCTAGATGATGGTTGGTTCTATCTAGAAACTTTAGTACACCCAGATACTGGATACACTATGCAGCGTGCTACCCAAATGACCGGAGCTTGGGCAGGTTCAGTTTCAATACGTGTTAAGCAAGGTGGTACTTGGAGTGTTTGGAAACAGGCTAGTGCGAATTTTGGTCTACTTGCTACTCCTGTAGGCAATAGGGCTACTTTTAGAAGTTCAGGTACTGCAACTGGAGGATCAGGTTGTCTAGTAGGTGGTCAGATTTCCGGAGGATCCTTTACCTCATGGAGAGATAGACCATGTGGTGTACTAGTTGAGCATGAAACTACTGATGCAGCCTACGCTATATGGAAGAGTGTTAAATGTGGGGTAGATTGGATCTCTGGAATGGATGCAGTTATGTGGTCTGCTGGGGGTGCTCAACTTAGTTTATATTGTAAGGGGGCTGAGTATCGTTTTGATAGTGCGGGAGCTGCTGCAGCAGGTAGTTGGGTTAGTACTTCAGATATTCGTATGAAGGCTAATCTACAGAAAATAGATACTGCTCGTGATAAACTTAAGTCACTTGTAGGCTATACATACTATAAGAGAAATAAACTTGAGGAAGACAAAGACACTATATATAGTGTTGAAGCTGGTGTTATTGCTCAAGATGTACAGTCTGTTCTTCCAGAAGCAGTATATAAGATTGAACCACAAAAAGAAGATAGTATGCTTGGCGTATCTCATGCTGGAGTCAACGCTCTTCTAGTTAACGCTGTAAATGAGCTTAGCGAAATTGTTGATCAGCAAAAGCAAGAGATTGATGAACTCAAGAAATTGGTAAAACAATTAATTGATAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
df7cccd27971bc64b9865eadafd61ae9757281526b0743e464033339f46216fa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50