Protein

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Genbank accession
QGZ18027.1 [GenBank]
Protein name
putative structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAGYTRQRTIADGNTIAADLFNGEYNALVTAFDVNNGHKHDGTAAEGPVIGLIGDAGLATPLNKILVDTTNDHLEFYVDVSGASTQQFRIEDGAIVPITDNDIDLGTSSLEFKDLYIDGVAYVDSIAMPTTTVTDILDEDNMASDSATALATQQSIKAYVDTQVATVPTGDITSVVAGDGLTGGGTSGDVTLNVVGGTGIDANANDIAIDSTVATLTGSQTLTNKVIDVDNNTVSNIEVDNLKSGVLDTDITSVSSSDDTLASAKAIKTYVDTQVATVPTGDITAVTAGTGLSGGGTTGAVTLNIDSTVATLTDSQNLTNKTLTSPVLDTAISGSAFLDEDNMASDSATKVASQQSIKAYVDAQVATVPTGDITAVTAGTGLSGGGTSGAVTLNIDSTVATLTGSQVLTNKSIDSDNNTITNIVNADIKAAAAIDATKIADGSVTNTEFQFINTLSSNAQTQLDAKQATIDSSNRLNANLIHDGSVDNTEFGYLNGVTSAIQTQINTANTNISNKASNGFAVAMAIAL
Physico‐chemical
properties
protein length:528 AA
molecular weight: 53683,03920 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,03598
hydropathy:0,00985

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC104P
[NCBI] 		2686459 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGZ18027.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN698243 [NCBI]
CDS location
range 40040 -> 41626
strand -
CDS
ATGGCAGGATATACTAGACAACGAACTATTGCAGATGGAAATACTATTGCAGCAGATTTATTTAATGGTGAATATAATGCATTAGTAACTGCATTTGATGTAAACAATGGACACAAACATGATGGTACTGCAGCAGAAGGTCCAGTAATAGGATTAATTGGTGATGCAGGTTTAGCTACACCTTTAAACAAAATTTTAGTAGATACAACTAATGACCATTTAGAATTTTATGTAGATGTATCTGGTGCATCAACACAACAATTTAGAATTGAAGATGGTGCTATTGTACCTATAACAGATAATGATATAGATTTAGGTACATCAAGTTTAGAATTTAAAGATTTATATATTGATGGTGTAGCTTATGTAGATTCAATAGCTATGCCTACAACTACAGTTACAGATATATTAGATGAAGATAATATGGCATCTGATAGTGCAACTGCATTAGCAACTCAACAATCAATTAAAGCATATGTTGATACTCAAGTTGCAACAGTACCTACAGGAGATATTACTTCAGTAGTTGCTGGTGATGGTTTAACAGGTGGTGGAACATCTGGTGATGTAACATTAAATGTAGTTGGTGGTACAGGTATTGATGCTAATGCAAATGATATAGCAATTGATTCTACAGTTGCAACATTAACAGGTTCACAAACTTTAACAAATAAAGTTATTGATGTAGATAACAATACAGTATCTAACATTGAAGTTGATAATTTAAAATCTGGAGTATTAGATACAGATATAACTTCAGTATCTTCTTCAGATGATACACTTGCTTCTGCAAAAGCTATTAAGACTTATGTAGATACACAAGTAGCAACAGTTCCTACTGGAGACATAACTGCAGTTACAGCAGGTACAGGTTTATCTGGTGGTGGTACAACTGGAGCTGTAACTTTAAATATAGATTCTACTGTAGCGACTCTAACAGACTCTCAAAATTTAACAAATAAAACTTTAACGAGTCCAGTTCTAGATACAGCTATTAGTGGTAGTGCTTTCTTAGATGAAGATAACATGGCATCTGATTCAGCTACTAAAGTTGCATCTCAACAATCTATTAAAGCTTATGTAGATGCTCAGGTAGCTACAGTTCCAACAGGTGATATTACAGCAGTTACTGCAGGTACTGGATTATCTGGAGGAGGAACTTCAGGAGCAGTAACTTTAAATATAGATTCAACAGTTGCTACTTTAACTGGTTCTCAAGTTTTAACAAATAAATCAATAGACTCAGATAATAATACAATTACTAATATAGTTAATGCAGATATTAAAGCTGCAGCAGCTATTGATGCTACTAAGATAGCAGATGGTAGTGTAACAAATACAGAGTTTCAATTTATTAATACTTTATCATCTAATGCTCAAACACAGTTAGATGCTAAACAAGCAACTATTGATTCGTCTAATAGATTAAATGCTAATCTAATACATGATGGTTCAGTAGATAATACAGAATTTGGATATTTGAATGGTGTAACTTCTGCTATTCAAACTCAAATAAACACAGCCAATACAAATATCAGTAATAAAGCTAGTAATGGTTTTGCTGTTGCAATGGCTATTGCATTATAG

Tertiary structure

PDB ID
33bcfffd1406e6978bc05f5f0a74c44e47f21e415416a0050c83da8acbc99254
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6835
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Novel pelagiphages prevail in the ocean Zhang,Z., Qin,F., Chen,F., Chu,X., Luo,H., Zhang,R., Du,S., Tian,Z. and Zhao,Y. 2019 — GenBank