Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIR93428.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAKLGISTGTTPNDGSGDSLLDGAVKVNSNFDEVYNKIGDGTDLFVGIVSSITVSGPLSISTTFGAPVITGLANTANINATNFQVTGVGTITGTTRLAGINTFSAAGYTVAGLVTASNIISNETIKVAGIVTTSEDGINVSAAVTARSLAIQDVTQTSHFVGLNTVFIDHTGVGATAINITDTATIGFGSISSANITTINANTANINSGILTTATVGTAITIHSKGIDAGQAGIITASRLFGAVTGAVTGTASSATEADLAYGLTGTPSIVVGVATLGGHIFNAPGAFISGILTATSFSVGTNEIVSSARQLKNIATLDATTKLTIENAISDPPNDFDDLNVVGLATVNRLFISGDTRGLNILGVTTGLSAPGITTLGIITGATSLQATDVYSNFLHGDGSNISNVTGGVTVQDEGSALSTVATTLNFVGSGVVASGSGATKTITISGGGGGGSIAGISTTGTSGFNQLNVTGVSTFGANIDLNANIDVSGSSTLHNGLVVNGGIVDINHQIVGLATDNVIPFYYANVSDFPSASTYHGAVAHGHNTGLLYFAHAGAWLELVSKDSSGVVNKIVVGAAVTIDQNNIDTVGIITASEFHGDGSNLTGITGSTVAGISTTGTSGFNQLSISGVSTFTGNIDANGALDVDGQTDLDVVNVAELATFSSRVQVGTGLTLDQNNIDAGSYVGIITAKEFHGDGTNVATSRWAVTNASSNHYVFNGPGNLVNANDPTIYLARGQKYEFDINASGHPFRIQTSSGASGYNSGNEYTTGITNVGAASSLLTFDVPFDANNTLYYVCQNHSSMNGTIIIYPSI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 814 AA molecular weight: 81821,29990 Da isoelectric point: 4,48951 aromaticity: 0,06143 hydropathy: 0,24988
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Prochlorococcus phage P-TIM68 [NCBI] |
1542477 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Prochlorococcus sp. [NCBI] |
1220 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIR93428.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM359505
[NCBI]
CDS location
range 75788 -> 78232
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAATTAGGAATTAGTACAGGAACCACGCCCAATGATGGATCAGGTGACAGTCTGTTGGATGGTGCTGTTAAGGTTAATTCAAATTTTGATGAAGTCTATAATAAAATAGGAGATGGGACAGATTTATTTGTTGGAATTGTTAGTTCTATTACTGTATCAGGACCTTTAAGTATAAGCACTACTTTTGGTGCACCTGTCATAACTGGATTAGCAAACACTGCAAATATAAATGCAACCAACTTTCAAGTAACTGGTGTAGGAACAATAACAGGAACAACAAGGTTGGCAGGTATCAATACATTCTCTGCTGCTGGATATACTGTGGCAGGTTTAGTAACTGCGAGTAATATAATATCAAATGAGACTATTAAGGTAGCAGGTATAGTTACAACATCTGAAGATGGTATAAATGTATCAGCTGCTGTAACTGCTAGATCACTAGCAATTCAGGATGTAACTCAAACCTCTCATTTTGTTGGTTTAAACACTGTATTCATAGATCATACTGGTGTTGGTGCTACTGCTATCAATATAACTGACACTGCAACCATAGGATTTGGATCTATATCTAGTGCAAACATCACTACTATAAATGCAAACACAGCAAATATAAACAGTGGTATATTAACAACTGCCACAGTTGGAACAGCAATTACTATACATTCAAAAGGAATTGATGCAGGTCAAGCTGGTATCATAACTGCAAGTAGATTATTTGGTGCTGTAACTGGTGCTGTAACTGGAACAGCATCCTCTGCTACTGAAGCAGACTTAGCATATGGGTTAACAGGAACACCTAGCATTGTTGTAGGTGTTGCAACTCTTGGTGGACATATATTCAATGCACCTGGTGCCTTTATATCAGGTATTCTTACTGCTACTTCATTCTCTGTTGGTACTAATGAGATTGTAAGTAGTGCTAGACAATTAAAAAATATAGCAACCTTAGATGCTACAACCAAACTTACAATAGAAAATGCCATATCTGATCCTCCAAATGATTTTGATGATTTAAATGTAGTAGGTCTTGCCACTGTCAATAGATTGTTCATAAGTGGAGATACAAGAGGTTTAAACATTCTTGGTGTCACCACTGGTTTAAGTGCACCAGGTATTACAACTCTTGGTATTATTACAGGTGCCACATCATTACAGGCAACTGATGTTTATTCAAACTTTTTACATGGTGATGGATCTAATATCTCAAATGTCACTGGTGGTGTTACTGTTCAAGATGAAGGAAGTGCATTATCAACTGTTGCAACCACATTAAACTTTGTAGGATCTGGTGTAGTGGCATCTGGATCTGGTGCGACTAAAACAATTACTATCTCTGGTGGTGGAGGTGGTGGTAGTATTGCTGGTATCAGTACTACAGGAACATCTGGATTCAATCAACTCAATGTAACTGGGGTATCAACCTTTGGTGCTAATATTGATCTCAATGCAAATATAGATGTCAGTGGATCATCAACTCTTCATAATGGATTGGTTGTAAATGGTGGTATTGTTGATATTAATCATCAGATAGTTGGTCTTGCAACAGACAATGTAATTCCATTCTACTATGCTAATGTAAGTGATTTCCCATCTGCATCTACATATCATGGTGCAGTTGCTCATGGACATAATACTGGTTTACTATATTTTGCACATGCTGGTGCTTGGTTAGAATTAGTCAGTAAAGATAGTAGTGGAGTGGTCAATAAGATTGTAGTTGGTGCTGCTGTTACTATTGATCAAAATAATATTGATACTGTAGGAATTATAACTGCTTCTGAATTTCATGGTGATGGTTCAAACTTAACTGGTATCACTGGTTCAACTGTTGCAGGTATCAGCACTACAGGAACATCTGGATTTAATCAACTAAGTATTTCTGGAGTTTCCACATTTACAGGTAATATAGATGCTAATGGTGCCTTAGATGTTGATGGACAAACTGATTTAGATGTAGTTAATGTTGCTGAACTTGCTACATTTAGTTCAAGAGTTCAAGTTGGAACTGGTCTTACACTTGATCAAAATAATATTGATGCTGGTTCTTATGTTGGTATTATAACTGCCAAAGAGTTTCATGGTGATGGAACAAATGTGGCAACATCTAGATGGGCAGTGACAAATGCTAGTTCAAATCATTATGTGTTCAATGGACCTGGTAATTTAGTTAATGCTAATGATCCAACTATATACCTTGCAAGAGGTCAGAAGTATGAATTTGACATTAATGCTAGCGGTCATCCATTTAGAATACAAACTAGCTCTGGTGCATCAGGTTATAATTCTGGAAATGAGTATACTACTGGTATTACTAATGTAGGTGCTGCATCTAGTTTGCTTACATTTGATGTTCCATTTGATGCTAACAATACTTTATACTATGTTTGTCAAAACCATTCTAGTATGAATGGAACTATTATCATCTATCCATCAATATAA
Tertiary structure
PDB ID
8822b2a3c647f84c8ee79e24f003d3c16b1889a9a67d81f9a1375f59d636e90e
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50