Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009797744.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTFTF
- Protein sequence
-
MSRSAFVEVNITNPTRLAQDSQDTADKAVRGVENLNDPNMMNVIEKQNNIVQFAGLTSQYNVLVQNAKDEGIDITAVTTAYNNLNIFMADILADPDHASDIDRARYKKYQDAYNEELAKLQNALQNNTNDKFTSAASAISQAASTANVAKSAADSAYTYANSEIAVQSTATAKAQSAADGAFSQAQVIGSQADSAIAAQSTATAKAQSAADSALAKAEEVDGKTSAEIAKQSAATAKAQEAATSALDKAQSAADYTDEQIASQASAVSEVSKTAAEASSKANSALDTANGANAEIVKLRGGSTVTIAQLEDGLGTKVSNDTFDSYQTQTASQFAQTVKEADFKTYQTQTSELIESKVDNGTYQTDKTQTAEAIASKVSSGEFETYQAQTDKALSSKVSSSDYKSDREQTASQIADKVSNGEFSTYKTQTDELIGSKVDNGDFKTYQTQTAELINSKVDNGTYQSDKTQTANQIASKVSSADFNSYKSQTDKAIISKVESKDFQTLQTQVNNSTVGTNLFSQSTATSGYIDSGTGNVDPASSFQNEIASDYIPVSASSAYTFQMWGTTPKGNYYWYGIGQYDSDKKFISRPSGAGATQSADTTEHVSKTLTTTSATAYVRVSFRKYNDFKAKFEKGSVATDYSVNPEDQATNSQITQLSGQIDQKVSSGDFNSYKTQTDELIGQKVDNGAFKTYQNQTAELIASKVDNGTYQSDKTQTANAIASKVSSDDFKTYQTQTDKLIDSKVDNGTYQSDKTQTANQIADKVSNGAFNTYKTQTDKLIAEKVSNGDFSTYKSQTADLISQKVATKDFEAYQTTTAQQIASKVTSTDFNSYKSQTDNAILSKVSKKDANNVNLIPYSSNFSDSLEGWQLMAWGATDKQLLAVTHNFYQNGTGKLLQLYTAQNATSAAGSLRFSVLPNTKYTFQFKAFASSNVVGANVYFLSRAYGSTKDYDTVHGLFTSLVTSPSHIDQYTVTFTTGANDNEGYIRVDNIGSNNGASSGLFFTELKMEPGDTATPYVYGGQDSMISQMSDNINLRVTKDGLLDQINLQAGKTLISSSGQLTLSANSVFLDSANPVIMKSANIDTLLVGKKLTAADIAANTFTTNNGTFTVSQNGAITAKDMTLNGGKLYSPTINAGTITGVTINGATFHGGDVINNQHNTSHFYPMTIESNGTYKTTFYDQMVGLQSIIESGGLQHKFRSMVAGSDGHFTAYNSALDGQGFHSQSGYTTSKDSDFNKPQTITGYVDVTPATGIYLYGPTQQINFAGKSGNIGSNGMTMDAYGNIRGQSDSAWWRIGDVNGNQIINFGIDKAGSNYTEFKRNIQVGNIGINTAHSITMQDGKGLYINSGKGGRADLNVASLNYQGSVSKSLLSEKKGVKKTDTAYWAQLVNSIDLATYQYKDDDNTSNLRLSGIVDDVNEDKQWNLPDIFVARDEDGKLSGIENIVLQNAMLATIQEQQKEIDKLNGHLLELEAKLNG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1479 AA molecular weight: 158955,82880 Da isoelectric point: 4,93433 aromaticity: 0,08316 hydropathy: -0,53394
Domains
Domains [InterPro]
DC_0336
RBD
1–210
RBD
1–210
Coil
Unmapped
103–130
Unmapped
103–130
Coil
Unmapped
1456–1476
Unmapped
1456–1476
1
1479
Architecture
RBD 1-210 | STR 313-1479
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Lactobacillus phage Satyr [NCBI] |
2070201 | Uroviricota > Caudoviricetes > Tybeckvirinae > Maenadvirus satyr > |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009797744.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047918.1
[NCBI]
CDS location
range 50514 -> 54953
strand -
strand -
CDS
ATGTCACGAAGCGCATTCGTTGAAGTTAATATCACCAACCCTACTAGACTAGCGCAAGATTCACAGGATACTGCCGACAAGGCGGTTAGGGGCGTTGAAAACTTAAATGACCCTAATATGATGAACGTCATTGAAAAACAAAACAATATCGTACAATTCGCCGGTTTAACATCTCAATATAACGTTCTCGTTCAGAACGCTAAAGATGAGGGAATTGATATAACCGCCGTAACTACGGCATATAACAATTTAAACATATTTATGGCCGATATTCTGGCAGACCCTGACCATGCTAGTGATATTGACCGTGCAAGATACAAAAAGTATCAAGACGCTTACAATGAAGAATTAGCAAAGCTTCAAAACGCTTTACAAAATAACACAAACGATAAATTCACCAGTGCCGCGAGTGCCATAAGTCAAGCGGCCTCAACAGCTAATGTTGCTAAATCAGCCGCAGATAGTGCCTACACTTATGCCAATTCAGAGATAGCTGTACAATCAACAGCTACTGCTAAGGCTCAAAGTGCCGCTGACGGCGCATTTAGCCAAGCCCAAGTGATTGGTAGTCAAGCCGATTCAGCAATAGCCGCGCAGTCCACAGCTACCGCTAAAGCTCAAAGTGCGGCCGATAGCGCTCTTGCTAAGGCCGAAGAGGTTGACGGCAAGACTAGCGCTGAAATCGCTAAACAATCTGCGGCCACTGCTAAAGCACAGGAAGCGGCTACCAGTGCTCTTGATAAAGCACAATCAGCCGCTGATTACACCGATGAACAGATTGCTTCACAGGCAAGTGCTGTGTCAGAAGTTTCTAAAACTGCCGCCGAAGCTTCATCAAAAGCCAACAGTGCTCTTGACACGGCTAACGGTGCTAACGCTGAAATTGTGAAGTTAAGGGGCGGCTCAACCGTAACCATTGCACAACTAGAAGATGGTTTGGGCACAAAGGTTTCTAATGACACGTTCGATTCATATCAAACACAAACCGCCAGTCAGTTTGCTCAAACGGTTAAGGAAGCCGACTTTAAAACTTACCAAACTCAAACCAGCGAGTTAATTGAATCCAAGGTTGACAACGGAACCTATCAAACTGATAAAACACAAACTGCCGAAGCTATTGCTTCTAAGGTTTCCTCTGGTGAGTTTGAAACTTATCAAGCCCAAACTGATAAGGCACTTTCAAGCAAAGTTTCGAGTTCCGATTACAAATCTGACAGAGAACAAACCGCCAGTCAAATTGCAGACAAAGTAAGCAATGGCGAGTTCTCAACATATAAAACACAAACTGACGAGTTAATTGGAAGCAAGGTCGATAATGGCGATTTTAAGACCTATCAGACACAAACTGCCGAATTAATTAACTCAAAGGTTGATAATGGCACCTATCAGTCAGATAAGACACAGACAGCAAACCAAATTGCCTCAAAAGTATCTTCTGCCGACTTTAATTCATATAAGTCACAAACTGATAAAGCAATTATTAGTAAGGTTGAATCTAAGGATTTTCAAACATTGCAAACACAGGTGAATAATAGCACAGTTGGAACCAACCTGTTTTCGCAATCAACGGCTACATCTGGGTATATAGATAGTGGAACTGGAAATGTTGACCCAGCTTCTTCTTTCCAGAATGAAATAGCGTCTGATTATATTCCGGTGAGTGCTAGTTCTGCCTACACTTTTCAAATGTGGGGCACTACTCCGAAAGGAAACTACTACTGGTATGGCATTGGACAATACGACTCTGACAAAAAATTTATTTCACGGCCTTCTGGAGCTGGGGCTACGCAATCTGCGGATACAACAGAACATGTATCTAAAACTTTAACCACCACTTCTGCCACGGCATATGTTAGAGTATCTTTTAGAAAATATAATGATTTTAAAGCTAAGTTTGAAAAAGGTAGTGTAGCTACTGATTATTCGGTCAACCCCGAAGACCAAGCTACTAACTCTCAAATCACACAGTTGAGTGGTCAGATAGACCAAAAAGTAAGTAGCGGCGACTTTAATTCTTACAAAACTCAAACCGATGAGTTAATCGGACAGAAAGTTGATAATGGTGCTTTTAAGACTTACCAAAATCAAACCGCAGAATTGATTGCGTCTAAAGTCGATAATGGAACTTATCAATCCGATAAAACACAGACGGCTAACGCTATCGCTTCTAAAGTGTCCTCCGATGACTTCAAGACTTATCAAACGCAGACTGATAAATTGATTGATTCTAAGGTCGATAATGGCACTTATCAATCAGATAAGACGCAAACCGCTAACCAAATTGCAGATAAGGTAAGCAATGGCGCCTTTAATACCTATAAGACACAGACGGATAAATTAATTGCCGAAAAAGTAAGTAACGGCGATTTTTCAACTTACAAATCACAAACGGCTGATTTAATTTCTCAAAAGGTAGCTACCAAAGACTTTGAGGCTTATCAAACTACAACTGCTCAACAGATTGCCTCGAAAGTTACATCTACGGACTTTAATTCATATAAATCGCAAACTGATAACGCGATTTTAAGCAAGGTTTCTAAGAAAGACGCTAACAATGTTAATTTAATACCTTACTCTAGTAATTTTTCAGATTCATTAGAAGGTTGGCAGTTAATGGCGTGGGGCGCAACTGATAAGCAACTATTAGCAGTGACCCATAACTTCTATCAAAATGGAACTGGAAAGCTATTACAACTCTATACAGCACAAAATGCAACTTCTGCCGCTGGTTCATTGCGCTTTTCAGTATTACCAAACACTAAATATACGTTCCAATTTAAAGCATTTGCCTCGTCTAACGTTGTTGGAGCTAATGTATATTTCTTATCACGTGCTTATGGTTCTACTAAAGACTACGACACCGTTCACGGACTATTCACGAGTTTAGTGACTTCTCCATCGCACATTGACCAGTACACAGTTACATTTACAACTGGGGCCAATGATAATGAAGGTTATATCAGGGTCGATAATATAGGTTCTAATAACGGAGCTTCTTCTGGTTTGTTCTTTACTGAACTAAAGATGGAACCCGGTGACACTGCGACACCTTATGTATATGGTGGTCAAGATTCAATGATTTCTCAGATGTCTGATAATATTAATCTTAGAGTTACTAAAGATGGTTTGCTTGACCAGATTAATCTTCAAGCTGGTAAAACTTTGATTTCATCTAGTGGTCAACTGACATTGTCTGCCAATAGCGTTTTCCTTGATAGTGCTAACCCCGTTATTATGAAAAGTGCTAATATCGACACGCTCCTTGTTGGCAAAAAATTGACAGCGGCTGATATTGCGGCTAACACTTTCACGACCAACAATGGAACTTTTACGGTAAGCCAAAATGGTGCGATAACGGCTAAGGATATGACGCTTAACGGCGGTAAATTGTATTCGCCAACAATAAATGCCGGTACAATTACCGGCGTAACCATCAACGGTGCAACTTTCCACGGTGGGGACGTTATCAATAACCAACACAACACTTCTCATTTTTATCCAATGACCATTGAGTCTAACGGAACATACAAGACAACGTTCTACGACCAGATGGTTGGGTTACAATCAATCATCGAATCTGGGGGGTTGCAACACAAGTTCCGCTCAATGGTAGCCGGTAGTGACGGACACTTCACCGCTTATAATTCGGCATTGGACGGTCAAGGATTCCACTCACAGTCTGGATATACAACATCTAAGGATTCAGACTTCAATAAGCCGCAAACAATCACGGGTTATGTTGATGTGACGCCAGCCACAGGAATCTATCTATATGGGCCAACACAACAAATAAACTTCGCTGGTAAATCCGGTAATATTGGTAGCAACGGAATGACTATGGACGCGTATGGTAACATACGTGGACAATCTGATTCTGCTTGGTGGCGGATTGGTGACGTTAACGGCAATCAGATTATTAACTTTGGTATTGACAAGGCTGGTTCAAACTACACTGAATTTAAACGTAATATACAGGTTGGTAATATTGGTATTAACACCGCTCATTCTATTACTATGCAAGATGGTAAGGGACTTTATATCAACTCAGGTAAAGGTGGAAGAGCTGACTTAAATGTAGCTAGTCTAAACTATCAGGGGTCTGTATCTAAATCGCTGTTATCTGAGAAGAAGGGCGTTAAAAAGACTGATACAGCTTATTGGGCGCAGTTAGTTAACTCAATCGACCTAGCAACCTACCAGTATAAAGATGATGATAATACCAGCAACCTTAGACTATCAGGGATTGTTGATGATGTTAACGAGGACAAGCAATGGAATCTACCAGACATCTTTGTTGCACGTGATGAAGATGGAAAGCTATCCGGTATTGAGAATATCGTACTTCAAAATGCTATGTTAGCAACTATACAAGAACAACAAAAGGAAATTGATAAGCTAAACGGACATTTATTAGAATTGGAGGCAAAATTAAATGGATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7a61ec8d77a108ad83ff73d8831a0b6c5cfb5767911f3208ae48e76ca08382ed
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains | Kyrkou,I. and Hestbjerg Hansen,L. | 2018-12-03 | — | GenBank |