Protein

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Genbank accession
WCD43927.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAAVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSASAINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVTANSVLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGELDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGAATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIIRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140129,68370 Da
isoelectric point:5,54751
aromaticity:0,07215
hydropathy:-0,32793

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
IPR048390 IPR048391
WCD43927.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage ECML-363
[NCBI] 		2910939 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCD43927.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL631483 [NCBI]
CDS location
range 147695 -> 151564
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGTTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGATGGAGAGCGTTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAATCAGGCGAATCGATTTCAGTTAACACTGCAGCGGGTAATGACATTACATTTACTTTGCCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAGGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAACTTTAGAGGTCAACAAGTACGCTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCGGCAGTTGTAACGCCAGCGAGTCTTTATCAAGCGCAATCAAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCTGCTTCAGCAATTAATATTAAACTTCCTAGATTTGCTAATCATGGGGATATTATTAATTTTGTTGATTTAGATAAATTAAATCCGTTATATCATACTATCGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCTATTGATGGTTTCTTAATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCAACTGATATTTCTATCGGTGATACTGTTAAGATTTCCATGAATTATATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTTCCAAAACGTTCAGAATACCCACCTGAAACTAAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAATGGCGAAACCAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATTGAAGATTCCGATGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAGGCTCAAGCTAATGCTGATCTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAACTGGCAATTACTCCAGAAACGCTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACAACTGCGCAAGTAAACCAGGATACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGTTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTCGCAGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATTACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGCCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCGGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAACTTAGTTGTTTCACCTAAAGCCTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAGCAAGGTGCGGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACTCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCTGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCACAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGGCTGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTACAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTTGTCGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATACGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTACAGCAAATAGTGTACTAACGATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGATTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCAGCCCAAACGATGACTGTTAGAGTGTGGGGAAATCAATTTAGTGGGGAATTAGATACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGCGCAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTATTCGCAACGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTCAATGGATTACGCCCATTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATCGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCTGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACTTATATACACGCGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGTCTTCCATATTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTATCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
b0b03bc1b370ce1a7254b50d800d31d1c19618df14d1c765a7a364845044a554
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5582
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Virulent bacteriophages provide an effective reduction of big-seven Shiga-toxin producing Escherichia coli on various foods Vikram,A., Woolston,J., Hickey,S. and Sulakvelidze,A. 2023-09 — GenBank