Protein
View in Explore- Genbank accession
- ANZ51423.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIVESGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYINESGDSKYWTFRRDGGFTVDGGGLGVSGGSITTSGNIAALGNITSPQINTKNIILDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKAIFGRSEDQGGTWTMPGTNAAFLSVQTQADENTAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGSNNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSETALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDTKLVVVTSHSRISPNYRMQVGQAAYIDAECTDTVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNINRTDTSTYVPILKQRYVQGNSCYSLGTLINGGNFRVHYHEGGDGSSTGAIIKDLGWEFTRSGDFISPKRISAGGSVYLGTDGNITGGSGNFANLNSTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDVGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNNTGAHTHSLSGSTNTAGAHSHTSALYAGSNNSPGTGSIRGSAGGGNTLGTSSSGAHSHSISGTAASAGAHAHTVGIGAHTHTVGIGAHTHTVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1073 AA molecular weight: 112699,07650 Da isoelectric point: 8,50211 aromaticity: 0,07922 hydropathy: -0,35322
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Enterobacteria phage GiZh [NCBI] |
1651199 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ANZ51423.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT184311.1
[NCBI]
CDS location
range 36794 -> 40015
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATCGATTTAAGCATTTCTGCTGGTGGTAATATCAGTGGTAATATTACTCAAACTGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGTCCGCAAATTGTAGAAAGCGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACATACTGCGAAAGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATCAATGAATCTGGCGATTCGAAATATTGGACGTTTCGACGTGACGGCGGATTTACTGTTGACGGTGGAGGTTTAGGAGTATCAGGAGGTAGTATAACTACATCTGGAAATATTGCAGCTCTCGGAAATATTACTTCGCCTCAGATTAATACTAAAAATATTATTTTAGATACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACCGGTGAAGAAAACGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACCGGTAAAAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACTGACGAAAATACTAACAACTATGGTTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCGTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCGATATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACGAACGCTGCCTTTTTATCAGTTCAAACACAGGCTGATGAAAACACTGCTGGAGACGGCCAGACGCATATTGGCTATAACTCAGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAGGAAGGTATGGAAGTTAATCCGGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAATGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGTCAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTAAAAATTGGTGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAACAGCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCCGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCACTTAGTATTAGTCTTAATAATGGTATGGTACAAATGCGCCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGCGCTGGCGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATACCAAACTTGTTGTTGTTACTAGTCATAGTCGTATTTCTCCTAATTACCGTATGCAGGTAGGACAAGCAGCTTATATTGATGCTGAATGTACTGACACCGTTCGCCCGGCTGGCGCAGGGTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTAATCGCACAGATACAAGTACTTACGTTCCTATTTTAAAACAACGTTATGTTCAAGGAAATAGCTGTTATTCTTTAGGTACTTTAATAAATGGCGGTAACTTCAGAGTTCATTATCATGAAGGTGGAGACGGAAGTTCAACAGGCGCAATTATAAAAGATTTAGGCTGGGAATTTACACGTTCTGGTGATTTTATATCTCCTAAGCGCATTTCTGCTGGGGGTTCAGTTTATTTAGGTACAGACGGTAACATTACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCCAACTTAAATAGTACAATTGAATCACTTAAAACTGATATTGTTTCAAGTTATCCTATTGGAGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGTTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGCGGGCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGTCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACGGATTTGGGTACTAAGACCACATCAAGCTTTGACTATGGTACTAAGACGACAAGTAGTTTCGACTATGGTACTAAGACCAGTAATAATACTGGTGCTCATACGCATAGTTTGAGCGGTTCCACAAACACCGCCGGTGCGCACAGCCACACAAGCGCTCTTTATGCGGGAAGTAACAACTCTCCTGGTACTGGTTCTATAAGAGGATCCGCCGGTGGTGGTAATACGCTTGGAACTTCTTCTTCTGGGGCACATTCGCACTCTATATCTGGTACTGCTGCAAGCGCAGGCGCTCACGCGCATACTGTTGGTATTGGTGCTCATACCCATACTGTAGGTATCGGTGCTCATACCCACACGGTAGCAATTGGCTCGCATGGTCATACTATCACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATTGTTCGTTTAGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
f9cde55d9888730f7693394cb56e7f6cea45d757c26ab6fb048abc1bea1bdea7
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Identification and characterization of nine bacteriophages able to infect non-O157 STEC | Farrokhzad,K., Applegate,B.M. and Zhang,J. | 2017-12 | — | GenBank |