Protein

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Genbank accession
WNV47113.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MLINILDVNLQKVAFLSNDVPGLPNYYDDEFHEYRDQGAATFKFTVKKVINNKLQSYARFLNGQSYFSFQIDGNDYLMTPASEQAIHETSEEISFFCVSLDRELMSEQANPLVNTSSHNIQWYFDQMGLISNTQITIGINEVSNLTRTINYDGQETKLARLISVIGNFDAEFEFITKLNNDGSLNSVTLNIYKENDGLNIQGVGKKRDDVRLIFGENIQAVERDVSTEGFLNATTVTGADNLNWNSASFSYINADGVEEFYKRAGSDTAFAPLSAKIYPAQLSKDKDDIWTRIDFTTEYKSVNDMWAYAVRQFKQYAYHQVSYTVTPSSKLVNAEIGDGPPLAKGDTVIIQDNNYIDIDGNVGLLLSARVSEKIVSETHPENNKLIFSNYKKLKSEVSTDIQAIVNQLVDAATPYRAELTTTNGTQFKNGTGSTTLAAHIFKGSATTETITDSYEWSKDGTVVANVQEITVDASGVSDKAVYSFKATVAGKVVASQSVTITNVDDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGINSTTITYAISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGHDGIAGKDGVGITATTITYAQSTSGTTAPSSGWTTSVPTVPAGQFLWTKTVWSYSDKTSETGYSVAMMGAKGDKGDQGVQGIQGVDGRQGIPGPKGADGKTQYTHIAYANSADGVTDFSTSDSNRAYIGMYVDFNINDSTTPSDYSWTLVKGADGTQGTPGKPGADGKTPYFHTAWSYSADGKDRFTTVYPNLNLLDGTRNFSGTWTNSSSWVTDGTYKGLTVKKRTGQWNGIYKTFTAPKDGIYTFSAYVKGSGIDSKIYRFLSVNGVVNGTVMPDTLIGNNFDWLRDSFTVTLKANDVVYAKYEIVGSGTDSILWTAGHKWEEGSTATPYMPSASEVTTADWPSYIGQYSDFTQADSTNPSDYTWSLIRGNDGKDGDMGKSVWSYPYDRGANRLGSWWSDLKPTPTTDNPPKVGDTIIDLVGKIYQITNVVVDSTIGGGGLFDYGPMLTSIKGADGSPGKDGIAGKDGVGLKSTIITYGISASDSTMPGTWSQNTPALVKGQWFWTKTQWTYTDNSTETGYQKTYISKDGNNGHDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPNTGWTTTVPTVAAGNYLWTKTVWDYTDKTSETGYSVAKMGNNGTPGPQGPPGSNGDPGKTVSNTEPTTRFKGLTWKYSGTTDLTASDRTVIKPNTEYYYNGTHWVINYFSVNNFAAESITSDKIDGKNLTITDGEFISKTSNGPVTTSTEIKDNHIAISKKDGTVNTRNDIALDSEQGLAQKFTNINTGFYRTAGINYQGPFTSDSDGNYAQLTPQGTKLSTDVPWTKLSLMNNFNGNIEYAIINGTVYISASGVGVPAMTAGQWKQAAQLPTGSSAIPIRANRIAAGDSGDGLSWALLSNQAGGIFIRCSANKAPTPNLFNATLPYPIG
Physico‐chemical
properties
protein length:1554 AA
molecular weight: 167890,95910 Da
isoelectric point:5,09024
aromaticity:0,10489
hydropathy:-0,46030

Domains

Domains [InterPro]
PTHR24637
576–828
PTHR24637 IPR008983
G3DSA:1.20.5.320
729–782
G3DSA:1.20.5.320 IPR008983
WNV47113.1
1 1554
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage D7893
[NCBI] 		3077244 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNV47113.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR480988 [NCBI]
CDS location
range 34048 -> 38712
strand +
CDS
GTGTTAATTAATATTTTAGATGTAAATTTACAAAAAGTTGCATTTTTGAGTAATGATGTTCCTGGGCTTCCGAATTATTATGATGATGAGTTTCATGAATATCGTGATCAGGGAGCCGCTACTTTCAAATTTACAGTAAAGAAAGTTATCAATAACAAGCTACAATCATATGCTAGATTCCTAAACGGACAGTCATATTTTAGTTTTCAAATTGATGGGAATGATTATTTGATGACCCCTGCTTCTGAACAAGCAATCCACGAAACAAGTGAAGAAATTTCATTCTTTTGTGTCTCTCTTGATAGAGAACTGATGAGTGAACAAGCTAACCCACTTGTTAATACATCAAGTCATAATATCCAGTGGTATTTTGACCAAATGGGATTAATATCAAACACTCAAATTACAATCGGAATCAATGAAGTTTCTAATCTGACACGAACCATTAATTATGATGGACAAGAAACAAAACTGGCCCGTCTAATATCTGTGATTGGAAACTTTGATGCAGAGTTTGAATTTATTACTAAGCTTAATAATGATGGTTCTCTCAATTCTGTTACACTCAATATTTATAAAGAAAATGATGGATTGAACATACAGGGTGTAGGTAAAAAAAGAGATGATGTTCGTCTAATATTTGGGGAAAACATTCAAGCAGTAGAACGTGATGTTAGTACAGAAGGATTTTTAAATGCAACAACTGTAACTGGGGCAGATAATTTAAATTGGAATAGCGCTTCATTCAGTTATATAAATGCGGATGGTGTGGAAGAATTTTATAAAAGAGCTGGTAGTGATACTGCATTTGCACCCCTCTCAGCTAAAATATATCCTGCACAATTATCAAAAGACAAAGACGATATTTGGACGAGAATAGATTTTACTACTGAATACAAGAGTGTAAATGATATGTGGGCTTATGCGGTGCGCCAATTTAAGCAGTACGCTTATCATCAAGTTAGTTATACTGTGACTCCATCATCAAAACTAGTAAATGCAGAAATTGGAGATGGTCCACCACTTGCAAAAGGCGATACGGTCATCATACAAGATAATAATTATATTGACATTGATGGCAATGTAGGGCTCTTATTATCTGCTAGGGTTTCAGAAAAAATAGTATCTGAAACACATCCTGAAAATAATAAACTTATTTTTTCAAATTATAAGAAGCTAAAGAGTGAAGTATCCACAGATATTCAAGCCATAGTTAATCAGTTGGTCGATGCAGCTACTCCATACAGAGCAGAGCTTACAACAACTAATGGCACACAGTTCAAAAACGGCACTGGATCAACAACTTTAGCAGCTCATATTTTCAAAGGCTCTGCAACAACTGAAACAATTACTGACAGCTACGAATGGTCGAAAGATGGAACGGTTGTCGCAAACGTTCAAGAAATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTTTCGGATAAAGCAGTTTACAGCTTTAAAGCGACAGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCAAGTCAGTCGGTTACCATCACTAATGTAGATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGAATTAATTCAACTACAATTACATACGCTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACTAAAACCGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGAAACAACGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGACGGAGTAGGAATTACAGCAACTACAATAACTTATGCACAATCAACAAGCGGAACGACAGCGCCAAGCAGTGGATGGACTACAAGCGTTCCTACTGTTCCTGCTGGACAATTTCTTTGGACAAAAACCGTATGGAGCTATTCTGATAAAACAAGTGAAACAGGCTATTCTGTTGCAATGATGGGAGCAAAAGGCGACAAGGGAGACCAAGGCGTCCAAGGTATTCAAGGTGTTGATGGACGTCAAGGGATTCCTGGTCCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACGCAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTGCCGATGGTGTAACTGATTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTGCCTATATCGGGATGTATGTTGATTTTAACATCAATGATTCAACCACCCCAAGCGATTACTCATGGACGCTTGTTAAAGGAGCGGACGGAACGCAAGGGACACCAGGAAAACCTGGAGCTGACGGTAAGACACCATATTTCCACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGAAAAGATAGATTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATTTACTAGACGGTACTAGAAATTTTAGTGGTACTTGGACAAATTCAAGTAGTTGGGTAACTGATGGAACATATAAAGGCTTAACTGTTAAAAAACGCACTGGTCAATGGAATGGTATTTATAAAACATTTACTGCACCTAAAGATGGCATTTATACTTTTTCAGCTTATGTTAAAGGTTCAGGGATTGACTCAAAGATATATAGATTTTTGAGTGTAAATGGTGTCGTCAATGGTACCGTAATGCCTGACACGTTAATAGGAAACAATTTTGATTGGTTAAGGGACAGTTTCACTGTAACTTTGAAAGCTAATGATGTTGTTTATGCCAAATATGAAATAGTTGGTTCAGGTACAGATTCAATTTTATGGACGGCTGGTCATAAATGGGAAGAAGGCTCAACCGCCACTCCTTACATGCCGTCAGCTAGCGAAGTAACAACCGCTGACTGGCCGAGCTACATTGGTCAGTATTCAGACTTTACGCAAGCTGACAGCACTAATCCATCCGACTACACTTGGAGTCTGATACGAGGAAATGACGGAAAAGATGGTGATATGGGTAAATCCGTCTGGTCTTATCCATATGACCGAGGTGCTAATAGGCTTGGAAGCTGGTGGTCAGATTTGAAACCCACGCCTACAACGGATAATCCACCTAAGGTTGGAGATACCATTATTGATTTGGTAGGTAAGATTTATCAGATTACCAATGTAGTAGTTGATAGTACAATAGGTGGCGGCGGTCTATTCGACTATGGCCCAATGCTTACAAGTATCAAAGGCGCAGATGGTTCGCCGGGTAAGGACGGTATCGCTGGAAAAGATGGTGTTGGATTAAAAAGCACTATTATTACTTATGGGATTTCAGCATCAGATAGTACCATGCCGGGGACGTGGTCTCAAAATACACCAGCATTAGTTAAGGGACAATGGTTCTGGACTAAAACACAGTGGACCTATACAGATAACAGCACTGAAACTGGTTATCAAAAAACATATATCTCTAAAGACGGAAATAACGGTCATGACGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGAATCAAAACTACGACCATTACATACGCAGGTTCAACAAGCGGAACGACAGCACCAAATACTGGTTGGACTACCACAGTTCCGACAGTTGCAGCAGGTAATTACCTGTGGACTAAGACTGTTTGGGATTATACGGATAAGACCAGCGAGACAGGTTATTCAGTAGCTAAAATGGGAAATAATGGAACACCTGGTCCGCAAGGTCCTCCTGGAAGTAATGGTGATCCTGGTAAAACTGTTTCCAATACTGAGCCGACCACTCGATTTAAAGGCTTGACTTGGAAATACTCAGGTACGACTGACCTTACAGCGAGTGATAGAACAGTGATTAAGCCAAATACAGAGTATTACTATAATGGCACTCATTGGGTGATTAACTATTTTAGCGTCAATAACTTTGCGGCTGAATCGATAACATCAGATAAAATTGATGGTAAAAATTTAACAATTACTGATGGTGAGTTCATAAGCAAAACATCTAATGGCCCAGTTACAACCTCTACAGAAATCAAAGATAATCATATTGCAATTTCAAAGAAAGATGGAACTGTTAATACTAGAAATGATATAGCGCTTGATTCTGAACAAGGACTAGCTCAGAAATTTACGAACATTAATACAGGATTCTACAGAACAGCTGGGATTAATTATCAAGGTCCATTCACAAGTGACTCAGATGGAAACTATGCTCAACTTACACCTCAAGGCACGAAGTTATCTACCGATGTTCCTTGGACCAAGCTTAGTTTGATGAATAATTTTAATGGAAATATTGAGTATGCAATTATCAATGGGACTGTCTATATATCAGCGTCAGGAGTTGGTGTACCAGCAATGACTGCTGGTCAATGGAAGCAAGCGGCTCAATTGCCAACAGGAAGTTCAGCAATTCCAATTAGAGCAAATCGAATTGCAGCAGGAGATAGTGGAGATGGTCTAAGTTGGGCATTACTTTCTAATCAGGCTGGAGGAATATTCATTCGATGCAGTGCTAATAAAGCACCAACACCTAACTTATTCAATGCCACATTACCATATCCAATAGGATAA

Tertiary structure

PDB ID
2610e049d8409c0d18beb9ec81f9c2feec93f75b56384643438730ab3c9dd091
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7930
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50