Genbank accession
XUI95520.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDITGGATVGKDLLVKGDAVFNKNLTVNGTVTFADAVFTAIEAGTVDISSTLDVAGKASLNGGIEVHGNSVIGNLPVGSDTATINSNAQFQSPVSMAGNLTQTAGTAVLKDTQVASMDVLGTSSFKGNITAETGTTAAFDKITATDATFTNTATTDITSTGTANFKDVNISGTLGGTFSLSDVNATTLTVSGLTSLQGGVTLGSNITGVNSSANFRDIKIGSNAANTNYRLSFNYSAPSLRPTVILQNEIQSELMSPATLSVLKTASFGDSSLSTFGITGNGLNKLDYLTVSGNSVQDPTTPLLQVTSGKTKVHDFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFSLDDIEANTLTVSGLTSLVGGVTLGADISGANSTANFKAVSLGQNAADANVKYGFAYSAPGARPTVILQNEIQSELVSPAVLNVQKTATFGDASLATYGITGNGLNKLDYLSITGNGTQSPATPQLQVAGKSVLNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVDAAEAIKGQTLESVGQTTVGTNLQVGGTANVVGALTGTAATFTGDVSAAKGTFSGDVSVTGQTVTVRDLVVTGTTTGVTAQADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGDTTLAGLTASSVTSTGDVTGASVSGNTVTAAGALSGGSLAVTGAGSMASLTVPSITGDTTFANNVTITGTLTPSSIDLSTTDVSAASLTTTGNVTVGGSLAVTGAIDLSAADVVTKSVSATNPSTFGVINASSVAATGDVSGGTLTTTGAAKVGTLTSTGVVSGSRLSSGTATITTSVTVPTLQAEAAGAGTLNLASNVVAAKDLTVTGVFKPEGGLDLTTVDITANSLTTTADVNVGGNLVVDGTFDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVTDSTNTSSLPKITSTDATLFTVNAGTINATGNSVLQSVSATQVTATSAEFSGGGLGLQVDNDANVGGALSVGGIATVGSLTTTAASLNIAKNTAITGDLAVSGTLTAGSIDLSNTDVTVKSLDSLGNAHIAGNLTVDGAFDLSATNLVAASLASTGSTTVGTDLVLTTGVVTGSPAISGNTTIGGTLGVTGAVNLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVDGGINTNTINVSGASTLAGTSITGTLGVTGASTLAGVSATSLTVSGDSTVQKLTVQGELIPQGGLDLSGADITANSLTTATTINATGLSTLSGGVSTSTVTASGLATVGSLTSTANASVGGNLGVTGTLDVTGATTVSSLTATGAVKTGTTLTVGTPVGEQPETVQIIPDTYIAGKLRVIGGINAEIDVSGQTLEPYAIEAAATLSAVGNITSGATIVSKAATIGDVGSQNNNLTVNGNVVTNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVVAGTSITAGTSITATGLLKGNSLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGDLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASASVTGALTVGGTLTANGNTVIGDAAADTLTVNATSTFKENATFDKNLTVTGSINTTTANFTTNNMVTKKYSVIPASVTASTAAVGGTWTPDGTTNVYRLTLDQSVTMDSIAGLIGSGQACSVYIYVTPSVADTTFTFGGAYSVVSGTVSAVVGQTSIIQVIYDGFSTVFDTFVAQRV
Physico‐chemical
properties
protein length:1644 AA
molecular weight: 160731,76880 Da
isoelectric point:4,14086
aromaticity:0,03467
hydropathy:0,29033

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
305–612
XUI95520.1
1 1644
Architecture
STR
STR
RBD
STR 1-612 | STR 740-1278 | RBD 1279-1644
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage WPEC5
[NCBI]
3425169 Viruses >
Host Escherichia coli
[NCBI]
562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUI95520.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV654397.1 [NCBI]
CDS location
range 223975 -> 228909
strand +
CDS
ATGTACTCGATTAAAACAGATCTCGATATAACTGGTGGTGCAACGGTTGGTAAAGATCTTCTTGTGAAAGGCGATGCAGTATTCAATAAAAATCTAACAGTTAATGGAACTGTAACTTTTGCTGACGCTGTATTCACTGCAATTGAAGCAGGAACTGTAGACATTTCATCTACACTAGATGTTGCTGGTAAAGCATCATTGAATGGTGGAATTGAAGTTCATGGTAATTCCGTAATTGGTAATTTGCCTGTTGGTTCTGATACTGCAACAATTAATTCTAATGCACAATTCCAAAGCCCAGTATCAATGGCAGGTAACCTAACACAAACCGCTGGCACTGCTGTACTAAAAGATACCCAAGTGGCATCAATGGATGTTCTTGGAACTTCTTCATTTAAAGGTAACATTACTGCTGAAACTGGCACTACCGCAGCATTTGACAAAATAACTGCAACTGATGCAACATTCACAAACACTGCAACTACTGATATTACATCAACTGGAACTGCAAACTTTAAAGATGTGAATATTTCCGGTACACTAGGTGGAACATTTAGTCTATCTGATGTTAATGCAACAACTCTAACTGTTTCTGGTTTAACCAGTCTACAAGGTGGTGTTACATTAGGTTCCAACATTACTGGTGTGAATAGTAGTGCAAACTTCCGTGATATTAAAATTGGTTCCAATGCTGCAAACACTAACTACCGTTTGAGCTTTAACTATTCTGCTCCAAGTCTTCGTCCAACTGTAATTCTACAGAACGAAATCCAATCAGAATTGATGTCTCCAGCTACCCTAAGTGTATTGAAAACTGCATCTTTTGGTGATTCGTCATTATCCACTTTTGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACAGTATCTGGTAACTCTGTTCAAGATCCAACAACTCCACTATTACAAGTAACTTCAGGTAAAACTAAAGTTCATGATTTCGAAGTAACAGGAACTGCAACTATTCCTAACATTGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATCAACGTATCTGGTACACTCGGTGGTACTTTCAGTCTTGATGATATTGAAGCAAACACACTAACTGTATCCGGTTTAACTAGCCTTGTTGGTGGTGTAACTTTAGGTGCTGATATTTCCGGTGCTAATAGTACTGCTAATTTTAAAGCAGTAAGTTTAGGACAAAACGCCGCCGATGCTAACGTTAAGTATGGTTTTGCTTATTCTGCCCCTGGTGCTCGTCCAACTGTAATTCTACAAAATGAAATTCAGTCTGAGCTAGTATCTCCAGCAGTACTTAATGTACAAAAAACTGCAACCTTTGGTGATGCATCTCTTGCAACCTATGGTATCACAGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTATCTATCTATTACTGGTAATGGTACACAAAGTCCAGCTACACCACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAGTACTAAATGATGTTGAATTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGATGCTGCTGAAGCAATCAAAGGTCAAACCCTTGAATCAGTTGGTCAAACCACAGTAGGAACTAACCTACAAGTTGGTGGAACTGCTAATGTTGTTGGTGCACTAACTGGTACTGCTGCTACCTTCACTGGTGATGTAAGTGCTGCTAAAGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGCGTTACTGGTCAAACTGTAACTGTACGTGATTTAGTAGTAACTGGTACAACTACTGGTGTAACTGCTCAAGCTGATGTTGATGGTCTTGATATCGCCCCAAATAAAGTTGATGTTACAACAACACTATCTGTTGCTGGGGACACTACTTTAGCTGGCCTAACTGCTAGTTCAGTAACCAGTACTGGTGATGTTACTGGTGCGTCTGTATCTGGTAATACAGTAACTGCGGCTGGTGCACTATCTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTGGTTCTATGGCTTCACTAACTGTTCCAAGTATTACTGGTGACACTACTTTTGCTAATAACGTAACTATTACTGGAACACTAACTCCGAGTAGTATAGATTTAAGCACTACTGATGTAAGTGCTGCTTCTTTAACAACTACTGGTAACGTAACTGTTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTATTGATTTGTCTGCTGCTGATGTAGTAACAAAATCAGTTAGTGCAACTAACCCAAGTACATTTGGTGTAATTAATGCATCTTCTGTTGCCGCAACTGGTGACGTTTCAGGTGGCACACTAACTACTACTGGTGCAGCGAAAGTAGGAACACTAACTAGTACTGGTGTAGTATCTGGTTCGCGTTTGTCTTCTGGTACTGCAACAATCACAACTTCTGTAACAGTTCCGACTTTACAAGCTGAAGCTGCTGGTGCTGGTACACTAAATCTAGCAAGTAATGTTGTCGCGGCAAAAGATCTAACTGTCACTGGTGTATTCAAACCTGAAGGTGGTCTTGATCTAACAACTGTTGATATTACTGCAAACTCACTAACTACTACTGCTGATGTTAATGTTGGTGGAAACTTAGTAGTTGATGGTACTTTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACCGTTACCGATTCAACCAATACTAGTTCGTTACCTAAAATTACTTCAACTGATGCAACACTCTTTACAGTAAATGCAGGTACTATTAATGCAACTGGCAACAGTGTACTACAAAGTGTATCAGCTACTCAAGTAACTGCTACTAGTGCTGAATTTTCTGGTGGTGGCCTTGGTCTTCAAGTTGATAATGATGCAAACGTTGGTGGTGCATTATCTGTTGGTGGCATTGCAACTGTTGGTTCTTTAACAACAACTGCTGCTTCTCTTAATATTGCAAAAAATACTGCAATCACTGGTGATTTAGCTGTATCTGGTACACTAACTGCTGGTTCAATCGACCTAAGCAATACTGATGTAACCGTTAAATCTCTTGATTCACTAGGTAACGCACACATTGCTGGTAACCTAACTGTTGATGGTGCATTCGACTTAAGTGCAACTAACCTTGTAGCTGCAAGTCTAGCAAGTACTGGTTCTACTACTGTTGGAACTGATCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTGACTGGTAGCCCAGCTATCTCTGGTAATACAACAATCGGTGGAACTCTTGGTGTAACTGGTGCTGTTAACCTAACTGATATTGTTAATATCGGTAAGAAAGTAACAGTGAGTACTGGTGGTATTCAGGTAGTTGATGGTGGTATCAATACTAACACAATTAACGTTTCTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGAACTTCCATTACTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGTGTATCTGCGACATCACTAACAGTTTCTGGTGACAGTACTGTTCAGAAACTAACTGTCCAAGGTGAATTGATCCCACAAGGTGGTCTTGACCTAAGCGGTGCAGACATTACTGCTAATAGTCTAACTACTGCAACAACTATCAATGCAACTGGCCTAAGTACTCTAAGTGGTGGTGTTAGTACTTCTACTGTGACTGCATCTGGTCTAGCAACTGTTGGAAGTTTAACTTCTACTGCAAACGCATCAGTTGGTGGTAATTTGGGTGTAACTGGAACTCTAGATGTTACTGGTGCTACTACTGTATCTTCACTAACAGCTACTGGTGCAGTGAAAACTGGCACAACCCTAACTGTTGGTACTCCAGTTGGTGAACAACCTGAAACTGTACAGATCATTCCAGATACTTATATTGCTGGTAAATTGCGTGTAATCGGCGGTATTAACGCTGAAATCGACGTAAGTGGTCAAACACTAGAACCATATGCAATTGAAGCTGCTGCAACACTATCTGCTGTTGGTAACATTACTTCTGGTGCAACCATCGTTTCTAAAGCTGCAACAATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACCTAACTGTTAATGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTCACCGTTACTGGTGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAATCTTTAACTGCAACTAATAACGTTGTGGCTGGTACTTCAATCACTGCTGGTACTTCCATCACTGCAACTGGATTACTAAAAGGTAATTCGTTAGAAGTCACCACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACTGTTGGTATCACTGCTGGTGACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGGACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACAATTACAACATCAGGTTTAGCTACACTTGCAAGTGCATCTGTAACTGGTGCTCTAACTGTAGGTGGTACATTAACTGCAAATGGTAACACTGTGATTGGTGATGCTGCTGCTGATACTTTAACTGTAAATGCAACATCTACATTTAAAGAGAACGCAACATTTGATAAGAACCTAACAGTGACTGGTTCTATTAACACCACCACTGCAAACTTCACTACAAACAACATGGTAACTAAGAAATATTCTGTTATCCCTGCTAGTGTTACTGCTTCTACTGCTGCTGTAGGTGGTACTTGGACACCAGATGGTACTACTAACGTATATCGCTTAACTCTTGACCAAAGTGTTACAATGGATTCCATCGCGGGTCTAATTGGTAGTGGTCAAGCATGTTCAGTGTATATCTATGTAACTCCATCTGTTGCTGATACTACTTTCACCTTCGGTGGTGCATACTCTGTAGTTTCTGGTACAGTAAGTGCTGTAGTTGGTCAAACAAGTATTATCCAAGTAATCTATGATGGTTTCAGTACTGTGTTTGATACCTTCGTTGCACAACGTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
366bcf3db52ceffdc4716cbf6ab277d91893429782320443e5126e725cc0d191
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5448
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50