Protein

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Genbank accession
CAB4193434.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MPIQIQLRRGSAAQWTAANSILAQGEIAVELDTGKFKIGSGTQGWNALSYSSGPIGVTGNTGATGATGATGATGATGAQGIQGIQGIQGIQGVVGTAATLAVGTVTTGTVGSSATISNSGTNAAAIFNFSIPVGATGATGATGATGATGTAATISVGTATTGSPGSSVVVSNSGTLAAAVFNFIIPQGATGAVGATGAVGATGAVGATGATGTAATITVGQITTLSPGSSANVTNSGSSSSALLNFNIPQGATGAQGIQGIQGIQGDIGISATVAVGTVTTGIVGSSSTVSNSGTTGAAVLNFSIPTGATGATGTAATIAVGTVTTGSTGSPTTVSNSGTTAAAVLNFSIPTGATGATGATGATGTTGATGPQGISVTLKGTKATAVLLPSSGQQAGDAWIVEADGDLYFWNVSAGTWDNIGQIVGPQGPTGATGTAATIAVGTVLTGITGSSVVVTNSGTSGAATLNFTIPTGATGATGATGATGTAATLAVGTVTTGITGSSATISNSGTTSAAVLDFSIPIGATGATGATGTAATIAVGTITTISSGSSATVSNSGTASAVLLDFSIPQGATGPTGNTGATGATGSTGTTGTAATLAVGTVTTGAAGGAVSVSNSGTSSAATLNFTIPIGDTGATGATGATGNTGTAATLAIGTVTTGTAGSSAIVSNSGTTSAATLNFTIPRGNTGDTGATGATGTAATLAVGTVATGAAGSSTLVSNSGTASAATFNFTIPRGDTGIQGATGNTGATGAAGATGTAATITIGTVITGTVGSSATVTNTGSSSAAVLDFSIPTGATGPQGATGATGATGPQGATGLQGATGPQGPTGPAGLTGDTGAAGTAGAAGAVGPAGATGSQGIQGIQGATGATGATGPQGDTGLTGPAGATGSQGIQGIQGNTGATGLTGPAGAVGPQGDTGLTGATGLTGPAGSQGIQGIQGATGTTGTTGQGIATGGTTGQVLVKLSNTDYDTGWAAQSGGGGGGSSVTVAATAPASPSTGSVWFNTENATMYIWTGTAWVEPSGGVAGPAGPAGSVLKITSISICNSSYTVLDDTAVSNTGGYIKLTGTNFAAGCIVTVGTINATTTTYVSATEVRAQLPATVAGSYTVYLTNTDGGTCFRLNAVTFSAPPVWSTGTYSSPTAVSTQLLATGDSTLTYTLTSGSLPSGITLSSSGLLSGTTTLNSYSFTVTATDAQLQDVSQVISLTIANVPPSAVEYLVVAGGGGGGSAVFNVDNGGGGGAGGYSTSTGFAVASGTPITVTVGAGGATATQGYNSQLGSLTASIGGGRGGTNGSFAGGSGGSGGGGAGVTGYTGGGSATSGQGNIGGNGNGSSWPGGGGGAGAAGGTAGVSPQTTGSGGVGLASSISGTSTYYAGGGGGSGSGATFPNGGNGGGGTGNASGTAGASGTANTGGGGGGGSGSGGAGAGGPGGSGIVIIRYADSYSAAASTTGSPTITNPTGYRVYKWTSSGSITF
Physico‐chemical
properties
protein length:1477 AA
molecular weight: 134552,17350 Da
isoelectric point:4,20133
aromaticity:0,04130
hydropathy:0,22167

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
3–156
SSF69349 IPR008160 IPR014756 IPR049304
IPR041352
5–42
IPR041352 IPR008160
IPR050149
54–759
IPR050149
CAB4193434.1
1 1477
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4193434.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797194 [NCBI]
CDS location
range 52268 -> 56701
strand -
CDS
ATGCCAATACAAATACAACTTAGAAGAGGATCAGCAGCTCAATGGACGGCTGCTAATTCTATACTTGCACAGGGTGAAATAGCTGTAGAGTTAGATACAGGTAAATTTAAAATTGGTAGTGGTACTCAAGGATGGAATGCTTTATCTTATTCTTCGGGACCAATAGGGGTAACAGGAAATACAGGTGCTACGGGTGCCACAGGTGCTACCGGTGCCACAGGTGCTACCGGTGCCCAAGGTATTCAAGGTATTCAAGGTATTCAAGGTATTCAGGGCGTAGTAGGTACTGCAGCTACATTAGCTGTAGGAACAGTTACAACAGGTACTGTAGGTAGTTCTGCTACTATAAGTAATTCAGGCACTAATGCAGCAGCTATTTTTAACTTTAGTATACCCGTAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACGATTAGTGTAGGTACTGCTACTACTGGTTCTCCAGGAAGTTCAGTAGTAGTAAGTAATTCAGGTACTTTAGCAGCAGCAGTATTTAATTTTATTATACCTCAAGGTGCTACAGGTGCTGTAGGTGCTACAGGTGCTGTAGGTGCTACAGGTGCTGTAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACTATTACTGTTGGACAAATTACTACTCTATCGCCAGGTAGTTCTGCTAATGTTACTAATTCTGGCTCTTCTTCATCAGCACTCTTAAACTTTAATATACCACAGGGTGCTACAGGTGCACAAGGTATCCAAGGTATTCAAGGTATCCAAGGTGATATAGGTATATCTGCTACTGTTGCTGTAGGTACAGTTACAACAGGAATAGTAGGTAGTTCTTCTACTGTAAGTAACTCGGGTACTACTGGAGCAGCTGTTCTTAACTTTAGTATACCCACAGGTGCAACAGGTGCTACTGGTACAGCAGCTACAATAGCTGTAGGTACAGTTACAACAGGGTCAACAGGTAGTCCCACTACTGTAAGTAACTCGGGTACTACTGCAGCAGCTGTTCTTAACTTTAGTATACCCACAGGTGCAACGGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACGGGTACTACAGGTGCGACTGGACCACAAGGTATTTCTGTAACTCTTAAAGGTACTAAAGCTACTGCAGTTTTATTACCAAGTTCTGGGCAACAAGCAGGAGATGCTTGGATTGTTGAAGCAGATGGTGATTTGTATTTTTGGAATGTTTCTGCAGGTACATGGGATAATATAGGACAAATAGTAGGGCCACAAGGCCCAACAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACAATAGCTGTAGGAACTGTACTAACAGGTATTACTGGAAGTTCTGTAGTAGTAACTAACTCTGGTACTAGTGGGGCCGCCACTCTTAATTTTACAATCCCTACAGGTGCAACAGGTGCTACGGGTGCTACGGGTGCAACAGGTACTGCAGCTACATTAGCTGTAGGAACAGTTACAACAGGTATTACTGGAAGTTCCGCTACTATTAGTAATTCAGGAACTACTTCAGCAGCCGTTCTAGATTTTAGTATACCTATAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACTGCAGCTACAATAGCTGTAGGAACAATTACAACTATATCTTCCGGTAGTTCTGCTACTGTAAGTAATTCAGGTACTGCTTCAGCAGTACTTTTAGATTTTAGTATTCCTCAAGGGGCCACGGGTCCCACAGGTAATACAGGTGCAACAGGTGCTACAGGTTCTACAGGTACTACGGGTACTGCAGCTACATTAGCTGTAGGAACAGTTACAACAGGCGCAGCAGGTGGAGCTGTTTCAGTAAGTAATTCTGGTACTAGTTCTGCAGCAACACTTAATTTTACAATTCCTATAGGTGATACTGGTGCTACAGGTGCCACAGGTGCCACAGGTAATACAGGTACTGCAGCTACATTAGCCATAGGAACAGTTACAACAGGAACTGCAGGTAGTTCTGCTATTGTAAGTAATTCAGGTACTACCTCAGCAGCAACACTTAACTTCACAATTCCTAGAGGAAATACGGGGGATACTGGTGCTACAGGTGCTACAGGTACTGCAGCTACATTAGCCGTAGGAACAGTAGCAACAGGTGCAGCAGGTAGTTCCACTTTAGTAAGTAATTCAGGTACTGCCTCAGCAGCAACATTTAATTTTACAATTCCTAGAGGTGATACAGGTATACAGGGTGCTACAGGTAATACGGGTGCTACAGGTGCAGCAGGTGCTACAGGTACAGCAGCTACAATAACTATAGGTACAGTTATAACAGGGACAGTAGGAAGTTCTGCTACGGTTACTAATACTGGCTCTTCTTCAGCTGCAGTTTTAGATTTTAGTATACCTACAGGTGCTACAGGCCCACAAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTCCACAAGGTGCTACAGGCCTACAGGGTGCTACAGGTCCACAAGGACCTACAGGACCAGCAGGTCTTACAGGTGATACAGGTGCTGCAGGTACTGCAGGTGCTGCAGGTGCAGTAGGTCCTGCAGGTGCTACAGGTTCTCAAGGTATTCAGGGTATTCAAGGTGCTACAGGTGCTACAGGTGCCACAGGTCCTCAAGGTGATACAGGTCTTACAGGGCCTGCAGGTGCTACAGGTTCTCAAGGTATTCAAGGTATTCAAGGTAATACAGGTGCTACAGGTCTCACAGGTCCTGCGGGTGCTGTGGGACCTCAAGGTGATACAGGTCTTACAGGAGCTACAGGACTTACAGGTCCTGCCGGTTCTCAAGGTATTCAGGGTATTCAAGGTGCTACAGGTACTACAGGTACTACAGGTCAGGGAATTGCTACAGGTGGTACAACTGGACAAGTATTAGTTAAATTATCTAATACTGACTATGATACTGGATGGGCGGCACAGTCTGGTGGTGGGGGAGGGGGATCTTCAGTTACAGTTGCAGCAACTGCACCTGCAAGTCCTTCTACAGGTAGTGTTTGGTTTAATACTGAAAATGCTACCATGTATATTTGGACAGGTACTGCATGGGTAGAGCCTTCTGGAGGGGTAGCCGGCCCTGCCGGCCCTGCGGGTTCTGTACTTAAAATTACTAGTATATCAATATGTAACTCTAGCTATACTGTTTTAGACGATACCGCAGTTAGTAATACTGGCGGATATATTAAATTAACTGGTACAAATTTTGCTGCGGGATGTATAGTTACAGTTGGTACTATTAATGCTACAACTACTACGTATGTAAGTGCTACGGAAGTAAGAGCTCAATTACCTGCTACAGTTGCTGGTTCTTATACGGTATATTTAACTAACACTGATGGGGGTACTTGTTTTAGACTTAATGCAGTCACCTTTAGTGCTCCGCCAGTATGGAGTACTGGAACTTATAGCTCCCCCACAGCGGTTAGTACCCAATTATTAGCTACTGGTGATAGTACATTAACATACACTCTTACTAGTGGTAGTCTACCTAGTGGGATTACATTAAGTAGTAGTGGACTTTTATCAGGAACTACTACATTAAATTCATATTCCTTTACTGTTACAGCTACTGATGCTCAGTTACAAGATGTAAGCCAAGTTATTAGTTTAACTATTGCTAATGTTCCGCCTTCTGCAGTTGAATACTTGGTTGTTGCTGGCGGCGGTGGTGGTGGCTCCGCTGTGTTTAATGTCGATAATGGGGGTGGAGGCGGTGCCGGTGGATATAGTACATCAACCGGATTTGCAGTTGCATCCGGCACTCCAATCACAGTAACGGTTGGGGCCGGGGGTGCAACAGCGACTCAAGGTTACAATTCTCAACTAGGATCTTTAACTGCTTCTATTGGTGGTGGGCGTGGCGGCACCAACGGTAGTTTTGCTGGTGGGTCCGGTGGCTCTGGTGGTGGTGGGGCCGGCGTTACTGGTTATACTGGCGGTGGTAGTGCAACTAGTGGTCAAGGTAATATAGGTGGTAATGGCAATGGAAGTAGTTGGCCTGGTGGTGGGGGTGGTGCTGGTGCTGCTGGAGGCACTGCTGGAGTATCCCCTCAAACAACAGGTTCCGGAGGTGTTGGTTTGGCATCTTCTATTTCTGGAACATCAACTTACTATGCGGGCGGTGGTGGTGGATCTGGTTCAGGCGCAACTTTCCCTAATGGTGGAAATGGGGGTGGCGGCACTGGAAATGCATCTGGTACTGCTGGAGCAAGTGGCACAGCTAATACTGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGCAGTGGTAGTGGGGGTGCAGGTGCAGGTGGCCCTGGTGGTTCAGGTATTGTAATCATTCGCTATGCAGATTCATATTCTGCTGCAGCTTCAACTACAGGCTCTCCTACAATTACTAATCCCACGGGATATAGAGTTTACAAATGGACCAGTTCTGGTTCAATAACATTTTAA

Tertiary structure

PDB ID
e360e2c37ac0dc89baf0befd36ec9fb16f4936b2476b4c42f6f1a846d949b671
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5346
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50