Protein

View in Explore
Genbank accession
QBQ76372.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIIKLLYGGKVVFNPTGSSEITIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFSIRQAIVTDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNANNTNVYLYNHATGSMLTLDATASFNKTLRVMGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQKFAQLAGDNTFSGSNIFTNFVVKKNANAITLQNVDTTAALYIQAKKSDGTCKWYIGNDTDENTVNIYNYLANTQISLGNTIAMSRTVQITGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSNLAKLSDVNTFRSAQVIKQNGPLLQLRNTIQDKEVYLSAHNADDVRRWYIGNGETADPTRLIIHNDRTATTIYMGSDFLLNKTVRITGQVQPSDWSNLDDRYYVKSATDAKYLWPASRALVEESDGGVAWNQPSGIYVETIKGGGSSRLVLHLFANTLASTPTAQLRFDYRNSGLWYRTARDRQGFEAEWSKVYTEAQRPNPSEIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNSTGGHTHSVSGTTSAAGNHAHHLGLLLVNGGDAQYGYTTIGNNKTRTLDWLDRTDNKFPNTNTTGNHTHTWSGTTSGAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:794 AA
molecular weight: 86650,81280 Da
isoelectric point:8,20259
aromaticity:0,08816
hydropathy:-0,46322

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_LMP25
[NCBI] 		2491663 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ76372.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK482688.1 [NCBI]
CDS location
range 50829 -> 53213
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACTGGTGACTTAGGGATTATTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGTAGTATTTAACCCGACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTACCATACTCTGAATAAACCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTTACAAATAACTTCAGCATTAGGCAAGCAATTGTAACTGATGGTGAGCAGTTAACCCTTAAGAAAGCAACCAATGCAGGTGCTTCATATATTCAAGGTAGGGATGCTAATAACCAGCAAACTTGGTATGTTGGGCAAGGAAATGCAAATAATACTAATGTTTATTTGTACAATCATGCCACCGGTTCAATGTTGACACTTGATGCAACAGCATCGTTTAACAAGACACTAAGAGTTATGGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACTCAGACAGTGGCTAATCAGAAATTTGCACAGTTGGCTGGTGATAATACTTTTAGTGGCTCTAATATTTTCACTAACTTTGTTGTTAAGAAGAATGCTAATGCTATCACTCTGCAAAATGTAGATACAACTGCTGCTTTGTATATCCAAGCAAAAAAATCAGATGGAACTTGTAAGTGGTATATTGGTAATGATACCGATGAAAACACTGTAAACATCTATAACTACTTAGCAAATACACAAATCTCACTAGGTAACACCATTGCCATGAGCAGAACAGTCCAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATCGACTCTAGATATATTCCAGCAGGAACTTTGAGTAATCTTGCTAAGCTAAGTGATGTAAACACTTTCAGGTCTGCACAGGTTATTAAACAGAATGGCCCATTATTGCAACTAAGGAATACTATTCAGGATAAAGAGGTGTATCTCTCTGCCCATAATGCTGACGATGTGAGAAGGTGGTATATTGGGAATGGAGAAACAGCAGACCCGACCAGACTCATTATTCACAATGACAGGACTGCTACCACCATTTACATGGGGAGTGATTTCTTACTGAATAAAACTGTTAGAATCACTGGTCAGGTACAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGATAGATACTACGTTAAATCTGCAACCGATGCAAAGTACTTATGGCCAGCATCCAGAGCTTTAGTGGAGGAGTCTGATGGTGGTGTGGCTTGGAACCAACCTTCAGGAATTTATGTAGAGACTATCAAGGGTGGTGGTTCAAGCCGTTTAGTCTTACACCTATTCGCTAATACGTTAGCATCAACACCAACTGCACAATTAAGGTTTGATTACAGGAATAGTGGTTTATGGTATAGAACAGCTAGAGATAGGCAGGGTTTTGAGGCTGAATGGTCTAAGGTTTACACTGAAGCTCAGAGACCAAACCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAAATTGCAGAAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTACCCAGTTGGTATTGTAACATGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAACACAGCGTTGCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATCGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACTTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCGCACACTCACAGTTTCTCTGCCACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGCACTAATAGTACTGGTGGTCATACTCACTCTGTAAGTGGTACAACAAGTGCTGCTGGTAACCACGCTCACCACTTAGGTCTACTATTGGTTAATGGTGGTGATGCTCAGTACGGTTATACCACTATTGGTAACAACAAGACAAGAACTCTTGACTGGCTTGACAGAACTGATAACAAGTTCCCTAACACTAACACAACTGGTAACCATACACACACATGGTCTGGTACTACAAGCGGTGCTGGTGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTCAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
fd94e991dada9bc035cff1d4279f406105773c20eba5d1167db1dbfbc65dc4f2
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6892
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Draft Escherichia bacteriophage genome sequences from raw wastewater Keely,S.P., Herrmann,M.P., Korajkic,A., Brinkman,N.E., McMinn,B.R., Fout,G.S. and Villegas,E.N. 2019-06-27 — GenBank