Genbank accession
QVW27798.1 [GenBank]
Protein name
baseplate protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Seq2Symm
C1 confidence 0,995
C1 0,995
C3 0,238
C7-C9 0,001
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAEFWSNNDRGYRIRLWVDQVGQDIQNNTSQVRLRLALLNTTTTFAQYTCSAFVEFNGQRLNWSGSPSMLGWYQTIPLIDQTVTINHDSNGEKTFYFSAQFNGSGGWSPGTLSIGGNSFTLTTIPRGSSVRVSDGFIGNQVDISIDKKVGSATHTLRYSWYNKQGKIADNVGTSYKWTIPEDFANDIPNSTSGRGTIYVDTYINGNFIQTQSTTFTASVITNNMKPSLTGFTLTDANPVSQRVIPESTHFVSIMSLVKVTFNGAQAKSGATIAGYYAEIVGANNSVTENGGVLREVSVNKDTEMTLRGRVLDSRGIWSDWVETKLMFLFYFSPALRFEVKRSDKKLDTLTIKRFAKIAPLTVNGVQKNTMKLTFTTRKVDSDNEVSDNGDAGGSWSQVSEFNASNANLGNLYPADTSYIVTGKLEDEFTSASFQATVPTDEVIMTYDRQGVGIGKYRERGALDVAGDIYAKNSPIQQYQLTSNNGAPKWVDGKPNVENANFLDQPGQYYLDASATGNPNGQWGYLFHYSNYGKNADGFKEAIQTFWGNNGQLFFRHHRWSMIIDDWEPWKEFTKNDHPNLINTGWQPAGYEGSFYKRVGDVLTVKYNFTGNGSDVTVASLPPEVFTAPQDYMFTISGWSIFADTQVHVQVDVGTGRFNAMQTRNGIDYKGQITIML
Physico‐chemical
properties
protein length:676 AA
molecular weight: 75170,62540 Da
isoelectric point:5,85603
aromaticity:0,12278
hydropathy:-0,42604

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
QVW27798.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ090946 [NCBI]
CDS location
range 18304 -> 20334
strand +
CDS
ATGGCTGAATTTTGGTCAAATAATGACCGTGGATATCGTATCAGACTTTGGGTTGACCAAGTTGGTCAAGATATCCAAAACAATACAAGTCAAGTTAGACTACGACTGGCACTTTTAAATACGACAACTACTTTTGCTCAATACACATGTAGTGCTTTTGTCGAGTTTAACGGTCAACGATTGAATTGGTCTGGTTCACCTAGTATGTTAGGTTGGTATCAAACAATTCCATTGATAGATCAAACAGTTACTATTAATCACGATTCCAACGGGGAAAAAACTTTCTATTTTTCAGCGCAGTTTAACGGTAGTGGCGGATGGTCTCCAGGCACTTTGTCTATCGGGGGTAACTCATTTACTCTAACAACTATTCCAAGGGGAAGCTCGGTGAGAGTGTCTGATGGGTTCATTGGCAATCAAGTAGACATCTCTATCGATAAAAAAGTAGGTAGCGCTACACATACACTACGCTATTCTTGGTACAACAAACAAGGTAAAATTGCCGACAATGTTGGAACGTCGTATAAATGGACAATCCCAGAAGATTTCGCTAACGATATACCAAATTCAACAAGTGGACGGGGTACTATATATGTAGATACTTATATTAATGGAAATTTCATTCAAACACAGTCGACAACGTTCACGGCAAGTGTTATCACAAATAACATGAAGCCGTCGTTAACTGGTTTCACGTTGACAGATGCTAATCCAGTATCTCAAAGAGTAATCCCAGAATCAACGCATTTTGTTTCCATCATGTCGCTTGTCAAAGTTACATTTAATGGAGCTCAAGCCAAGAGCGGGGCTACCATAGCTGGTTACTATGCTGAAATTGTTGGCGCTAACAATTCTGTTACTGAGAATGGCGGAGTGTTGCGTGAGGTGTCTGTTAACAAAGACACTGAAATGACCTTAAGAGGAAGGGTTCTAGATTCTCGTGGGATATGGTCTGATTGGGTAGAGACGAAACTAATGTTTCTATTCTATTTTAGCCCAGCACTAAGATTCGAGGTTAAGAGAAGTGATAAGAAGTTAGATACCCTAACTATTAAGAGATTCGCTAAAATAGCACCACTTACAGTTAACGGCGTGCAGAAAAACACCATGAAGCTGACTTTCACCACACGAAAAGTCGATTCTGATAACGAAGTTTCAGACAACGGAGATGCTGGTGGAAGTTGGTCACAAGTTTCTGAATTTAACGCATCTAATGCAAACCTTGGAAATCTTTATCCTGCAGATACATCATATATAGTTACAGGTAAATTAGAAGATGAGTTTACAAGCGCTTCATTCCAAGCCACTGTTCCAACAGATGAAGTTATTATGACATATGATCGTCAAGGCGTTGGGATTGGTAAGTACCGAGAGCGTGGTGCTCTTGACGTGGCTGGTGACATCTACGCTAAAAACAGTCCGATTCAGCAATATCAGCTAACCAGTAATAACGGCGCTCCGAAATGGGTAGATGGAAAGCCTAACGTTGAAAATGCTAATTTTTTAGACCAGCCCGGGCAGTATTACCTTGATGCTTCTGCAACAGGTAACCCTAACGGTCAGTGGGGCTATTTATTTCACTACAGTAATTACGGTAAGAATGCCGATGGCTTTAAAGAAGCCATTCAAACTTTTTGGGGAAATAATGGTCAGCTATTTTTCAGACATCACCGATGGTCAATGATAATCGACGATTGGGAACCGTGGAAGGAATTTACTAAAAACGACCACCCAAATCTAATTAACACAGGATGGCAACCAGCAGGATATGAAGGCAGCTTTTACAAACGTGTCGGAGATGTGCTGACTGTGAAATACAATTTTACTGGAAACGGCAGTGATGTGACCGTAGCCAGTTTGCCGCCAGAGGTGTTTACAGCACCACAAGATTACATGTTTACAATTTCTGGTTGGTCTATTTTTGCTGATACACAAGTCCATGTCCAAGTTGATGTGGGAACTGGAAGGTTTAATGCTATGCAAACTAGAAATGGTATAGATTATAAAGGTCAAATCACAATAATGCTATAA

Genome Context

Tertiary structure

QVW27798.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 78.8
Oligomeric state monomer