Protein

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UniProt accession
A0A0E3G2L9 [UniProt]
Protein name
Virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,64
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MQYGTTNERPVLDFLYDGQTGISTVTIRGTHGLSQGDLVKLKGLEFSCTNSPGITTTIFPDGTAAGLNIYKVTEIISNSTFKTNVGRVGFDHTYIQGGSAFVGITTNIFPDGTQGYNYTVAAIPNKNQVTVDVGISSIQHDYIRGGSLFSGKTNERDIADFKYDHISGDAVLTFRKAQNLFTQDLVKLKNLQFDCPNSTGITTTLFPDGTRSNLFLIKERLNPTQFKLNVGTSPFGHDYVRGTGQAFVGITTNIFPDTKTQPSKLFKVVDVPTPTTISAKIGVSTISHSYVKGGKVFVGINTDIFPGDEQVSPLGDTYTVQSITKDGELVINVGLSSISHSYGGGGKVLYGQSSGNNLQHITGPGVLDATIAAIDFEKQVAINALNNRPWGSFVPEETAVVEAFAYDNQTGFGTVTARGINVNTGDTIRMSDIQFVCSEEYAGVTTTFFPDNTRPEGQYFRVERRINIDEFEVNIGVSTIKHVFTYNTGGNVYRYRQSILDVNYDRSSGITSIRATKHGYKAKDIVELGDIEFDCPVFKPQYDIENFVYDNTTGLSTVTTTVDNTIKVGDNVKLADIKLECPPYGNQRVIDNFVYDNKSGLSTISLTAAHGLNLRPRPSVSISTALYDNQTGILTVTTNADINFTDRSGQGVQLSGLRFSCDSAGFPGTLTYPEENLVYDILEIQSPSKFKINVGLSTIAHEYVDGGAATKVDRFDVKLQGIKFDCPAYGNTIDVTNFLYDQRSGNSLVTVDKAHKLSVGDNIKLADLKFQCAPYGNDYNVLNADYDNTTGIITVTTNQNINGVGVGDTIRLSRLQFDCVGSGPEYNITNVFFNTGNRSVILTVPERPIGLNPGDDIKLTNMSYLEGGSGNVVAYPDGRDSSLNIFRINDVQPNSILPGYFDVTTAFPNVKDPFAIFNNTGRLTTGITTNIYPENVGAEGGFYEVIRLRQDNQFEIQVGTSTITHNYVRQGQMFTGVTTNFFPGNLQNSPRGNIFEIVEVPTATQVRINVGVSSISHSYDSGGQMFVGITTNIFPDGTRGNLFPVVGVANTLTLRIDAGVSSIPHNYVSGGELFVGITTNIFPGNSQNSPRGSIFKVLSKDNECGSDRFTINVGVSSITHGYVEGGTVTTGVTTNKFPDGTHGFKFPVIDVLDDNYFTVNVGTSTITHNYISGGFTRRLEVPINSFVYDRVSGLSTVGIQSHRMNIGDLVKLRDVKFNCDPYGGEKTISGVVYDNTSGRMTVNTTGSHSLNINDVVKLSNIQLDCSPYGNERTITAATYNRNNGNLSVQVSEPHNLKISENVKLKGLEFSCSSEHAGVTTTIFPDSTAPSLNIYAIQSITNSTTFMVNVGTSTISHNYVSGGSAFVGITTNIFPGDSQNSPRGSFLSVVDIPASDAFVVNVGVSTISHGYVRGGLVQTGITTDVFPDGTQSDFFKIEDVPSNNTVVINAGISSIIHRYNSGGFAAKYVTYQSNNSQLLDSSVIRVSGDCMAVGERVEELAGIVTSIIKNGPSIAPGGIPVDVVSASYDQSGGALSVTVKDAIDLTPTNIVRIEGLIFECESSGVTNTRVYPDNKVFNYEVLSVQSPTTFTINVGSQADIPHTYVNGGTVRPGNKFDVATATYNTENGIVRVTTTEDNYLVLGRGVNLQGLNFSCTSGGPNNKPGTLTFPDKTPTNVTAATYDSVTGVLRITTNRPHQAYKDAFVSLNGLTFTCDPGGPLVFPRNPDTKSFRVTKRVDDYTYECQLAPTNKVHTYLSGGTSSTGNGNFRVSRLIDTKTFEVTMVPLDLPHTYVNGGSAASVFTRQIIDGININTRKCARDVRRIYLAVAHDITRGGNWKCVEGAKLYYDNVGQTKFISGGEVNQTVEALDFSLNIVRCLINNVTWGGVPRGYLTKGERSELRIPSSAKTSVVGFRQQLLSNQYTTQKKSISGMVYDNLTGIATVTTKLSHELIKYDGIQLSDIEMRCTGSPRITTNVFPDGTQGEIFEVMETLDDRVAYIVTDASYTNTTGKLVVTTTGNNDIPVGSRAKLDGLLWTCSYDPSKQLKFPENRKFRYEVIAKPDGTTLEFNVGISTIPHTFVPAPIDVEYTVKEDPVKFKVHVGTVSFPHTYFGGGTVWHKLPFTPPFTQTQIKDVSQQKDPVQFSNNTPNGCANVFSAISNCIGVVTSIVANGLEGSGISTTYPGNDGKGVPTMDEMPSQGVGNIIKGPYIRNCTNFVPKSIGMRMDGFDAEPGDEISNGVQGSSNVDSFTQFNPGGVGCSISNGTYQQLVSIFTICCDEAIVCDSGAQLDLTNSNSSFGRLGLVARGIGDKLSKCIDRYTGIVAKEASIEDDLVVVKGIGDKRPYDGQGIFFGELFRDVVSIEVLDGGSGYNDDIPPNAFVAEPTGPAGIKAEVSPTVRDGVVVSIEVIANGNQYREKFPEVVISPPKSPLGRTAKARAITEPLYYNVESSSPPEEGTTSIIFKQRLNNTVSVGTTVFFSRLSLQIASSHSFEYIGAGNSINGARPSEGGVPIKENEIVKEDGGSIVYTSTDQAGNFNIGDDFVINQFTGTITGRSFDQSVLNKVTPLIIALDS
Physico‐chemical
properties
protein length:2574 AA
molecular weight: 277716,03520 Da
isoelectric point:5,34920
aromaticity:0,08858
hydropathy:-0,19184

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX42480.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019146 [NCBI]
CDS location
range 186862 -> 194586
strand +
CDS
ATGCAGTATGGCACTACCAATGAGAGACCTGTTCTAGACTTCCTATATGATGGTCAGACTGGTATTTCCACTGTAACCATCAGAGGAACCCATGGTTTGTCACAGGGTGACCTAGTGAAACTCAAAGGTCTTGAGTTCTCTTGCACCAACTCACCTGGTATTACAACTACTATCTTCCCAGATGGAACTGCCGCTGGTCTCAATATCTACAAGGTTACTGAGATTATTAGTAACAGTACCTTCAAGACAAATGTAGGTAGAGTTGGATTCGATCATACTTACATCCAAGGTGGTTCCGCTTTCGTTGGTATCACTACTAACATCTTCCCCGATGGAACACAAGGTTATAACTACACAGTTGCCGCCATTCCTAATAAGAATCAGGTAACAGTTGATGTGGGTATCTCCAGTATCCAACATGATTATATTCGTGGTGGATCACTATTCTCTGGTAAGACTAACGAGAGAGATATCGCAGACTTCAAGTATGATCACATCTCTGGTGATGCGGTTCTTACCTTCAGAAAGGCACAGAACTTATTCACACAAGATCTAGTAAAACTTAAGAACCTTCAGTTTGATTGTCCAAACTCTACTGGTATCACTACTACTCTCTTCCCAGACGGAACCAGAAGTAACCTCTTCCTAATCAAGGAGAGACTAAACCCAACACAGTTCAAACTCAATGTTGGCACTTCACCATTCGGTCATGACTATGTGAGAGGAACAGGTCAGGCATTCGTTGGTATCACTACTAACATCTTCCCTGATACCAAGACACAACCAAGTAAGTTATTCAAGGTTGTTGATGTTCCAACTCCTACTACTATCTCTGCCAAGATTGGTGTATCCACTATCTCCCACTCATATGTTAAGGGTGGTAAGGTATTCGTTGGTATTAACACTGATATCTTCCCTGGAGATGAGCAAGTATCACCACTAGGTGACACATATACAGTTCAGAGTATCACTAAAGATGGTGAGTTGGTTATCAATGTTGGACTATCTTCTATCAGTCACTCCTATGGTGGCGGTGGTAAGGTTCTATATGGACAGAGTTCTGGTAACAACCTACAACATATCACTGGTCCTGGTGTACTAGACGCAACCATCGCCGCTATCGATTTCGAGAAACAGGTAGCAATCAACGCACTAAACAACAGACCTTGGGGTTCATTCGTTCCTGAAGAGACTGCTGTTGTGGAGGCGTTCGCCTATGATAACCAGACTGGTTTCGGAACAGTAACCGCTAGGGGAATCAACGTCAACACTGGTGACACCATCAGGATGAGTGACATTCAGTTTGTTTGTTCTGAGGAGTACGCAGGTGTAACCACTACCTTCTTCCCTGATAATACTAGACCAGAGGGTCAGTACTTTAGAGTAGAAAGAAGAATCAACATCGATGAGTTTGAAGTTAATATTGGTGTTTCTACTATCAAACACGTCTTCACCTACAACACAGGTGGTAACGTATATCGTTACAGACAGTCTATTCTAGATGTTAACTATGATAGATCCAGTGGTATCACTAGTATCCGAGCAACCAAGCATGGTTACAAGGCAAAAGATATTGTGGAACTAGGTGATATCGAGTTTGATTGCCCCGTATTCAAACCTCAATATGATATTGAGAACTTTGTTTATGATAACACAACTGGTCTATCCACAGTTACTACTACTGTAGATAACACCATCAAGGTAGGTGACAATGTAAAACTAGCAGACATCAAACTAGAGTGTCCTCCATATGGTAACCAGAGAGTTATTGATAACTTTGTTTATGATAATAAGAGTGGTCTTTCCACCATATCACTAACAGCAGCACACGGACTCAACCTAAGACCTAGACCTTCTGTTTCTATCTCTACCGCCCTATATGACAACCAGACTGGTATTCTAACCGTCACTACTAACGCTGACATCAACTTCACTGATAGAAGTGGTCAGGGTGTTCAACTCAGTGGTCTAAGGTTCTCCTGTGACTCCGCTGGTTTCCCTGGAACTCTCACCTACCCTGAAGAGAATCTAGTTTATGACATCCTAGAGATTCAGTCTCCTAGTAAGTTCAAGATCAATGTTGGTCTTTCCACTATCGCTCACGAGTATGTGGATGGTGGTGCCGCTACTAAGGTTGATAGATTCGATGTGAAACTACAGGGTATCAAGTTTGATTGTCCCGCCTATGGAAACACAATCGATGTTACTAACTTCCTATACGATCAGAGAAGTGGTAACTCACTAGTTACCGTAGATAAGGCACACAAACTATCTGTTGGTGATAACATCAAACTAGCGGATCTCAAGTTCCAATGTGCTCCATATGGTAACGATTACAATGTTCTAAACGCAGATTACGACAACACAACTGGTATTATTACAGTAACCACTAACCAAAACATCAACGGTGTTGGTGTTGGTGATACTATTCGCCTCTCCAGACTACAGTTTGATTGTGTAGGTAGTGGTCCTGAGTATAATATCACTAACGTATTCTTCAATACTGGTAACAGATCAGTTATTCTCACAGTTCCTGAAAGACCAATTGGTCTAAACCCAGGTGATGACATTAAACTAACCAATATGTCATACCTAGAAGGTGGTAGTGGTAATGTAGTTGCGTATCCAGATGGAAGAGATTCAAGTCTAAACATCTTCCGTATCAATGATGTTCAACCTAACTCCATTCTCCCTGGATACTTCGATGTAACCACAGCGTTCCCCAATGTTAAGGATCCTTTCGCGATCTTCAACAATACTGGTAGACTAACCACTGGTATTACTACTAACATCTACCCTGAGAATGTAGGTGCTGAAGGTGGTTTCTATGAAGTTATCCGACTAAGACAAGATAACCAGTTTGAGATTCAGGTAGGAACCTCTACTATCACTCACAACTATGTGAGACAAGGACAGATGTTTACTGGTGTAACCACCAACTTCTTCCCTGGTAACCTACAGAACTCACCTAGAGGAAACATCTTTGAGATTGTGGAAGTTCCCACAGCAACACAGGTGAGAATCAATGTAGGTGTATCTTCTATCTCTCATAGTTATGATAGTGGTGGTCAGATGTTTGTTGGTATCACTACTAACATTTTCCCTGATGGAACCAGAGGTAACCTGTTCCCAGTTGTTGGTGTAGCAAATACACTCACCCTAAGAATCGACGCTGGTGTATCCAGTATTCCTCACAACTATGTTTCTGGTGGAGAACTATTCGTAGGTATTACAACTAATATCTTCCCTGGTAACTCACAGAACTCACCAAGAGGTAGTATCTTCAAGGTCCTATCTAAGGATAATGAGTGTGGTTCTGATAGATTCACTATCAATGTTGGTGTATCTTCCATCACTCACGGTTATGTTGAGGGTGGAACAGTAACCACTGGTGTTACAACTAACAAGTTCCCTGATGGAACACACGGATTCAAGTTCCCTGTTATCGATGTTCTAGATGACAACTACTTCACCGTGAATGTTGGTACTTCTACTATCACTCACAACTATATCTCTGGTGGTTTCACTAGAAGACTTGAAGTTCCTATCAATAGTTTCGTATATGATAGAGTTTCTGGTCTATCCACAGTGGGTATCCAAAGTCACAGAATGAATATCGGTGACCTTGTGAAACTTCGTGATGTGAAGTTCAACTGTGATCCATATGGTGGAGAAAAGACTATCTCTGGTGTTGTTTATGATAATACCTCTGGTAGAATGACCGTTAACACCACTGGTTCTCATAGTCTAAACATCAATGATGTTGTGAAACTCTCCAATATTCAGTTGGATTGTTCCCCATATGGTAACGAGAGAACTATTACCGCCGCCACCTACAACAGAAACAATGGAAACCTAAGTGTTCAGGTATCTGAACCTCACAACCTCAAGATTAGTGAGAATGTGAAACTTAAAGGTTTAGAGTTCTCCTGTTCCTCAGAACACGCAGGTGTGACAACAACAATCTTCCCAGATTCAACCGCACCTTCTCTAAACATCTACGCCATCCAGAGTATAACCAACTCCACAACCTTCATGGTTAATGTTGGAACCTCTACTATCAGTCACAACTATGTTTCTGGTGGTTCCGCTTTCGTAGGTATCACAACTAACATCTTCCCAGGTGATAGCCAGAACTCCCCCAGAGGTTCTTTCCTCAGTGTGGTAGATATCCCAGCATCAGACGCCTTCGTGGTGAATGTAGGGGTTTCTACTATCTCTCACGGGTATGTTAGAGGTGGATTGGTTCAGACAGGTATTACAACTGATGTATTCCCTGATGGAACACAGAGTGATTTCTTCAAGATTGAAGATGTCCCTAGTAATAATACAGTTGTAATCAACGCAGGTATCTCTTCTATCATCCATAGATACAACTCTGGTGGTTTCGCCGCCAAGTATGTTACCTATCAGTCCAATAACTCACAACTACTTGATAGTTCTGTTATTAGAGTGAGTGGTGATTGTATGGCAGTTGGTGAGAGAGTTGAAGAACTCGCAGGTATTGTTACCTCCATCATCAAGAATGGTCCTTCAATCGCACCTGGTGGTATTCCAGTAGATGTGGTAAGTGCATCCTACGACCAGTCTGGTGGAGCACTATCAGTCACAGTCAAAGACGCAATTGACCTCACACCAACTAACATAGTTAGAATCGAAGGTCTTATCTTCGAGTGTGAGTCCTCTGGTGTAACAAACACTCGTGTATATCCTGACAATAAGGTATTCAACTATGAGGTTCTATCAGTTCAGTCTCCAACAACCTTCACTATCAATGTAGGTTCTCAGGCAGATATCCCACACACATATGTGAATGGTGGAACTGTAAGACCAGGTAACAAGTTTGATGTGGCAACCGCAACCTACAATACTGAAAATGGTATTGTTAGAGTTACTACCACTGAAGATAACTACTTGGTTCTTGGTAGAGGAGTTAACCTACAGGGTCTAAACTTCTCCTGTACCTCTGGTGGTCCTAACAACAAACCTGGAACACTAAC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Tertiary structure

PDB ID
1126591e15bc711553fbfc57413a2aad75e838c4e16bc94d9a627f65d1a47a43
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5012
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50