Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAM0102975.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MATKIEVTKLNALDDNLVEGQKVIEIILGPTIGADTADLALAVAQAEAAQAAAELAEDNAKASELAALASEGAAQTAQTLAEVAEGNAKASEIAAQSSEDDAQISEDAAAASEAAALASQNAAAVSAAAALASENAAQSSEDDAQVSEDNAAASEVAAAASAAAALASENAAQSSEDDAQISEDAAAASAAAALASENAAQSSEDDAKVSEDAAAASAAAALTQANRAETEADRSETEADRAQTIADSMTTALVPRGDWDASTGAFPTPTLSPERADFYQISVAGTMTTNKPAGQDDLSVEVGDQLYWNVVIDVWYSIDNTDQVTSVDGKKGVVVIDKYTQAEADARFVNAAGDTMTGALTIEESVMLVGNTAADNYMELAQVYGSSYGFTFQHNNASTMTNLQGSTNQALVLGDVSANVTDVLLGVSLKEGAGAWTKRLELDGAGELYLGSGAAYRTFHENYHPNADKWTTSRTVTLTGDATGSFAIDGSADVSVSVVVEDDSHVHTDYLSNVATDLSNIMYGNIYASDEKPLIQLVGDDAYFGSHGRVGLQLASSSNPEWKTSTAAYKLFNESYHPNADTWTTARTITLTGDATGSFTMDGSSDESVEVTVVNDSHTHDTRYLKLAGGYMAGEITGPYSWVLNRTFVMIENETPQYLLLCLNAGGNNVNGEFILNRTSGNYQSANLNVVVSSGSSVSPYGTIVSVQSTQDDEEYRLVTVDYAGDSWVAIKYVGNSYPVTDPGLFSGRIQSSKAGSLTAVGAASITNEAPLRDATKFELNGQAIFHQGYHPNADKWTTSRTVTFTGDATGSLSLDGSSNESVTMTVVDDSHNHSYVNGTFEIRHANEQLKLVDTTDGNKWWMLDHQNGDLNFRYNGVSVTPALVIHETGNYVSAPSFSATTYLNLPIENVRTGNQADIRYNPVKGFEGHDGVEWGAIGGGGGVEWEATTGTSVVAETGAGYLVTEAGVTVVLPPTPDQGNTVGVGDYNGLNFEVTINPNGGKIMGLTEDFTFDTKNANIVFSYVDTTVGWILTQGFGESEAPQAIANKVIVTDAVGQSVISIPNNGSQTVDVWYNGLKLLRNDDYIVDEDLDTVTLTDPIDLSDDIVEVYAWNQALVLDTTDLLYHGTQMRKTIEGDGISLTEAIEARAPQPNLLINGDFVINQRQFAISSDVPIDGEFFVDRWFARNAIGGTNLCYSDFRNNTGMYTRMTHTGAAVSAYIGQRIEVMDWRPFVNTTASVEVSHSQDCVMSGVIHLRRVSDDTVLSSVFSNEVIVTPGLKTVVFTMEGLDISMVGSTECYAEFRIIYNNGGSIATPDGQYRFYTAKLESGLLATPFVPDSPQESLAKCQRYFYTTRGRTKSQIFGTATVSSTNDGTFQAGVPIPVPMRINKPALTQFGSFAIYGVSSTSGAKDETVTFTDGGSGAGVGFIDIIIQSNTVPTLLRGAVTLRGLNSSAWFNVDAEL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1465 AA molecular weight: 155041,17710 Da isoelectric point: 4,25061 aromaticity: 0,07782 hydropathy: -0,16928
Domains
Domains [InterPro]
Coil
39–66
39–66
1
1465
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAM0102975.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ196886
[NCBI]
CDS location
range 20301 -> 24698
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACAAAAATAGAAGTAACCAAGCTTAATGCCTTAGATGACAATCTAGTAGAGGGTCAGAAGGTAATTGAGATCATACTTGGTCCGACTATCGGGGCAGACACAGCAGATCTAGCCCTTGCTGTTGCGCAAGCAGAAGCAGCACAGGCAGCTGCAGAGTTAGCGGAAGATAACGCTAAGGCCTCTGAACTTGCAGCGCTAGCATCAGAAGGTGCGGCACAAACAGCACAAACACTTGCAGAAGTGGCAGAAGGCAATGCTAAGGCATCCGAAATAGCTGCACAGAGCTCAGAAGATGATGCTCAAATATCAGAAGATGCGGCAGCAGCCTCTGAAGCGGCAGCGCTTGCGTCTCAAAACGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTTCAGAAAACGCAGCACAAAGCTCAGAAGACGATGCTCAGGTGTCAGAAGACAACGCGGCAGCCTCAGAAGTAGCGGCAGCGGCATCAGCAGCTGCGGCACTTGCGTCAGAAAACGCAGCACAGAGCTCTGAGGATGATGCACAGATCTCCGAGGATGCAGCGGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCACTTGCATCTGAGAATGCAGCGCAAAGCTCAGAAGACGATGCTAAAGTATCAGAAGATGCAGCAGCGGCATCCGCAGCGGCAGCACTAACTCAGGCAAACCGCGCAGAGACAGAAGCAGATCGCTCAGAAACAGAAGCGGATCGTGCTCAAACCATCGCAGATTCTATGACAACAGCTCTAGTTCCTCGCGGTGACTGGGATGCATCTACAGGAGCATTCCCTACACCTACACTATCTCCTGAACGAGCAGACTTCTATCAGATCTCCGTAGCAGGTACAATGACAACTAACAAGCCTGCTGGACAGGATGATCTATCAGTTGAAGTAGGTGACCAATTATACTGGAACGTTGTAATCGACGTTTGGTACTCAATAGACAACACAGACCAAGTTACTAGCGTAGATGGTAAGAAAGGTGTTGTTGTAATTGATAAATACACACAGGCTGAAGCAGACGCTCGCTTTGTAAACGCTGCAGGCGATACGATGACTGGCGCTTTAACTATCGAAGAAAGCGTAATGTTAGTGGGAAATACCGCGGCGGATAACTACATGGAACTTGCCCAAGTTTATGGTAGCTCTTACGGGTTTACTTTCCAACATAATAACGCATCCACTATGACTAACTTGCAGGGTTCAACCAACCAAGCACTAGTTCTAGGTGATGTTAGTGCAAATGTTACAGACGTGCTATTGGGGGTGTCCCTAAAAGAAGGTGCGGGTGCATGGACTAAGCGTCTTGAACTCGACGGAGCAGGTGAATTATACCTCGGCTCTGGTGCAGCATATAGAACTTTCCATGAAAACTACCACCCTAACGCAGACAAGTGGACAACCTCTCGTACAGTAACCCTTACAGGTGATGCTACTGGTAGCTTTGCTATTGATGGATCGGCAGATGTCTCAGTCTCCGTTGTTGTTGAGGACGACAGTCACGTCCACACGGATTACTTGAGTAATGTAGCAACCGACCTAAGTAACATTATGTATGGTAACATATATGCCTCCGACGAGAAGCCCCTAATACAACTAGTCGGGGATGACGCATATTTTGGGTCTCACGGCCGAGTAGGATTGCAACTGGCATCCTCGTCAAACCCAGAGTGGAAGACTTCAACAGCCGCCTACAAACTATTTAATGAGTCCTACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACAATTACTCTTACTGGTGATGCTACAGGTTCATTTACTATGGACGGTTCCTCTGATGAATCGGTAGAAGTTACAGTCGTTAATGACTCCCATACCCATGATACGCGTTACTTAAAACTAGCTGGTGGGTACATGGCCGGTGAGATTACAGGGCCTTACAGCTGGGTACTAAATCGCACTTTCGTTATGATTGAGAACGAGACTCCTCAGTACCTATTGCTATGTCTCAACGCGGGAGGCAACAATGTGAACGGTGAGTTCATACTGAATAGGACGTCTGGTAATTACCAGTCTGCTAACCTTAATGTTGTAGTCTCTTCTGGTTCTTCTGTATCGCCGTACGGTACTATAGTGTCCGTGCAATCTACCCAAGATGATGAAGAGTACAGGCTAGTAACAGTGGACTATGCAGGCGATAGTTGGGTAGCTATTAAGTACGTAGGCAACTCGTATCCTGTAACAGACCCTGGTCTATTCTCAGGGCGTATACAGTCTTCTAAAGCTGGTTCACTTACTGCTGTAGGTGCCGCGAGCATAACCAATGAAGCACCCCTAAGAGACGCTACTAAGTTCGAGTTAAATGGGCAGGCTATATTCCATCAAGGATACCACCCTAATGCAGATAAGTGGACTACATCTAGAACAGTTACATTCACCGGTGATGCAACAGGCTCACTGAGTTTAGATGGCTCTTCAAACGAATCTGTTACTATGACAGTTGTAGATGACTCACATAATCACAGCTATGTTAACGGTACATTTGAGATTCGCCACGCTAATGAGCAACTTAAGTTAGTGGATACTACAGATGGTAATAAATGGTGGATGCTAGATCACCAGAATGGTGACCTTAACTTCCGCTATAACGGAGTGTCAGTAACCCCTGCCCTAGTAATACATGAAACAGGTAATTACGTTAGTGCCCCTAGCTTTAGTGCTACAACCTACTTAAACCTACCTATAGAGAATGTCCGTACTGGTAATCAGGCAGATATTCGATACAACCCAGTCAAAGGCTTCGAAGGACACGACGGAGTAGAGTGGGGAGCTATTGGTGGTGGTGGTGGTGTTGAGTGGGAAGCAACCACAGGAACATCTGTAGTTGCAGAAACTGGCGCAGGCTATTTAGTTACAGAAGCCGGAGTTACAGTTGTACTTCCACCAACCCCAGATCAAGGTAATACTGTAGGTGTAGGTGATTACAACGGTCTTAACTTCGAAGTAACTATTAACCCTAACGGTGGTAAGATCATGGGGCTTACTGAAGATTTTACCTTTGATACCAAGAACGCTAACATAGTATTCTCTTACGTAGATACAACGGTTGGTTGGATCCTTACACAAGGTTTTGGTGAATCTGAAGCGCCACAGGCTATTGCTAACAAGGTTATAGTAACAGATGCAGTCGGACAGTCCGTTATCTCTATCCCAAATAATGGATCTCAGACGGTAGATGTATGGTATAATGGTCTTAAACTCCTACGCAACGACGACTACATCGTAGATGAGGACTTAGATACTGTTACGCTAACAGACCCTATAGACTTAAGTGATGATATAGTTGAGGTATACGCTTGGAATCAGGCTCTAGTACTAGATACTACTGATTTACTGTACCACGGTACGCAGATGCGTAAAACAATCGAGGGTGACGGTATTTCTCTTACAGAAGCTATTGAAGCCCGTGCTCCGCAACCAAATCTATTGATTAATGGTGACTTTGTTATCAACCAGCGTCAGTTTGCTATAAGTAGTGATGTTCCAATTGATGGGGAGTTCTTTGTTGACCGTTGGTTCGCTCGTAACGCAATAGGCGGTACTAACCTTTGTTACTCTGATTTCCGTAATAACACAGGTATGTATACTCGTATGACTCACACAGGAGCTGCAGTTAGCGCATACATTGGTCAAAGAATTGAAGTTATGGACTGGCGTCCGTTCGTAAATACAACAGCGTCTGTGGAAGTTAGTCACTCGCAAGATTGTGTCATGAGTGGTGTTATTCATCTTCGTCGGGTTTCTGATGATACTGTCCTTTCTTCTGTATTTAGTAATGAAGTTATCGTTACACCAGGGTTAAAGACAGTAGTGTTTACTATGGAAGGTTTAGACATCTCTATGGTGGGGTCTACAGAATGTTACGCAGAGTTCCGAATCATCTATAACAACGGAGGTAGCATCGCTACACCGGATGGTCAGTATCGTTTCTATACTGCTAAGTTGGAATCTGGTTTATTAGCTACACCATTTGTTCCGGACTCTCCTCAAGAGAGCCTGGCTAAGTGTCAGCGCTACTTCTACACAACTAGGGGCAGAACAAAGTCTCAAATATTCGGAACAGCTACCGTATCCAGTACTAACGATGGCACATTCCAAGCAGGCGTACCGATTCCTGTACCTATGCGAATTAATAAACCAGCACTTACTCAGTTTGGTTCTTTCGCTATTTACGGGGTTTCTTCTACGTCAGGTGCTAAGGATGAGACAGTAACCTTTACAGACGGAGGCTCTGGGGCAGGTGTAGGTTTCATTGACATCATAATACAGTCTAATACAGTGCCTACCTTGTTAAGAGGTGCGGTAACGCTTAGGGGACTTAACTCAAGTGCGTGGTTTAATGTAGACGCGGAACTGTAA
Tertiary structure
PDB ID
d6db08c97fee4892163082dc0ce9011cbda2ea4560229dbfd17da70a6a93ce96
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50