Protein

View in Explore
Genbank accession
XWX30339.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,49
Seq2Symm
C1 confidence 0,786
C1 0,786
C3 0,732
I 0,001
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAFSYTKLIESNTIVEMMNKVNSIGTELSKPNSIYKELADLKNLVNTYQKYKVTDDNGLLSSGDEINLNTINSSKTVFGYIADPPKGVSNKGWVEYKEDSNRDSAMVTFTPLDSDNVYNKVRKLPKQTQNPNLLHDTTFSELPMYGSFTIPEGLWWDTNGDRTTVNYPDPTVKYQGINTVRLQDTATTYPMLRHKGLEVGKDVNIGDKVTLSAYIYTPDKSLFNGNNAYITITGYPGEIGSTNTSLSTANVYESDLENGQWKKITCTATVPSTVSGSPIQYISAMLRLSLTKGGLNNGLKVYYALPKLEKGTVATPYVSHSDDKIQFNELWSEWSEQKSKLQSINDSVTDIYHDNYFKYAWWKDKVGTRTLQELAYELPQGFHTFYAQRGIPGILPDASIRGMINVDYHEGDITNNNKFIQVYYMDYNGNFYTQYYDANKGWYETIRSVGSRELWTGTQDMGGNLNYIYNLQDDINNYDYIEIEYYTNNSSRFTETRKLKVLSSSALAITTNRMDANDPTGTNISTWQAEFSIDNNTQITGRYCKRMLVNNSGNRSILGHNTSGLFTIKRIVGIKE
Physico‐chemical
properties
protein length:576 AA
molecular weight: 65239,96750 Da
isoelectric point:5,68483
aromaticity:0,11458
hydropathy:-0,59549

Taxonomy

Phage
Staphylococcus phage PG-2021_15 [NCBI] · taxon 2815614
Uroviricota Caudoviricetes Herelleviridae Staphylococcus phage PG-2021_15
Host
Staphylococcus xylosus [NCBI] · taxon 1288
Bacillota Bacilli Caryophanales Staphylococcaceae Staphylococcus Staphylococcus xylosus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XWX30339.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ417318 [NCBI]
CDS location
range 80480 -> 82210
strand +
CDS
ATGGCGTTTAGCTATACTAAGTTAATAGAAAGCAATACCATTGTTGAAATGATGAATAAGGTTAATAGCATTGGTACAGAATTATCTAAACCTAATAGCATATACAAAGAGTTAGCAGACCTTAAAAATCTAGTTAATACTTATCAAAAATATAAGGTTACTGATGATAATGGTTTACTAAGTTCAGGTGACGAGATTAATTTAAATACAATAAATAGTTCTAAAACGGTATTTGGTTATATAGCAGACCCACCTAAAGGTGTGAGTAATAAAGGTTGGGTAGAATATAAGGAAGATAGTAATAGAGATTCAGCTATGGTAACATTTACACCTTTAGATAGTGATAATGTTTACAATAAAGTACGTAAGTTACCTAAACAAACACAAAACCCTAACTTACTGCACGATACAACGTTCTCAGAGTTACCTATGTATGGTTCGTTTACAATACCGGAAGGTTTATGGTGGGATACTAATGGTGATAGAACTACAGTTAACTACCCAGACCCTACCGTTAAATATCAAGGTATCAATACAGTAAGGTTACAAGATACAGCTACAACCTACCCTATGTTGAGACATAAAGGATTAGAAGTAGGTAAAGATGTAAATATAGGGGATAAAGTAACACTTAGTGCTTACATTTATACACCGGATAAATCATTATTTAATGGGAATAATGCCTATATTACAATAACGGGATATCCCGGTGAGATAGGTTCTACTAATACCAGTTTATCTACTGCTAATGTGTATGAAAGTGATTTGGAAAACGGTCAATGGAAAAAAATTACATGTACAGCTACAGTTCCAAGTACAGTAAGTGGTTCACCTATACAATATATTAGTGCTATGTTAAGGTTAAGCTTAACTAAAGGTGGTCTTAATAATGGACTTAAAGTTTATTATGCACTGCCTAAGTTAGAAAAAGGTACGGTAGCAACACCTTATGTATCACACTCGGATGACAAGATACAGTTTAATGAATTATGGTCAGAATGGTCAGAGCAGAAAAGTAAACTACAATCTATAAATGATAGTGTTACCGATATCTACCATGATAACTACTTTAAATATGCATGGTGGAAAGATAAAGTAGGTACTAGAACATTACAAGAACTAGCTTATGAATTACCACAAGGTTTCCATACGTTCTATGCTCAAAGAGGTATACCGGGTATATTACCCGATGCTAGTATTAGAGGTATGATTAATGTAGACTACCATGAAGGTGATATAACTAATAATAACAAATTTATCCAAGTTTATTACATGGATTATAATGGTAATTTCTATACTCAATATTACGATGCCAATAAGGGTTGGTATGAAACTATAAGAAGTGTCGGTTCAAGAGAACTTTGGACTGGTACACAAGATATGGGAGGTAATCTTAATTATATATATAATTTACAAGATGATATAAATAATTACGATTATATAGAAATTGAATACTATACTAATAATTCAAGTAGATTTACAGAAACTAGAAAGTTAAAAGTTTTAAGTAGTTCTGCCTTAGCCATAACAACTAATAGAATGGATGCTAATGACCCTACCGGTACTAATATAAGTACATGGCAAGCAGAGTTTTCTATAGACAATAACACCCAAATAACTGGTAGGTATTGTAAACGTATGCTTGTTAATAATAGTGGTAACAGGTCTATACTTGGTCATAATACTTCGGGATTATTTACTATAAAGCGTATTGTAGGTATTAAGGAATAG

Genome Context

Tertiary structure

XWX30339.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 74.2
Oligomeric state monomer
Download structure