Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOO04667.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MAREVPGSGAVIKPIFDEVFGVRAVELINSGSGYDPADPPRLTIDGCGTPEREALLYPIIDADSGKIIHVRVLERGRGYDPLRLQIVPTSETPSVLDSFDVNRIWQSHPNSLTRGTFQTAGVPPVKNDRLRIESDNHPKPTWTSAEAVPGGGPLVDRSFDQVFIYRGGKDVPNPGTRTGQNNKSLGILANGGLLHTPEWGTVGNAPINFSIDTVKYDYVKDTNANDVIVDNNIHYYQTSKLINEFKDTNGVFEWGKFEQFVWNIKVEFDNVMLTVNNIDETLSEVEVGRTVTEIGGSARGEIAKIVRNGQNVITRVYLRDVTGTFEDGDLLLGSTGFGMRVNADPITFPNGIFYIDFGADATEFGPFVPGQYYFAPENVRVKRNYLIVWNQDDSTNQPSAMHTLGHPMQFSTTQDGLLTGGTLYYNSTGSSAAPATDYENEFRPIFMMNADETNRIYYYCKVHRYMSGYDGDEGYMILDPTIEDEDIVNNYYVENYYQSDSNDPATIDRSRHVNGHSKVLGMSFDGYPIYGPYGYTTGRTVGKMISAYRLRTTEELPGTREEVVTASTVTYTITVSNNKFYVGGQEEQLLTLKRGKTYAFNQDDSSNDSHYLFFSLSNDGWHGTGDPANIGSEAYLYTGEDSVTYHLEGSAVTKLEYLQGFNTATAREIRITIPVNAPRVAYVFSYLDSGHGIRLVNEGYILGDLTQDYIYDATIGGSSLDPEYNNGPIVNVVGDGSDFFKREVTSNGVRILGAGTVGGQTAVPDAWLEKVARMVELFTDVNGAGINETSQRNLIKTLSGDAGTYHAGLPTIQRVARGAGADYTPNFLTDAGIIAWNLTDLFDTTVQNDMVWYLNSTGDGYGDGDIDAQEVIEHVFHTLHMHGLPADDIKLYPYISSDWNTGDLYAAMEEAYDAGKWDPSGYQSPSNAWKTDADAFEVAAKEYLFLLNFAMFEYTELWDGGSLAPEWTDDMRTQAGIQANNPLGYAFHNTYIAPVISKPSLATIRSIFQDGNTPAQDDPSLAGASGYVVDISSGESLDEFNGKFGPTPEYPNGTYAYFMTEDQSGIPQYPYAIGPKYYSVPLFEGDTVPDLVSSFPTQASGDIILNNDGTISYIKMTKKGDSFFGSAKAVILGGEGTGAKATPVTQTVTGLSLLNQGRSYATPPNLIFEGGGGQGAEGAAQIDTLGKVTSISVVDPGEFYQEPPFILITGGGGIGAKAEAVISQGEITGINVIDPGEGYTSPPNIVFTKLVNLKRKTRARQAFNSTDIYLTGLTKTLGSQDTQIFVTSTDAYAGSGQLIVNKETITYTAKSRGRFTGLTRGVNFKYDQRIILDTGQNDGDGVSTYGFNVGDRVIRRVENAGNKVAKVYDWDPATRELLVTFEVDELAFIDAGIPSTEDAIVQFDAGVANSSGTGVLPHTVIEETDSTIITLTYPIGTIQNRTFEDDDENDGAGDGIPDLLNAGTTFADQINLDGGIYNSLYGIEETQGGQNTTLFQVGDNIKDASIPFKFATVIAAGGLSDGVEHVAQVVLTLGSGSGTFQVNELVTGDVSGVRGTVVSWDNNTKKLTLKDIVPYNLNNVALGVNGFLYEFSHNSTIVDFVITDNGTNYTVAPTITVENTGDIQATGTVNLTAAGDQVASISITNGGYGIPQTVDAGYSLHPTITFTNDVSDTTGSGASAQAVLGGELAVGNGGGSYRIKSIEYVTLVRSDSA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1713 AA molecular weight: 185276,48580 Da isoelectric point: 4,46939 aromaticity: 0,10158 hydropathy: -0,28313
Domains
Domains [InterPro]
IPR025924
1025–1066
1025–1066
1
1713
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-RIM2 [NCBI] |
687800 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO04667.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349259
[NCBI]
CDS location
range 74382 -> 79523
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAGAGAAGTTCCTGGATCTGGCGCAGTAATCAAGCCAATCTTCGATGAAGTTTTTGGTGTACGCGCAGTTGAGTTAATCAACAGTGGTAGTGGGTATGATCCTGCAGATCCACCTAGACTAACTATCGATGGTTGCGGGACGCCTGAACGAGAGGCGTTATTGTATCCTATTATCGACGCAGACTCGGGTAAAATCATTCATGTCCGTGTTCTTGAAAGGGGTAGAGGATACGACCCCTTAAGACTTCAGATTGTTCCTACTTCCGAAACACCCAGTGTTTTAGATTCTTTTGATGTCAATAGAATCTGGCAGAGCCATCCTAACTCATTGACTAGAGGCACTTTTCAAACTGCTGGTGTACCTCCTGTTAAGAATGATAGACTTCGTATTGAATCAGATAACCATCCCAAACCTACCTGGACAAGTGCAGAGGCGGTTCCTGGTGGTGGTCCTCTTGTAGATCGTTCTTTTGATCAGGTATTCATTTACAGGGGCGGTAAAGACGTTCCTAATCCTGGAACTAGAACAGGACAAAATAATAAGTCGCTTGGTATTTTAGCGAACGGTGGTCTTCTTCACACTCCCGAATGGGGAACGGTTGGCAATGCTCCAATCAACTTTTCTATTGATACTGTAAAGTATGATTATGTAAAGGATACGAATGCTAATGATGTTATTGTTGATAACAATATTCATTATTATCAAACAAGTAAACTGATAAATGAGTTTAAAGATACCAATGGTGTATTTGAATGGGGTAAGTTTGAGCAGTTTGTCTGGAATATTAAGGTAGAGTTTGATAATGTGATGTTGACAGTCAATAATATTGACGAAACATTATCTGAAGTTGAAGTTGGTAGAACTGTAACTGAAATTGGTGGAAGTGCTCGTGGTGAGATTGCAAAGATTGTTAGGAACGGTCAAAATGTAATCACTAGAGTTTACCTCAGAGACGTTACAGGAACATTTGAAGATGGCGACCTTCTTCTTGGTTCTACAGGATTCGGTATGCGAGTCAATGCAGATCCAATAACGTTCCCTAACGGTATTTTCTATATTGATTTTGGTGCCGATGCTACCGAATTCGGTCCTTTTGTTCCTGGTCAGTATTATTTTGCTCCAGAAAATGTCAGAGTCAAGAGAAACTATCTGATTGTTTGGAATCAGGATGATTCTACAAATCAACCTAGTGCAATGCATACCTTAGGTCATCCAATGCAGTTCAGCACGACTCAAGACGGTCTGCTAACTGGTGGCACTTTGTATTACAACAGCACTGGTTCATCTGCTGCTCCTGCTACTGATTACGAGAACGAGTTCAGACCTATATTCATGATGAATGCGGATGAAACTAACCGCATCTATTACTATTGCAAAGTCCATCGTTACATGTCTGGATATGATGGTGACGAGGGTTATATGATTCTCGATCCCACTATTGAAGATGAGGACATTGTAAATAACTATTATGTTGAGAACTATTATCAATCTGATTCTAACGATCCAGCAACCATTGACCGTTCTAGGCACGTAAACGGTCACTCTAAGGTTCTGGGTATGTCCTTTGATGGATACCCCATCTACGGTCCATATGGATACACTACAGGTAGAACTGTAGGCAAAATGATTAGTGCTTACAGATTAAGAACTACAGAAGAACTTCCTGGTACTAGAGAAGAAGTTGTCACTGCAAGTACGGTAACGTATACTATTACTGTTTCTAATAATAAGTTCTATGTTGGTGGGCAAGAAGAACAACTTTTGACTTTGAAGAGAGGTAAGACATATGCCTTTAATCAAGACGATTCTTCAAATGATAGTCATTATCTGTTCTTCTCTCTGTCGAATGACGGATGGCATGGTACAGGAGATCCTGCGAACATTGGCAGTGAGGCATACTTATATACTGGTGAAGATTCAGTAACTTACCACCTAGAGGGATCTGCAGTTACAAAACTAGAATATCTGCAAGGATTTAATACTGCTACAGCAAGAGAAATCAGAATCACTATTCCTGTGAATGCACCTCGTGTTGCATATGTATTCTCATATCTCGATTCTGGTCATGGTATCCGTCTTGTTAACGAGGGATATATTCTTGGTGATTTGACTCAAGACTACATCTATGATGCTACTATTGGTGGTAGTAGTTTAGATCCAGAATATAACAATGGTCCAATTGTTAATGTTGTTGGTGATGGTAGTGATTTCTTCAAGCGTGAAGTTACATCTAACGGTGTAAGAATACTGGGTGCTGGCACAGTAGGTGGTCAAACAGCAGTTCCCGATGCATGGTTAGAAAAAGTTGCTCGTATGGTTGAACTGTTTACAGATGTAAATGGTGCAGGTATTAACGAAACATCCCAAAGAAACTTGATCAAAACATTGAGTGGTGATGCAGGAACTTATCACGCAGGCTTACCGACTATACAAAGAGTAGCAAGAGGTGCAGGAGCAGATTACACTCCAAACTTCTTAACTGACGCAGGTATTATTGCTTGGAACTTAACTGACTTATTTGACACCACTGTTCAAAATGACATGGTGTGGTACTTGAACTCAACTGGTGATGGGTATGGCGATGGTGACATTGATGCACAAGAAGTTATTGAACACGTATTCCACACACTTCATATGCACGGGTTACCTGCAGATGATATAAAACTATATCCATATATAAGTTCCGATTGGAACACTGGTGATTTGTATGCCGCAATGGAAGAAGCATATGATGCAGGCAAATGGGATCCATCAGGTTATCAAAGTCCATCAAATGCTTGGAAAACAGATGCAGATGCATTTGAAGTAGCCGCAAAAGAATACTTGTTCCTACTAAACTTTGCTATGTTTGAATACACAGAATTATGGGACGGTGGAAGTCTTGCTCCAGAATGGACAGACGACATGCGTACCCAAGCAGGTATTCAAGCAAATAACCCATTAGGTTATGCATTCCATAACACATACATTGCTCCAGTTATTAGTAAACCATCACTTGCTACTATTAGAAGCATATTCCAAGATGGTAATACACCAGCACAAGACGATCCAAGTTTAGCAGGTGCGTCAGGATATGTTGTTGACATTTCTTCTGGGGAATCTCTTGATGAGTTCAATGGTAAGTTTGGACCCACTCCTGAGTATCCTAATGGTACATATGCATACTTCATGACTGAGGATCAATCTGGTATTCCTCAGTATCCATATGCGATTGGTCCTAAGTATTACAGCGTTCCTTTATTTGAAGGTGATACTGTTCCCGATCTTGTATCTTCTTTCCCAACACAGGCATCTGGTGACATCATTCTGAATAATGATGGAACGATTTCATACATTAAGATGACGAAGAAGGGTGACAGTTTCTTCGGTTCTGCAAAAGCAGTTATTCTTGGTGGTGAAGGAACAGGGGCAAAAGCAACTCCCGTAACTCAAACTGTCACTGGTCTGTCTCTGCTAAATCAGGGTAGAAGTTATGCTACACCACCTAACCTCATCTTTGAAGGTGGTGGTGGACAAGGTGCTGAGGGTGCTGCTCAAATCGATACTCTTGGTAAGGTTACCTCTATCAGTGTGGTAGATCCTGGGGAGTTCTATCAAGAACCTCCTTTTATTCTCATCACTGGTGGTGGTGGCATTGGTGCTAAGGCAGAAGCAGTCATTAGTCAAGGTGAGATTACTGGGATTAATGTTATTGACCCTGGTGAAGGATACACCTCTCCTCCAAATATTGTCTTCACAAAACTCGTTAATCTCAAACGTAAGACAAGAGCACGTCAAGCATTTAACTCAACTGACATCTATCTTACTGGTCTTACCAAAACTCTTGGATCTCAAGACACGCAGATTTTTGTCACATCTACTGATGCATATGCTGGTTCTGGTCAACTTATCGTTAATAAAGAGACCATTACATATACTGCGAAGAGCAGGGGTAGATTTACAGGACTAACTAGAGGTGTAAACTTCAAATATGATCAGAGAATCATTCTTGACACAGGACAGAACGATGGTGATGGAGTTTCCACTTACGGATTTAATGTTGGTGACCGAGTAATCCGTAGGGTTGAGAATGCGGGCAACAAAGTTGCTAAAGTCTATGACTGGGATCCTGCGACAAGAGAACTGTTAGTTACGTTTGAAGTCGATGAACTGGCATTTATTGATGCTGGTATTCCTTCTACTGAAGATGCAATTGTTCAGTTTGATGCTGGCGTTGCTAATAGTTCTGGTACTGGTGTTCTTCCTCATACAGTTATCGAAGAAACCGATTCCACTATTATTACTTTGACATATCCTATCGGAACTATTCAAAATAGAACCTTTGAGGATGATGATGAAAATGATGGTGCTGGTGATGGTATTCCCGATCTTCTCAATGCTGGAACTACCTTTGCCGATCAAATCAATCTTGATGGTGGTATCTATAACTCTCTATATGGTATTGAAGAGACACAAGGTGGTCAGAATACTACATTGTTCCAAGTTGGCGATAATATCAAAGACGCATCTATACCATTCAAGTTTGCAACCGTCATTGCGGCAGGTGGACTGAGTGATGGCGTTGAGCACGTTGCACAAGTTGTTCTAACTCTTGGTAGTGGTAGTGGTACTTTCCAAGTAAATGAACTTGTCACTGGTGATGTTTCTGGTGTTAGAGGAACAGTTGTTTCTTGGGATAATAACACTAAGAAACTTACACTTAAGGATATTGTTCCTTATAACTTGAATAACGTTGCACTTGGTGTCAACGGATTCCTGTATGAATTCTCTCATAATAGCACTATCGTTGATTTTGTTATTACAGATAATGGAACAAACTATACTGTTGCTCCAACTATTACAGTTGAAAATACTGGAGATATTCAGGCAACTGGAACAGTAAATCTTACTGCTGCAGGTGACCAGGTTGCGTCGATTTCAATCACAAATGGAGGATACGGAATCCCTCAAACAGTTGATGCTGGTTACAGTCTCCATCCTACGATCACCTTTACTAATGATGTATCCGATACAACTGGATCTGGTGCATCTGCTCAGGCAGTTCTTGGCGGAGAACTGGCAGTTGGTAACGGTGGCGGTTCGTATAGAATCAAGAGCATTGAGTATGTGACATTGGTCCGCTCAGATTCCGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
ce45bcfb07df60dc6088ef89e9685655480e481e63ec4b34523e620d39a78670
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50