Protein
View in Explore- Genbank accession
- XPK40268.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MIVYNNQAPANPNNVGQFGATEGSIGAYKQAAEYAADSKYWALLAESKFGTIDDLIAQVERLYQQGVLLREDIEDLKQDFAAQDVRLMNLIAQTNAAVADANNSVALIDQKIVEVQKQLDILMDMKVTVTTLPPGSQATGSFDNQTGEIKLGIPEGEKGADGSVTDLSTVSSGVPELGDLGFYVDKDDNTVHKTTLENIANLIPSVRSISVNGGEAQDGDVALDINKTTVGLGNVLNVAQYSRQEINDKFDKPIKIYQSKAEADANAQYRQAGESVLVWEDTQYVFYTVAANKTLTPVKSESRILTVNSRSPDSTGNIDITIPTGNPSLYLGEMVMFPYDPNKTVAYPGVLPADGRLVSKENASDLGPSLVSGQLPVVSETEWQAGAKQYFSWGKLADGITDADSTNFINIRLPDWTGGEAIRAPDSIKDSNYKGRIQNQIPYIVTVNGKGPDDANGNVVLSASNIGAAASGANSDITSLSGLTTPLSPSQGGTGVTDLGMLRRAILVQGVECNDQAGPQSYNSYKSPNGTYTFKVDNSGLVAAINTGTEAVVPFAVSAGGTGGTTPAESRSNLGLDRVDQRELETVIYSPDKNSYIFMNNGDWGCFSNVSGTIALSIPRGGTGAQSVEGAKTNLGIDKFVQSSTDTKVLDGEGTHTFFVAGNDWGYFNNADSVRVALPVISGGTGGTTPAHSCENLSALHTQYGADTFYGSEDLPSGIGFYSGDSSPFPGGNGAPYTYAEIMTIAEGGRGGNWSQIGFSTITNQAPRYRQRTNDPALITNWRDFLIRDLNTTVDVNGFVKIASPIVKVKSDGSFEVNDAAVGATVEKLGVGIYKVSGVLGFNSDPSWGGTSGGFSVPYNSNGLALLWVDYEIEETGDIILKTYHRVHADAPVFARNEIDGLADGDPVDIPEGRWIDLRVEMPSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 925 AA molecular weight: 98291,62440 Da isoelectric point: 4,49582 aromaticity: 0,07892 hydropathy: -0,27438
Domains
Domains [InterPro]
Coil
59–79
59–79
1
925
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage AnnaHegner_Bas87 [NCBI] |
3398404 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPK40268.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ850594.1
[NCBI]
CDS location
range 8487 -> 11264
strand +
strand +
CDS
ATGATCGTTTATAACAACCAAGCACCAGCTAATCCTAATAATGTTGGTCAGTTTGGTGCTACAGAAGGCTCTATCGGAGCCTATAAACAAGCAGCGGAATATGCTGCTGATTCTAAATATTGGGCACTTTTAGCAGAATCTAAGTTTGGGACAATTGATGATCTGATTGCACAGGTAGAGCGTCTATACCAACAAGGTGTTTTACTCCGAGAAGATATTGAAGATTTGAAGCAGGATTTTGCTGCTCAAGACGTTCGCTTAATGAACCTGATTGCTCAAACAAACGCTGCTGTTGCAGATGCCAATAACTCAGTTGCACTTATTGATCAAAAGATTGTAGAAGTCCAGAAGCAATTGGATATTCTAATGGATATGAAGGTTACTGTCACTACCCTGCCTCCGGGTTCTCAAGCTACTGGCTCTTTTGATAACCAAACTGGTGAGATTAAGCTGGGAATTCCTGAGGGTGAAAAAGGTGCAGATGGCTCTGTAACTGACTTATCAACAGTATCTTCTGGGGTTCCCGAGTTAGGGGATTTAGGTTTTTATGTAGACAAAGATGATAACACTGTACATAAAACCACCCTAGAAAACATTGCTAACCTGATCCCTTCTGTTCGCTCTATCTCTGTCAATGGTGGAGAGGCTCAGGATGGTGACGTTGCTTTGGATATTAATAAAACCACAGTAGGTTTAGGTAATGTTCTTAATGTAGCTCAGTACAGTCGCCAAGAGATTAATGATAAGTTTGACAAACCTATTAAGATTTATCAATCCAAAGCAGAAGCAGATGCAAATGCTCAATATCGTCAAGCCGGAGAATCTGTTTTAGTTTGGGAAGACACTCAGTATGTATTCTACACTGTTGCTGCTAATAAAACCTTAACTCCAGTTAAATCTGAAAGTCGTATATTGACAGTAAACTCAAGATCTCCCGACTCTACAGGTAATATTGATATTACAATACCTACAGGGAACCCTTCTCTATATTTGGGTGAAATGGTAATGTTTCCATATGACCCTAACAAAACTGTAGCATACCCCGGTGTGTTGCCTGCTGATGGTAGATTAGTTTCTAAAGAAAACGCATCTGACTTAGGTCCATCTCTTGTTAGTGGACAGTTACCAGTAGTTAGCGAAACCGAGTGGCAAGCTGGTGCTAAACAATATTTCTCTTGGGGTAAGTTAGCTGATGGTATCACTGATGCAGACTCTACCAACTTCATTAATATTCGACTTCCAGACTGGACTGGTGGAGAAGCCATTCGTGCTCCAGATTCTATTAAAGACTCTAATTACAAAGGTCGTATCCAGAATCAGATTCCTTACATTGTGACCGTAAATGGTAAAGGTCCAGATGATGCTAATGGTAATGTGGTATTATCTGCCTCTAATATCGGAGCAGCTGCTTCTGGCGCTAACTCGGATATCACTTCACTCTCCGGTTTAACTACACCACTATCTCCAAGTCAAGGTGGTACAGGGGTAACCGATCTTGGAATGCTTCGTAGGGCTATTCTAGTTCAGGGTGTAGAGTGTAATGATCAAGCAGGTCCACAGTCTTATAACAGCTACAAATCCCCTAATGGGACATATACTTTTAAAGTTGATAACTCTGGGTTAGTTGCTGCTATTAATACAGGCACAGAAGCAGTTGTTCCTTTTGCAGTAAGTGCAGGAGGTACAGGAGGCACTACTCCGGCTGAATCTCGTAGTAATTTAGGGCTTGACAGGGTTGATCAAAGAGAATTAGAGACTGTAATCTACTCTCCCGACAAGAACTCCTATATCTTTATGAACAACGGAGATTGGGGGTGCTTTAGTAATGTTTCAGGGACTATAGCTCTTTCTATTCCGCGTGGTGGTACAGGTGCACAAAGTGTTGAGGGAGCTAAAACTAATCTCGGAATCGATAAGTTTGTACAAAGTTCTACGGATACTAAGGTGTTGGATGGTGAAGGGACTCATACATTCTTTGTAGCCGGAAATGATTGGGGGTATTTTAATAACGCTGACTCTGTACGAGTTGCGCTTCCTGTAATAAGTGGCGGTACAGGAGGCACTACCCCAGCTCATTCATGCGAAAATCTATCTGCGCTACACACTCAATATGGAGCTGACACTTTTTATGGTAGTGAAGATTTACCTTCTGGAATAGGTTTTTATTCTGGTGACTCTTCTCCTTTTCCGGGAGGCAACGGGGCGCCTTACACTTACGCCGAAATTATGACTATCGCTGAAGGTGGTCGTGGTGGTAACTGGTCTCAGATTGGTTTCTCTACTATAACTAACCAAGCTCCTCGGTATCGTCAAAGAACTAATGACCCAGCTTTAATTACAAACTGGAGAGATTTCTTAATCCGAGATTTAAACACAACAGTAGATGTTAATGGTTTTGTCAAAATAGCGTCGCCTATTGTGAAAGTTAAGTCTGACGGCTCTTTTGAAGTTAACGATGCAGCGGTTGGTGCGACAGTAGAGAAGCTGGGGGTTGGTATTTATAAGGTTTCTGGTGTCTTAGGTTTTAACTCTGACCCTTCTTGGGGAGGGACTTCTGGTGGATTCTCAGTTCCTTACAACTCTAACGGATTGGCTCTGCTCTGGGTCGACTATGAGATTGAAGAAACTGGTGATATTATCCTGAAAACCTACCATCGTGTCCATGCTGATGCTCCTGTTTTTGCTAGAAATGAAATAGATGGATTAGCGGATGGGGATCCTGTAGATATTCCAGAAGGTCGGTGGATTGATCTTCGTGTCGAAATGCCATCCAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
a76944681a52c2f8a20319e642c0a82711f577140b4bc07d6a8c1b64146b3d89
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequences of Escherichia coli phages Huey, Dewey, and Louie | Maffei,E., Willi,L. and Harms,A. | — | — | GenBank |