Protein

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Genbank accession
AOO11347.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFSAGTITASLIGNASTASRLSSTRQIQLSQDVTGSGVFDGSANLNINAVLGLVPSLPHYDGTDTSSGTYTKVVVDAKGRITNASNPTTIQDYGLDGTVVGQSAQPYDLDLISLTNLPDGAAGFGIVTRTSTGNITVRYIVTASTQRIIVDNGDGIGGNPAIDLANTTVVPDPTTYSDGNYNTESLTSVTSVGAKGEPVGTQTVNTVKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYPTYSAGASYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGSGAPAHTDSSDTGGWRFLASAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAAGVDNTQLQNNRIIFTDQNTVQEFELDNELTTATAHTGFDYLNYIKVNDTSGNLLFGANNTGDGGAGEIDINVRSYFSDPDITLDGIVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGSGTSNIIVTAEDTVQISASQAAGKVWVEDARFQDNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIVTLGGDTAPVANDNLDRGVEFRYYDSAAKLGFYGYDASYSDLAGHTGGYRFLYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVLAGGAGIGQDVNIGGLLDVDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGQTTLTGALDLNNTLNVSGFTYLESTDEPQIALNSGTGLYEIQNSDYGAFRFNGGGYIEGDFMFNSDVYVNGTVVQKEDETAVFNRQNYLNVRYILYAGSSSARTPSYATDTTTNLRVFGGAGIATDLHIGDDLYIGKLNSSDTIEFQVVGESGNTTIGRSGAGTNSVGTLTVHGDVTFNRDLFANGNITLGNATSDTLTVQANSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLYVLGNTNIDGTLDVDSNFAVRSGTTDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAIEKFSVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGVSGIVTSTNNTQQSINGNSIALDGAARFSGGVGVAKNLAVGEDLMVYGDFNIVGNQVINGTTTYNARIDITNTAEADSLSDNNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDTANARNAFFVDVSTGDATLHNTLTVGGDLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFTFLTDSTNVSEVHTGTDAALRAGSLNLTGTGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVTSGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAAGTITASLAGNATTASRLQTARTITIDGVVDGSVSFNGSSNVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVTRTAANTYAQRSVTATAASGITITNADGVSGDITINVASASTNASNNLVLRDASGNFAAGTITASLVGNVTGNVTGNVTGDLTGQADGADRVVTQEVTTNFDYPIVFASARFTTPTNTQIYTEASGGAAATYNPSTKTLEVETIKCDTISPRDPGAIQFNINANSVTATIGFTGDLTGDVTGDVTGNADTATVADTATQVATQTVQTNFNQEHFLPFVVSNSASVINQSVLTDGGATYNPFQNRITAQTFAGDLTGDVTGNVDGNVAGEVTLEGTVPATATDPGTAGDVRYDADYVYVCVATNTWKRSALATW
Physico‐chemical
properties
protein length:1806 AA
molecular weight: 187513,49990 Da
isoelectric point:4,14359
aromaticity:0,06921
hydropathy:-0,16196

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
1–44
G3DSA:2.10.10.30
SSF69349
4–244
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AOO11347.1
1 1806
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8
[NCBI] 		756278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO11347.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349290 [NCBI]
CDS location
range 82805 -> 88225
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGCTCGGCTACGCAGTGGAGTAATGCAAACCCCACTCTAGCTCAAGGCGAGTTGGGAATCGAACTTGATACGGGTCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACCGCATGGAACTCATTGAGGTATGAGAGACCGATTGAATCTGTGTCAGCAACTGCCAATACTTTGGTGCAACGTGATGCCGATGGAAATTTCTCGGCAGGAACAATCACAGCATCCTTAATTGGTAATGCTTCTACTGCATCTAGACTGTCATCTACACGCCAGATTCAGTTGTCTCAAGACGTTACTGGTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCTAACTTAAATATTAATGCTGTTCTTGGATTAGTGCCATCGTTACCACATTACGATGGTACAGATACTTCTAGTGGCACTTACACAAAAGTTGTAGTTGATGCCAAGGGTAGAATAACCAATGCTTCCAATCCAACCACTATTCAAGACTACGGACTAGATGGCACTGTTGTTGGTCAATCTGCTCAACCATATGACCTCGATTTAATATCGCTCACAAATCTTCCTGATGGTGCCGCAGGTTTTGGTATTGTTACCCGAACATCTACAGGTAACATTACCGTTAGATATATTGTAACTGCTTCGACACAACGCATCATTGTTGATAATGGTGATGGTATTGGCGGCAATCCCGCAATCGATTTAGCAAACACTACTGTTGTTCCAGACCCAACAACATATAGTGATGGTAACTATAATACAGAATCGTTAACTTCAGTAACTAGTGTTGGTGCCAAAGGAGAACCAGTAGGAACTCAAACAGTAAATACTGTCAAATTTACTGTTGATAAGTACGGTCGTCTTCAATCTGCTACAAATGTACCAATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGCAAGTATCCTACATATAGTGCTGGGGCATCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGCAACGTTTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGTTCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGTCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCATGTCACCATTGCCGCCGCTGGTGTAGATAACACCCAATTACAGAATAATAGAATTATCTTTACTGACCAGAACACTGTTCAAGAGTTTGAGTTAGATAACGAACTCACTACTGCTACAGCACATACTGGTTTTGATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACACGAGTGGTAATTTACTGTTCGGCGCTAATAATACAGGTGACGGTGGTGCTGGTGAGATTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTATTGTTGCTCAAACCCTGGACAAGACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCCAACAGAAACTTCAACATCCTGACAACAAATGCTGGTTCTGGAACTAGCAACATTATTGTCACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCTCAAGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAGGATGCACGTTTCCAAGATAATTATATTGCTACAACCAATGCAACTCTCAACCTTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACGGTCAATTCGACGACCCTTCAGGTTGATGACCCCATTGTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGTTGCTAACGATAATCTCGATAGAGGCGTTGAGTTCAGATATTATGATAGTGCAGCAAAGCTTGGATTCTACGGTTACGATGCTTCGTATTCTGATCTCGCAGGTCATACAGGAGGATACCGATTCCTCTACGATGCTACAAACACTTCTGAAGTCTTCTCTGGAACAGATGCAGGCATCATCGCTGGTAACCTTAAACTAACTACCAACACTAACTCCACCTCCAATACAACTGGCGACCTTGTACTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAGGATGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAGCATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTACTGGTACAACTCGTATTGAGTTGCAATCTACAACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACATCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCTGGTACACTTGGAGTAACTGGTCAGACTACTTTAACTGGTGCTCTTGACCTTAACAACACTCTGAATGTTTCTGGATTTACATATCTGGAAAGTACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAATTCTGGCACTGGTCTGTATGAGATTCAGAACAGTGACTATGGTGCATTCCGATTTAATGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTTTATGTCAACGGTACTGTAGTTCAGAAAGAAGACGAAACCGCAGTATTCAACAGACAAAACTACCTGAACGTTCGTTATATTCTATATGCAGGTTCTTCTTCTGCACGCACACCTTCTTATGCAACAGACACTACAACTAACTTAAGAGTTTTTGGTGGTGCTGGTATTGCAACTGACCTTCACATCGGTGATGACCTGTATATCGGTAAACTCAACAGTAGCGATACTATTGAATTCCAAGTCGTCGGTGAAAGCGGCAACACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACTAACTCTGTAGGTACACTGACTGTCCATGGTGATGTAACATTCAACAGAGACCTGTTTGCTAATGGCAACATCACTCTTGGTAACGCAACTAGCGATACTCTGACTGTCCAAGCAAACTCCGAGTTTAATGGCACGGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACAGGTAACACTGATATTCAAGGAACTTTATACGTATTGGGTAATACCAATATCGATGGTACTTTAGATGTTGACTCCAACTTTGCTGTTAGAAGTGGCACTACAGACAAATTTACTGTTGCTTCTGCTTCTGGTAACGTTGCAACTGATGGTACTCTGGTCGTCCAAGGTCAAACAACTATTAACGATTCTTTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTTTTCTCTATCAGAAATGGTTCTGCTATTGAAAAGTTTAGTGTTGATGCAGATAACGGTAATACCAACATCATTGGTACTCTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGATACCTTCGGCGTATCTGGTATTGTAACCTCAACCAATAATACTCAACAATCTATTAATGGCAATTCTATTGCTCTTGACGGTGCTGCAAGATTCTCGGGTGGTGTTGGTGTTGCTAAGAACTTAGCAGTTGGTGAAGACCTTATGGTCTACGGGGACTTCAACATTGTTGGTAATCAGGTCATCAATGGTACTACCACTTATAATGCACGAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGACTCTCTTAGTGATAATAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATTAGAAAGAAACTTTGGGCGGGTGGAGACTTCACTGTATATGATACTGCAAACGCTAGAAATGCATTCTTTGTTGATGTAAGCACTGGCGATGCCACCCTACACAATACACTTACTGTTGGTGGAGACTTAATTGTAAATGGCACAACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGATTCGACAGGTCGTCCTCCCAATTCACATTCCTAACAGATTCTACCAATGTATCTGAAGTTCACACTGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGCCTGAATCTGACTGGCACTGGCACCATTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTACATCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTAACACTACTAAGATTAATAACCTGAATGCTGACTTGCTGGATGGTTATACAACTGCAACTGCTAATACTGCAAGTACGGTTGTTGTCAGAGATGCTTCGGGAGATTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTTCCCTGGCGGGCAATGCTACTACTGCATCTAGATTGCAGACAGCACGCACAATCACAATCGACGGAGTTGTTGATGGCAGCGTTTCCTTTAATGGTTCTTCCAACGTAACAATCAGCACCACCTACAACGACGCAGACATCACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGTACAGGTCTGGTTACCAGAACTGCTGCTAATACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCAGCGTCTGGAATCACGATTACTAATGCAGACGGTGTATCAGGCGACATCACCATTAACGTCGCTTCTGCGAGCACCAACGCATCAAATAACCTCGTTCTTCGTGATGCCTCTGGTAACTTTGCTGCTGGCACAATTACGGCAAGTTTGGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTCACTGGTAACGTAACTGGAGACTTGACTGGTCAGGCAGATGGTGCAGATAGAGTAGTTACTCAAGAGGTTACAACTAATTTTGATTACCCAATTGTTTTTGCATCGGCAAGATTTACAACTCCAACTAATACTCAGATTTATACAGAGGCTTCGGGTGGTGCAGCTGCAACATATAATCCATCTACTAAAACTTTAGAAGTAGAAACAATTAAGTGTGATACAATTTCACCTAGGGATCCTGGAGCCATCCAATTCAATATTAATGCAAATAGTGTTACTGCTACTATTGGATTTACTGG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Tertiary structure

PDB ID
8a70b9738384b570abe58f91813f0da19c6b74bddfb6cdaaa847399c13996e13
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5544
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50