Protein

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Genbank accession
XOD32014.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,98
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHKGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFHDSISRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSMSTPQILTNKVITNNKSTGDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYSGDGLDAYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGNKDYSILGPSSIALGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGRYHHYFRGRGTTNINTAGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMLKGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSEGTRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLDLNYASFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAISKYYPIVKQKFLNSKAVWSLGTEINSGTFVLHHLKEDGSQGHTSRFNADGTVNFPDNVQVGGGEATIARNGNIFSDIWKSFTSAGDTTNIRDAIATRVAKEGDTMTGRLTLSAGNDALVLTAGTGASSHIRSDVGGTNNWFIGKGGADNGLSFYSYITQGGVNITNTGEIALSPQGQGAFHFNRDRLYINASQWTAHQAGDWGNQWRQEAPVFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYISGVDFGMRRIPNNWAQGIIRVGNQENGHDPQAIFEFHHNGTFYALSMVKSNRISAGGGDPVWTGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGIHIANWGAGYQSHPGLWDSNGAFWTEVGKAIISHGHLVQANDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQKLSKINGYTYMQKRGMDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDLDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTVEIAELKSEIEELKALIKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1102 AA
molecular weight: 118672,01410 Da
isoelectric point:5,73155
aromaticity:0,09437
hydropathy:-0,33485

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
449–549
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR030392
992–1090
IPR030392
XOD32014.1
1 1102
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage sb2
[NCBI] 		3387547 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD32014.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ666540 [NCBI]
CDS location
range 157416 -> 160724
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGACGATCAAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAGGGTGGTAGTATTGACGGAAATGTTATTCATAAAGGAAATTACAACCAAACTGGCGATTACACTTTAAATGGCACCTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGTGATATTATTGCAGCTGGGCAGATTATGACTGAAGGTGGGGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCGCATGTTCGTTTTCATGATAGCATTAGCCGTGAGCGTGGAATCATTTATGCTCCGGCTAATGATGGATTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTAGCGAAAGCACTTATGCATTTTCAGGTAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATGTCAACTCCTCAGATTTTGACCAACAAAGTCATTACTAATAATAAATCTACAGGTGATTATGACATTTATTCGATGGCAGATAATGTTCCACTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTCCGTGTCATGCGTAATGCAGTCGGTTCTGGCATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACTTGGTACAGCGGAGATGGGCTAGACGCTTATCTTTGGTCATTTACATGGAGCGGCGGAATTAAATCGAGTCACTCAATTTCTATCGGTTTAACACCTGGCAATAAAGATTATTCAATACTAGGACCATCTAGTATTGCTTTAGGGGATAATGATACTGGATTTAAATGGCACCAGGATGGATATTATTTCAGCGTCAATAATGGAACGAAAACATTTTTATTTAGCCCTAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACCAATGGAACCGATTTAACTACTCCTCCTACTGAAAACTATGCTCTCGCTACTGTTGTTACATATCATGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTGGGATATTATCAAGGCGGTAGATATCATCATTATTTTCGTGGAAGAGGAACAACTAATATTAATACCGCTGGAGGATTATTAGTTACTCCTGGTAATATTGATGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATCGATGGTAGAAATAATGCTTCTACATTGATGCTTAAAGGTAACACAACTGGTAGTAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCCGTGTGGGGTAATACGTTTACTAATCCTAGTGAAGGCACCCGTAAAAATGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACCGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAATGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACAGGTGAAATTTCATCTGGGGCCGTGAATGCGCTTCGCATTTGGAATGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTACGGTGAAGGTAAACACGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTCACTATTCCTGATTTAGATTTAAATTATGCTTCGTTTGCCGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTATAAGCAAATATTACCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACAGTAAAGCTGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCAGGTACATTTGTTTTACATCATTTAAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACATCAAGATTTAATGCTGACGGTACAGTTAATTTCCCTGATAATGTTCAGGTTGGTGGTGGTGAAGCTACTATTGCTAGAAATGGTAATATTTTTTCTGATATTTGGAAATCGTTTACTTCAGCAGGAGACACCACAAACATTCGCGATGCGATAGCTACTCGTGTTGCCAAAGAAGGCGATACGATGACTGGTAGGTTGACTTTATCTGCTGGAAATGATGCCCTTGTTTTAACTGCAGGCACGGGCGCTTCATCGCACATCCGTAGCGATGTAGGTGGTACAAATAATTGGTTTATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAAGTTTTTACAGTTACATTACACAAGGCGGTGTGAACATAACAAATACCGGTGAAATAGCGCTTTCTCCTCAAGGACAAGGAGCGTTTCATTTTAATAGAGACCGCCTTTATATAAATGCTAGTCAATGGACCGCACACCAGGCTGGCGATTGGGGCAATCAATGGCGCCAGGAAGCTCCTGTATTTGTTGATTTTGGTAATGTTGGTAATGATAGTTATTATCCGATTATCAAAGGAAAATCAGGTATTACTAATGAAGGGTATATATCTGGTGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTCCTAATAACTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAATCAGGAAAACGGCCATGACCCACAAGCTATCTTCGAATTCCACCATAATGGTACGTTTTATGCCCTGAGCATGGTTAAGAGTAACAGAATATCAGCTGGTGGAGGTGACCCTGTATGGACAGGCGCATGTGTTGTTATTGGTGATAATGATACCGGATTAGTTCATGGTGGTGACGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATACATATTGCAAACTGGGGCGCAGGCTATCAATCTCATCCGGGCCTTTGGGATTCAAATGGGGCTTTTTGGACAGAAGTTGGCAAAGCAATTATTTCTCATGGGCATCTCGTTCAGGCGAATGACAGTTATTCCACATATGTCCGTGATGTTTATGTCCGCTCTGATATTCGTGTTAAAAAGGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTCAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAATGGATGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCAGAATTAGTTGAAGGCGACCTTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGCGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGTAGAAATTGCAGAACTTAAATCAGAAATCGAAGAACTTAAAGCATTAATTAAATCATTGTTAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
8d8896a8777ec99a8a1a32f526e2969f57fe8d9967256242c549db478cda6fd1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2398
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50