Protein

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Genbank accession
XUQ13328.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,67
Seq2Symm
C1 confidence 0,927
C1 0,927
C3 0,361
D3 0,010
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MKQNIKIGNVVDDGQGDYLRRGGAKINENFDELYYELGDGEVPYSAGAWKTYHSSDGLNLAVEWGKSYAIDTSTGRVSINLPKGTVEDYNKVIRARDVFATWNINPVTLIAASGDTIKGSSSPVEINVQFSDLELVYCSPGRWEYVKNKQIDKITSSDISSVARKEFLVEVQGQTDFLDVFGSVSYNVNNIRVKHRGNELYYGDAFSDNSDFGSPGANPGEIVALDGKNIRLRQPCNIGDTVQIETFLDGITQLRSSYSRRQIRILDSKLTTRPSLEGSVYVADLSTLKSIPFSAFGVNPSEPVNTNSLEVRFNGILQELAGTVGLPMFRCEGADAETSTECSALGGTWVTSNTDYSIEYDDNDATIARALVFDRKFEDQDIIDITWFNNDLGTLLSIDDILDTTDERYVAQGATVNVTGDVALTDFNNIGWPNVEPVPTYSREFSSIANIFNTIYPVGTIYENAVNPNNPATYLGFGSWKLWGQGKVLVGWNDDISDPNFALNNNDLDSSGNPTHTAGGTVGTTSNTLTNSDLPPTQTDEKVLISDENGTIIIGGCQYDPDAEGPIYTKYREGHATTNSTHIPPQAVNNIQPSITVYRWVRIA
Physico‐chemical
properties
protein length:604 AA
molecular weight: 66238,24900 Da
isoelectric point:4,46012
aromaticity:0,09437
hydropathy:-0,37517

Taxonomy

Phage
Escherichia phage LF82-9 [NCBI] · taxon 3433674
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Straboviridae Mosigvirus Escherichia phage LF82-9
Host
Escherichia coli LF82 [NCBI] · taxon 591946
Pseudomonadota Gammaproteobacteria Enterobacterales Enterobacteriaceae Escherichia Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XUQ13328.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV660452 [NCBI]
CDS location
range 162770 -> 164584
strand +
CDS
ATGAAACAAAATATTAAAATTGGGAACGTCGTTGATGACGGACAAGGCGATTACCTTCGTCGTGGTGGTGCAAAAATTAATGAAAACTTTGATGAGTTGTATTATGAATTAGGCGATGGCGAAGTTCCATATTCCGCTGGTGCCTGGAAAACATACCATTCTTCAGATGGACTTAATTTAGCTGTTGAATGGGGTAAATCATACGCAATTGATACTTCAACAGGGCGTGTTTCTATAAATTTACCTAAAGGAACAGTGGAAGATTATAATAAAGTAATTAGAGCCCGTGATGTATTCGCCACGTGGAATATTAACCCTGTAACATTAATTGCTGCCAGCGGTGATACTATTAAAGGTTCTTCCAGCCCAGTAGAAATCAATGTGCAGTTTTCAGACTTAGAATTAGTTTACTGTTCTCCTGGGCGCTGGGAATACGTTAAAAATAAACAAATAGACAAAATTACTAGTTCTGATATTAGTAGTGTAGCTCGTAAAGAATTTTTAGTCGAAGTTCAAGGTCAAACTGATTTTCTTGATGTATTTGGGTCTGTTTCTTATAATGTGAATAATATCCGTGTAAAACATCGTGGTAACGAATTATACTACGGTGATGCGTTCAGTGACAATAGCGACTTTGGTTCTCCAGGAGCTAATCCCGGAGAAATCGTTGCATTAGATGGTAAAAACATCCGTTTAAGACAACCATGTAATATTGGCGACACCGTACAAATTGAAACCTTTTTGGATGGGATTACACAATTACGCAGTTCTTATTCTCGCCGCCAAATACGTATTTTAGATTCAAAATTAACAACCCGTCCTTCCTTAGAAGGAAGTGTATATGTCGCTGATTTGTCAACTTTGAAATCTATTCCTTTTTCCGCATTTGGAGTTAATCCTTCAGAACCGGTCAATACCAATTCTTTAGAAGTTCGTTTTAACGGTATTCTTCAAGAATTAGCTGGTACTGTTGGTTTACCTATGTTCAGATGTGAAGGAGCTGACGCAGAAACTTCTACTGAGTGTTCAGCTTTAGGTGGGACTTGGGTTACATCTAACACAGATTATTCTATTGAATATGATGATAACGATGCAACTATCGCACGTGCTTTAGTCTTTGACCGTAAGTTTGAAGACCAAGACATTATTGATATTACATGGTTTAATAACGATTTAGGCACTTTATTAAGTATCGATGACATTTTAGATACAACTGATGAAAGGTATGTCGCACAAGGTGCAACCGTAAATGTGACAGGCGATGTGGCTTTGACCGATTTCAATAATATCGGATGGCCTAATGTAGAACCTGTTCCGACATATAGCAGGGAATTCTCGTCTATTGCAAATATTTTTAACACTATTTACCCTGTCGGTACTATTTACGAAAATGCGGTGAACCCTAATAACCCAGCCACATATTTAGGATTTGGCTCTTGGAAATTATGGGGACAAGGAAAAGTATTAGTTGGATGGAATGACGATATTAGCGATCCTAATTTTGCATTAAATAATAACGACCTTGATTCTAGCGGGAATCCTACACATACCGCCGGTGGAACAGTCGGAACAACGTCTAACACACTAACTAATTCTGATTTACCTCCTACTCAAACTGACGAGAAAGTTCTTATTTCCGATGAGAACGGTACAATTATTATTGGTGGTTGTCAATACGACCCTGATGCAGAAGGTCCTATATACACCAAATACCGTGAAGGCCACGCCACAACGAATAGTACACACATACCGCCTCAAGCTGTAAATAATATTCAACCGTCAATTACCGTATACCGTTGGGTAAGGATTGCATAA

Genome Context

Tertiary structure

XUQ13328.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 67.6
Oligomeric state monomer
Download structure