Protein

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Genbank accession
AGH06988.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Seq2Symm
C3 confidence 0,999 truncated
C3 0,999
C1 0,026
D3 0,003
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNTLRYERPVESNTNTPNTLVQRDADGNFSAAIVTASLIGNASTATRLDQTRQIQLSGDVTASGNFDGSQNLNLSSALTLVSTLPHYLQDNDPSITRVFTEVTVDQKGRVVNARTPAQMNLADYGLDGSATSDTSLAQPWNPNLEAISDETGTGFYVRTGAGSIAVRQILAESADIVVSNGTGVSGNPNLSLAIQAGLVAGNYNTESLTSVTQAGGSGEPFGTETVNAVKFSCDNHGRLSSATNVPIATATEGSKYASYNAGTTYARYDIIANESKVYQAYQAISAGAGAPTHSSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTGTTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDINVRSYFSDPDITLDGIVDQTLDKTGDGNLTFQLTQNSASARNLSILSTNAGSGTSTVTITAEDVVDIDTSDANGKVHIEDLRIQSNYLASTGQLNLDPGDDRTASGLVRIFGDLQIDGTTTTVNSTVTTVDDPVITLGGDTAPASDDNKDRGIEFRYYDTQARVGFYGWDTGYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSEVFAGTDSGLIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRVNSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNAGTGVWEIQSNDYGALRIDGGVYAAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHIGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNTEINGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTNIEGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDADFAVRTGTTDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIIDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTDQTLTGLYGADGAVRITGGVGVQRNLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQTGNTGFSGLVSITNTSDATSFSDNSVALTTDGGLIVSKNAWVGGDFYVWDDANSRNAFYVDTSTGDATLHNTLTVGGNLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDSAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSANQFSFLVDATNNAEVHTGTDAPLRAGSLNLTGSGTALDVDNNANIDGTLTVDGQITSNVAQGVTPLIITSTTKVNNLNVDLLDSMTTASANTPTTVVNRDSFGNFAAGTITAALVGNASTATTLETARTITVDGVVDGNVSFNGSADVTITTVFNDSDITALAAQTGTGLVVRTGTGTYARRSVTATASSGVTITNGDAVAGNITINVASASSNSANNLVLRDGSGNFSAGTITAALIGSVTGNVTGNLTGNVTGNVTGDLTGNVTGNVTGNLDGIVGGNTPAAVTGTTITANTGFTGNLTGNVTGQVTGNVTGDLTGDVTGNLTGNVTGNVTGNVTGDLTGDVTGNVTGNVTGNVTGTVSSISNHTTSNLTEGTNLYYTDARADARIAAADTDNLSEGSTNLYFTNARADARIAAADTGDLSEGTNLYYTEARVQTQLDNAYEQLRAMLNNLATATTLTLALSGDPTPGDVTALNNGTLVGGTGYNTATGVATTSSGSGTGLTVDITASGGIITSVAINAGGAGYAVGETITISTGNADATINVSAVIEMAVGDTVTGGTSGTTAVITAVGTNQITVDNVDGFFKKTETVSAGDVSNLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1912 AA
molecular weight: 195887,96120 Da
isoelectric point:4,19463
aromaticity:0,05753
hydropathy:-0,16532

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage S-RIM2 R9_2006 [NCBI] · taxon 869663
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Kyanoviridae Nerrivikvirus Nerrivikvirus srim2
Host
Synechococcus [NCBI] · taxon 1129
Cyanobacteriota Cyanophyceae Synechococcales Synechococcaceae Synechococcus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AGH06988.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317291 [NCBI]
CDS location
range 89978 -> 95716
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCCCAGGAATGGGCAAACGCGAACCCAACTCTTGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTCGATACGGGTCGTATTAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACGCTAAGATATGAGCGTCCTGTTGAATCTAACACCAACACGCCAAATACCCTTGTTCAAAGAGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCAGCAATTGTTACTGCTTCATTGATTGGTAATGCTTCTACTGCAACCCGTCTTGATCAAACTCGTCAGATTCAGTTATCTGGGGATGTTACTGCTTCTGGAAACTTTGACGGTTCTCAAAACCTGAACCTGTCTTCGGCATTGACGCTTGTTTCTACTCTGCCACACTATTTGCAAGACAACGATCCTAGTATTACTCGTGTCTTTACTGAAGTAACAGTTGACCAGAAAGGTAGAGTTGTAAATGCTAGAACTCCTGCTCAGATGAATCTGGCAGATTATGGTCTGGACGGTTCTGCAACTAGTGACACTTCTCTGGCACAACCTTGGAATCCAAACCTGGAAGCAATCTCAGATGAAACTGGTACAGGTTTCTATGTAAGAACTGGTGCTGGTTCGATTGCAGTCAGGCAGATTCTTGCTGAAAGTGCTGACATCGTTGTTTCTAATGGTACTGGTGTTTCTGGTAACCCCAACCTTTCTCTTGCTATTCAGGCAGGTCTTGTTGCTGGTAACTATAATACAGAGAGTCTTACATCTGTAACTCAAGCAGGTGGTAGTGGTGAACCTTTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGTTAAGTTCTCCTGCGACAATCATGGTCGCTTATCGAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACTGAAGGTAGTAAGTATGCTAGCTATAATGCAGGCACTACTTATGCTCGCTATGATATCATCGCGAACGAATCAAAAGTTTACCAAGCATATCAGGCAATCAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTTCATTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCTGCACTAGGTGTAGATAACACTCAACTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGGAACCACTGGATACAGAGGATTCAACTATCTTAACTATATCAAAGTTAATGATACGAGCGGCAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATATTAATGTACGCTCGTACTTCTCTGATCCTGACATTACTCTTGACGGCATTGTTGATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAACCCAAAACTCTGCATCTGCTAGAAACCTTAGTATCCTCTCTACAAATGCTGGGTCTGGCACAAGCACAGTTACAATCACTGCAGAAGATGTTGTTGACATTGATACATCTGATGCAAATGGTAAGGTTCATATTGAGGACTTGAGGATTCAGTCCAACTATTTGGCATCTACTGGTCAACTAAATCTTGACCCTGGTGATGATCGTACTGCATCTGGTCTGGTTCGTATCTTTGGCGATCTCCAGATTGACGGTACTACAACTACAGTCAACTCAACAGTAACAACAGTTGATGATCCTGTAATAACTTTGGGTGGCGATACTGCTCCTGCATCTGATGATAACAAAGATCGTGGTATTGAGTTCCGTTATTATGACACTCAAGCACGAGTCGGTTTCTATGGTTGGGATACTGGGTACACTGATCTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTTCCGAAGTCTTTGCTGGTACTGATTCTGGTCTTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAACACTAACTCCACTTCAAATACAACGGGTGACCTCGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAGGATGTAAACATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGTTAATAGCACCTCTCGTTTTGATGACAACATTGTCCTTCAGGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTAAACAATGGTAGCGGCACCACTAAGATTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATGTTAATACTAATAAGTTTAATGTTGTTGCTGCTTCTGGCAATACCTCTATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACGTTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTGACCTCCACATGGAGAGTACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGCTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGATTATGGTGCTCTTCGCATTGACGGTGGTGTGTATGCTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACATTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACTGATATCCAAGGCACACTCGACGTTGCTGGCAACACTGAAATCAATGGTACTTTAGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGTACAACTGATAAGTTCTTTGTTGATAACTTAACTGGCAATACTAACATCGAAGGCACTTTGGATGTCAACGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTCCTGGTCCAAGGCAACTCAGAATTTAATGGCACTGTTGATGTTGATGCTGACTTTGCAGTTAGAACTGGCACTACAGACAAGTTCACTGTTGCTTCTGCATCTGGTAATGTTGCAACTGATGGTACTCTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAACGATTCTCTGATTATTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCGATTAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGATAACGGAAATACAAATATCATTGGCACTCTTACTGTTGGTGATGCAACTCAGATCAACGATACCCTGGGCGTCTCTGATGTTGTTACCTTCACAAGAAATACTGATCAAACTCTGACAGGTCTCTACGGTGCTGATGGTGCAGTTCGTATTACTGGTGGTGTTGGTGTTCAGAGAAACCTCGCTGTTGGCGGCAACATGCGTGTCTATGGTGACTTTGAGATTACTGGTAGCACAACTCAGACTGGTAACACTGGTTTCAGTGGTCTTGTTTCGATTACCAATACTTCAGATGCTACATCATTCTCTGATAACTCTGTCGCTCTTACAACCGATGGCGGTTTAATAGTAAGCAAGAATGCATGGGTTGGTGGCGATTTCTATGTTTGGGATGATGCAAACTCTAGAAATGCATTCTATGTTGATACAAGCACTGGTGATGCAACTTTACATAATACACTTACTGTCGGTGGGAACCTGATTGTTAATGGAACAACAACTACTGTTAACTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACTCAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAGTTCTCATTCTTAGTCGATGCAACTAACAACGCCGAAGTTCATACTGGCACAGATGCTCCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGCACAGCACTTGATGTTGATAACAATGCCAACATTGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAAATCACATCAAACGTTGCTCAAGGTGTAACACCTCTGATCATCACATCTACCACTAAGGTCAACAACCTGAACGTTGACCTCCTGGATAGCATGACGACTGCTTCGGCAAACACACCTACCACGGTTGTTAATCGCGATTCTTTTGGTAACTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTGCTCTGGTTGGTAACGCTTCTACAGCAACCACCCTGGAGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGTAATGTCTCCTTTAATGGATCTGCTGATGTAACTATCACAACGGTCTTCAACGACTCTGATATTACTGCTCTTGCTGCCCAGACTGGCACAGGTCTGGTAGTAAGGACTGGCACAGGCACTTATGCAAGACGCTCTGTGACCGCTACAGCGTCCTCTGGCGTCACTATTACTAACGGTGATGCAGTTGCTGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCGTCCTCTAACTCGGCAAATAACCTGGTCCTGCGTGACGGTTCTGGTAACTTCTCTGCTGGTACAATCACTGCAGCACTGATTGGTAGTGTTACAGGTAACGTTACAGGTAATCTGACTGGTAATGTAACGGGTAATGTCACTGGTGATTTGACTGGAAATGTTACAGGTAACGTTACTGGTAATCTCGATGGCATCGTTGGTGGTAATACACCTGCTGCGGTCACGGGTACTACGATTACAGCGAACACTGGATTTACTGGTAATCTCACAGGTAACGTTACTGGCCAGGTCACTGGTAATGTCACTGGTGATTTGACTGGTGATGTAACTGGCAACCTGACTGGTAATGTCACGGGTAATGTAACTGGTAATGTTACTGGTGATTTGACTGGCGATGTTACAGGTAACGTCACTGGTAATGTAACTGGCAATGTAACTGGAACAGT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Genome Context

Tertiary structure

AGH06988.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 55.0
Oligomeric state monomer
Download structure