Protein

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Genbank accession
XRX14591.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Seq2Symm
C3 confidence 0,892
C3 0,892
C1 0,122
I 0,000
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAFNYTPLTETQKLKDMYPKVNDIGNFLKTEVNLSDVKQISQPDFNNILSSIPDSGNYYVTNSRNAPAGEATAGFVRLDKRNVNYYKIYYSPYSSNKMYIKTYANGTVYDWISFKLDEGSLYNEGNTINVKELTESTTQYATLVNPPKENLNTGWVNYKESKNGVSSLVEFNPVNSTSTFKMIRKLPVQEQKPNLLRDSLFVYPETSSSNIKTDNWATPPFWGYTANSGRSGVRFRGENTIQIDDGNSTYPTAMTNRFKMGNELSVGDTITVSVYAKINDPALLKDNLVYFELAGYDTVDRTDNPYTGGRREITASEITTEWKKYSFTFTIPENTIGASGVKVNYVSLLLRMNCSSSKGNGAVVYYALPKLEKSSKVTPFITHVNDVRKYDEIWSNWQEVISKDELKGHSPVDIEYNDYFKYQWWKSEVNEKNLKDLAMTVPQGYHTFYCQGSIEGTPKGRSIRGTIQVDYDKGDPYRANKFVKLLFTDTEGIPYTLYYGGYNQGWKPLKQQRTSTILWEGTLDYGSKDTIPLNDSWTNYDLLEVVYLTQSAGHYKTMFLDLRIPTTPYLYIRDFNLSNNSTGSGVDFFEGYLTFPTNTSATPTMVKKVTLNGSTNTTSVTDFNAQGIITIYRIAGINTL
Physico‐chemical
properties
protein length:640 AA
molecular weight: 72594,32740 Da
isoelectric point:6,51803
aromaticity:0,12969
hydropathy:-0,55281

Taxonomy

Phage
Staphylococcus phage vB_SaRS_FS19-1 [NCBI] · taxon 3411027
Uroviricota Caudoviricetes Herelleviridae Kayvirus Staphylococcus phage vB_SaRS_FS19-1
Host
Staphylococcus aureus [NCBI] · taxon 1280
Bacillota Bacilli Caryophanales Staphylococcaceae Staphylococcus Staphylococcus aureus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
XRX14591.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV290134 [NCBI]
CDS location
range 66831 -> 68753
strand -
CDS
ATGGCATTTAATTACACGCCTCTTACTGAAACACAAAAGTTAAAAGATATGTACCCGAAGGTAAATGATATTGGTAACTTTTTAAAAACAGAGGTTAACCTTAGTGATGTAAAACAGATATCACAGCCTGATTTTAATAATATTTTATCATCTATACCTGATAGCGGTAACTATTATGTAACTAATTCAAGAAATGCTCCTGCAGGAGAAGCAACAGCAGGATTTGTAAGATTAGATAAAAGAAATGTAAATTATTACAAAATATATTATTCACCTTATAGCAGTAATAAAATGTATATTAAGACTTATGCTAATGGAACAGTATATGATTGGATTAGTTTTAAATTAGATGAAGGTAGTTTATATAATGAGGGTAATACTATTAACGTCAAAGAACTTACTGAATCTACAACACAATATGCAACACTAGTTAATCCTCCTAAAGAGAACTTAAACACTGGATGGGTTAATTATAAAGAAAGTAAGAATGGTGTTTCTTCTTTAGTAGAATTTAATCCAGTTAACTCTACTTCAACTTTTAAAATGATAAGAAAACTACCAGTACAAGAGCAAAAACCTAACTTACTTAGAGATAGTTTATTTGTTTATCCTGAAACAAGCTCTTCTAACATTAAAACGGATAATTGGGCTACACCTCCATTTTGGGGATATACAGCTAATAGTGGTCGTTCAGGAGTTAGATTTAGAGGAGAAAACACTATACAGATTGATGATGGTAATAGCACATACCCTACAGCAATGACTAATAGATTTAAAATGGGTAATGAGCTTTCTGTAGGGGATACTATAACTGTATCAGTATATGCTAAAATTAATGACCCTGCTTTACTTAAAGATAACTTAGTTTATTTTGAACTGGCAGGATATGATACTGTAGATAGAACAGATAATCCTTATACAGGTGGTCGAAGAGAAATAACAGCAAGTGAAATAACTACTGAGTGGAAAAAGTATTCATTTACATTTACAATACCTGAAAATACGATTGGTGCGTCAGGTGTTAAAGTTAATTATGTGTCACTACTTTTACGAATGAATTGTTCTTCTAGTAAAGGAAATGGTGCAGTAGTATATTATGCTTTACCTAAATTAGAGAAATCATCTAAAGTAACTCCGTTTATTACACATGTAAACGATGTTCGTAAATATGATGAGATTTGGTCTAATTGGCAGGAAGTTATTAGTAAAGATGAATTAAAGGGTCATTCCCCTGTAGACATTGAGTATAATGATTACTTCAAGTACCAATGGTGGAAGTCAGAAGTTAATGAGAAAAACTTAAAAGATTTAGCTATGACTGTACCTCAAGGCTATCATACTTTCTATTGTCAAGGTTCTATTGAAGGGACACCTAAAGGACGCTCTATTAGAGGAACTATACAAGTGGATTATGATAAAGGTGACCCTTATAGAGCTAATAAGTTTGTTAAGTTATTATTTACAGATACAGAAGGTATACCATATACATTATATTATGGTGGTTACAACCAAGGTTGGAAGCCTTTAAAACAGCAAAGAACATCTACAATACTTTGGGAAGGCACTTTGGATTACGGTTCAAAAGATACTATTCCTTTAAATGATTCATGGACTAACTATGACTTATTAGAAGTTGTATATCTGACTCAATCAGCGGGACATTATAAAACAATGTTTTTAGATTTAAGAATACCTACGACTCCGTATTTATATATAAGAGATTTTAATTTATCTAACAACTCTACAGGTTCAGGAGTAGACTTCTTTGAAGGATATTTAACTTTCCCTACAAATACTTCAGCAACACCAACTATGGTTAAAAAGGTTACTTTAAATGGGTCTACTAATACAACATCTGTAACAGATTTTAATGCACAAGGAATAATAACTATATATAGAATAGCAGGAATTAACACACTTTAG

Genome Context

Tertiary structure

XRX14591.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 76.9
Oligomeric state monomer
Download structure