Protein

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Genbank accession
WKV24564.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANCNDYISADDLKTGKQAILHIEHVAKSRDATGKPALEATDTIRGESVTNKTLDGFFSSVGFKPADGSFEGGSTINHRWETLLYESEGNYYQWMGMLPKIVPPGSTPATTGGIDATHWVNQTDLMLRSDLNKSNGLSYIGTVSSVSELSSISGSIGDSIILDSYVSGFNFGGGIMVAVSATTTVDNIVTFPGNGVVWKRKFFNGTVDVYDAGYTGTEDLAVFINKINAAGFDCVVPVSGEITTPIIFDIAKGALIGKNKCTLTETASVTGDYYLTIINTGADYINRDAVNATALMSGVSFVGKGSRKLAIGGSTSGVVSELRISNSGFISTAGIEFLDNAYRILFDKCALSRSFTNSAIFNSPANSGEVIKFNHCWMVDNGGPFTFVNGQFIFDSCSLPAGKKSGYFDPTVALSDNATVVFTNGNIEYQPGQSFVGFTVDGSSRLTVSNSTILLPDGYTSVPIVSNGDGVVSLNNCSLPLYGNTTIATGFPTRQLIGGASKKVMSRGCYPRAGFITSNWNLGSIVSPYINSISNGSGQFLNISNWTLSQTGTGVVTATTTNDVPNDLMFSTSFVLSVPSSDAAANFTQTIIDCEPGRYFQLGFWAKNTTTTLASLRFLDQQGNAVADSMGYNISAGGTFNFYALVDCVPPGAYKAEINFNVSSVVGGVVIHNAIYGLI
Physico‐chemical
properties
protein length:679 AA
molecular weight: 71827,66100 Da
isoelectric point:4,93450
aromaticity:0,10309
hydropathy:0,07216

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.80
63–133
G3DSA:2.10.10.80 G3DSA:2.60.120.260
IPR040775
68–121
IPR040775
WKV24564.1
1 679
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoS_PJ16
[NCBI] 		3061300 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WKV24564.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ955832.1 [NCBI]
CDS location
range 33998 -> 36037
strand -
CDS
ATGGCTAACTGTAACGATTATATCAGTGCTGATGATTTGAAAACAGGCAAACAAGCGATTTTACATATTGAACACGTTGCAAAAAGTCGTGACGCTACCGGTAAACCTGCACTGGAAGCAACCGATACAATCCGTGGCGAATCAGTTACTAACAAAACACTGGATGGTTTTTTTAGTTCAGTTGGTTTTAAACCTGCAGACGGTTCGTTTGAAGGCGGTAGTACTATTAACCATCGTTGGGAAACACTACTATATGAATCAGAAGGTAATTATTACCAGTGGATGGGTATGTTGCCTAAAATTGTTCCACCTGGTTCAACACCTGCAACTACGGGTGGTATTGATGCTACACACTGGGTTAATCAGACGGATTTAATGTTACGTTCTGATTTAAACAAATCAAATGGTTTGTCTTATATAGGGACTGTATCATCAGTTTCTGAGTTATCATCGATATCAGGATCAATTGGTGATTCCATAATTCTTGATTCGTATGTGAGCGGGTTTAATTTTGGTGGTGGTATTATGGTAGCTGTTAGCGCGACTACTACTGTAGACAATATTGTTACCTTCCCCGGAAACGGTGTGGTATGGAAAAGAAAATTCTTCAACGGCACCGTGGACGTGTATGATGCTGGTTATACTGGAACCGAAGATTTGGCGGTATTCATCAACAAAATAAACGCTGCCGGATTTGACTGTGTGGTTCCTGTTTCTGGTGAGATAACAACACCGATTATTTTCGACATAGCAAAAGGCGCACTTATTGGAAAAAATAAATGTACTTTAACAGAAACTGCATCTGTAACCGGTGACTACTACCTAACCATTATTAATACAGGCGCGGATTACATTAACAGAGATGCAGTTAACGCAACTGCTTTGATGAGTGGTGTGTCATTCGTCGGAAAAGGTTCCAGGAAATTGGCTATCGGTGGCTCTACCAGTGGTGTAGTATCAGAGTTAAGAATATCTAATAGTGGGTTTATCTCAACTGCCGGAATTGAGTTTCTTGATAATGCATATCGTATTCTTTTTGATAAATGCGCGTTGTCCAGAAGTTTTACAAATTCTGCTATTTTCAATTCACCAGCGAATTCCGGTGAGGTTATAAAATTTAATCACTGCTGGATGGTTGACAACGGTGGACCTTTCACGTTTGTTAATGGTCAATTTATATTCGATAGCTGCTCTCTACCGGCAGGTAAAAAATCAGGATATTTTGACCCTACTGTTGCGTTATCAGATAACGCAACAGTGGTTTTCACAAACGGTAACATTGAGTACCAACCTGGTCAGAGTTTCGTTGGGTTTACTGTGGATGGCAGTTCACGATTAACCGTCAGTAATTCGACGATACTACTCCCAGACGGGTATACCAGTGTACCTATTGTTAGCAACGGCGATGGGGTTGTTAGCCTAAATAATTGCTCGTTACCCCTCTATGGGAATACAACGATTGCTACCGGATTTCCCACAAGACAGTTGATAGGTGGCGCGAGCAAAAAAGTAATGTCCAGAGGGTGCTATCCACGGGCAGGATTTATCACAAGTAACTGGAATTTAGGGAGCATTGTAAGCCCTTATATTAATAGCATCAGTAATGGCTCAGGACAGTTTTTAAACATATCTAACTGGACACTCTCGCAAACTGGAACAGGAGTTGTCACTGCTACTACAACAAACGATGTTCCTAATGATTTAATGTTTTCAACTTCTTTTGTTTTATCTGTACCATCATCTGACGCAGCAGCTAATTTCACCCAAACAATCATTGATTGTGAGCCAGGTCGTTATTTTCAGCTTGGTTTTTGGGCTAAAAATACAACAACCACCCTGGCGTCACTTAGGTTCCTTGACCAACAAGGAAATGCTGTCGCGGACTCCATGGGATATAACATCTCAGCAGGAGGCACGTTCAATTTTTATGCTTTGGTAGATTGTGTTCCACCAGGAGCTTACAAAGCTGAAATTAATTTCAATGTTTCCTCTGTTGTTGGGGGTGTCGTAATACACAATGCCATTTATGGATTGATTTAA

Tertiary structure

PDB ID
46d0bd50c313f1111abec9be3602dfdd601ae6cece7f9397bf7abfa1fc2b095c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,8043
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Escherichia phage vB_EcoS_PJ16 against multidrug resistant avian pathogenic E. coli Jhandai,P., Mittal,D. and Gupta,R. 2024 37632591 GenBank