Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_010681674.1 [GenBank]
Protein name
receptor-binding protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
Protein sequence
MATSIGRGQLTLTDLNDVIASNVAPENPVEGSLWFNKEDNSLYVYNNGSWILASPELQIGGRNLVINSTFNNGMTDWTNSYEVLTPEDDKPTSSILRIASVGYTSARYAQTWSREIPMSINPNNTYTLSFDIKIDDLTALADTDVIFSIRTFAVKGKTSSSDSAWEKTIKKSDIANKITNGKWYRHCVTFQPTASEYIRVSPYLTMNGVVYYREIKLEVGNTATDWTPSPEDVATKLSSITETLGNMANDNIIDYSERQVIKDKLTNILGYVIVDNISELPTSTVNDQATNGKGSFYFVRKNATMSGLPTSNEKYIAVETQYNNLKIYLESMSPKPWDVSEANKGQIITIDKSVFRDKWLQYYKAEQDLANATADQLKKNVDNVSVGGTNWASNGNFEYDIRKSLWASSYVGDIHEIVDISTETPPFHYAYHVRQDTNGLAGIFSPSIWKDESANAMLNKEITISFWLKYQNITQGISAINAGRFGELIIVGENDNGEKKYLYLKVNFKDIITGSNMTWEKYSSTARIVMPDGATKITGINFKHGIENGTGEFWTTGIKIEIGNKATDWSQCPLDIQARLTDVEFKVTPDGIFTQVSQSQAFNAAMTSKQDLRDYSFENGVSLWKKDKELTTALEGTIQNGQGNFGSNAIQLTGDSSGFYGKMIPVNTNHVYKVTFRVKQLVDPTTAGLSKVYAGVAAYDANKQPLVTQTFGLHRYCAVHDQPITVADGWQEYTGTISLEGDDDYSQFITGTKYAVPVFIVNNSGGDGVALVDYCTLEDISEVEALGAEIDTVKQSITPSGITTVISQSDFYNQYLNDLEGKADSSKLGDYATQDQLKEVQDGIGGAINDGIANLNIDQVYATKQELQQTATDFTAKFTATGGLNLIKNSIGYADFDFWTGVDGNMQTIQNTSLDSLGFGSGFYSPVGTTSSHAIQEIVVVPDQTYSLGFYMDKTVDNTSSSWAGIDILNEDGSILQFTGIGTNGGTTSGWQSFSYTFTPTTATIKIRITIGGYASATLTGLMLNIGDIPLQWSLATGETYNTNVRLDINGIRVSQLETLSDGTKQEVGYTQITPDEFAGYYDLDGTGNFDKVFYLNGDETVTKKFIATDEISMASLKIVPVTSTNYNGWAFVPKR
Physico‐chemical
properties
protein length:1136 AA
molecular weight: 125050,60030 Da
isoelectric point:4,65389
aromaticity:0,10475
hydropathy:-0,32562

Domains

Domains [InterPro]
IPR008979
58–133
IPR008979 G3DSA:2.60.120.260 G3DSA:2.60.120.260
G3DSA:2.60.120.260
61–219
G3DSA:2.60.120.260
YP_010681674.1
1 1136
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage vB_BsuS_PJN02
[NCBI] 		2920374 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010681674.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_071050 [NCBI]
CDS location
range 58429 -> 61839
strand +
CDS
ATGGCGACAAGTATTGGTCGTGGTCAATTAACATTGACAGATTTAAATGATGTTATTGCTTCTAATGTTGCACCAGAAAATCCAGTAGAAGGAAGTTTATGGTTTAACAAAGAGGATAATTCATTATACGTATATAATAATGGTTCTTGGATTCTGGCATCACCTGAGTTACAAATTGGAGGAAGAAACCTCGTTATAAACTCTACATTCAATAATGGAATGACAGATTGGACGAATAGTTATGAGGTTTTGACACCAGAAGATGACAAACCTACATCGAGTATTCTCAGAATAGCATCAGTAGGGTATACATCAGCTAGATATGCTCAAACATGGTCAAGAGAAATTCCAATGAGCATAAATCCAAACAATACATATACATTGTCTTTTGATATAAAAATTGATGATTTGACTGCTCTGGCTGATACGGATGTTATATTTTCGATTAGGACATTTGCAGTAAAAGGAAAAACTTCTAGCTCAGATTCAGCATGGGAAAAAACTATTAAAAAGAGTGATATTGCGAATAAGATAACAAACGGTAAATGGTATAGACATTGTGTAACATTTCAGCCTACTGCATCGGAATATATAAGAGTTTCCCCATATCTAACAATGAATGGCGTTGTTTATTATAGAGAGATAAAGTTGGAGGTTGGTAATACAGCCACAGACTGGACACCTTCGCCAGAAGACGTAGCAACTAAGTTGTCATCAATTACAGAAACTCTTGGTAATATGGCGAATGACAATATTATAGATTACAGTGAAAGACAAGTAATCAAAGATAAATTAACGAATATCCTTGGTTATGTGATTGTAGACAATATATCAGAACTACCTACTTCAACAGTAAATGATCAAGCAACAAACGGTAAAGGCTCTTTTTATTTTGTAAGAAAAAATGCTACGATGTCTGGTTTACCAACATCGAATGAAAAATACATAGCTGTTGAAACTCAATATAATAATTTAAAAATATATTTAGAATCTATGTCTCCTAAACCTTGGGATGTATCAGAAGCGAATAAAGGTCAAATTATTACGATTGACAAGTCTGTATTTAGAGATAAATGGTTGCAATATTATAAAGCAGAACAAGATTTAGCCAACGCAACAGCAGATCAGTTAAAAAAGAATGTTGACAATGTTTCAGTTGGTGGAACTAACTGGGCAAGCAATGGTAACTTTGAATATGATATAAGGAAATCATTATGGGCTAGTAGCTATGTTGGAGACATACATGAAATTGTAGATATTTCAACTGAAACACCGCCTTTTCATTATGCTTATCATGTAAGACAAGACACGAATGGGTTGGCAGGGATATTTTCTCCGTCAATTTGGAAAGATGAATCAGCAAATGCTATGCTAAACAAAGAGATAACTATTTCATTCTGGTTAAAATACCAAAATATTACACAGGGTATAAGTGCAATTAATGCAGGAAGATTTGGAGAATTAATTATTGTTGGTGAAAATGATAATGGTGAAAAGAAATACCTTTATTTAAAGGTGAACTTCAAAGATATAATAACTGGAAGCAACATGACATGGGAAAAATATAGCTCAACAGCAAGAATTGTAATGCCTGATGGGGCAACAAAAATAACTGGTATCAATTTTAAACATGGAATTGAAAATGGAACAGGTGAGTTTTGGACTACTGGTATTAAAATTGAAATTGGGAACAAAGCTACTGATTGGTCTCAGTGTCCTCTAGATATTCAAGCAAGACTTACGGATGTAGAATTTAAAGTAACACCAGATGGTATCTTCACACAGGTCTCACAGTCGCAAGCATTTAATGCGGCAATGACAAGCAAGCAAGATTTACGTGATTACAGCTTTGAAAATGGAGTATCACTTTGGAAAAAAGATAAAGAATTAACAACAGCACTTGAAGGAACAATTCAGAATGGTCAAGGTAACTTTGGTAGCAATGCTATTCAACTAACAGGTGACTCATCGGGATTCTATGGAAAAATGATTCCTGTAAACACTAATCACGTTTATAAAGTAACGTTTAGAGTTAAACAGTTAGTTGACCCTACAACAGCAGGATTATCAAAAGTTTATGCGGGGGTTGCGGCGTATGATGCAAACAAACAGCCACTTGTCACTCAAACATTTGGTCTCCATAGGTATTGTGCAGTTCATGATCAACCTATTACCGTAGCAGATGGATGGCAAGAGTATACAGGCACAATCTCTCTAGAAGGCGATGATGACTATAGTCAGTTTATAACAGGAACAAAATATGCAGTTCCAGTATTCATTGTCAATAACAGTGGTGGAGATGGTGTAGCTCTAGTTGATTATTGTACATTAGAGGATATAAGTGAAGTTGAAGCCCTTGGTGCAGAAATTGACACTGTTAAACAATCAATTACACCGTCTGGTATTACAACTGTAATTTCTCAATCAGACTTTTATAACCAATACTTAAACGATCTTGAAGGGAAAGCAGATTCAAGTAAGTTGGGAGATTATGCTACACAAGATCAATTAAAAGAAGTTCAAGATGGTATTGGTGGAGCGATTAATGATGGCATTGCAAATCTAAACATTGATCAAGTTTACGCTACCAAACAAGAATTACAACAGACTGCAACAGATTTTACAGCAAAGTTCACAGCAACAGGTGGATTGAACTTAATTAAAAACTCAATTGGATACGCTGATTTCGACTTCTGGACAGGAGTCGATGGAAATATGCAAACCATCCAAAATACGTCACTAGATAGCTTAGGATTTGGTAGTGGATTTTATTCTCCTGTAGGAACAACATCATCCCATGCGATACAAGAAATAGTAGTTGTTCCAGATCAAACATACTCTCTCGGTTTCTATATGGATAAAACAGTGGATAATACTAGTAGTTCTTGGGCTGGTATTGATATCTTAAATGAAGATGGTAGTATTCTTCAATTTACAGGAATAGGAACTAATGGAGGCACTACTAGTGGCTGGCAATCGTTTTCATACACTTTTACACCAACAACTGCAACTATAAAAATTAGAATCACAATTGGAGGATATGCCTCGGCAACATTAACTGGTTTAATGCTGAACATCGGAGACATACCTTTACAATGGTCGTTAGCAACTGGTGAAACATATAATACAAACGTAAGATTAGATATAAACGGTATCAGAGTTTCACAACTGGAAACGCTTTCTGACGGAACGAAGCAAGAAGTTGGCTACACCCAAATCACCCCAGATGAATTTGCAGGATACTATGATCTAGATGGAACTGGAAACTTTGATAAAGTGTTTTATCTAAATGGTGATGAAACAGTAACAAAGAAATTTATTGCAACGGATGAAATATCTATGGCTAGTTTAAAGATAGTACCTGTAACTTCAACTAATTATAATGGGTGGGCGTTCGTTCCCAAGAGGTAA

Tertiary structure

PDB ID
6754f5f1677bf293c5608a2449e358bfd521167ff22d86edd744b2a4a42c5518
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2427
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50