Protein
View in Explore- Genbank accession
- XDC48515.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MCGREQLNFFTGAIKPLLRGKFIMADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPKMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEVTIGDILKTFKINSNGLKLTIADATRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNRNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFTSLVVKKNANAITLQNTDTSTALYILGKKSDGTNKWYVGTDSDETRLNIYNYLTGSQVSLGTTIGINKTVQITGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSTIARTNAANTFSAQQVINADGEALALKAKTATSLFIRGKDVDGTSKWYVGNGDASDILNLYNYKTGKGLNIGSVFEMNATLAITGQVQPSDWANIDARYFTQSASDGRYLRVRSTGFNNGNVEKWAKIATVVMPQSASTAVIEVFGGSGFNVNAPHQAGKCEIILRTSNNNPKGLNVVAWRTAENTIVTDIGYVNTSGDTYDIYCRVGTYQNGTTSRVQSSSNASVQLFEVPQTFDDAPQGIVKGTIAKYYTSLQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTSSTTGNHNHNRGTMEITGTVGYFRSDSSSFYTASGAFTLGSSTASKGFTGSNFTYGIPANFNASRTWSGVTNTTGNHSHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 868 AA molecular weight: 93439,63280 Da isoelectric point: 9,19972 aromaticity: 0,09101 hydropathy: -0,33525
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_I14.1 [NCBI] |
3229723 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XDC48515.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP892526.1
[NCBI]
CDS location
range 37390 -> 39996
strand +
strand +
CDS
ATGTGTGGCAGAGAACAGCTTAATTTCTTTACAGGGGCTATAAAGCCCCTTTTAAGAGGAAAATTCATAATGGCAGATTACAAATTGAGTCAGTTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCACATCAGAGTTAAGAAAAGACCTAAAATGTTGGGTGACGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACAGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGGTTACTATTGGGGATATTTTAAAGACTTTTAAAATTAATTCAAATGGGCTTAAACTCACTATTGCAGATGCCACAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAACAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGCATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGAACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCGAAATGCAAACAATGCACAATACATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCAGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGCAATGGTTCTGACGAAGTAAAACTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAATCTTTAGCAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGCAATAATACTTTTACAGGTGCTAACACTTTCACTAGCCTTGTTGTTAAGAAGAATGCTAATGCTATTACTTTGCAGAATACTGATACAAGTACAGCACTTTACATTCTCGGTAAGAAGTCTGATGGAACAAATAAATGGTATGTTGGTACAGATTCTGACGAGACACGTCTGAACATTTATAACTACCTTACAGGTTCACAGGTTTCACTAGGTACTACTATTGGTATCAATAAGACTGTGCAAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCGGATTGGGCTAATATCGATTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCTGCTAATACATTCTCTGCACAACAGGTTATCAACGCTGATGGTGAAGCTCTTGCGTTAAAAGCAAAAACTGCAACGTCATTATTTATTAGAGGTAAGGATGTTGATGGAACCAGCAAGTGGTATGTTGGTAATGGTGATGCCAGTGATATCTTAAACCTGTATAACTACAAGACAGGTAAAGGGCTTAACATTGGTTCAGTATTTGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCTGATTGGGCTAATATTGATGCAAGATACTTTACGCAAAGTGCTAGTGATGGTAGATACCTGAGAGTCAGAAGTACTGGCTTCAATAATGGAAACGTTGAAAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTCGTTATGCCGCAATCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCTGGTTTTAATGTTAACGCACCACACCAAGCAGGTAAGTGTGAGATTATTTTACGAACATCAAACAATAACCCAAAGGGTTTAAATGTTGTAGCTTGGAGAACCGCAGAGAATACCATTGTCACAGATATTGGTTATGTTAACACATCTGGCGACACTTATGATATTTACTGTAGGGTCGGTACGTACCAAAATGGTACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAGCTATTTGAAGTCCCACAAACGTTTGATGATGCCCCACAAGGTATTGTGAAGGGTACAATTGCAAAATACTACACAAGTTTGCAAAAGCCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATATACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAAATTGCAGAAGCAATCAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTCGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGCAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGCTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCATTTGATTATGGTACTAAGACTTCTAGCACAACTGGTAACCATAACCACAACAGGGGGACTATGGAGATTACTGGTACAGTAGGTTACTTCAGAAGTGATTCTAGCAGCTTCTACACAGCAAGTGGTGCATTCACACTTGGTAGTTCAACTGCTTCTAAAGGTTTTACTGGTTCTAACTTCACTTATGGTATCCCTGCTAACTTCAATGCGTCAAGAACTTGGTCTGGTGTAACGAATACAACAGGTAACCACAGCCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGCGGTAACACAGGTGGTACTGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
43b227d705c374ad6725d81062e45b41c617968a35868c0c37881ad6041d71fe
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50