Protein

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Genbank accession
WWD12790.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MADLSRIQFKRTSTKGRRPDAGTMNPGELAINLADQYLLTKNDSGAIINLSCPPVYDSDVTMAGKVKGNNYILSKTANYFEDQTARDLNYFGAFRPNNADGWSNLILNIPHPSGKAHGRGFEFEYGSSSSQVKTYGFDKDGNKRFSFRMYHEGDKPTPSELNVYSKQEIDRMFVKNVKMSTPSGEATRGYFKIASAMIPQSGRMAFLRIYGGNGFNVNSYDQVDFLEIVIRSGNNNPKGVSIAAYRRNSLNVHEVFAINTSGDNYDIYVNYGRFTDNVIVEFGKTVDVALTVHDVPEFSATKPETGTKFDARVITMFNTENKAGTLMFDNNSQATYDIVSLSNAPDNSRNYLRKFRSKANETIWHETVQGDVYRLATGSTDQKEVLKIVGSDGLFVNRLHLQGNNAIRMWRPTGCSNYFEYMDQRDGANKRQGWFGFGSTETNDFQWYSDEGKNFVKLEASGQVSLSAGATKIVYTNGQYVAANSDAYRMIFGNYGAFWRNDGTKVYLMSTAENDRFGGWNAYRPFIYDLTSGNVQLGGDGNEDALTLESASRAARFSNDVYIKKGLLTFDAGRLGSRDFFKINHWGDSNNARDNILQFEDSQGAHFTTERAMGTGNITARFKGFVRVESGEIAFDANRGSQSQFTLHTWGNEQRKQVFECKDATSYHWYTERTQGGTGPILFCMAGSLNVGSNITTTGADITFKRAGNKHIWFRDPDGLELGLMYCDDAGVIRFRGQKQAQAWKFADKMIQLESGTVSGGGNGLIRGEVAGGSWASWRDRAAGLMVGCPQSTDSAHNIWKATHWGKYHIAAMGVHVPSGTIGNAIARLNVHDANFEFSASGDMSAGRNGSFNDVYIRSDTRLKINKEEYKENATDKVNRLTVYTYDKVKSLTDRTVIAHEVGIIAQDLEKELPEAVTTSKIGDPDKPEEILTISNSAVNALLIKAFQEMSEELKAVKAELAELKKN
Physico‐chemical
properties
protein length:967 AA
molecular weight: 107479,43900 Da
isoelectric point:7,02686
aromaticity:0,10962
hydropathy:-0,53433

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
462–526
IPR048390 IPR030392 Coil
IPR030392
859–961
IPR030392
WWD12790.1
1 967
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage GoldenSnicker
[NCBI] 		3098281 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WWD12790.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR896832 [NCBI]
CDS location
range 65048 -> 67951
strand +
CDS
ATGGCAGATTTAAGCAGAATCCAATTTAAACGTACTAGCACTAAAGGCCGTCGACCTGATGCTGGTACGATGAATCCGGGGGAATTGGCAATCAACCTTGCGGATCAATATCTTCTTACTAAAAATGATTCCGGTGCTATTATCAATTTAAGTTGTCCTCCGGTTTATGACAGCGATGTTACAATGGCGGGTAAGGTTAAAGGAAATAATTATATTTTAAGTAAAACCGCTAATTATTTTGAAGACCAAACCGCGCGAGATCTTAATTATTTTGGTGCGTTTCGACCGAATAATGCTGATGGTTGGTCTAACTTGATTCTGAACATTCCTCATCCCAGCGGTAAAGCACACGGTCGCGGGTTTGAATTTGAATATGGTTCTAGTTCCTCTCAGGTTAAAACCTATGGCTTTGATAAGGATGGTAACAAGAGATTCAGCTTTCGCATGTATCACGAAGGTGATAAACCTACTCCCTCAGAATTGAACGTCTATAGCAAACAAGAAATTGACCGTATGTTTGTTAAGAACGTTAAAATGTCCACTCCTTCCGGTGAAGCAACCCGTGGTTATTTTAAAATTGCATCCGCAATGATCCCGCAGAGTGGTCGGATGGCGTTTCTGCGAATCTATGGTGGGAACGGATTTAATGTTAACTCCTACGATCAGGTGGATTTCCTTGAAATTGTGATTCGTAGTGGTAATAATAACCCTAAAGGCGTTAGTATTGCTGCATATCGTCGAAATTCTTTGAACGTCCATGAAGTATTTGCAATTAATACTTCCGGTGATAACTATGACATTTATGTTAACTATGGTCGCTTCACCGATAACGTTATTGTAGAGTTTGGAAAAACTGTTGATGTTGCATTGACTGTTCACGATGTTCCTGAATTTTCGGCGACTAAACCAGAAACCGGAACTAAATTTGATGCTCGTGTTATTACCATGTTCAACACCGAAAACAAAGCAGGAACGTTGATGTTTGATAATAACTCACAAGCAACCTATGATATTGTGAGCCTTAGCAATGCACCTGATAATAGCCGAAATTATCTGCGTAAATTCCGTAGCAAAGCGAATGAAACAATATGGCATGAAACTGTTCAAGGTGATGTGTATCGTTTGGCTACTGGTTCCACCGACCAAAAAGAAGTATTAAAAATTGTTGGTAGTGATGGTTTATTTGTCAATAGACTTCATCTGCAAGGCAATAACGCGATTCGTATGTGGCGTCCTACTGGTTGTAGTAACTATTTTGAATATATGGATCAGCGAGACGGGGCTAATAAACGTCAAGGGTGGTTTGGTTTTGGTTCTACAGAAACCAACGATTTTCAATGGTATAGTGACGAAGGTAAAAACTTTGTTAAGCTAGAAGCAAGTGGTCAAGTATCTTTAAGCGCAGGTGCAACCAAAATTGTATACACTAATGGTCAATATGTAGCTGCCAATTCTGATGCATACCGTATGATCTTTGGTAATTATGGTGCATTCTGGCGTAATGACGGCACTAAAGTTTATCTTATGTCTACTGCCGAAAATGATAGATTTGGTGGCTGGAATGCCTATCGTCCATTCATTTATGATTTAACTTCCGGTAACGTTCAATTAGGCGGTGATGGTAACGAAGATGCATTAACGTTAGAAAGTGCTTCTCGTGCCGCTCGCTTTAGTAATGACGTTTACATTAAGAAAGGGCTTTTGACTTTCGACGCTGGACGATTAGGATCTCGTGATTTCTTTAAAATCAACCATTGGGGTGATAGCAATAACGCCCGTGATAACATTTTGCAGTTTGAAGACAGTCAGGGCGCACATTTTACCACTGAACGTGCTATGGGTACTGGTAACATAACAGCACGTTTTAAAGGCTTTGTTCGTGTAGAATCTGGCGAAATTGCATTTGATGCTAATCGGGGGTCGCAGTCTCAATTTACCTTACACACATGGGGTAACGAGCAACGCAAACAGGTTTTTGAATGTAAGGATGCTACAAGTTATCACTGGTATACTGAACGTACTCAGGGTGGCACTGGACCTATTCTGTTCTGTATGGCTGGTAGTCTAAACGTTGGTAGCAATATCACAACAACTGGTGCTGATATTACGTTTAAACGCGCTGGCAATAAGCACATCTGGTTTAGAGATCCAGACGGTTTAGAGTTGGGCTTGATGTATTGCGATGACGCTGGTGTTATTCGCTTCCGTGGTCAGAAACAAGCCCAGGCGTGGAAATTTGCAGATAAAATGATCCAGTTGGAATCTGGTACTGTATCTGGTGGCGGTAATGGCCTGATTCGTGGTGAAGTTGCTGGCGGTAGTTGGGCTAGCTGGCGTGACCGTGCTGCTGGCCTTATGGTTGGGTGTCCTCAATCAACCGATTCCGCTCATAACATCTGGAAAGCTACTCATTGGGGTAAATATCACATCGCAGCAATGGGTGTACACGTTCCTAGCGGTACTATCGGTAATGCTATAGCTCGCCTAAACGTTCATGACGCCAACTTTGAATTTAGCGCCTCCGGTGACATGTCGGCAGGGCGTAACGGTTCGTTTAACGATGTTTATATTCGTTCTGATACTCGCCTTAAAATCAATAAGGAAGAGTATAAGGAGAATGCCACCGATAAAGTTAATCGCTTGACGGTATACACCTATGACAAGGTTAAATCTTTAACCGACCGTACTGTCATTGCTCATGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGATCTTGAAAAAGAATTGCCGGAAGCCGTAACAACTTCTAAGATCGGCGATCCTGATAAGCCAGAAGAGATCTTAACAATTTCTAACTCTGCTGTCAACGCTCTTTTAATTAAGGCGTTTCAGGAAATGAGCGAAGAACTTAAAGCCGTTAAAGCTGAACTAGCGGAACTTAAAAAGAATTAA

Tertiary structure

PDB ID
19941519766a66307178a4e1044759e125f88661a08f874b12d640ee806e63af
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2411
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50