Protein
View in Explore- Genbank accession
- BBF63405.1 [GenBank]
- Protein name
- phage tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYTQTGKFNLIGPQIVASGGYIEFNYRTTGSGAWSGQHTAKAPIFVDLSSATSTSEYNPIIKQRFKDGTFSLGTLVSEGSLKIHYINESGDSKYWTFRRDGGFTVDGGGLGVSGGSITTSGNIAALGNITSPQINTKNIILDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITADENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWTMPGTNAALLSVQTQADVNNAGDGQTHIGYNSGGKMSHYFRGKGQTNINTQKGMEVNPGILKLVTDSNNVQFYANGTVSSIQRIKFDNGLVLTGARPDGIQLDAPTAADGTKTILWAGGTRAGQNKSYVSIKAWGNSFNASGDRARETVFEVGDGQGFHFYSQRVAPAPGSTVGPIQLRVNGGLLTAGSIVASGSITTESSLNVNNGLSVNGQAKFGGTANALRIWNAEYGVIFRRSESNFYIIPTNQNEGESGDIHSSLRPVRIGLNDGAVGLGRDSFIVDQNNALTTINSNSRINANFRMQLGQSTYIDAECTDTVRPAGAGSFVSQNNENVRAPFYMNINRTDTSTYVPILKQRYVQGNSCYSLGTLISTGDFRIHYHEGGDNGSTGPQKADLAWQFRRDGSFRSPNKIEINAVTIGTDGNITGGTGNFANLNTTLNRKTTVGGWAGSSVVGWYKFATVTIPQSTGTVTFKISGGAGFNFKSYNQASIAEIVLRTGNNPKGINAVLWNRSDLSFNQIATMNTSDDTYDVYVFCEGYTNALIVEYSCSENSSVTVVGLNGGIQPVVDALPEGHVVGKTVRLLNNIGGTFAAGESDIVTRGEYVADNQKGMRIKSNGNNIGSNAAILRNDGGSFYILATDKNTAEKSDAANGDWNGLRPFAINMADGRVGMNHGLNITGGGLNVTGGLNVTSGNTSLGNISSRVVARWRGASGWADNSDTMKSKITFMADHGDLSNSDSYYPIVGAYSNYGSAGYRQTFEFGWVGSGTTAGWRDGIIRIRGDNANGQQARWRFTMDGTLDCPGKVLLPQTGAFGVNTSNGLGGNSITFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1341 AA molecular weight: 143151,12810 Da isoelectric point: 8,16706 aromaticity: 0,08501 hydropathy: -0,34512
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage T2 [NCBI] |
2060721 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBF63405.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP018813
[NCBI]
CDS location
range 150027 -> 154052
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATTTAAGCATTTCTGCTGGTGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATACACAGACTGGAAAATTTAATTTAATTGGTCCGCAAATTGTAGCAAGCGGTGGATATATTGAGTTTAATTATCGTACTACTGGAAGTGGGGCTTGGTCCGGTCAACATACTGCGAAAGCTCCAATTTTTGTAGATTTAAGCTCAGCTACTTCCACATCTGAATATAATCCTATAATTAAACAGCGCTTTAAAGATGGAACTTTTTCATTAGGTACTTTAGTTTCTGAAGGTTCGTTGAAGATTCATTATATCAATGAATCTGGCGATTCGAAATATTGGACGTTTCGACGTGACGGCGGATTTACTGTTGACGGTGGAGGTTTAGGAGTATCAGGAGGTAGTATAACTACATCTGGAAATATTGCAGCTCTCGGAAATATTACTTCGCCTCAGATTAATACTAAAAATATTATTTTAGATACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCGCAATCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACCATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACCGGTAAAAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACTGCTGACGAAAATACCAATAACTACGGCTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACGAACGCTGCTCTCTTGTCTGTTCAAACTCAGGCAGATGTGAATAACGCAGGTGATGGACAAACTCATATCGGTTATAACTCCGGCGGGAAAATGTCCCACTATTTCCGCGGTAAAGGCCAAACTAATATTAATACTCAAAAAGGCATGGAAGTTAACCCTGGTATTTTAAAATTGGTAACTGACTCTAATAACGTACAGTTTTATGCTAATGGAACAGTATCTTCAATACAAAGAATTAAATTTGATAACGGATTAGTTCTTACTGGTGCTAGACCCGACGGTATTCAACTTGACGCTCCTACAGCAGCAGATGGCACTAAAACTATACTGTGGGCTGGTGGTACTCGCGCAGGTCAGAATAAAAGTTATGTATCTATTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTGCTCGTGAAACGGTTTTTGAGGTAGGTGATGGGCAAGGTTTCCATTTTTATTCTCAACGTGTAGCTCCTGCGCCTGGTTCGACTGTCGGGCCTATTCAACTCCGAGTTAATGGTGGTTTATTAACTGCAGGTAGTATTGTTGCTTCTGGTTCTATTACAACTGAATCTTCTTTAAATGTTAATAATGGATTGTCTGTAAATGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACAGCAAACGCACTGAGAATTTGGAACGCTGAATACGGTGTTATTTTCCGTCGTTCTGAAAGTAACTTTTATATTATTCCAACCAATCAAAATGAAGGCGAAAGTGGAGACATTCACAGCTCTTTAAGACCCGTGAGAATAGGATTAAACGATGGTGCGGTTGGATTAGGAAGAGATTCTTTTATAGTAGATCAAAATAATGCTTTAACTACGATAAACAGTAACTCTCGCATTAATGCCAACTTTAGAATGCAATTGGGGCAGTCGACATATATTGATGCAGAATGTACTGATACTGTTCGACCAGCTGGTGCAGGTTCATTTGTCTCGCAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCATTCTATATGAATATTAATCGTACAGATACAAGTACTTACGTTCCTATTTTAAAACAACGTTATGTTCAAGGAAATAGCTGTTATTCTTTAGGTACATTAATTAGTACGGGTGATTTTAGAATTCATTATCATGAAGGTGGTGATAATGGTTCAACAGGTCCACAAAAGGCGGATTTAGCATGGCAATTTAGACGTGATGGCTCGTTCCGTTCACCTAATAAAATTGAAATTAATGCCGTTACAATTGGTACTGATGGCAACATCACAGGTGGTACTGGTAATTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAACGACTGTGGGAGGTTGGGCTGGTAGTTCCGTTGTTGGATGGTACAAATTTGCTACAGTAACAATTCCTCAGAGTACTGGCACAGTAACTTTTAAAATTTCCGGTGGAGCTGGTTTTAATTTTAAAAGCTATAACCAAGCTTCTATTGCTGAGATAGTTCTTCGCACAGGTAATAATCCTAAAGGCATAAACGCTGTACTATGGAACAGGTCAGACCTGAGTTTTAATCAGATAGCTACTATGAATACATCTGATGATACTTATGATGTATACGTATTCTGTGAAGGTTATACAAACGCATTGATAGTTGAATATTCATGTAGTGAAAACTCTTCAGTAACTGTAGTCGGTCTTAACGGAGGCATTCAACCAGTTGTTGATGCATTGCCTGAGGGACATGTTGTAGGTAAAACAGTTCGTCTGTTAAATAATATTGGCGGAACTTTCGCAGCTGGCGAATCTGACATTGTTACTCGTGGTGAATACGTTGCTGATAATCAAAAAGGCATGCGTATTAAATCTAACGGTAATAATATCGGTTCTAATGCTGCTATACTTCGAAATGACGGCGGAAGTTTTTATATTTTAGCTACAGATAAAAATACAGCAGAAAAATCCGATGCAGCTAATGGTGATTGGAATGGCTTAAGACCTTTCGCCATTAATATGGCTGATGGTCGCGTTGGTATGAACCATGGTCTAAATATTACCGGCGGTGGCTTGAATGTTACTGGTGGCTTGAATGTTACTAGTGGTAATACTAGTTTAGGTAATATTTCGTCTCGTGTGGTGGCTCGTTGGCGAGGAGCGTCCGGTTGGGCTGATAACTCGGATACAATGAAATCTAAAATCACCTTTATGGCAGACCATGGGGATTTATCTAATTCAGACAGTTATTATCCTATTGTAGGCGCATACAGCAACTATGGTTCAGCGGGTTATCGTCAAACCTTTGAGTTCGGATGGGTCGGTTCCGGCACTACAGCGGGTTGGCGCGATGGTATTATTCGTATTCGCGGAGATAATGCTAATGGCCAGCAAGCAAGATGGCGCTTTACAATGGACGGTACTTTAGATTGCCCTGGTAAAGTACTGCTACCACAAACAGGTGCCTTTGGTGTCAATACATCAAATGGTCTCGGTGGAAATAGTATAACATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATACAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTCAAACCTATCGAAAATGCGCTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA
Tertiary structure
PDB ID
7d7fa5b3d86542b731f0f34a160ee842fbc10ecd11a90aa4298b235a4345753b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of bacteriophage T2 | Akiyama,T., Ando,H., Kitao,T. and Shimada,K. | 2012-04-24 | — | GenBank |