Protein

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Genbank accession
WCZ54865.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MQYPVDGIRASLIAKNRILKVDAGHKLKDQRFVIKRINRIMGNDGLSYSIYAEHISYITADYALKPNLTVNGSGNVAMTQWLNGIIDSNRIHVDSDITTENTTSWTIDKVQNARQALGGVQGSILDVWGGEYRFDNLNISLLRHRGTVSNTLLSYGRNITDFDQEENITNTYTSIYPFASYSVQNGDTSEQKILTIPDLVVDSEYVNNFPNRKIQVVDFSDKFSTDEKPTVERLAEFAKSYIKSNNVGVPTVSTKISFVDLSKTENYKEFAPLEELDLCDEVPFAFEKFGIKTTAKISRIVWNVLLDSYDSLELGELKTNLSDVINNTNNAALDAKDAANDAKNSADNAALSANGKNRNWYGADDPTFGHLSELREGDSWYMPNGEDTELYHWINGQWVFILSTKDAHDAADAADKASKEAEEAKKTANKAVDGANDAVAKAGFANDTATQAKSDAAAATQNATTALTNAGTALTNAKNALDNVTKLDQTVKTEVTNINGQLAQKVSQTTFDTLKGTVTSQGTLINQNKDAIKLKADQTYVDTIKGTVANNTAAIDLNSKEIKLKASQSDVDKLGGRVTNAEAQIKLQADQIKLTVSKTELTNVLGDYATQTWTQSQIKSTADQINLSVEQSITTSENTLNNNIANATNDMATKTWTKGQLDLTDSSLTSQISSVKDGLTTQYTQLQQTLNGVQVTANNAVTQTQYTQLSDQFTTTIANVGNGGTNLLYDGGFESGKLNGLPEFYNNSLGNRPLPRGNYAVYLYAMPAEVNDDKVWYWSLPNPIVIKANQYYVISYDYSAAGSATTASDYAVDNAGNIIFGIMMEHTAHDMSDQSAWKRYKKVFRLSTDTTITKLRFGWVANSLSGGWKVIDNVQIEDGSIAHPYSPSQNDLATSSQFTQLQNDINLRVKAGDVVNQINISPESILIDGKKVHITGQTSIDNAVIKDAMIADIKADKITAGTLNAANVNVINLNADNITTGTLKGANLSLNLNTGEVVFQKGSIKSTNGNLNIDISKGTMAVINQYKSGFYFEDGKLVLNDGWLEGTSNQPKYGSLEYNANFFTVNGLAVKGTEGVTIGTPGYNPLAMFSSVKESGIAIDKKHLEIGSVGPTIISSGNEFFMNLWTQPPFIAVGTTADGNHMTTSDPGSRISLYAEYVHIKSAYSKTASGSANVIVSEDGALVRSTSASKYKTDIVRTNISNYGEKLLELPTATWTDIAETKRYRDDPVNQIKPTRNFGMIAEDLAEAGLEMLVVRGTDGELEGINYDRIGPALIPVIAKLKNEVETLKQQLEEKTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1297 AA
molecular weight: 141294,57050 Da
isoelectric point:5,04426
aromaticity:0,07556
hydropathy:-0,38921

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
5–315
IPR007119 Coil IPR012892 IPR030392
IPR010572
100–325
IPR010572
WCZ54865.1
1 1297
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Latilactobacillus phage TMW 1.706 P1
[NCBI] 		3027591 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCZ54865.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ240253 [NCBI]
CDS location
range 21412 -> 25305
strand -
CDS
ATGCAATATCCGGTTGATGGGATTCGGGCTAGTTTAATCGCTAAGAATCGTATTCTTAAAGTAGATGCTGGACATAAATTAAAGGACCAGCGCTTTGTAATCAAGCGGATTAATCGCATCATGGGGAACGACGGATTATCTTACTCTATTTATGCTGAACATATTAGTTATATAACTGCTGATTATGCCCTCAAACCAAATTTAACGGTTAATGGTAGCGGAAATGTAGCTATGACTCAATGGCTAAACGGCATCATAGACTCTAATAGAATTCACGTTGATAGTGATATCACCACCGAGAATACGACAAGTTGGACGATTGACAAGGTGCAGAATGCACGCCAAGCATTAGGCGGTGTTCAAGGTTCAATTCTTGACGTTTGGGGCGGCGAATATCGCTTTGACAATCTGAACATTAGTTTATTAAGACATCGTGGAACTGTTTCAAATACGCTGCTATCATATGGGCGTAATATTACAGATTTTGACCAAGAAGAGAATATTACAAACACTTATACTTCAATATATCCATTTGCTAGCTACTCCGTACAAAATGGCGACACTTCGGAGCAGAAGATTTTAACTATTCCCGATCTAGTTGTAGATTCCGAATATGTAAATAATTTTCCAAATCGAAAAATTCAAGTTGTAGATTTCAGCGATAAGTTTAGTACCGATGAAAAGCCCACTGTTGAACGCTTAGCAGAATTTGCTAAAAGCTATATCAAAAGCAATAACGTAGGTGTACCGACTGTTTCTACTAAAATTAGTTTTGTTGACTTATCTAAAACTGAAAATTATAAAGAATTTGCACCGCTAGAAGAGCTCGATTTATGCGATGAAGTTCCTTTCGCTTTTGAAAAATTTGGGATAAAAACAACTGCTAAAATTAGTAGAATTGTGTGGAATGTTTTACTTGATAGCTACGATTCATTAGAACTAGGCGAGTTAAAGACGAATTTAAGCGATGTTATTAATAACACTAATAATGCTGCTCTTGATGCAAAAGATGCCGCTAATGATGCAAAAAACAGCGCAGACAATGCAGCATTATCTGCCAATGGGAAAAATAGAAATTGGTACGGGGCAGATGACCCGACTTTTGGTCATCTTAGTGAACTTCGCGAGGGTGATTCCTGGTATATGCCTAACGGCGAAGATACCGAACTATATCATTGGATTAACGGCCAGTGGGTCTTTATTTTGTCGACCAAGGATGCCCATGACGCGGCAGACGCAGCGGACAAAGCATCAAAAGAAGCCGAAGAAGCCAAAAAAACGGCTAACAAGGCAGTAGATGGTGCCAATGACGCAGTAGCCAAAGCGGGATTTGCGAACGACACGGCGACACAAGCTAAATCAGATGCGGCGGCTGCCACTCAGAATGCAACGACAGCCCTAACTAATGCGGGCACAGCTTTAACCAATGCTAAAAATGCCTTGGATAACGTTACTAAGTTAGACCAAACGGTTAAAACCGAAGTCACTAACATTAATGGGCAGCTTGCACAAAAGGTTAGCCAGACTACGTTTGATACGTTAAAAGGCACTGTTACAAGCCAAGGTACACTTATCAATCAAAATAAAGATGCTATTAAATTAAAGGCTGATCAGACTTACGTCGACACGATTAAGGGTACGGTGGCAAATAATACTGCTGCCATTGACCTTAACAGCAAAGAAATCAAGCTAAAGGCTAGCCAATCAGACGTCGATAAGCTAGGCGGGCGAGTAACCAACGCGGAAGCTCAAATCAAACTGCAAGCTGACCAGATTAAGTTGACGGTAAGTAAGACAGAACTAACCAACGTTTTGGGCGACTATGCCACACAAACATGGACGCAGTCGCAGATTAAAAGCACTGCTGACCAGATTAATTTAAGTGTTGAGCAATCGATCACGACCTCAGAAAATACGTTAAATAATAACATTGCAAACGCCACAAACGATATGGCCACAAAAACGTGGACAAAAGGACAACTTGATTTAACGGATAGCAGCCTAACGAGCCAGATATCAAGTGTTAAAGATGGGTTAACAACCCAATATACTCAGTTACAGCAAACGCTAAATGGCGTGCAAGTGACGGCCAATAACGCGGTCACACAAACTCAATACACTCAACTGTCAGATCAATTTACGACAACAATCGCCAATGTGGGTAATGGAGGTACAAACCTTTTATACGATGGAGGGTTTGAGAGCGGCAAATTAAATGGTCTACCGGAATTTTATAATAATAGTCTCGGTAATCGGCCGTTACCACGAGGTAATTATGCTGTTTACTTATATGCTATGCCGGCTGAGGTCAATGACGATAAAGTATGGTATTGGTCATTGCCAAACCCGATTGTGATTAAAGCAAATCAATATTATGTTATCTCTTATGATTATTCTGCGGCAGGATCAGCGACAACTGCTAGTGATTATGCGGTCGATAATGCCGGTAACATAATTTTTGGTATTATGATGGAACATACCGCACATGACATGTCAGATCAGAGTGCCTGGAAACGGTATAAAAAGGTGTTTAGATTAAGCACTGATACCACAATTACAAAGTTGAGATTTGGTTGGGTTGCTAACAGCTTATCGGGAGGCTGGAAAGTAATAGACAATGTGCAGATTGAGGACGGTTCAATTGCACATCCGTATAGTCCATCGCAAAACGATTTAGCAACATCTAGTCAGTTTACTCAGCTCCAAAACGACATTAATCTCCGCGTTAAAGCGGGCGACGTAGTCAACCAAATTAACATCAGTCCAGAAAGCATTTTAATTGACGGCAAGAAGGTCCACATCACGGGGCAAACGTCAATTGATAACGCAGTGATTAAAGATGCCATGATTGCAGACATTAAAGCCGATAAGATTACCGCTGGGACGCTTAATGCTGCTAACGTGAATGTGATTAACCTTAATGCGGATAACATTACGACGGGGACTTTAAAGGGCGCTAATTTAAGCTTGAATCTTAATACCGGGGAAGTTGTATTCCAGAAAGGTTCGATTAAATCAACCAATGGCAATCTAAACATCGACATCAGCAAGGGTACAATGGCGGTTATCAACCAGTACAAAAGTGGTTTTTATTTTGAAGATGGCAAGCTTGTTTTAAATGACGGCTGGTTGGAAGGTACTTCGAACCAGCCTAAATATGGGTCGCTTGAATACAACGCCAATTTCTTCACTGTTAACGGCTTAGCTGTTAAAGGAACAGAAGGCGTGACGATTGGGACACCAGGTTACAATCCATTAGCAATGTTCTCGTCAGTTAAGGAATCCGGGATTGCAATTGACAAAAAACATCTAGAAATAGGAAGTGTTGGCCCAACAATAATTAGTTCTGGCAATGAATTCTTTATGAATTTATGGACACAGCCGCCTTTTATTGCCGTTGGGACAACAGCGGATGGTAATCATATGACTACTAGTGATCCTGGCTCTCGAATTTCTTTATACGCCGAGTATGTACACATTAAATCGGCATACTCAAAGACAGCCAGTGGTTCGGCGAATGTTATCGTTTCCGAAGATGGCGCGCTTGTCCGTTCCACGTCAGCCTCTAAATATAAAACCGATATTGTTCGAACTAACATCTCTAATTACGGAGAGAAGTTGCTAGAGTTGCCAACTGCGACATGGACTGATATTGCTGAAACTAAACGTTATCGAGATGATCCAGTTAATCAGATTAAACCGACGCGCAACTTCGGGATGATTGCCGAAGATTTGGCGGAAGCTGGGCTTGAAATGCTGGTTGTCCGCGGAACAGATGGCGAACTTGAAGGAATTAATTACGACCGTATCGGGCCAGCTTTAATCCCGGTAATTGCGAAACTTAAAAATGAAGTTGAAACACTAAAACAACAATTGGAGGAAAAAACAGCATGA

Tertiary structure

PDB ID
8fc3ab1c04b4d13f9a54bd6341add3f6264018e02facecde4540db9712bf33f8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7501
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50