Protein
- Genbank accession
- CAB4151508.1 [GenBank]
- Protein name
- Collagen triple helix repeat
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C1 confidence 0,360
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C1 0,360 I 0,277 C3 0,172 - Protein sequence
-
MAGVTTTTEIVVQISTETQGVVTSGSISVISSAGVGPIGPTGPRGLDGIQGLQGIQGPVGDIGPAGPAGATGSTGATGATGLTGPTGTAATVTVGSTTTGAAGSSASTSNSGTTAAAILNFTIPRGDTGATGATGATGATGPIGLTGATGPTGATGPIGPTGLTGATGAQGIQGIQGITGATGATGSTGATGATGAGVAAGGTANQLLAKINSTDYNTQWVDAPVAPYTAMVKHTVKAGEALTKGQAVYVSSANGTNMIVSKASNATEATSSKTMGLIDATVALNGFASVVTEGLLTGLDTSAAGAAGDAVWLGTAGNLLYGASNQPSSPAHLVFIGIVTKVNASAGEIFIRPQNGFELDEIHDVAITSAVSGDILKWNGTAWVNDSALLAAKAPLASPTFTGTVSGVTKSMVGLGSVDNTSDAGKPVSTAQQTALDLKANLASPSLTGTPLAPTAAVDTNTTQVATTAYVVGQGYAKLSSPTFTGTPTLPTGTIATTQTATDSTTKVATTAFVTTADNLKANLAGPTFTGVPAAPTAAVDTNTTQLATTAYVVGQGYAKLASPTFTGTPVVPSAFGGTNTTQAANTAFVQTAIGFYDTAYTSLEYYSSPVDSTVNAAATANYQYYIPFYVAQYGTFDRIGIRTGTTWSGTTTVRLGIYNNSAYTPTTVLIDGGTVSCSAANTVYTVTISQTLGAGWYWLSAAFSTVSATPNFNGSAAFSSSANIGVASFGTTLTSPPSRYRFRQDTASSNSALATATPNATGTTSPLIGLRRA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 774 AA molecular weight: 75924,05730 Da isoelectric point: 5,13503 aromaticity: 0,06331 hydropathy: 0,13773
Taxonomy
Phage
uncultured Caudovirales phage
[NCBI]
· taxon 2100421
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4151508.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796566
[NCBI]
CDS location
range 13850 -> 16174
strand -
strand -
CDS
ATGGCTGGTGTAACAACTACTACAGAAATTGTCGTACAAATAAGTACAGAAACCCAAGGAGTTGTAACTTCGGGGTCTATCAGTGTTATCTCTTCTGCTGGTGTTGGTCCTATAGGTCCAACTGGTCCTAGAGGTCTTGACGGTATTCAAGGACTTCAAGGCATTCAGGGTCCTGTTGGTGATATAGGTCCTGCGGGTCCTGCTGGTGCTACTGGCAGTACGGGAGCCACAGGTGCTACAGGTCTTACAGGACCCACTGGGACGGCTGCTACGGTCACTGTAGGGTCAACAACGACTGGTGCCGCAGGTTCTTCTGCTTCTACTTCTAATAGTGGTACAACAGCAGCAGCAATTTTAAACTTTACAATACCTAGAGGTGATACTGGTGCCACAGGCGCTACTGGTGCTACAGGTGCAACAGGTCCTATAGGTTTAACAGGTGCTACTGGTCCTACTGGTGCTACTGGTCCTATAGGTCCAACGGGTTTAACAGGGGCTACTGGTGCCCAAGGCATTCAAGGTATCCAAGGAATCACGGGTGCAACAGGCGCTACTGGTAGCACAGGGGCTACTGGCGCAACTGGTGCTGGTGTTGCTGCTGGCGGTACTGCTAACCAGTTGCTAGCAAAAATTAACTCAACCGACTACAACACCCAATGGGTAGATGCCCCTGTAGCGCCATATACCGCTATGGTTAAACATACTGTTAAGGCTGGTGAAGCACTAACTAAAGGTCAAGCAGTTTATGTTTCTTCTGCTAACGGAACAAACATGATTGTTTCAAAAGCCAGCAACGCTACAGAGGCTACTTCATCTAAGACGATGGGTTTGATTGATGCTACTGTTGCTTTAAATGGTTTTGCTAGTGTTGTTACTGAAGGTCTGTTAACTGGTTTAGATACCAGCGCAGCAGGTGCTGCTGGTGATGCTGTGTGGCTTGGTACTGCTGGTAACTTACTTTATGGCGCAAGTAATCAACCTAGTTCTCCTGCTCATCTTGTTTTTATTGGTATAGTAACAAAAGTTAATGCTAGTGCGGGTGAAATTTTTATTCGTCCTCAGAATGGTTTTGAACTTGATGAAATCCATGATGTTGCAATAACTAGTGCTGTTTCTGGTGATATTCTTAAATGGAATGGAACTGCTTGGGTTAATGATAGTGCTTTGCTTGCTGCAAAAGCACCATTGGCTAGTCCTACTTTTACTGGTACTGTTTCTGGTGTTACAAAATCAATGGTTGGTCTTGGAAGCGTGGACAACACTAGCGATGCTGGTAAACCTGTTTCTACTGCTCAACAGACGGCTCTTGATTTAAAGGCTAATCTTGCTAGTCCATCATTAACTGGTACGCCATTGGCACCTACGGCTGCTGTTGATACAAACACTACACAAGTTGCTACCACCGCCTATGTAGTAGGTCAAGGATATGCTAAACTTTCATCACCTACTTTTACTGGCACACCAACATTGCCTACAGGTACGATTGCTACTACGCAAACTGCTACTGATAGTACTACTAAAGTTGCTACTACTGCGTTTGTTACAACGGCTGACAACCTTAAAGCAAACCTTGCTGGTCCCACTTTTACTGGTGTACCTGCTGCACCAACTGCTGCGGTAGATACAAACACAACGCAACTTGCTACTACTGCGTATGTTGTTGGTCAAGGATATGCAAAGTTGGCTTCACCAACTTTTACTGGGACCCCTGTTGTGCCAAGTGCTTTTGGTGGCACAAACACAACACAAGCGGCTAATACAGCGTTTGTTCAGACAGCAATAGGTTTTTATGACACTGCCTATACATCTCTTGAATACTATAGTTCTCCTGTTGATAGCACCGTAAATGCAGCTGCGACTGCTAATTATCAGTATTATATTCCGTTTTATGTTGCACAATATGGAACATTTGACAGAATAGGAATACGAACTGGAACTACTTGGTCTGGCACTACAACAGTAAGATTAGGTATTTACAATAACAGTGCATATACACCAACCACGGTTTTGATTGATGGTGGGACTGTTTCCTGTAGTGCTGCCAACACGGTATATACGGTTACGATTTCTCAAACTCTTGGTGCTGGATGGTATTGGCTATCAGCAGCGTTCAGTACTGTTAGTGCAACCCCTAACTTTAACGGTTCAGCAGCATTTAGTTCCAGTGCTAATATTGGTGTAGCATCATTTGGAACAACTTTGACAAGTCCCCCTTCTCGTTATCGTTTCCGTCAAGACACTGCTAGTAGCAACTCTGCTTTGGCTACAGCAACACCAAATGCGACTGGTACCACCTCACCGCTTATTGGATTAAGACGAGCATGA
Genome Context
Tertiary structure
CAB4151508.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
65.7
Oligomeric state
monomer