Genbank accession
CAB4151508.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,99
Seq2Symm
C1 confidence 0,360
C1 0,360
I 0,277
C3 0,172
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAGVTTTTEIVVQISTETQGVVTSGSISVISSAGVGPIGPTGPRGLDGIQGLQGIQGPVGDIGPAGPAGATGSTGATGATGLTGPTGTAATVTVGSTTTGAAGSSASTSNSGTTAAAILNFTIPRGDTGATGATGATGATGPIGLTGATGPTGATGPIGPTGLTGATGAQGIQGIQGITGATGATGSTGATGATGAGVAAGGTANQLLAKINSTDYNTQWVDAPVAPYTAMVKHTVKAGEALTKGQAVYVSSANGTNMIVSKASNATEATSSKTMGLIDATVALNGFASVVTEGLLTGLDTSAAGAAGDAVWLGTAGNLLYGASNQPSSPAHLVFIGIVTKVNASAGEIFIRPQNGFELDEIHDVAITSAVSGDILKWNGTAWVNDSALLAAKAPLASPTFTGTVSGVTKSMVGLGSVDNTSDAGKPVSTAQQTALDLKANLASPSLTGTPLAPTAAVDTNTTQVATTAYVVGQGYAKLSSPTFTGTPTLPTGTIATTQTATDSTTKVATTAFVTTADNLKANLAGPTFTGVPAAPTAAVDTNTTQLATTAYVVGQGYAKLASPTFTGTPVVPSAFGGTNTTQAANTAFVQTAIGFYDTAYTSLEYYSSPVDSTVNAAATANYQYYIPFYVAQYGTFDRIGIRTGTTWSGTTTVRLGIYNNSAYTPTTVLIDGGTVSCSAANTVYTVTISQTLGAGWYWLSAAFSTVSATPNFNGSAAFSSSANIGVASFGTTLTSPPSRYRFRQDTASSNSALATATPNATGTTSPLIGLRRA
Physico‐chemical
properties
protein length:774 AA
molecular weight: 75924,05730 Da
isoelectric point:5,13503
aromaticity:0,06331
hydropathy:0,13773

Taxonomy

Phage
uncultured Caudovirales phage [NCBI] · taxon 2100421
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
CAB4151508.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796566 [NCBI]
CDS location
range 13850 -> 16174
strand -
CDS
ATGGCTGGTGTAACAACTACTACAGAAATTGTCGTACAAATAAGTACAGAAACCCAAGGAGTTGTAACTTCGGGGTCTATCAGTGTTATCTCTTCTGCTGGTGTTGGTCCTATAGGTCCAACTGGTCCTAGAGGTCTTGACGGTATTCAAGGACTTCAAGGCATTCAGGGTCCTGTTGGTGATATAGGTCCTGCGGGTCCTGCTGGTGCTACTGGCAGTACGGGAGCCACAGGTGCTACAGGTCTTACAGGACCCACTGGGACGGCTGCTACGGTCACTGTAGGGTCAACAACGACTGGTGCCGCAGGTTCTTCTGCTTCTACTTCTAATAGTGGTACAACAGCAGCAGCAATTTTAAACTTTACAATACCTAGAGGTGATACTGGTGCCACAGGCGCTACTGGTGCTACAGGTGCAACAGGTCCTATAGGTTTAACAGGTGCTACTGGTCCTACTGGTGCTACTGGTCCTATAGGTCCAACGGGTTTAACAGGGGCTACTGGTGCCCAAGGCATTCAAGGTATCCAAGGAATCACGGGTGCAACAGGCGCTACTGGTAGCACAGGGGCTACTGGCGCAACTGGTGCTGGTGTTGCTGCTGGCGGTACTGCTAACCAGTTGCTAGCAAAAATTAACTCAACCGACTACAACACCCAATGGGTAGATGCCCCTGTAGCGCCATATACCGCTATGGTTAAACATACTGTTAAGGCTGGTGAAGCACTAACTAAAGGTCAAGCAGTTTATGTTTCTTCTGCTAACGGAACAAACATGATTGTTTCAAAAGCCAGCAACGCTACAGAGGCTACTTCATCTAAGACGATGGGTTTGATTGATGCTACTGTTGCTTTAAATGGTTTTGCTAGTGTTGTTACTGAAGGTCTGTTAACTGGTTTAGATACCAGCGCAGCAGGTGCTGCTGGTGATGCTGTGTGGCTTGGTACTGCTGGTAACTTACTTTATGGCGCAAGTAATCAACCTAGTTCTCCTGCTCATCTTGTTTTTATTGGTATAGTAACAAAAGTTAATGCTAGTGCGGGTGAAATTTTTATTCGTCCTCAGAATGGTTTTGAACTTGATGAAATCCATGATGTTGCAATAACTAGTGCTGTTTCTGGTGATATTCTTAAATGGAATGGAACTGCTTGGGTTAATGATAGTGCTTTGCTTGCTGCAAAAGCACCATTGGCTAGTCCTACTTTTACTGGTACTGTTTCTGGTGTTACAAAATCAATGGTTGGTCTTGGAAGCGTGGACAACACTAGCGATGCTGGTAAACCTGTTTCTACTGCTCAACAGACGGCTCTTGATTTAAAGGCTAATCTTGCTAGTCCATCATTAACTGGTACGCCATTGGCACCTACGGCTGCTGTTGATACAAACACTACACAAGTTGCTACCACCGCCTATGTAGTAGGTCAAGGATATGCTAAACTTTCATCACCTACTTTTACTGGCACACCAACATTGCCTACAGGTACGATTGCTACTACGCAAACTGCTACTGATAGTACTACTAAAGTTGCTACTACTGCGTTTGTTACAACGGCTGACAACCTTAAAGCAAACCTTGCTGGTCCCACTTTTACTGGTGTACCTGCTGCACCAACTGCTGCGGTAGATACAAACACAACGCAACTTGCTACTACTGCGTATGTTGTTGGTCAAGGATATGCAAAGTTGGCTTCACCAACTTTTACTGGGACCCCTGTTGTGCCAAGTGCTTTTGGTGGCACAAACACAACACAAGCGGCTAATACAGCGTTTGTTCAGACAGCAATAGGTTTTTATGACACTGCCTATACATCTCTTGAATACTATAGTTCTCCTGTTGATAGCACCGTAAATGCAGCTGCGACTGCTAATTATCAGTATTATATTCCGTTTTATGTTGCACAATATGGAACATTTGACAGAATAGGAATACGAACTGGAACTACTTGGTCTGGCACTACAACAGTAAGATTAGGTATTTACAATAACAGTGCATATACACCAACCACGGTTTTGATTGATGGTGGGACTGTTTCCTGTAGTGCTGCCAACACGGTATATACGGTTACGATTTCTCAAACTCTTGGTGCTGGATGGTATTGGCTATCAGCAGCGTTCAGTACTGTTAGTGCAACCCCTAACTTTAACGGTTCAGCAGCATTTAGTTCCAGTGCTAATATTGGTGTAGCATCATTTGGAACAACTTTGACAAGTCCCCCTTCTCGTTATCGTTTCCGTCAAGACACTGCTAGTAGCAACTCTGCTTTGGCTACAGCAACACCAAATGCGACTGGTACCACCTCACCGCTTATTGGATTAAGACGAGCATGA

Genome Context

Tertiary structure

CAB4151508.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 65.7
Oligomeric state monomer