Protein

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Genbank accession
CAB4151508.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAGVTTTTEIVVQISTETQGVVTSGSISVISSAGVGPIGPTGPRGLDGIQGLQGIQGPVGDIGPAGPAGATGSTGATGATGLTGPTGTAATVTVGSTTTGAAGSSASTSNSGTTAAAILNFTIPRGDTGATGATGATGATGPIGLTGATGPTGATGPIGPTGLTGATGAQGIQGIQGITGATGATGSTGATGATGAGVAAGGTANQLLAKINSTDYNTQWVDAPVAPYTAMVKHTVKAGEALTKGQAVYVSSANGTNMIVSKASNATEATSSKTMGLIDATVALNGFASVVTEGLLTGLDTSAAGAAGDAVWLGTAGNLLYGASNQPSSPAHLVFIGIVTKVNASAGEIFIRPQNGFELDEIHDVAITSAVSGDILKWNGTAWVNDSALLAAKAPLASPTFTGTVSGVTKSMVGLGSVDNTSDAGKPVSTAQQTALDLKANLASPSLTGTPLAPTAAVDTNTTQVATTAYVVGQGYAKLSSPTFTGTPTLPTGTIATTQTATDSTTKVATTAFVTTADNLKANLAGPTFTGVPAAPTAAVDTNTTQLATTAYVVGQGYAKLASPTFTGTPVVPSAFGGTNTTQAANTAFVQTAIGFYDTAYTSLEYYSSPVDSTVNAAATANYQYYIPFYVAQYGTFDRIGIRTGTTWSGTTTVRLGIYNNSAYTPTTVLIDGGTVSCSAANTVYTVTISQTLGAGWYWLSAAFSTVSATPNFNGSAAFSSSANIGVASFGTTLTSPPSRYRFRQDTASSNSALATATPNATGTTSPLIGLRRA
Physico‐chemical
properties
protein length:774 AA
molecular weight: 75924,05730 Da
isoelectric point:5,13503
aromaticity:0,06331
hydropathy:0,13773

Domains

Domains [InterPro]
IPR008160
36–88
IPR008160 IPR008160
IPR050149
36–196
IPR050149
CAB4151508.1
1 774
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4151508.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796566 [NCBI]
CDS location
range 13850 -> 16174
strand -
CDS
ATGGCTGGTGTAACAACTACTACAGAAATTGTCGTACAAATAAGTACAGAAACCCAAGGAGTTGTAACTTCGGGGTCTATCAGTGTTATCTCTTCTGCTGGTGTTGGTCCTATAGGTCCAACTGGTCCTAGAGGTCTTGACGGTATTCAAGGACTTCAAGGCATTCAGGGTCCTGTTGGTGATATAGGTCCTGCGGGTCCTGCTGGTGCTACTGGCAGTACGGGAGCCACAGGTGCTACAGGTCTTACAGGACCCACTGGGACGGCTGCTACGGTCACTGTAGGGTCAACAACGACTGGTGCCGCAGGTTCTTCTGCTTCTACTTCTAATAGTGGTACAACAGCAGCAGCAATTTTAAACTTTACAATACCTAGAGGTGATACTGGTGCCACAGGCGCTACTGGTGCTACAGGTGCAACAGGTCCTATAGGTTTAACAGGTGCTACTGGTCCTACTGGTGCTACTGGTCCTATAGGTCCAACGGGTTTAACAGGGGCTACTGGTGCCCAAGGCATTCAAGGTATCCAAGGAATCACGGGTGCAACAGGCGCTACTGGTAGCACAGGGGCTACTGGCGCAACTGGTGCTGGTGTTGCTGCTGGCGGTACTGCTAACCAGTTGCTAGCAAAAATTAACTCAACCGACTACAACACCCAATGGGTAGATGCCCCTGTAGCGCCATATACCGCTATGGTTAAACATACTGTTAAGGCTGGTGAAGCACTAACTAAAGGTCAAGCAGTTTATGTTTCTTCTGCTAACGGAACAAACATGATTGTTTCAAAAGCCAGCAACGCTACAGAGGCTACTTCATCTAAGACGATGGGTTTGATTGATGCTACTGTTGCTTTAAATGGTTTTGCTAGTGTTGTTACTGAAGGTCTGTTAACTGGTTTAGATACCAGCGCAGCAGGTGCTGCTGGTGATGCTGTGTGGCTTGGTACTGCTGGTAACTTACTTTATGGCGCAAGTAATCAACCTAGTTCTCCTGCTCATCTTGTTTTTATTGGTATAGTAACAAAAGTTAATGCTAGTGCGGGTGAAATTTTTATTCGTCCTCAGAATGGTTTTGAACTTGATGAAATCCATGATGTTGCAATAACTAGTGCTGTTTCTGGTGATATTCTTAAATGGAATGGAACTGCTTGGGTTAATGATAGTGCTTTGCTTGCTGCAAAAGCACCATTGGCTAGTCCTACTTTTACTGGTACTGTTTCTGGTGTTACAAAATCAATGGTTGGTCTTGGAAGCGTGGACAACACTAGCGATGCTGGTAAACCTGTTTCTACTGCTCAACAGACGGCTCTTGATTTAAAGGCTAATCTTGCTAGTCCATCATTAACTGGTACGCCATTGGCACCTACGGCTGCTGTTGATACAAACACTACACAAGTTGCTACCACCGCCTATGTAGTAGGTCAAGGATATGCTAAACTTTCATCACCTACTTTTACTGGCACACCAACATTGCCTACAGGTACGATTGCTACTACGCAAACTGCTACTGATAGTACTACTAAAGTTGCTACTACTGCGTTTGTTACAACGGCTGACAACCTTAAAGCAAACCTTGCTGGTCCCACTTTTACTGGTGTACCTGCTGCACCAACTGCTGCGGTAGATACAAACACAACGCAACTTGCTACTACTGCGTATGTTGTTGGTCAAGGATATGCAAAGTTGGCTTCACCAACTTTTACTGGGACCCCTGTTGTGCCAAGTGCTTTTGGTGGCACAAACACAACACAAGCGGCTAATACAGCGTTTGTTCAGACAGCAATAGGTTTTTATGACACTGCCTATACATCTCTTGAATACTATAGTTCTCCTGTTGATAGCACCGTAAATGCAGCTGCGACTGCTAATTATCAGTATTATATTCCGTTTTATGTTGCACAATATGGAACATTTGACAGAATAGGAATACGAACTGGAACTACTTGGTCTGGCACTACAACAGTAAGATTAGGTATTTACAATAACAGTGCATATACACCAACCACGGTTTTGATTGATGGTGGGACTGTTTCCTGTAGTGCTGCCAACACGGTATATACGGTTACGATTTCTCAAACTCTTGGTGCTGGATGGTATTGGCTATCAGCAGCGTTCAGTACTGTTAGTGCAACCCCTAACTTTAACGGTTCAGCAGCATTTAGTTCCAGTGCTAATATTGGTGTAGCATCATTTGGAACAACTTTGACAAGTCCCCCTTCTCGTTATCGTTTCCGTCAAGACACTGCTAGTAGCAACTCTGCTTTGGCTACAGCAACACCAAATGCGACTGGTACCACCTCACCGCTTATTGGATTAAGACGAGCATGA

Tertiary structure

PDB ID
ecff0a55dccf7e5e157e8ca046e54d0637fa475130a500addb209033161932d3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2767
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50