Protein
- Genbank accession
- UYE89917.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TFTFTF
- Seq2Symm
-
C3 confidence 0,990 truncated
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C3 0,990 C1 0,124 D3 0,004 - Protein sequence
-
MIVYNNQEPTNPNNVGQFGATEGSIGAYKQAAEYAADAKYWSLLAEAKFGTVDDLIAEVEKLYQQGILLREDIEALKQDFKDQDARLMQLIAQSNAAVANANNAIALINQKLVEVDKQLDILLGMTVEVTTLSPGQPATGEFDPTTGKISLGIPEGLPGKDGSVKDLNTVDTGVPVAGDLGFYVDQTDNTVHKTTLENIANLIPSVRDISVNGGPAESGSVSLTIDKSTVGLDNVENVASYSKEETDKKVDRFIKAYNTKADADADAINRKAGETILVWEDTKYSFYTVASDKILEPLKTEPRVVTVNSRIPDSTGNIDITIPTGNPSLYLGEMVMFPYDPAKNISYPGILPADGRLVSKESAADLGPSLLSGQLPVVSETEWQAGAKQYFSWGKQADGITDADSTNYVNIRLPDWTGGETIRSPNSATDTEYKGQVQAQKPYIVTVNGLSPNDNTGNVNLTPATIGAIAKAGGKMDGNLVLNNGISLRRIKDDSSQVNMVSRSGSDSSVFGDHLARTVIASSSVPYLSTPSGDYLFYAENNKPTPAAIGAAAVTTDGVNSDLKTFTQKATFQQPVTIPDAVGDYDAVTYRQLKNQGGGGGGATMNGISNFNIGDFRLVDSRAFIHSSDITSDGQLLTRADYPELWAYAQLLTPISDDDWLASPEKRGKYSLGDGSTTFRVPDRNGVQANSIAGLFGRGDSGNSGNDGAVFSSGAPNITGTPEVTMLSGWGSGGSVRGRGSFSPQTTTLTPIGGTNAINGSYVNIDFDASKSNPIYGRTVSELRPNNFIGVWVIRAKGAFIAANTSWSVINSDDIRPSDGTTITGGNLVSDYRVGTEPEGSAEFKMQGTVGGSYSARIGVYNKTSSKGTTFDFTEAGNIETPKGRVLVKDDYGVGVQGGTVLPDSNYNQFITDSDGNSPWAAANGGGFQTSYAVNRICQFWISLNGSAYVRTNTINNNPKELKTNLPWTTLQNAGTSDANVKDIGDDLDLNVALSNIKALEFKNFTYKSDEKKSPRRGVIAQQAEQVDPQYVHSAEKSGVMTLDTNPLLLDALAAIKCLSEKVEELEAKLAAK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1073 AA molecular weight: 114292,30070 Da isoelectric point: 4,70447 aromaticity: 0,07456 hydropathy: -0,35815
Domains
Domain architecture
UYE89917.1
1
1073 aa
STR 633–798 · CHP 977–1070 ·
ATT Attachment Domain
STR Structural Domain
RBD Receptor-Binding Domain
CBM Carbohydrate-Binding Module
LEC Lectin-like Domain
ENZ Enzymatic Domain
CHP Intramolecular Chaperone
LNK Linker/Spacer Domain
TAS Tail-Associated Structural
TTP Tail Tubular Protein
UNK Uncharacterized Domain
Unmapped
Proteins with similar domain architecture
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE89917.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP293233.1
[NCBI]
CDS location
range 10170 -> 13391
strand +
strand +
CDS
ATGATCGTTTATAACAACCAAGAGCCAACTAATCCTAACAACGTTGGTCAGTTTGGTGCAACAGAAGGCTCTATTGGAGCCTATAAGCAAGCAGCTGAATATGCTGCTGATGCTAAATATTGGTCACTATTGGCAGAGGCTAAATTTGGTACGGTTGATGATCTGATTGCAGAAGTGGAAAAACTTTATCAACAAGGGATTCTGTTACGTGAGGATATTGAAGCTCTTAAGCAAGACTTCAAAGATCAAGACGCTCGTTTGATGCAACTTATTGCTCAGTCTAATGCTGCCGTTGCTAATGCTAATAACGCTATTGCACTAATTAATCAAAAACTGGTAGAGGTTGACAAACAGCTGGATATCTTGTTAGGGATGACTGTTGAGGTAACAACTTTAAGTCCGGGACAGCCTGCTACTGGTGAGTTTGACCCTACCACTGGTAAGATCAGCCTTGGTATTCCTGAGGGTCTTCCGGGTAAAGATGGATCGGTTAAAGACTTAAACACTGTTGATACTGGTGTTCCTGTTGCTGGGGATTTGGGTTTTTACGTAGACCAAACTGATAATACAGTCCATAAAACCACTTTGGAAAACATCGCAAACCTAATCCCATCTGTTAGGGATATCAGTGTTAATGGTGGACCTGCTGAAAGTGGTAGCGTCTCTTTAACCATTGACAAAAGCACGGTAGGTCTAGATAACGTAGAAAACGTAGCTTCTTACAGTAAAGAAGAAACCGACAAGAAAGTTGACAGGTTCATCAAAGCCTATAATACTAAAGCTGATGCTGATGCTGATGCGATTAACCGAAAGGCTGGTGAGACAATTCTAGTTTGGGAAGATACTAAGTATTCATTCTACACCGTGGCTTCTGATAAAATCTTAGAGCCTTTGAAAACAGAACCTCGCGTTGTTACTGTTAACTCTAGAATCCCAGACTCCACTGGTAACATTGATATCACCATTCCTACAGGAAACCCTTCTCTGTATCTTGGTGAAATGGTAATGTTCCCCTATGACCCAGCTAAGAATATTTCATATCCCGGGATTCTTCCTGCTGATGGTCGTCTTGTTTCTAAAGAATCGGCAGCAGATTTGGGTCCATCTTTACTCAGTGGTCAGCTCCCTGTTGTCAGTGAAACAGAATGGCAAGCAGGTGCTAAGCAATACTTCTCTTGGGGTAAGCAAGCTGACGGTATTACTGATGCAGATTCTACTAACTATGTTAACATCCGACTCCCAGACTGGACTGGTGGTGAAACAATTCGATCTCCTAACTCGGCTACAGATACTGAATACAAAGGCCAAGTGCAAGCTCAGAAGCCTTATATTGTAACAGTTAATGGGTTATCCCCTAATGACAACACTGGTAATGTAAATCTCACCCCTGCAACAATTGGAGCTATTGCCAAAGCTGGTGGTAAAATGGATGGTAACTTGGTTCTGAACAATGGAATCTCTTTAAGACGTATTAAAGATGACAGCAGTCAAGTCAACATGGTTTCTAGAAGTGGTTCAGATTCATCTGTGTTTGGTGATCACTTAGCCCGTACAGTTATTGCTAGTTCTAGTGTACCTTATCTGTCAACACCCTCTGGGGACTATTTGTTCTATGCAGAGAACAATAAGCCAACACCTGCTGCGATAGGTGCTGCTGCTGTAACTACTGACGGTGTAAACTCTGATCTTAAAACGTTTACACAGAAAGCTACTTTCCAGCAACCGGTTACTATTCCTGATGCTGTTGGTGATTATGATGCTGTTACCTATCGTCAGTTGAAAAACCAAGGTGGTGGCGGTGGTGGGGCTACAATGAATGGTATCTCCAACTTCAATATTGGCGACTTCCGACTAGTAGACAGTCGTGCTTTTATCCACTCAAGTGATATAACATCAGATGGTCAACTCCTTACCCGTGCTGATTATCCAGAGCTTTGGGCTTACGCCCAGCTATTAACCCCAATCAGTGATGACGATTGGTTAGCTTCTCCGGAAAAAAGAGGTAAATATTCTTTGGGTGACGGTTCTACAACTTTCCGTGTCCCTGACCGAAACGGGGTTCAGGCTAATTCCATAGCAGGGTTATTCGGGAGAGGTGATAGCGGTAACAGCGGTAATGATGGAGCTGTTTTTTCATCAGGAGCTCCTAATATAACAGGAACACCCGAGGTCACTATGCTGTCTGGTTGGGGTTCTGGTGGATCTGTTCGTGGTAGGGGTTCCTTCTCACCACAGACTACCACTTTAACTCCTATCGGCGGAACAAATGCCATAAATGGGTCTTATGTAAATATTGATTTTGATGCATCTAAATCCAACCCTATTTATGGCAGGACTGTATCAGAACTGAGACCTAACAACTTCATAGGCGTATGGGTAATTCGTGCTAAGGGTGCTTTCATTGCAGCTAATACTTCTTGGTCTGTTATTAATAGTGATGACATAAGACCGTCGGACGGTACAACCATTACAGGTGGCAACTTGGTATCCGATTATAGGGTTGGCACAGAACCAGAAGGGTCAGCTGAGTTCAAAATGCAAGGCACTGTTGGTGGTTCATACTCTGCAAGAATTGGAGTTTATAACAAAACTTCTTCGAAAGGTACAACTTTTGATTTCACTGAAGCGGGGAATATAGAGACTCCCAAAGGTCGTGTTTTAGTTAAAGATGATTATGGTGTTGGTGTTCAGGGTGGTACAGTGTTACCTGATTCTAACTATAACCAGTTCATAACAGACTCGGATGGTAATTCGCCGTGGGCAGCTGCAAATGGGGGAGGTTTCCAAACTTCTTATGCCGTAAACAGAATCTGCCAGTTTTGGATAAGCTTGAATGGTTCGGCTTATGTTAGAACTAACACCATAAACAATAATCCAAAAGAACTCAAAACCAACCTTCCGTGGACAACTCTTCAGAATGCTGGAACCTCTGACGCGAATGTTAAAGATATTGGTGATGATTTGGATTTAAATGTCGCTCTAAGTAATATTAAAGCTCTTGAGTTTAAGAACTTTACATATAAGAGTGATGAGAAGAAATCTCCACGTCGAGGGGTTATTGCACAACAGGCAGAACAGGTTGACCCTCAGTATGTTCATAGTGCGGAAAAAAGTGGAGTTATGACTCTCGACACTAACCCTCTTTTACTTGATGCTCTTGCAGCAATTAAGTGCTTGTCTGAGAAAGTGGAAGAGTTAGAAGCTAAGTTGGCTGCTAAATAA
Genome Context
Tertiary structure
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization and genome of Eschericha coli phage E20-1 | Bao,H. | 2015 | — | GenBank |