Protein

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Genbank accession
UYE89917.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,81
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MIVYNNQEPTNPNNVGQFGATEGSIGAYKQAAEYAADAKYWSLLAEAKFGTVDDLIAEVEKLYQQGILLREDIEALKQDFKDQDARLMQLIAQSNAAVANANNAIALINQKLVEVDKQLDILLGMTVEVTTLSPGQPATGEFDPTTGKISLGIPEGLPGKDGSVKDLNTVDTGVPVAGDLGFYVDQTDNTVHKTTLENIANLIPSVRDISVNGGPAESGSVSLTIDKSTVGLDNVENVASYSKEETDKKVDRFIKAYNTKADADADAINRKAGETILVWEDTKYSFYTVASDKILEPLKTEPRVVTVNSRIPDSTGNIDITIPTGNPSLYLGEMVMFPYDPAKNISYPGILPADGRLVSKESAADLGPSLLSGQLPVVSETEWQAGAKQYFSWGKQADGITDADSTNYVNIRLPDWTGGETIRSPNSATDTEYKGQVQAQKPYIVTVNGLSPNDNTGNVNLTPATIGAIAKAGGKMDGNLVLNNGISLRRIKDDSSQVNMVSRSGSDSSVFGDHLARTVIASSSVPYLSTPSGDYLFYAENNKPTPAAIGAAAVTTDGVNSDLKTFTQKATFQQPVTIPDAVGDYDAVTYRQLKNQGGGGGGATMNGISNFNIGDFRLVDSRAFIHSSDITSDGQLLTRADYPELWAYAQLLTPISDDDWLASPEKRGKYSLGDGSTTFRVPDRNGVQANSIAGLFGRGDSGNSGNDGAVFSSGAPNITGTPEVTMLSGWGSGGSVRGRGSFSPQTTTLTPIGGTNAINGSYVNIDFDASKSNPIYGRTVSELRPNNFIGVWVIRAKGAFIAANTSWSVINSDDIRPSDGTTITGGNLVSDYRVGTEPEGSAEFKMQGTVGGSYSARIGVYNKTSSKGTTFDFTEAGNIETPKGRVLVKDDYGVGVQGGTVLPDSNYNQFITDSDGNSPWAAANGGGFQTSYAVNRICQFWISLNGSAYVRTNTINNNPKELKTNLPWTTLQNAGTSDANVKDIGDDLDLNVALSNIKALEFKNFTYKSDEKKSPRRGVIAQQAEQVDPQYVHSAEKSGVMTLDTNPLLLDALAAIKCLSEKVEELEAKLAAK
Physico‐chemical
properties
protein length:1073 AA
molecular weight: 114292,30070 Da
isoelectric point:4,70447
aromaticity:0,07456
hydropathy:-0,35815

Domains

Domains [InterPro]
Coil
73–93
Coil Coil SSF88874 IPR030392
IPR030392
977–1032
IPR030392 Coil
UYE89917.1
1 1073
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage E20-1
[NCBI] 		2981564 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE89917.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP293233.1 [NCBI]
CDS location
range 10170 -> 13391
strand +
CDS
ATGATCGTTTATAACAACCAAGAGCCAACTAATCCTAACAACGTTGGTCAGTTTGGTGCAACAGAAGGCTCTATTGGAGCCTATAAGCAAGCAGCTGAATATGCTGCTGATGCTAAATATTGGTCACTATTGGCAGAGGCTAAATTTGGTACGGTTGATGATCTGATTGCAGAAGTGGAAAAACTTTATCAACAAGGGATTCTGTTACGTGAGGATATTGAAGCTCTTAAGCAAGACTTCAAAGATCAAGACGCTCGTTTGATGCAACTTATTGCTCAGTCTAATGCTGCCGTTGCTAATGCTAATAACGCTATTGCACTAATTAATCAAAAACTGGTAGAGGTTGACAAACAGCTGGATATCTTGTTAGGGATGACTGTTGAGGTAACAACTTTAAGTCCGGGACAGCCTGCTACTGGTGAGTTTGACCCTACCACTGGTAAGATCAGCCTTGGTATTCCTGAGGGTCTTCCGGGTAAAGATGGATCGGTTAAAGACTTAAACACTGTTGATACTGGTGTTCCTGTTGCTGGGGATTTGGGTTTTTACGTAGACCAAACTGATAATACAGTCCATAAAACCACTTTGGAAAACATCGCAAACCTAATCCCATCTGTTAGGGATATCAGTGTTAATGGTGGACCTGCTGAAAGTGGTAGCGTCTCTTTAACCATTGACAAAAGCACGGTAGGTCTAGATAACGTAGAAAACGTAGCTTCTTACAGTAAAGAAGAAACCGACAAGAAAGTTGACAGGTTCATCAAAGCCTATAATACTAAAGCTGATGCTGATGCTGATGCGATTAACCGAAAGGCTGGTGAGACAATTCTAGTTTGGGAAGATACTAAGTATTCATTCTACACCGTGGCTTCTGATAAAATCTTAGAGCCTTTGAAAACAGAACCTCGCGTTGTTACTGTTAACTCTAGAATCCCAGACTCCACTGGTAACATTGATATCACCATTCCTACAGGAAACCCTTCTCTGTATCTTGGTGAAATGGTAATGTTCCCCTATGACCCAGCTAAGAATATTTCATATCCCGGGATTCTTCCTGCTGATGGTCGTCTTGTTTCTAAAGAATCGGCAGCAGATTTGGGTCCATCTTTACTCAGTGGTCAGCTCCCTGTTGTCAGTGAAACAGAATGGCAAGCAGGTGCTAAGCAATACTTCTCTTGGGGTAAGCAAGCTGACGGTATTACTGATGCAGATTCTACTAACTATGTTAACATCCGACTCCCAGACTGGACTGGTGGTGAAACAATTCGATCTCCTAACTCGGCTACAGATACTGAATACAAAGGCCAAGTGCAAGCTCAGAAGCCTTATATTGTAACAGTTAATGGGTTATCCCCTAATGACAACACTGGTAATGTAAATCTCACCCCTGCAACAATTGGAGCTATTGCCAAAGCTGGTGGTAAAATGGATGGTAACTTGGTTCTGAACAATGGAATCTCTTTAAGACGTATTAAAGATGACAGCAGTCAAGTCAACATGGTTTCTAGAAGTGGTTCAGATTCATCTGTGTTTGGTGATCACTTAGCCCGTACAGTTATTGCTAGTTCTAGTGTACCTTATCTGTCAACACCCTCTGGGGACTATTTGTTCTATGCAGAGAACAATAAGCCAACACCTGCTGCGATAGGTGCTGCTGCTGTAACTACTGACGGTGTAAACTCTGATCTTAAAACGTTTACACAGAAAGCTACTTTCCAGCAACCGGTTACTATTCCTGATGCTGTTGGTGATTATGATGCTGTTACCTATCGTCAGTTGAAAAACCAAGGTGGTGGCGGTGGTGGGGCTACAATGAATGGTATCTCCAACTTCAATATTGGCGACTTCCGACTAGTAGACAGTCGTGCTTTTATCCACTCAAGTGATATAACATCAGATGGTCAACTCCTTACCCGTGCTGATTATCCAGAGCTTTGGGCTTACGCCCAGCTATTAACCCCAATCAGTGATGACGATTGGTTAGCTTCTCCGGAAAAAAGAGGTAAATATTCTTTGGGTGACGGTTCTACAACTTTCCGTGTCCCTGACCGAAACGGGGTTCAGGCTAATTCCATAGCAGGGTTATTCGGGAGAGGTGATAGCGGTAACAGCGGTAATGATGGAGCTGTTTTTTCATCAGGAGCTCCTAATATAACAGGAACACCCGAGGTCACTATGCTGTCTGGTTGGGGTTCTGGTGGATCTGTTCGTGGTAGGGGTTCCTTCTCACCACAGACTACCACTTTAACTCCTATCGGCGGAACAAATGCCATAAATGGGTCTTATGTAAATATTGATTTTGATGCATCTAAATCCAACCCTATTTATGGCAGGACTGTATCAGAACTGAGACCTAACAACTTCATAGGCGTATGGGTAATTCGTGCTAAGGGTGCTTTCATTGCAGCTAATACTTCTTGGTCTGTTATTAATAGTGATGACATAAGACCGTCGGACGGTACAACCATTACAGGTGGCAACTTGGTATCCGATTATAGGGTTGGCACAGAACCAGAAGGGTCAGCTGAGTTCAAAATGCAAGGCACTGTTGGTGGTTCATACTCTGCAAGAATTGGAGTTTATAACAAAACTTCTTCGAAAGGTACAACTTTTGATTTCACTGAAGCGGGGAATATAGAGACTCCCAAAGGTCGTGTTTTAGTTAAAGATGATTATGGTGTTGGTGTTCAGGGTGGTACAGTGTTACCTGATTCTAACTATAACCAGTTCATAACAGACTCGGATGGTAATTCGCCGTGGGCAGCTGCAAATGGGGGAGGTTTCCAAACTTCTTATGCCGTAAACAGAATCTGCCAGTTTTGGATAAGCTTGAATGGTTCGGCTTATGTTAGAACTAACACCATAAACAATAATCCAAAAGAACTCAAAACCAACCTTCCGTGGACAACTCTTCAGAATGCTGGAACCTCTGACGCGAATGTTAAAGATATTGGTGATGATTTGGATTTAAATGTCGCTCTAAGTAATATTAAAGCTCTTGAGTTTAAGAACTTTACATATAAGAGTGATGAGAAGAAATCTCCACGTCGAGGGGTTATTGCACAACAGGCAGAACAGGTTGACCCTCAGTATGTTCATAGTGCGGAAAAAAGTGGAGTTATGACTCTCGACACTAACCCTCTTTTACTTGATGCTCTTGCAGCAATTAAGTGCTTGTCTGAGAAAGTGGAAGAGTTAGAAGCTAAGTTGGCTGCTAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
a43e384eaec8469f440a44c02990ab20399ac89d8976aacaf43f06bb9e865385
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6014
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and genome of Eschericha coli phage E20-1 Bao,H. 2015 — GenBank