Protein

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Genbank accession
AUE22482.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDVNLLRLRNQNANNAQYIEGVDLDGSARWLVGISKNGSDAVQLYNNKYDSALTIASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLAGNNTFSGSNTFTNFVIKKNANAITIQNVDTTTALYIQARKSDGTNKWYIGNDGDENIVNIYNYLAKTQISLGNTITMSKTVQIGGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGAQTVVSDGEGLVIKNSTQNRPLYIRGKDAANVSRWWLGVGDPNSTDVALNNSFSGTQLILGNSSASINKTLTLAGQIQPSDFSNLDARYYTQSTANSRYMLAYSSGTGTEVGDSDGVAWNAKTGLYNVTRFNGGSTLLVFQMYQGSSSTPSAQLKFDYRNGGFWYRSSRDNFGFEEDFTQIYTERYKPTPSAIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGRYGGDSIGGKQRVQVSGTEQVSSSAGAHAHTVSGTAASNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:781 AA
molecular weight: 83878,31590 Da
isoelectric point:8,71079
aromaticity:0,08707
hydropathy:-0,42049

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–266
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 IPR048388 IPR048388
IPR051934
Unmapped
427–753
IPR051934
AUE22482.1
1 781
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-354 | STR 355-378 | ATT 379-473 | STR 474-777 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella virus VSe102
[NCBI] 		2053700 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella enteritidis
[NCBI] 		149539 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AUE22482.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG251392.1 [NCBI]
CDS location
range 48465 -> 50810
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCCGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTCACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGTTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAGACCTAGATGGCTCGGCTAGATGGTTGGTTGGTATTAGTAAAAATGGTTCTGATGCAGTGCAGTTGTACAATAATAAATATGACTCAGCTTTGACTATTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATTACTGGTCAAGTCCAACCTTCGGATTTCTCTAACTTAGATGCGAGATACTTTACTCAGACGGCAGCTAATCAGAGGTTTGCACAGTTAGCTGGTAATAACACATTTAGTGGTTCTAATACTTTCACTAATTTTGTTATTAAGAAGAATGCTAATGCTATTACTATTCAAAATGTAGATACAACTACGGCTTTGTATATCCAAGCAAGGAAATCAGATGGAACTAATAAGTGGTACATTGGTAATGACGGTGATGAGAACATTGTAAACATCTATAACTATTTAGCAAAAACACAAATCTCACTAGGTAACACCATTACCATGAGTAAAACAGTCCAAATTGGTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGCGCAAACAGTTGTTAGTGATGGCGAAGGTTTAGTTATTAAAAACTCTACTCAGAATAGGCCATTGTATATTCGTGGTAAGGACGCTGCCAATGTATCAAGATGGTGGTTAGGTGTTGGTGACCCAAATTCTACTGATGTAGCCTTAAACAACAGCTTCTCTGGCACTCAGTTAATTTTAGGTAACTCATCTGCAAGTATCAATAAGACATTAACCCTAGCAGGGCAGATTCAACCCTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTACACGCAATCTACCGCAAACTCTAGGTATATGCTTGCTTATTCTTCTGGCACTGGTACAGAGGTAGGTGATAGTGATGGCGTTGCTTGGAATGCTAAAACTGGTCTGTATAATGTTACAAGGTTTAATGGAGGCTCAACACTACTTGTTTTCCAAATGTATCAAGGTTCAAGCTCTACTCCTTCTGCTCAATTGAAATTCGACTACAGGAATGGAGGATTTTGGTACAGGTCATCAAGGGATAATTTTGGTTTTGAAGAGGACTTCACACAGATTTATACAGAAAGGTATAAACCAACCCCTTCAGCTATCGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAACAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCCGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTGGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGCTTCTCTGCGACTACTTCATCATTTGACTATGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACAGTTGGTGGTCGTTATGGTGGTGACTCTATCGGTGGTAAACAACGTGTTCAGGTATCTGGTACAGAACAGGTATCTAGCTCTGCTGGTGCTCACGCTCACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAAACCATGCTCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f4acade53cb49636ef05c87627339828fb31a7302d883e53b8123bf516be6ebd
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6969
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50