Protein
View in Explore- Genbank accession
- AUE22482.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDVNLLRLRNQNANNAQYIEGVDLDGSARWLVGISKNGSDAVQLYNNKYDSALTIASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLAGNNTFSGSNTFTNFVIKKNANAITIQNVDTTTALYIQARKSDGTNKWYIGNDGDENIVNIYNYLAKTQISLGNTITMSKTVQIGGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGAQTVVSDGEGLVIKNSTQNRPLYIRGKDAANVSRWWLGVGDPNSTDVALNNSFSGTQLILGNSSASINKTLTLAGQIQPSDFSNLDARYYTQSTANSRYMLAYSSGTGTEVGDSDGVAWNAKTGLYNVTRFNGGSTLLVFQMYQGSSSTPSAQLKFDYRNGGFWYRSSRDNFGFEEDFTQIYTERYKPTPSAIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGRYGGDSIGGKQRVQVSGTEQVSSSAGAHAHTVSGTAASNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 781 AA molecular weight: 83878,31590 Da isoelectric point: 8,71079 aromaticity: 0,08707 hydropathy: -0,42049
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella virus VSe102 [NCBI] |
2053700 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AUE22482.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG251392.1
[NCBI]
CDS location
range 48465 -> 50810
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCCGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTCACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGTTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAGACCTAGATGGCTCGGCTAGATGGTTGGTTGGTATTAGTAAAAATGGTTCTGATGCAGTGCAGTTGTACAATAATAAATATGACTCAGCTTTGACTATTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATTACTGGTCAAGTCCAACCTTCGGATTTCTCTAACTTAGATGCGAGATACTTTACTCAGACGGCAGCTAATCAGAGGTTTGCACAGTTAGCTGGTAATAACACATTTAGTGGTTCTAATACTTTCACTAATTTTGTTATTAAGAAGAATGCTAATGCTATTACTATTCAAAATGTAGATACAACTACGGCTTTGTATATCCAAGCAAGGAAATCAGATGGAACTAATAAGTGGTACATTGGTAATGACGGTGATGAGAACATTGTAAACATCTATAACTATTTAGCAAAAACACAAATCTCACTAGGTAACACCATTACCATGAGTAAAACAGTCCAAATTGGTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGCGCAAACAGTTGTTAGTGATGGCGAAGGTTTAGTTATTAAAAACTCTACTCAGAATAGGCCATTGTATATTCGTGGTAAGGACGCTGCCAATGTATCAAGATGGTGGTTAGGTGTTGGTGACCCAAATTCTACTGATGTAGCCTTAAACAACAGCTTCTCTGGCACTCAGTTAATTTTAGGTAACTCATCTGCAAGTATCAATAAGACATTAACCCTAGCAGGGCAGATTCAACCCTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTACACGCAATCTACCGCAAACTCTAGGTATATGCTTGCTTATTCTTCTGGCACTGGTACAGAGGTAGGTGATAGTGATGGCGTTGCTTGGAATGCTAAAACTGGTCTGTATAATGTTACAAGGTTTAATGGAGGCTCAACACTACTTGTTTTCCAAATGTATCAAGGTTCAAGCTCTACTCCTTCTGCTCAATTGAAATTCGACTACAGGAATGGAGGATTTTGGTACAGGTCATCAAGGGATAATTTTGGTTTTGAAGAGGACTTCACACAGATTTATACAGAAAGGTATAAACCAACCCCTTCAGCTATCGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAACAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCCGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTGGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGCTTCTCTGCGACTACTTCATCATTTGACTATGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACAGTTGGTGGTCGTTATGGTGGTGACTCTATCGGTGGTAAACAACGTGTTCAGGTATCTGGTACAGAACAGGTATCTAGCTCTGCTGGTGCTCACGCTCACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAAACCATGCTCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
f4acade53cb49636ef05c87627339828fb31a7302d883e53b8123bf516be6ebd
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50